Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00491703

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      kshv-miR-K12-8-5p:  MIMAT0015216          BASP1:  NM_001271606     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	kshv-miR-K12-8-5p	BASP1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0015216	10409
Organism	Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CAP-23//CAP23//NAP-22//NAP22

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	BASP1	chr5:17237464(+) A-I      intronic chr5:17270246(+) A-I      intronic chr5:17247219(+) A-I      intronic chr5:17234062(+) A-I      intronic chr5:17234067(+) A-I      intronic chr5:17247226(+) A-I      intronic chr5:17266730(+) A-I      intronic chr5:17266754(+) A-I      intronic chr5:17266771(+) A-I      intronic chr5:17270210(+) A-I      intronic chr5:17270377(+) A-I      intronic chr5:17234185(+) A-I      intronic chr5:17234192(+) A-I      intronic chr5:17234073(+) A-I      intronic chr5:17237472(+) A-I      intronic chr5:17237199(+) A-I      intronic chr5:17233983(+) A-I      intronic chr5:17237301(+) A-I      intronic chr5:17237300(+) A-I      intronic chr5:17237287(+) A-I      intronic chr5:17237859(+) A-I      intronic chr5:17237872(+) A-I      intronic chr5:17237917(+) A-I      intronic chr5:17237967(+) A-I      intronic chr5:17237981(+) A-I      intronic chr5:17240457(+) A-I      intronic chr5:17245230(+) A-I      intronic chr5:17234085(+) A-I      intronic chr5:17234086(+) A-I      intronic chr5:17234087(+) A-I      intronic chr5:17244856(+) A-I      intronic chr5:17234089(+) A-I      intronic chr5:17240458(+) A-I      intronic chr5:17270239(+) A-I      intronic chr5:17234090(+) A-I      intronic chr5:17266674(+) A-I      intronic chr5:17240484(+) A-I      intronic chr5:17240492(+) A-I      intronic chr5:17245157(+) A-I      intronic chr5:17245158(+) A-I      intronic chr5:17237838(+) A-I      intronic chr5:17237342(+) A-I      intronic chr5:17237302(+) A-I      intronic chr5:17234061(+) A-I      intronic chr5:17245250(+) A-I      intronic chr5:17233988(+) A-I      intronic chr5:17245296(+) A-I      intronic chr5:17245313(+) A-I      intronic chr5:17245320(+) A-I      intronic chr5:17247024(+) A-I      intronic chr5:17247110(+) A-I      intronic chr5:17244967(+) A-I      intronic chr5:17272153(+) A-I      intronic chr5:17234165(+) A-I      intronic chr5:17244980(+) A-I      intronic chr5:17245260(+) A-I      intronic chr5:17235639(+) A-I      intronic chr5:17237849(+) A-I      intronic chr5:17240498(+) A-I      intronic chr5:17244985(+) A-I      intronic chr5:17237885(+) A-I      intronic chr5:17245374(+) A-I      intronic chr5:17247136(+) A-I      intronic chr5:17241295(+) A-I      intronic chr5:17271453(+) A-I      intronic chr5:17237332(+) A-I      intronic chr5:17271912(+) A-I      intronic chr5:17244874(+) A-I      intronic chr5:17247112(+) A-I      intronic chr5:17237886(+) A-I      intronic chr5:17234052(+) A-I      intronic chr5:17237963(+) A-I      intronic chr5:17237920(+) A-I      intronic chr5:17235499(+) A-I      intronic chr5:17245366(+) A-I      intronic chr5:17245290(+) A-I      intronic chr5:17247145(+) A-I      intronic chr5:17237982(+) A-I      intronic chr5:17237290(+) A-I      intronic chr5:17244927(+) A-I      intronic chr5:17272095(+) A-I      intronic chr5:17246403(+) A-I      intronic chr5:17237306(+) A-I      intronic chr5:17245264(+) A-I      intronic chr5:17233982(+) A-I      intronic chr5:17270369(+) A-I      intronic chr5:17240560(+) A-I      intronic chr5:17244901(+) A-I      intronic chr5:17247034(+) A-I      intronic chr5:17243550(+) A-I      intronic chr5:17266837(+) A-I      intronic chr5:17247173(+) A-I      intronic chr5:17245291(+) A-I      intronic chr5:17270166(+) A-I      intronic chr5:17237303(+) A-I      intronic chr5:17271372(+) A-I      intronic chr5:17244940(+) A-I      intronic chr5:17266768(+) A-I      intronic chr5:17238000(+) A-I      intronic chr5:17237181(+) A-I      intronic chr5:17241289(+) A-I      intronic chr5:17244983(+) A-I      intronic chr5:17234056(+) A-I      intronic chr5:17235556(+) A-I      intronic chr5:17237794(+) A-I      intronic chr5:17241392(+) A-I      intronic chr5:17241309(+) A-I      intronic