Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00482513

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      kshv-miR-K12-11-5p:           CLIC4:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol kshv-miR-K12-11-5p CLIC4
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0015213 25932
Organism Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - CLIC4L//H1//huH1//MTCLIC//p64H1

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR CLIC4
chr1:25118079(+) A-I      intronic
chr1:25147658(+) A-I      intronic
chr1:25147608(+) A-I      intronic
chr1:25131479(+) A-I      intronic
chr1:25131475(+) A-I      intronic
chr1:25131433(+) A-I      intronic
chr1:25131432(+) A-I      intronic
chr1:25131430(+) A-I      intronic
chr1:25131415(+) A-I      intronic
chr1:25131404(+) A-I      intronic
chr1:25131390(+) A-I      intronic
chr1:25118075(+) A-I      intronic
chr1:25167778(+) A-I      3'UTR
chr1:25076410(+) A-I      intronic
chr1:25118072(+) A-I      intronic
chr1:25095253(+) A-I      intronic
chr1:25095237(+) A-I      intronic
chr1:25095216(+) A-I      intronic
chr1:25091030(+) A-I      intronic
chr1:25088836(+) A-I      intronic
chr1:25086814(+) A-I      intronic
chr1:25086785(+) A-I      intronic
chr1:25086778(+) A-I      intronic
chr1:25076407(+) A-I      intronic
chr1:25074366(+) A-I      intronic
chr1:25086833(+) A-I      intronic
chr1:25161960(+) A-I      intronic
chr1:25118073(+) A-I      intronic
chr1:25131381(+) A-I      intronic
chr1:25131363(+) A-I      intronic
chr1:25118080(+) A-I      intronic
chr1:25161943(+) A-I      intronic
chr1:25161933(+) A-I      intronic
chr1:25151471(+) A-I      intronic
chr1:25151441(+) A-I      intronic
chr1:25151440(+) A-I      intronic
chr1:25147664(+) A-I      intronic
chr1:25147663(+) A-I      intronic
chr1:25151412(+) A-I      intronic
chr1:25083490(+) A-I      intronic
chr1:25083504(+) A-I      intronic
chr1:25083513(+) A-I      intronic
chr1:25083516(+) A-I      intronic
chr1:25083571(+) A-I      intronic
chr1:25083648(+) A-I      intronic
chr1:25083687(+) A-I      intronic
chr1:25083782(+) A-I      intronic
chr1:25083802(+) A-I      intronic
chr1:25083953(+) A-I      intronic
chr1:25083967(+) A-I      intronic
chr1:25083976(+) A-I      intronic
chr1:25084016(+) A-I      intronic
chr1:25084021(+) A-I      intronic
chr1:25084488(+) A-I      intronic
chr1:25084502(+) A-I      intronic
chr1:25100567(+) A-I      intronic
chr1:25100136(+) A-I      intronic
chr1:25148160(+) A-I      intronic
chr1:25099154(+) A-I      intronic
chr1:25083341(+) A-I      intronic
chr1:25099142(+) A-I      intronic
chr1:25099094(+) A-I      intronic
chr1:25083390(+) A-I      intronic
chr1:25100650(+) A-I      intronic
chr1:25100676(+) A-I      intronic
chr1:25100701(+) A-I      intronic
chr1:25101021(+) A-I      intronic
chr1:25101098(+) A-I      intronic
chr1:25101167(+) A-I      intronic
chr1:25101285(+) A-I      intronic
chr1:25101356(+) A-I      intronic
chr1:25101397(+) A-I      intronic
chr1:25101447(+) A-I      intronic
chr1:25101451(+) A-I      intronic
chr1:25101494(+) A-I      intronic
chr1:25103203(+) A-I      intronic
chr1:25103352(+) A-I      intronic
chr1:25103358(+) A-I      intronic
chr1:25103955(+) A-I      intronic
chr1:25147646(+) A-I      intronic
chr1:25105692(+) A-I      intronic
chr1:25105838(+) A-I      intronic
chr1:25105840(+) A-I      intronic
