Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00472169

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      kshv-miR-K12-12-5p:  MIMAT0003712          MAP3K3:  NM_001363768     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	kshv-miR-K12-12-5p	MAP3K3
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003712	4215
Organism	Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	MAPKKK3//MEKK3

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	MAP3K3	chr17:61749493(+) A-I      intronic chr17:61715516(+) A-I      intronic chr17:61715469(+) A-I      intronic chr17:61747793(+) A-I      intronic chr17:61715478(+) A-I      intronic chr17:61710381(+) A-I      intronic chr17:61715479(+) A-I      intronic chr17:61749482(+) A-I      intronic chr17:61715500(+) A-I      intronic chr17:61761288(+) A-I      intronic chr17:61740803(+) A-I      intronic chr17:61720284(+) A-I      intronic chr17:61720244(+) A-I      intronic chr17:61761283(+) A-I      intronic chr17:61725983(+) A-I      intronic chr17:61732875(+) A-I      intronic chr17:61761267(+) A-I      intronic chr17:61749535(+) A-I      intronic chr17:61749532(+) A-I      intronic chr17:61749512(+) A-I      intronic chr17:61749496(+) A-I      intronic chr17:61715503(+) A-I      intronic chr17:61720247(+) A-I      intronic chr17:61715515(+) A-I      intronic chr17:61719758(+) A-I      intronic chr17:61719770(+) A-I      intronic chr17:61749487(+) A-I      intronic chr17:61749484(+) A-I      intronic chr17:61740097(+) A-I      intronic chr17:61710412(+) A-I      intronic chr17:61719786(+) A-I      intronic chr17:61715662(+) A-I      intronic chr17:61720257(+) A-I      intronic chr17:61720270(+) A-I      intronic chr17:61747747(+) A-I      intronic chr17:61747733(+) A-I      intronic chr17:61715664(+) A-I      intronic chr17:61725961(+) A-I      intronic chr17:61715694(+) A-I      intronic chr17:61715672(+) A-I      intronic chr17:61715668(+) A-I      intronic chr17:61740751(+) A-I      intronic chr17:61725922(+) A-I      intronic chr17:61725965(+) A-I      intronic chr17:61725966(+) A-I      intronic chr17:61725968(+) A-I      intronic chr17:61740742(+) A-I      intronic chr17:61749492(+) A-I      intronic chr17:61740741(+) A-I      intronic chr17:61732925(+) A-I      intronic chr17:61740774(+) A-I      intronic chr17:61746981(+) A-I      intronic chr17:61747212(+) A-I      intronic chr17:61747309(+) A-I      intronic chr17:61715456(+) A-I      intronic chr17:61756946(+) A-I      intronic chr17:61756487(+) A-I      intronic chr17:61756483(+) A-I      intronic chr17:61756368(+) A-I      intronic chr17:61756225(+) A-I      intronic chr17:61756203(+) A-I      intronic chr17:61751805(+) A-I      intronic chr17:61751361(+) A-I      intronic chr17:61751199(+) A-I      intronic chr17:61751037(+) A-I      intronic chr17:61751013(+) A-I      intronic chr17:61749613(+) A-I      intronic chr17:61749588(+) A-I      intronic chr17:61749555(+) A-I      intronic chr17:61749490(+) A-I      intronic chr17:61749467(+) A-I      intronic chr17:61749448(+) A-I      intronic chr17:61749444(+) A-I      intronic chr17:61749443(+) A-I      intronic chr17:61749396(+) A-I      intronic chr17:61748813(+) A-I      intronic chr17:61748801(+) A-I      intronic chr17:61748790(+) A-I      intronic chr17:61748755(+) A-I      intronic chr17:61740704(+) A-I      intronic chr17:61748742(+) A-I      intronic chr17:61748733(+) A-I      intronic chr17:61748716(+) A-I      intronic chr17:61748715(+) A-I      intronic chr17:61747913(+) A-I      intronic chr17:61747903(+) A-I      intronic chr17:61747893(+) A-I      intronic chr17:61747888(+) A-I      intronic chr17:61747858(+) A-I      intronic chr17:61747836(+) A-I      intronic chr17:61747832(+) A-I      intronic chr17:61747828(+) A-I      intronic chr17:61747796(+) A-I      intronic chr17:61747761(+) A-I      intronic chr17:61747412(+) A-I      intronic