chr5:17245046(+) A-I      intronic chr5:17234146(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	BASP1	chr5:17227415(+) G-A intron -    22484847 chr5:17233982(+) A-G intron -    22484847 chr5:17234052(+) A-G intron -    22484847 chr5:17234056(+) A-G intron -    22484847 chr5:17234093(+) A-G intron -    22484847 chr5:17234165(+) A-G intron -    22484847 chr5:17234253(+) C-A intron -    22484847 chr5:17235388(+) G-T intron -    22484847 chr5:17235499(+) A-G intron -    22484847 chr5:17235556(+) A-G intron -    22484847 chr5:17237238(+) A-G intron -    22484847 chr5:17237267(+) A-G intron -    22484847 chr5:17237290(+) A-G intron -    22484847 chr5:17237303(+) A-G intron -    22484847 chr5:17237332(+) A-G intron -    22484847 chr5:17237849(+) A-G intron -    22484847 chr5:17237885(+) A-G intron -    22484847 chr5:17237886(+) A-G intron -    22484847 chr5:17237893(+) A-G intron -    22484847 chr5:17237920(+) A-G intron -    22484847 chr5:17237963(+) A-G intron -    22484847 chr5:17237982(+) A-G intron -    22484847 chr5:17238000(+) A-G intron -    22484847 chr5:17240485(+) A-G intron -    22484847 chr5:17240498(+) A-G intron -    22484847 chr5:17240560(+) A-G intron -    22484847 chr5:17241283(+) A-G intron -    22484847 chr5:17241295(+) A-G intron -    22484847 chr5:17241308(+) A-G intron -    22484847 chr5:17241309(+) A-G intron -    22484847 chr5:17241397(+) T-C intron -    22484847 chr5:17243276(+) A-T intron -    22484847 chr5:17244874(+) A-G intron -    22484847 chr5:17244901(+) A-G intron -    22484847 chr5:17244927(+) A-G intron -    22484847 chr5:17244930(+) A-G intron -    22484847 chr5:17244940(+) A-G intron -    22484847 chr5:17244967(+) A-G intron -    22484847 chr5:17244985(+) A-G intron -    22484847 chr5:17245264(+) A-G intron -    22484847 chr5:17245290(+) A-G intron -    22484847 chr5:17245291(+) A-G intron -    22484847 chr5:17245300(+) A-G intron -    22484847 chr5:17245317(+) A-G intron -    22484847 chr5:17245366(+) A-G intron -    22484847 chr5:17245374(+) A-G intron -    22484847 chr5:17247136(+) A-G intron -    22484847 chr5:17266815(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	BASP1	chr5:17212246-17212247(+) m6A 5'UTR       24981863 chr5:17218571-17218572(+) Cm intron       - chr5:17228816-17228817(+) Cm intron       - chr5:17275349-17275350(+) m1A CDS       26863196 chr5:17275392-17275393(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//26404942//27371828//27773536//22575960//22608085 chr5:17275430-17275431(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//26404942//27371828//27773536//22575960//22608085 chr5:17275589-17275590(+) Am CDS       - chr5:17275765-17275766(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773536//22575960//22608085 chr5:17275775-17275776(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773536//22575960//22608085 chr5:17275808-17275809(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773536//22575960//22608085 chr5:17275836-17275837(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773536//22575960//22608085 chr5:17275843-17275844(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773536//22575960//22608085 chr5:17275880-17275881(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr5:17275988-17275989(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr5:17276014-17276015(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr5:17276030-17276031(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr5:17276045-17276046(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr5:17276346-17276347(+) m6A 3'UTR       26404942 chr5:17276457-17276458(+) Cm 3'UTR       - chr5:17276558-17276559(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22575960 chr5:17276639-17276640(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22575960 chr5:17276785-17276786(+) Y 3'UTR       26075521 chr5:17276846-17276847(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:17276857-17276858(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:17276929-17276930(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	BASP1	Exosome Blood     - Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: kshv-miR-K12-8-5p
Interactor2: BASP1

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg