Detail Information
Binding sites in RBPDB, PDB | ||
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RBPDB | RRMx1 | |
PDB | 2CQ3 |
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | kshv-miR-K12-7-5p | RBFOX2 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0015217 | 23543 |
Organism | Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV) | Homo sapiens |
Category | miRNA | protein |
Alias | - | dJ106I20.3//Fox-2//FOX2//fxh//HNRBP2//HRNBP2//RBM9//RTA |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | RBFOX2 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID |
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DARNED | RBFOX2 |
Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | RBFOX2 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | RBFOX2 |
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Interactor1: kshv-miR-K12-7-5p | Interactor2: RBFOX2 |
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Strong-Evidence | Dual luciferase reporter assay//RT-PCR//Western blot | |
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Support Database | VIRmiRNA |
PMID | 21283761 | Target region | 3'UTR |
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Source | VIRmiRNA | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | HEK293 cells | Interactor2 expression | None |
Description | We found that miR-K12-7 targeted the RTA 3'untranslated region (RTA3'UTR) in a seed sequence-dependent manner. miR-K12-7-5p derived from miR-K12-7 mediates the inhibition of RTA expression, and the mutation of the seed match site totally abrogated the inhibitory effect of miR-K12-7 on RTA 3'UTR. |