chr17:61747395(+) A-I      intronic chr17:61747311(+) A-I      intronic chr17:61747304(+) A-I      intronic chr17:61747285(+) A-I      intronic chr17:61747279(+) A-I      intronic chr17:61747277(+) A-I      intronic chr17:61747207(+) A-I      intronic chr17:61747072(+) A-I      intronic chr17:61747055(+) A-I      intronic chr17:61747047(+) A-I      intronic chr17:61746946(+) A-I      intronic chr17:61746880(+) A-I      intronic chr17:61742777(+) A-I      intronic chr17:61742712(+) A-I      intronic chr17:61742606(+) A-I      intronic chr17:61742505(+) A-I      intronic chr17:61742503(+) A-I      intronic chr17:61742453(+) A-I      intronic chr17:61742448(+) A-I      intronic chr17:61742434(+) A-I      intronic chr17:61742429(+) A-I      intronic chr17:61742413(+) A-I      intronic chr17:61742407(+) A-I      intronic chr17:61740849(+) A-I      intronic chr17:61740832(+) A-I      intronic chr17:61740807(+) A-I      intronic chr17:61740720(+) A-I      intronic chr17:61740710(+) A-I      intronic chr17:61740705(+) A-I      intronic chr17:61740318(+) A-I      intronic chr17:61740198(+) A-I      intronic chr17:61740159(+) A-I      intronic chr17:61740087(+) A-I      intronic chr17:61740082(+) A-I      intronic chr17:61739725(+) A-I      intronic chr17:61739537(+) A-I      intronic chr17:61739511(+) A-I      intronic chr17:61739492(+) A-I      intronic chr17:61739412(+) A-I      intronic chr17:61739404(+) A-I      intronic chr17:61739352(+) A-I      intronic chr17:61739348(+) A-I      intronic chr17:61739252(+) A-I      intronic chr17:61739247(+) A-I      intronic chr17:61739246(+) A-I      intronic chr17:61739244(+) A-I      intronic chr17:61739235(+) A-I      intronic chr17:61739217(+) A-I      intronic chr17:61739200(+) A-I      intronic chr17:61738500(+) A-I      intronic chr17:61737076(+) A-I      intronic chr17:61737059(+) A-I      intronic chr17:61736358(+) A-I      intronic chr17:61736279(+) A-I      intronic chr17:61736234(+) A-I      intronic chr17:61736115(+) A-I      intronic chr17:61733505(+) A-I      intronic chr17:61733074(+) A-I      intronic chr17:61732915(+) A-I      intronic chr17:61732302(+) A-I      intronic chr17:61732285(+) A-I      intronic chr17:61728739(+) A-I      intronic chr17:61728164(+) A-I      intronic chr17:61728102(+) A-I      intronic chr17:61726547(+) A-I      intronic chr17:61725931(+) A-I      intronic chr17:61722645(+) A-I      intronic chr17:61722584(+) A-I      intronic chr17:61722583(+) A-I      intronic chr17:61721674(+) A-I      intronic chr17:61720800(+) A-I      intronic chr17:61720786(+) A-I      intronic chr17:61720395(+) A-I      intronic chr17:61719943(+) A-I      intronic chr17:61719939(+) A-I      intronic chr17:61719756(+) A-I      intronic chr17:61718720(+) A-I      intronic chr17:61716158(+) A-I      intronic chr17:61710521(+) A-I      intronic chr17:61710429(+) A-I      intronic chr17:61710426(+) A-I      intronic chr17:61708566(+) A-I      intronic chr17:61705862(+) A-I      intronic chr17:61705860(+) A-I      intronic chr17:61704948(+) A-I      intronic chr17:61704944(+) A-I      intronic chr17:61704864(+) A-I      intronic chr17:61703310(+) A-I      intronic chr17:61703296(+) A-I      intronic chr17:61703170(+) A-I      intronic chr17:61720816(+) A-I      intronic chr17:61748745(+) A-I      intronic chr17:61762112(+) A-I      intronic chr17:61762111(+) A-I      intronic chr17:61762074(+) A-I      intronic chr17:61762052(+) A-I      intronic chr17:61762049(+) A-I      intronic chr17:61742710(+) A-I      intronic chr17:61739209(+) A-I      intronic chr17:61720252(+) A-I      intronic chr17:61741077(+) A-I      intronic chr17:61719842(+) A-I      intronic chr17:61721655(+) A-I      intronic chr17:61739590(+) A-I      intronic chr17:61738468(+) A-I      intronic chr17:61739669(+) A-I      intronic chr17:61747778(+) A-I      intronic chr17:61757313(+) A-I      intronic chr17:61728285(+) A-I      intronic chr17:61722623(+) A-I      intronic chr17:61740271(+) A-I      intronic chr17:61742665(+) A-I      intronic chr17:61739716(+) A-I      intronic chr17:61719853(+) A-I      intronic chr17:61746850(+) A-I      intronic chr17:61720752(+) A-I      intronic chr17:61739687(+) A-I      intronic chr17:61708383(+) A-I      intronic chr17:61742736(+) A-I      intronic chr17:61720392(+) A-I      intronic chr17:61747086(+) A-I      intronic chr17:61747342(+) A-I      intronic chr17:61747229(+) A-I      intronic chr17:61720394(+) A-I      intronic chr17:61757106(+) A-I      intronic chr17:61737010(+) A-I      intronic chr17:61746909(+) A-I      intronic chr17:61748876(+) A-I      intronic chr17:61743725(+) A-I      intronic chr17:61751675(+) A-I      intronic chr17:61751015(+) A-I      intronic chr17:61747688(+) A-I      intronic chr17:61756554(+) A-I      intronic chr17:61747073(+) A-I      intronic chr17:61749523(+) A-I      intronic chr17:61731503(+) A-I      intronic chr17:61739546(+) A-I      intronic chr17:61720142(+) A-I      intronic chr17:61762038(+) A-I      intronic chr17:61703174(+) A-I      intronic chr17:61736196(+) A-I      intronic chr17:61739762(+) A-I      intronic chr17:61761255(+) A-I      intronic chr17:61739660(+) A-I      intronic chr17:61751151(+) A-I      intronic chr17:61738082(+) A-I      intronic chr17:61751852(+) A-I      intronic chr17:61737168(+) A-I      intronic chr17:61732937(+) A-I      intronic chr17:61756310(+) A-I      intronic chr17:61762119(+) A-I      intronic chr17:61747378(+) A-I      intronic chr17:61727007(+) A-I      intronic chr17:61742543(+) A-I      intronic chr17:61721598(+) A-I      intronic chr17:61751840(+) A-I      intronic chr17:61747316(+) A-I      intronic chr17:61726676(+) A-I      intronic chr17:61748888(+) A-I      intronic chr17:61739724(+) A-I      intronic chr17:61746933(+) A-I      intronic chr17:61747000(+) A-I      intronic chr17:61762042(+) A-I      intronic chr17:61742643(+) A-I      intronic chr17:61720678(+) A-I      intronic chr17:61740184(+) A-I      intronic chr17:61742732(+) A-I      intronic chr17:61749522(+) A-I      intronic chr17:61747015(+) A-I      intronic chr17:61720686(+) A-I      intronic chr17:61742517(+) A-I      intronic chr17:61708391(+) A-I      intronic chr17:61707805(+) A-I      intronic chr17:61740183(+) A-I      intronic chr17:61736415(+) A-I      intronic chr17:61751739(+) A-I      intronic chr17:61742579(+) A-I      intronic chr17:61749564(+) A-I      intronic chr17:61720196(+) A-I      intronic chr17:61737081(+) A-I      intronic chr17:61739342(+) A-I      intronic chr17:61739285(+) A-I      intronic chr17:61748717(+) A-I      intronic chr17:61757021(+) A-I      intronic chr17:61739690(+) A-I      intronic chr17:61740270(+) A-I      intronic chr17:61741609(+) A-I      intronic chr17:61708373(+) A-I      intronic chr17:61721633(+) A-I      intronic chr17:61737067(+) A-I      intronic chr17:61719898(+) A-I      intronic chr17:61746852(+) A-I      intronic chr17:61747864(+) A-I      intronic chr17:61746932(+) A-I      intronic chr17:61747764(+) A-I      intronic chr17:61739388(+) A-I      intronic chr17:61726954(+) A-I      intronic chr17:61740192(+) A-I      intronic chr17:61749633(+) A-I      intronic chr17:61739504(+) A-I      intronic chr17:61740309(+) A-I      intronic chr17:61747849(+) A-I      intronic chr17:61728753(+) A-I      intronic chr17:61720251(+) A-I      intronic chr17:61739306(+) A-I      intronic chr17:61740585(+) A-I      intronic chr17:61738536(+) A-I      intronic chr17:61748696(+) A-I      intronic chr17:61739316(+) A-I      intronic chr17:61740118(+) A-I      intronic chr17:61727011(+) A-I      intronic chr17:61747791(+) A-I      intronic chr17:61740707(+) A-I      intronic chr17:61757000(+) A-I      intronic chr17:61740147(+) A-I      intronic chr17:61749388(+) A-I      intronic chr17:61751892(+) A-I      intronic