chr1:25105858(+) A-I      intronic
chr1:25107726(+) A-I      intronic
chr1:25109242(+) A-I      intronic
chr1:25109929(+) A-I      intronic
chr1:25110073(+) A-I      intronic
chr1:25110083(+) A-I      intronic
chr1:25112081(+) A-I      intronic
chr1:25112133(+) A-I      intronic
chr1:25112147(+) A-I      intronic
chr1:25112156(+) A-I      intronic
chr1:25112159(+) A-I      intronic
chr1:25112166(+) A-I      intronic
chr1:25112167(+) A-I      intronic
chr1:25112193(+) A-I      intronic
chr1:25112196(+) A-I      intronic
chr1:25112200(+) A-I      intronic
chr1:25112204(+) A-I      intronic
chr1:25112212(+) A-I      intronic
chr1:25112220(+) A-I      intronic
chr1:25112223(+) A-I      intronic
chr1:25112249(+) A-I      intronic
chr1:25112254(+) A-I      intronic
chr1:25112255(+) A-I      intronic
chr1:25112264(+) A-I      intronic
chr1:25112268(+) A-I      intronic
chr1:25112298(+) A-I      intronic
chr1:25112311(+) A-I      intronic
chr1:25112316(+) A-I      intronic
chr1:25112334(+) A-I      intronic
chr1:25112372(+) A-I      intronic
chr1:25113238(+) A-I      intronic
chr1:25113308(+) A-I      intronic
chr1:25113316(+) A-I      intronic
chr1:25114156(+) A-I      intronic
chr1:25114310(+) A-I      intronic
chr1:25114446(+) A-I      intronic
chr1:25114447(+) A-I      intronic
chr1:25115772(+) A-I      intronic
chr1:25115807(+) A-I      intronic
chr1:25115808(+) A-I      intronic
chr1:25115862(+) A-I      intronic
chr1:25115889(+) A-I      intronic
chr1:25115934(+) A-I      intronic
chr1:25116632(+) A-I      intronic
chr1:25116662(+) A-I      intronic
chr1:25116699(+) A-I      intronic
chr1:25116783(+) A-I      intronic
chr1:25118918(+) A-I      intronic
chr1:25123900(+) A-I      intronic
chr1:25124031(+) A-I      intronic
chr1:25124052(+) A-I      intronic
chr1:25131429(+) A-I      intronic
chr1:25131444(+) A-I      intronic
chr1:25131483(+) A-I      intronic
chr1:25131492(+) A-I      intronic
chr1:25134542(+) A-I      intronic
chr1:25134617(+) A-I      intronic
chr1:25134698(+) A-I      intronic
chr1:25136011(+) A-I      intronic
chr1:25136012(+) A-I      intronic
chr1:25137099(+) A-I      intronic
chr1:25138076(+) A-I      intronic
chr1:25141873(+) A-I      intronic
chr1:25141878(+) A-I      intronic
chr1:25141889(+) A-I      intronic
chr1:25146294(+) A-I      intronic
chr1:25146295(+) A-I      intronic
chr1:25146434(+) A-I      intronic
chr1:25146436(+) A-I      intronic
chr1:25146444(+) A-I      intronic
chr1:25146484(+) A-I      intronic
chr1:25146506(+) A-I      intronic
chr1:25147420(+) A-I      intronic
chr1:25147425(+) A-I      intronic
chr1:25147438(+) A-I      intronic
chr1:25147473(+) A-I      intronic
chr1:25147474(+) A-I      intronic
chr1:25147489(+) A-I      intronic
chr1:25147499(+) A-I      intronic
chr1:25147621(+) A-I      intronic
chr1:25147631(+) A-I      intronic
chr1:25095525(+) A-I      intronic
chr1:25095521(+) A-I      intronic
chr1:25095344(+) A-I      intronic
chr1:25095313(+) A-I      intronic
chr1:25095281(+) A-I      intronic
chr1:25095277(+) A-I      intronic
chr1:25095261(+) A-I      intronic
chr1:25095228(+) A-I      intronic
chr1:25095209(+) A-I      intronic
chr1:25094606(+) A-I      intronic
chr1:25094547(+) A-I      intronic
chr1:25094541(+) A-I      intronic
chr1:25094449(+) A-I      intronic
chr1:25094408(+) A-I      intronic
chr1:25094390(+) A-I      intronic
