Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00495556

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      kshv-miR-K12-7-5p:  MIMAT0015217          MIGA1:  NM_001363583     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	kshv-miR-K12-7-5p	MIGA1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0015217	374986
Organism	Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	FAM73A

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	MIGA1	chr1:78337753(+) A-I      intronic chr1:78334151(+) A-I      intronic chr1:78334133(+) A-I      intronic chr1:78334127(+) A-I      intronic chr1:78293088(+) A-I      intronic chr1:78341928(+) A-I      3'UTR chr1:78341937(+) A-I      3'UTR chr1:78341940(+) A-I      3'UTR chr1:78341562(+) A-I      3'UTR chr1:78278766(+) A-I      intronic chr1:78256659(+) A-I      intronic chr1:78256678(+) A-I      intronic chr1:78256824(+) A-I      intronic chr1:78256777(+) A-I      intronic chr1:78256774(+) A-I      intronic chr1:78256771(+) A-I      intronic chr1:78256768(+) A-I      intronic chr1:78256767(+) A-I      intronic chr1:78256765(+) A-I      intronic chr1:78256763(+) A-I      intronic chr1:78256742(+) A-I      intronic chr1:78256679(+) A-I      intronic chr1:78256741(+) A-I      intronic chr1:78256713(+) A-I      intronic chr1:78255115(+) A-I      intronic chr1:78341864(+) A-I      3'UTR chr1:78341525(+) A-I      3'UTR chr1:78341532(+) A-I      3'UTR chr1:78341563(+) A-I      3'UTR chr1:78341568(+) A-I      3'UTR chr1:78341915(+) A-I      3'UTR chr1:78337770(+) A-I      intronic chr1:78341920(+) A-I      3'UTR chr1:78256792(+) A-I      intronic chr1:78256914(+) A-I      intronic chr1:78256932(+) A-I      intronic chr1:78256934(+) A-I      intronic chr1:78283827(+) A-I      intronic chr1:78283865(+) A-I      intronic chr1:78284069(+) A-I      intronic chr1:78284070(+) A-I      intronic chr1:78257366(+) A-I      intronic chr1:78257458(+) A-I      intronic chr1:78260286(+) A-I      intronic chr1:78260389(+) A-I      intronic chr1:78260390(+) A-I      intronic chr1:78261137(+) A-I      intronic chr1:78261239(+) A-I      intronic chr1:78261240(+) A-I      intronic chr1:78261395(+) A-I      intronic chr1:78261415(+) A-I      intronic chr1:78268269(+) A-I      intronic chr1:78270159(+) A-I      intronic chr1:78272988(+) A-I      intronic chr1:78272994(+) A-I      intronic chr1:78274655(+) A-I      intronic chr1:78274702(+) A-I      intronic chr1:78277983(+) A-I      intronic chr1:78278108(+) A-I      intronic chr1:78278759(+) A-I      intronic chr1:78278765(+) A-I      intronic chr1:78287247(+) A-I      intronic chr1:78287289(+) A-I      intronic chr1:78287978(+) A-I      intronic chr1:78284579(+) A-I      intronic chr1:78287996(+) A-I      intronic chr1:78290060(+) A-I      intronic chr1:78290132(+) A-I      intronic chr1:78284607(+) A-I      intronic chr1:78284609(+) A-I      intronic chr1:78284644(+) A-I      intronic chr1:78290136(+) A-I      intronic chr1:78292240(+) A-I      intronic chr1:78292246(+) A-I      intronic chr1:78293114(+) A-I      intronic chr1:78294850(+) A-I      intronic chr1:78294919(+) A-I      intronic chr1:78295038(+) A-I      intronic chr1:78295271(+) A-I      intronic chr1:78305135(+) A-I      intronic chr1:78305310(+) A-I      intronic chr1:78310569(+) A-I      intronic chr1:78314807(+) A-I      intronic chr1:78314816(+) A-I      intronic chr1:78314856(+) A-I      intronic chr1:78315626(+) A-I      intronic chr1:78316598(+) A-I      intronic chr1:78316681(+) A-I      intronic chr1:78284690(+) A-I      intronic chr1:78285072(+) A-I      intronic chr1:78285073(+) A-I      intronic chr1:78285086(+) A-I      intronic chr1:78285472(+) A-I      intronic chr1:78285487(+) A-I      intronic chr1:78285503(+) A-I      intronic