chr1:25091086(+) A-I      intronic
chr1:25091073(+) A-I      intronic
chr1:25090998(+) A-I      intronic
chr1:25090980(+) A-I      intronic
chr1:25090776(+) A-I      intronic
chr1:25090774(+) A-I      intronic
chr1:25090771(+) A-I      intronic
chr1:25090757(+) A-I      intronic
chr1:25088840(+) A-I      intronic
chr1:25088824(+) A-I      intronic
chr1:25088723(+) A-I      intronic
chr1:25088713(+) A-I      intronic
chr1:25086863(+) A-I      intronic
chr1:25086807(+) A-I      intronic
chr1:25086798(+) A-I      intronic
chr1:25086769(+) A-I      intronic
chr1:25086763(+) A-I      intronic
chr1:25086707(+) A-I      intronic
chr1:25086706(+) A-I      intronic
chr1:25086695(+) A-I      intronic
chr1:25073436(+) A-I      intronic
chr1:25074316(+) A-I      intronic
chr1:25074327(+) A-I      intronic
chr1:25074330(+) A-I      intronic
chr1:25074365(+) A-I      intronic
chr1:25074368(+) A-I      intronic
chr1:25074471(+) A-I      intronic
chr1:25075101(+) A-I      intronic
chr1:25075211(+) A-I      intronic
chr1:25075212(+) A-I      intronic
chr1:25075435(+) A-I      intronic
chr1:25086350(+) A-I      intronic
chr1:25086244(+) A-I      intronic
chr1:25086190(+) A-I      intronic
chr1:25086162(+) A-I      intronic
chr1:25084904(+) A-I      intronic
chr1:25075540(+) A-I      intronic
chr1:25075549(+) A-I      intronic
chr1:25075554(+) A-I      intronic
chr1:25075646(+) A-I      intronic
chr1:25075659(+) A-I      intronic
chr1:25075725(+) A-I      intronic
chr1:25076440(+) A-I      intronic
chr1:25077876(+) A-I      intronic
chr1:25077932(+) A-I      intronic
chr1:25077941(+) A-I      intronic
chr1:25078190(+) A-I      intronic
chr1:25078251(+) A-I      intronic
chr1:25078284(+) A-I      intronic
chr1:25078296(+) A-I      intronic
chr1:25079277(+) A-I      intronic
chr1:25079313(+) A-I      intronic
chr1:25079397(+) A-I      intronic
chr1:25081316(+) A-I      intronic
chr1:25081353(+) A-I      intronic
chr1:25081386(+) A-I      intronic
chr1:25081448(+) A-I      intronic
chr1:25081452(+) A-I      intronic
chr1:25081513(+) A-I      intronic
chr1:25081731(+) A-I      intronic
chr1:25081819(+) A-I      intronic
chr1:25082595(+) A-I      intronic
chr1:25082764(+) A-I      intronic
chr1:25083243(+) A-I      intronic
chr1:25165871(+) A-I      intronic
chr1:25163319(+) A-I      intronic
chr1:25163314(+) A-I      intronic
chr1:25163249(+) A-I      intronic
chr1:25163246(+) A-I      intronic
chr1:25158364(+) A-I      intronic
chr1:25158359(+) A-I      intronic
chr1:25157828(+) A-I      intronic
chr1:25157823(+) A-I      intronic
chr1:25157815(+) A-I      intronic
chr1:25157793(+) A-I      intronic
chr1:25151417(+) A-I      intronic
chr1:25151401(+) A-I      intronic
chr1:25151394(+) A-I      intronic
chr1:25151350(+) A-I      intronic
chr1:25151033(+) A-I      intronic
chr1:25151021(+) A-I      intronic
chr1:25151019(+) A-I      intronic
chr1:25151006(+) A-I      intronic
chr1:25150933(+) A-I      intronic
chr1:25150904(+) A-I      intronic
chr1:25150839(+) A-I      intronic
chr1:25150838(+) A-I      intronic
chr1:25149062(+) A-I      intronic
chr1:25149025(+) A-I      intronic
chr1:25149020(+) A-I      intronic
chr1:25148943(+) A-I      intronic
chr1:25148926(+) A-I      intronic
chr1:25148184(+) A-I      intronic
chr1:25107423(+) A-I      intronic
chr1:25107431(+) A-I      intronic
chr1:25107507(+) A-I      intronic
chr1:25107569(+) A-I      intronic
chr1:25146311(+) A-I      intronic
chr1:25107395(+) A-I      intronic
chr1:25147545(+) A-I      intronic
chr1:25114166(+) A-I      intronic
chr1:25107567(+) A-I      intronic
chr1:25107449(+) A-I      intronic
chr1:25107381(+) A-I      intronic
chr1:25089920(+) A-I      intronic
chr1:25151371(+) A-I      intronic
chr1:25107426(+) A-I      intronic
chr1:25095505(+) A-I      intronic
chr1:25094461(+) A-I      intronic
chr1:25107384(+) A-I      intronic
chr1:25107458(+) A-I      intronic
chr1:25076239(+) A-I      intronic
chr1:25107479(+) A-I      intronic
chr1:25139718(+) A-I      intronic
chr1:25107499(+) A-I      intronic
chr1:25107457(+) A-I      intronic
chr1:25107393(+) A-I      intronic
chr1:25112271(+) A-I      intronic
chr1:25107907(+) A-I      intronic
chr1:25124003(+) A-I      intronic
chr1:25107535(+) A-I      intronic
chr1:25161892(+) A-I      intronic
chr1:25107488(+) A-I      intronic
chr1:25107523(+) A-I      intronic
chr1:25107489(+) A-I      intronic
chr1:25101352(+) A-I      intronic
chr1:25118461(+) A-I      intronic
chr1:25077929(+) A-I      intronic
chr1:25107568(+) A-I      intronic
chr1:25123919(+) A-I      intronic
chr1:25076263(+) A-I      intronic
chr1:25075585(+) A-I      intronic
chr1:25083312(+) A-I      intronic
chr1:25074465(+) A-I      intronic
chr1:25077840(+) A-I      intronic
chr1:25107369(+) A-I      intronic
chr1:25123506(+) A-I      intronic
chr1:25118111(+) A-I      intronic
chr1:25082697(+) A-I      intronic
chr1:25118733(+) A-I      intronic
chr1:25081810(+) A-I      intronic
chr1:25148285(+) A-I      intronic
chr1:25101321(+) A-I      intronic
chr1:25089884(+) A-I      intronic
chr1:25146028(+) A-I      intronic
chr1:25099143(+) A-I      intronic
chr1:25163147(+) A-I      intronic
chr1:25118794(+) A-I      intronic
chr1:25094471(+) A-I      intronic
chr1:25111345(+) A-I      intronic
chr1:25139715(+) A-I      intronic
chr1:25094497(+) A-I      intronic
chr1:25161931(+) A-I      intronic
chr1:25100227(+) A-I      intronic
chr1:25123966(+) A-I      intronic
chr1:25088792(+) A-I      intronic
chr1:25086680(+) A-I      intronic
chr1:25083351(+) A-I      intronic
chr1:25150054(+) A-I      intronic
chr1:25101245(+) A-I      intronic
chr1:25095294(+) A-I      intronic
chr1:25074301(+) A-I      intronic
chr1:25088731(+) A-I      intronic
chr1:25075095(+) A-I      intronic
chr1:25112089(+) A-I      intronic
chr1:25088651(+) A-I      intronic
chr1:25081545(+) A-I      intronic
chr1:25121932(+) A-I      intronic
chr1:25083783(+) A-I      intronic
chr1:25075187(+) A-I      intronic
chr1:25095271(+) A-I      intronic
chr1:25086777(+) A-I      intronic
chr1:25091034(+) A-I      intronic
chr1:25081639(+) A-I      intronic
chr1:25089875(+) A-I      intronic
chr1:25083992(+) A-I      intronic
chr1:25076404(+) A-I      intronic
chr1:25082060(+) A-I      intronic
chr1:25146370(+) A-I      intronic
chr1:25077795(+) A-I      intronic
chr1:25118112(+) A-I      intronic
chr1:25073253(+) A-I      intronic
chr1:25147546(+) A-I      intronic
chr1:25115961(+) A-I      intronic
chr1:25084002(+) A-I      intronic
chr1:25158417(+) A-I      intronic
chr1:25088759(+) A-I      intronic
chr1:25099070(+) A-I      intronic
chr1:25086239(+) A-I      intronic
chr1:25114716(+) A-I      intronic
chr1:25078199(+) A-I      intronic
chr1:25101029(+) A-I      intronic
chr1:25088854(+) A-I      intronic
chr1:25075210(+) A-I      intronic
chr1:25086297(+) A-I      intronic
chr1:25091006(+) A-I      intronic
chr1:25100565(+) A-I      intronic
chr1:25084359(+) A-I      intronic
chr1:25095577(+) A-I      intronic
chr1:25101415(+) A-I      intronic
chr1:25079379(+) A-I      intronic
chr1:25074461(+) A-I      intronic
chr1:25081787(+) A-I      intronic
chr1:25083784(+) A-I      intronic
chr1:25095148(+) A-I      intronic
chr1:25086373(+) A-I      intronic
chr1:25076437(+) A-I      intronic
chr1:25073466(+) A-I      intronic
chr1:25147442(+) A-I      intronic
chr1:25151314(+) A-I      intronic
chr1:25109937(+) A-I      intronic
chr1:25090652(+) A-I      intronic
chr1:25086359(+) A-I      intronic
chr1:25109304(+) A-I      intronic
chr1:25150858(+) A-I      intronic
chr1:25094412(+) A-I      intronic
chr1:25109333(+) A-I      intronic
chr1:25075170(+) A-I      intronic
chr1:25084470(+) A-I      intronic
chr1:25077862(+) A-I      intronic
chr1:25081526(+) A-I      intronic
chr1:25147419(+) A-I      intronic
chr1:25077023(+) A-I      intronic
chr1:25090904(+) A-I      intronic
chr1:25088790(+) A-I      intronic
chr1:25086602(+) A-I      intronic
chr1:25100364(+) A-I      intronic
chr1:25081301(+) A-I      intronic
chr1:25081597(+) A-I      intronic
chr1:25150689(+) A-I      intronic
chr1:25076207(+) A-I      intronic
chr1:25085084(+) A-I      intronic
chr1:25146975(+) A-I      intronic
chr1:25090969(+) A-I      intronic
chr1:25101121(+) A-I      intronic
chr1:25134498(+) A-I      intronic
chr1:25073356(+) A-I      intronic
chr1:25099046(+) A-I      intronic
chr1:25134620(+) A-I      intronic
chr1:25073336(+) A-I      intronic
chr1:25109349(+) A-I      intronic
chr1:25077830(+) A-I      intronic
chr1:25124011(+) A-I      intronic
chr1:25096477(+) A-I      intronic
chr1:25073772(+) A-I      intronic
chr1:25084049(+) A-I      intronic
chr1:25117490(+) A-I      intronic
chr1:25118846(+) A-I      intronic
chr1:25075547(+) A-I      intronic
chr1:25094473(+) A-I      intronic
chr1:25076456(+) A-I      intronic
chr1:25088762(+) A-I      intronic
chr1:25107765(+) A-I      intronic
chr1:25112252(+) A-I      intronic
chr1:25112111(+) A-I      intronic
chr1:25095293(+) A-I      intronic
chr1:25147555(+) A-I      intronic
chr1:25161934(+) A-I      intronic
chr1:25091070(+) A-I      intronic
chr1:25095222(+) A-I      intronic
chr1:25131469(+) A-I      intronic
chr1:25088727(+) A-I      intronic
chr1:25079278(+) A-I      intronic
chr1:25101102(+) A-I      intronic
chr1:25115870(+) A-I      intronic
chr1:25092602(+) A-I      intronic
chr1:25100165(+) A-I      intronic
chr1:25114297(+) A-I      intronic
chr1:25090038(+) A-I      intronic
chr1:25095333(+) A-I      intronic
chr1:25084891(+) A-I      intronic
chr1:25112112(+) A-I      intronic
chr1:25073335(+) A-I      intronic
chr1:25150876(+) A-I      intronic
chr1:25151226(+) A-I      intronic
chr1:25086601(+) A-I      intronic
chr1:25092615(+) A-I      intronic
chr1:25151330(+) A-I      intronic
chr1:25086241(+) A-I      intronic
chr1:25073867(+) A-I      intronic
chr1:25073244(+) A-I      intronic
chr1:25084899(+) A-I      intronic
chr1:25114267(+) A-I      intronic
chr1:25094409(+) A-I      intronic
chr1:25088847(+) A-I      intronic
chr1:25147617(+) A-I      intronic
chr1:25166064(+) A-I      intronic
chr1:25158295(+) A-I      intronic
chr1:25086324(+) A-I      intronic
chr1:25116737(+) A-I      intronic
chr1:25074361(+) A-I      intronic
chr1:25100741(+) A-I      intronic
chr1:25081642(+) A-I      intronic
chr1:25150973(+) A-I      intronic
chr1:25140383(+) A-I      intronic
chr1:25095337(+) A-I      intronic
chr1:25093197(+) A-I      intronic
chr1:25100647(+) A-I      intronic
chr1:25161840(+) A-I      intronic
chr1:25093211(+) A-I      intronic
chr1:25082002(+) A-I      intronic
chr1:25075543(+) A-I      intronic
chr1:25086207(+) A-I      intronic
chr1:25163109(+) A-I      intronic
chr1:25082042(+) A-I      intronic
chr1:25075552(+) A-I      intronic
chr1:25088640(+) A-I      intronic
chr1:25112275(+) A-I      intronic
chr1:25088653(+) A-I      intronic
chr1:25100325(+) A-I      intronic
chr1:25103888(+) A-I      intronic
chr1:25082028(+) A-I      intronic
chr1:25079394(+) A-I      intronic
chr1:25123934(+) A-I      intronic
chr1:25088830(+) A-I      intronic
chr1:25095207(+) A-I      intronic
chr1:25095149(+) A-I      intronic
chr1:25164290(+) A-I      intronic
chr1:25082413(+) A-I      intronic
chr1:25100286(+) A-I      intronic
chr1:25161776(+) A-I      intronic
chr1:25090647(+) A-I      intronic
chr1:25073763(+) A-I      intronic
chr1:25091022(+) A-I      intronic
chr1:25122191(+) A-I      intronic
chr1:25090691(+) A-I      intronic
chr1:25151340(+) A-I      intronic
chr1:25123823(+) A-I      intronic
chr1:25078208(+) A-I      intronic
chr1:25137117(+) A-I      intronic
chr1:25081659(+) A-I      intronic
chr1:25164243(+) A-I      intronic
chr1:25075529(+) A-I      intronic
chr1:25086365(+) A-I      intronic
chr1:25101361(+) A-I      intronic
chr1:25095317(+) A-I      intronic
chr1:25088864(+) A-I      intronic
chr1:25073329(+) A-I      intronic
chr1:25095246(+) A-I      intronic
chr1:25118847(+) A-I      intronic
chr1:25077116(+) A-I      intronic
chr1:25081307(+) A-I      intronic
chr1:25118147(+) A-I      intronic
chr1:25149997(+) A-I      intronic
chr1:25076331(+) A-I      intronic
chr1:25151454(+) A-I      intronic
chr1:25081308(+) A-I      intronic
chr1:25150199(+) A-I      intronic
chr1:25111268(+) A-I      intronic
chr1:25090692(+) A-I      intronic
chr1:25095539(+) A-I      intronic
chr1:25095242(+) A-I      intronic
chr1:25101304(+) A-I      intronic
chr1:25099077(+) A-I      intronic
chr1:25083613(+) A-I      intronic
chr1:25075173(+) A-I      intronic
chr1:25100221(+) A-I      intronic
chr1:25165865(+) A-I      intronic
chr1:25163086(+) A-I      intronic
chr1:25079265(+) A-I      intronic
chr1:25118812(+) A-I      intronic
chr1:25095217(+) A-I      intronic
chr1:25101442(+) A-I      intronic
chr1:25088807(+) A-I      intronic
chr1:25086670(+) A-I      intronic
chr1:25083232(+) A-I      intronic
chr1:25084433(+) A-I      intronic
chr1:25149023(+) A-I      intronic
chr1:25083702(+) A-I      intronic
chr1:25082630(+) A-I      intronic
chr1:25083975(+) A-I      intronic
chr1:25081515(+) A-I      intronic
chr1:25101171(+) A-I      intronic
chr1:25073400(+) A-I      intronic
chr1:25076194(+) A-I      intronic
chr1:25077046(+) A-I      intronic
chr1:25088647(+) A-I      intronic
chr1:25076996(+) A-I      intronic
chr1:25100564(+) A-I      intronic
chr1:25137449(+) A-I      intronic
chr1:25074428(+) A-I      intronic
chr1:25084431(+) A-I      intronic
chr1:25163104(+) A-I      intronic
chr1:25092897(+) A-I      intronic
chr1:25075544(+) A-I      intronic
chr1:25114298(+) A-I      intronic
chr1:25074449(+) A-I      intronic
chr1:25090987(+) A-I      intronic
chr1:25111374(+) A-I      intronic
chr1:25084866(+) A-I      intronic
chr1:25082015(+) A-I      intronic
chr1:25086364(+) A-I      intronic
chr1:25100563(+) A-I      intronic
chr1:25150862(+) A-I      intronic
chr1:25141774(+) A-I      intronic
chr1:25092627(+) A-I      intronic
chr1:25150859(+) A-I      intronic
chr1:25075175(+) A-I      intronic
chr1:25122723(+) A-I      intronic
chr1:25099025(+) A-I      intronic
chr1:25081491(+) A-I      intronic
chr1:25137069(+) A-I      intronic
chr1:25138251(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED CLIC4
chr1:25095222(+) A-I intron -    15545495
chr1:25095271(+) A-I intron -    15545495
chr1:25095293(+) A-I intron -    15545495
chr1:25095294(+) A-I intron -    15545495
chr1:25095317(+) A-I intron -    15545495
chr1:25095333(+) A-I intron -    15545495
chr1:25095337(+) A-I intron -    15545495
chr1:25095505(+) A-I intron -    15545495
chr1:25107369(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107381(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107384(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107393(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107395(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107423(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107426(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107431(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107449(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107457(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107458(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107479(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107488(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107489(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107499(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107507(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107523(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107535(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107567(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107568(+) A-I intron -    22028664
chr1:25107569(+) A-I intron -    22028664
chr1:25073253(+) A-G intron -    22484847
chr1:25073356(+) A-G intron -    22484847
chr1:25073763(+) A-G intron -    22484847
chr1:25073867(+) A-G intron -    22484847
chr1:25074461(+) A-G intron -    22484847
chr1:25075095(+) A-G intron -    22484847
chr1:25075170(+) A-G intron -    22484847
chr1:25075173(+) A-G intron -    22484847
chr1:25075175(+) A-G intron -    22484847
chr1:25075210(+) A-G intron -    22484847
chr1:25075543(+) A-G intron -    22484847
chr1:25075544(+) A-G intron -    22484847
chr1:25076207(+) A-G intron -    22484847
chr1:25076331(+) A-G intron -    22484847
chr1:25077046(+) A-G intron -    22484847
chr1:25077795(+) A-G intron -    22484847
chr1:25077840(+) A-G intron -    22484847
chr1:25077862(+) A-G intron -    22484847
chr1:25078199(+) A-G intron -    22484847
chr1:25078208(+) A-G intron -    22484847
chr1:25079265(+) A-G intron -    22484847
chr1:25079379(+) A-G intron -    22484847
chr1:25079394(+) A-G intron -    22484847
chr1:25081307(+) A-G intron -    22484847
chr1:25081526(+) A-G intron -    22484847
chr1:25081810(+) A-G intron -    22484847
chr1:25081885(+) A-G intron -    22484847
chr1:25082413(+) A-G intron -    22484847
chr1:25083312(+) A-G intron -    22484847
chr1:25083351(+) A-G intron -    22484847
chr1:25083784(+) A-G intron -    22484847
chr1:25084815(+) C-T intron -    22484847
chr1:25084899(+) A-G intron -    22484847
chr1:25085084(+) A-G intron -    22484847
chr1:25088854(+) A-G intron -    22484847
chr1:25090987(+) A-G intron -    22484847
chr1:25091022(+) A-G intron -    22484847
chr1:25091070(+) A-G intron -    22484847
chr1:25094412(+) A-G intron -    22484847
chr1:25095148(+) A-G intron -    22484847
chr1:25095149(+) A-G intron -    22484847
chr1:25095271(+) A-G intron -    22484847
chr1:25099025(+) A-G intron -    22484847
chr1:25099046(+) A-G intron -    22484847
chr1:25099070(+) A-G intron -    22484847
chr1:25099077(+) A-G intron -    22484847
chr1:25100165(+) A-G intron -    22484847
chr1:25100563(+) A-G intron -    22484847
chr1:25100565(+) A-G intron -    22484847
chr1:25100647(+) A-G intron -    22484847
chr1:25100686(+) T-C intron -    22484847
chr1:25101304(+) A-G intron -    22484847
chr1:25101321(+) A-G intron -    22484847
chr1:25103888(+) A-G intron -    22484847
chr1:25111268(+) A-G intron -    22484847
chr1:25112093(+) C-T intron -    22484847
chr1:25112174(+) C-T intron -    22484847
chr1:25114350(+) T-A intron -    22484847
chr1:25115870(+) A-G intron -    22484847
chr1:25118794(+) A-G intron -    22484847
chr1:25124003(+) A-G intron -    22484847
chr1:25137069(+) A-G intron -    22484847
chr1:25141774(+) A-G intron -    22484847
chr1:25148285(+) A-G intron -    22484847
chr1:25149997(+) A-G intron -    22484847
chr1:25150858(+) A-G intron -    22484847
chr1:25150859(+) A-G intron -    22484847
chr1:25150862(+) A-G intron -    22484847
chr1:25150973(+) A-G intron -    22484847
chr1:25151371(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase CLIC4
chr1:25071935-25071936(+) m6A 5'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27371828//27773536//22608085
chr1:25071961-25071962(+) m6A 5'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27371828//27773536//22608085
chr1:25072084-25072085(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773536//22575960//22608085
chr1:25124260-25124261(+) m6A CDS//exon       -
chr1:25124347-25124348(+) m6A exon//intron       -
chr1:25124380-25124381(+) m6A exon//intron       -
chr1:25166516-25166517(+) m6A CDS       27773535
chr1:25167415-25167416(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535
chr1:25167671-25167672(+) m6A 3'UTR       -
chr1:25167685-25167686(+) m6A 3'UTR       -
chr1:25167763-25167764(+) m6A 3'UTR       -
chr1:25167826-25167827(+) m6A 3'UTR       -
chr1:25169223-25169224(+) Y 3'UTR//intron       25219674
chr1:25169388-25169389(+) m6A 3'UTR//intron       24981863
chr1:25169460-25169461(+) m6A 3'UTR//intron       24981863
chr1:25169499-25169500(+) m6A 3'UTR//intron       24981863
chr1:25169540-25169541(+) m6A 3'UTR//intron       24981863
chr1:25170518-25170519(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:25170608-25170609(+) m6A 3'UTR//intron       27773535

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate CLIC4
Chromatin K562 cells     -
Exosome Blood     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: kshv-miR-K12-11-5p
Interactor2: CLIC4

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//PITA//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...