chr1:78316721(+) A-I      intronic chr1:78317670(+) A-I      intronic chr1:78317674(+) A-I      intronic chr1:78286590(+) A-I      intronic chr1:78286633(+) A-I      intronic chr1:78286699(+) A-I      intronic chr1:78287185(+) A-I      intronic chr1:78287198(+) A-I      intronic chr1:78287207(+) A-I      intronic chr1:78287220(+) A-I      intronic chr1:78261132(+) A-I      intronic chr1:78333973(+) A-I      intronic chr1:78250176(+) A-I      intronic chr1:78256289(+) A-I      intronic chr1:78256493(+) A-I      intronic chr1:78256495(+) A-I      intronic chr1:78256732(+) A-I      intronic chr1:78256772(+) A-I      intronic chr1:78256784(+) A-I      intronic chr1:78317696(+) A-I      intronic chr1:78317709(+) A-I      intronic chr1:78317711(+) A-I      intronic chr1:78317727(+) A-I      intronic chr1:78317736(+) A-I      intronic chr1:78318611(+) A-I      intronic chr1:78284618(+) A-I      intronic chr1:78319293(+) A-I      intronic chr1:78323119(+) A-I      intronic chr1:78323911(+) A-I      intronic chr1:78324443(+) A-I      intronic chr1:78324510(+) A-I      intronic chr1:78330203(+) A-I      intronic chr1:78330205(+) A-I      intronic chr1:78330241(+) A-I      intronic chr1:78333111(+) A-I      intronic chr1:78333247(+) A-I      intronic chr1:78333259(+) A-I      intronic chr1:78333981(+) A-I      intronic chr1:78334064(+) A-I      intronic chr1:78337027(+) A-I      intronic chr1:78337108(+) A-I      intronic chr1:78338096(+) A-I      intronic chr1:78338126(+) A-I      intronic chr1:78343958(+) A-I      3'UTR chr1:78343895(+) A-I      3'UTR chr1:78343801(+) A-I      3'UTR chr1:78342709(+) A-I      3'UTR chr1:78341665(+) A-I      3'UTR chr1:78341743(+) A-I      3'UTR chr1:78343859(+) A-I      3'UTR chr1:78341392(+) A-I      3'UTR chr1:78341730(+) A-I      3'UTR chr1:78341675(+) A-I      3'UTR chr1:78341671(+) A-I      3'UTR chr1:78343959(+) A-I      3'UTR chr1:78343973(+) A-I      3'UTR chr1:78343985(+) A-I      3'UTR chr1:78344105(+) A-I      3'UTR chr1:78341440(+) A-I      3'UTR chr1:78343869(+) A-I      3'UTR chr1:78255035(+) A-I      intronic chr1:78256547(+) A-I      intronic chr1:78286731(+) A-I      intronic chr1:78290926(+) A-I      intronic chr1:78278034(+) A-I      intronic chr1:78286760(+) A-I      intronic chr1:78268370(+) A-I      intronic chr1:78284509(+) A-I      intronic chr1:78288031(+) A-I      intronic chr1:78337752(+) A-I      intronic chr1:78256365(+) A-I      intronic chr1:78289319(+) A-I      intronic chr1:78278806(+) A-I      intronic chr1:78309651(+) A-I      intronic chr1:78249963(+) A-I      intronic chr1:78334140(+) A-I      intronic chr1:78319198(+) A-I      intronic chr1:78270145(+) A-I      intronic chr1:78256699(+) A-I      intronic chr1:78285252(+) A-I      intronic chr1:78324494(+) A-I      intronic chr1:78255033(+) A-I      intronic chr1:78287313(+) A-I      intronic chr1:78337026(+) A-I      intronic chr1:78286734(+) A-I      intronic chr1:78324404(+) A-I      intronic chr1:78315039(+) A-I      intronic chr1:78255116(+) A-I      intronic chr1:78256482(+) A-I      intronic chr1:78256705(+) A-I      intronic chr1:78338188(+) A-I      intronic chr1:78331672(+) A-I      intronic chr1:78333146(+) A-I      intronic chr1:78256413(+) A-I      intronic chr1:78315568(+) A-I      intronic chr1:78343917(+) A-I      3'UTR chr1:78338503(+) A-I      intronic chr1:78284343(+) A-I      intronic chr1:78337942(+) A-I      intronic chr1:78289317(+) A-I      intronic chr1:78255078(+) A-I      intronic chr1:78256873(+) A-I      intronic chr1:78260388(+) A-I      intronic chr1:78256406(+) A-I      intronic chr1:78284686(+) A-I      intronic chr1:78293089(+) A-I      intronic chr1:78341739(+) A-I      3'UTR chr1:78275164(+) A-I      intronic chr1:78287181(+) A-I      intronic chr1:78294872(+) A-I      intronic chr1:78337025(+) A-I      intronic chr1:78341738(+) A-I      3'UTR chr1:78292209(+) A-I      intronic chr1:78256727(+) A-I      intronic chr1:78330240(+) A-I      intronic chr1:78292369(+) A-I      intronic chr1:78305221(+) A-I      intronic chr1:78341801(+) A-I      3'UTR chr1:78290774(+) A-I      intronic chr1:78270143(+) A-I      intronic chr1:78268379(+) A-I      intronic chr1:78317805(+) A-I      intronic chr1:78338084(+) A-I      intronic chr1:78305479(+) A-I      intronic chr1:78306230(+) A-I      intronic chr1:78316824(+) A-I      intronic chr1:78246757(+) A-I      intronic chr1:78305229(+) A-I      intronic chr1:78338087(+) A-I      intronic chr1:78324502(+) A-I      intronic chr1:78256808(+) A-I      intronic chr1:78337853(+) A-I      intronic chr1:78256327(+) A-I      intronic chr1:78255163(+) A-I      intronic chr1:78287977(+) A-I      intronic chr1:78337107(+) A-I      intronic chr1:78274675(+) A-I      intronic chr1:78334174(+) A-I      intronic chr1:78255156(+) A-I      intronic chr1:78283774(+) A-I      intronic chr1:78316641(+) A-I      intronic chr1:78343920(+) A-I      3'UTR chr1:78285502(+) A-I      intronic chr1:78337786(+) A-I      intronic chr1:78334096(+) A-I      intronic chr1:78338205(+) A-I      intronic chr1:78332498(+) A-I      intronic chr1:78334147(+) A-I      intronic chr1:78337093(+) A-I      intronic chr1:78273603(+) A-I      intronic chr1:78334095(+) A-I      intronic chr1:78262139(+) A-I      intronic chr1:78294896(+) A-I      intronic chr1:78256835(+) A-I      intronic chr1:78295085(+) A-I      intronic chr1:78337802(+) A-I      intronic chr1:78338136(+) A-I      intronic chr1:78317673(+) A-I      intronic chr1:78255095(+) A-I      intronic chr1:78319199(+) A-I      intronic chr1:78292265(+) A-I      intronic chr1:78341411(+) A-I      3'UTR chr1:78310560(+) A-I      intronic chr1:78338206(+) A-I      intronic chr1:78315613(+) A-I      intronic chr1:78268346(+) A-I      intronic chr1:78255104(+) A-I      intronic chr1:78277967(+) A-I      intronic chr1:78290128(+) A-I      intronic chr1:78255030(+) A-I      intronic chr1:78256660(+) A-I      intronic chr1:78286708(+) A-I      intronic chr1:78256810(+) A-I      intronic chr1:78344000(+) A-I      3'UTR chr1:78333110(+) A-I      intronic chr1:78305293(+) A-I      intronic chr1:78332469(+) A-I      intronic chr1:78305259(+) A-I      intronic chr1:78334041(+) A-I      intronic chr1:78301383(+) A-I      intronic chr1:78338511(+) A-I      intronic chr1:78254956(+) A-I      intronic chr1:78256473(+) A-I      intronic chr1:78333233(+) A-I      intronic chr1:78333235(+) A-I      intronic chr1:78255157(+) A-I      intronic chr1:78256719(+) A-I      intronic chr1:78316757(+) A-I      intronic chr1:78306250(+) A-I      intronic chr1:78323938(+) A-I      intronic chr1:78256729(+) A-I      intronic chr1:78285408(+) A-I      intronic chr1:78292361(+) A-I      intronic chr1:78317699(+) A-I      intronic chr1:78255168(+) A-I      intronic chr1:78323982(+) A-I      intronic chr1:78246796(+) A-I      intronic chr1:78256702(+) A-I      intronic chr1:78337917(+) A-I      intronic chr1:78316655(+) A-I      intronic chr1:78256411(+) A-I      intronic chr1:78284999(+) A-I      intronic chr1:78338104(+) A-I      intronic chr1:78289974(+) A-I      intronic chr1:78293038(+) A-I      intronic chr1:78260421(+) A-I      intronic chr1:78337765(+) A-I      intronic chr1:78277934(+) A-I      intronic chr1:78337706(+) A-I      intronic chr1:78305653(+) A-I      intronic chr1:78333248(+) A-I      intronic chr1:78290061(+) A-I      intronic chr1:78317687(+) A-I      intronic chr1:78260420(+) A-I      intronic chr1:78272870(+) A-I      intronic chr1:78334051(+) A-I      intronic chr1:78342775(+) A-I      3'UTR chr1:78331675(+) A-I      intronic chr1:78337022(+) A-I      intronic chr1:78256821(+) A-I      intronic chr1:78324368(+) A-I      intronic chr1:78256372(+) A-I      intronic chr1:78323953(+) A-I      intronic chr1:78289335(+) A-I      intronic chr1:78256662(+) A-I      intronic chr1:78333079(+) A-I      intronic chr1:78287210(+) A-I      intronic chr1:78333222(+) A-I      intronic chr1:78272947(+) A-I      intronic chr1:78256872(+) A-I      intronic chr1:78256909(+) A-I      intronic chr1:78293129(+) A-I      intronic chr1:78289324(+) A-I      intronic chr1:78333275(+) A-I      intronic chr1:78334126(+) A-I      intronic chr1:78333152(+) A-I      intronic chr1:78337836(+) A-I      intronic chr1:78260766(+) A-I      intronic chr1:78284645(+) A-I      intronic chr1:78289353(+) A-I      intronic chr1:78289383(+) A-I      intronic chr1:78317753(+) A-I      intronic chr1:78316738(+) A-I      intronic chr1:78285541(+) A-I      intronic chr1:78337850(+) A-I      intronic chr1:78336932(+) A-I      intronic chr1:78319211(+) A-I      intronic chr1:78272959(+) A-I      intronic chr1:78331623(+) A-I      intronic chr1:78342729(+) A-I      3'UTR chr1:78318469(+) A-I      intronic chr1:78316654(+) A-I      intronic chr1:78260302(+) A-I      intronic chr1:78334005(+) A-I      intronic chr1:78255084(+) A-I      intronic chr1:78253923(+) A-I      intronic chr1:78331839(+) A-I      intronic chr1:78284342(+) A-I      intronic chr1:78343919(+) A-I      3'UTR chr1:78316611(+) A-I      intronic chr1:78333287(+) A-I      intronic chr1:78277958(+) A-I      intronic chr1:78294926(+) A-I      intronic chr1:78257323(+) A-I      intronic chr1:78261432(+) A-I      intronic chr1:78331782(+) A-I      intronic chr1:78256830(+) A-I      intronic chr1:78256737(+) A-I      intronic chr1:78272900(+) A-I      intronic chr1:78292290(+) A-I      intronic chr1:78329777(+) A-I      intronic chr1:78329890(+) A-I      intronic chr1:78309735(+) A-I      intronic chr1:78334084(+) A-I      intronic chr1:78310408(+) A-I      intronic chr1:78323861(+) A-I      intronic chr1:78287180(+) A-I      intronic chr1:78323351(+) A-I      intronic chr1:78256833(+) A-I      intronic chr1:78301513(+) A-I      intronic chr1:78318455(+) A-I      intronic chr1:78272986(+) A-I      intronic chr1:78288026(+) A-I      intronic chr1:78289267(+) A-I      intronic chr1:78256456(+) A-I      intronic chr1:78317779(+) A-I      intronic chr1:78305607(+) A-I      intronic chr1:78331874(+) A-I      intronic chr1:78286740(+) A-I      intronic chr1:78255117(+) A-I      intronic chr1:78293100(+) A-I      intronic chr1:78278033(+) A-I      intronic chr1:78284685(+) A-I      intronic chr1:78305556(+) A-I      intronic chr1:78278796(+) A-I      intronic chr1:78338268(+) A-I      intronic chr1:78330106(+) A-I      intronic chr1:78316629(+) A-I      intronic chr1:78256494(+) A-I      intronic chr1:78337137(+) A-I      intronic chr1:78337040(+) A-I      intronic chr1:78305502(+) A-I      intronic chr1:78334132(+) A-I      intronic chr1:78286768(+) A-I      intronic chr1:78293093(+) A-I      intronic chr1:78333115(+) A-I      intronic chr1:78256915(+) A-I      intronic chr1:78273552(+) A-I      intronic chr1:78331233(+) A-I      intronic chr1:78337067(+) A-I      intronic chr1:78293649(+) A-I      intronic chr1:78337754(+) A-I      intronic chr1:78324445(+) A-I      intronic chr1:78324437(+) A-I      intronic chr1:78336955(+) A-I      intronic chr1:78284510(+) A-I      intronic chr1:78256885(+) A-I      intronic chr1:78256800(+) A-I      intronic

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	MIGA1	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: kshv-miR-K12-7-5p
Interactor2: MIGA1

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//Targetscan
Support Database	VmiReg