chr17:61756314(+) A-I      intronic chr17:61737034(+) A-I      intronic chr17:61751150(+) A-I      intronic chr17:61751320(+) A-I      intronic chr17:61739309(+) A-I      intronic chr17:61747264(+) A-I      intronic chr17:61749489(+) A-I      intronic chr17:61721644(+) A-I      intronic chr17:61740263(+) A-I      intronic chr17:61751994(+) A-I      intronic chr17:61707908(+) A-I      intronic chr17:61741167(+) A-I      intronic chr17:61720601(+) A-I      intronic chr17:61751022(+) A-I      intronic chr17:61741228(+) A-I      intronic chr17:61746980(+) A-I      intronic chr17:61746998(+) A-I      intronic chr17:61725939(+) A-I      intronic chr17:61740851(+) A-I      intronic chr17:61738621(+) A-I      intronic chr17:61751070(+) A-I      intronic chr17:61741194(+) A-I      intronic chr17:61751734(+) A-I      intronic chr17:61746928(+) A-I      intronic chr17:61748680(+) A-I      intronic chr17:61747822(+) A-I      intronic chr17:61728627(+) A-I      intronic chr17:61741177(+) A-I      intronic chr17:61756936(+) A-I      intronic chr17:61757035(+) A-I      intronic chr17:61732119(+) A-I      intronic chr17:61747204(+) A-I      intronic chr17:61736151(+) A-I      intronic chr17:61708413(+) A-I      intronic chr17:61747383(+) A-I      intronic chr17:61751963(+) A-I      intronic chr17:61739556(+) A-I      intronic chr17:61757115(+) A-I      intronic chr17:61751319(+) A-I      intronic chr17:61720357(+) A-I      intronic chr17:61715697(+) A-I      intronic chr17:61739284(+) A-I      intronic chr17:61747298(+) A-I      intronic chr17:61737073(+) A-I      intronic chr17:61749387(+) A-I      intronic chr17:61740255(+) A-I      intronic chr17:61747310(+) A-I      intronic chr17:61747792(+) A-I      intronic chr17:61746854(+) A-I      intronic chr17:61747804(+) A-I      intronic chr17:61733479(+) A-I      intronic chr17:61740297(+) A-I      intronic chr17:61751870(+) A-I      intronic chr17:61707741(+) A-I      intronic chr17:61737152(+) A-I      intronic chr17:61747790(+) A-I      intronic chr17:61732900(+) A-I      intronic chr17:61740608(+) A-I      intronic chr17:61722570(+) A-I      intronic chr17:61741132(+) A-I      intronic chr17:61728730(+) A-I      intronic chr17:61747074(+) A-I      intronic chr17:61742408(+) A-I      intronic chr17:61747206(+) A-I      intronic chr17:61716460(+) A-I      intronic chr17:61720677(+) A-I      intronic chr17:61740715(+) A-I      intronic chr17:61756243(+) A-I      intronic chr17:61736164(+) A-I      intronic chr17:61756528(+) A-I      intronic chr17:61756879(+) A-I      intronic chr17:61721606(+) A-I      intronic chr17:61717026(+) A-I      intronic chr17:61751918(+) A-I      intronic chr17:61733866(+) A-I      intronic chr17:61747088(+) A-I      intronic chr17:61728083(+) A-I      intronic chr17:61751985(+) A-I      intronic chr17:61733114(+) A-I      intronic chr17:61710481(+) A-I      intronic chr17:61760987(+) A-I      intronic chr17:61751176(+) A-I      intronic chr17:61739296(+) A-I      intronic chr17:61756269(+) A-I      intronic chr17:61720338(+) A-I      intronic chr17:61740157(+) A-I      intronic chr17:61726898(+) A-I      intronic chr17:61740850(+) A-I      intronic chr17:61749316(+) A-I      intronic chr17:61756299(+) A-I      intronic chr17:61721847(+) A-I      intronic chr17:61749549(+) A-I      intronic chr17:61747365(+) A-I      intronic chr17:61757038(+) A-I      intronic chr17:61736224(+) A-I      intronic chr17:61733443(+) A-I      intronic chr17:61746929(+) A-I      intronic chr17:61731565(+) A-I      intronic chr17:61748866(+) A-I      intronic chr17:61727003(+) A-I      intronic chr17:61741069(+) A-I      intronic chr17:61720746(+) A-I      intronic chr17:61757105(+) A-I      intronic chr17:61722647(+) A-I      intronic chr17:61726542(+) A-I      intronic chr17:61736924(+) A-I      intronic chr17:61737156(+) A-I      intronic chr17:61747220(+) A-I      intronic chr17:61751842(+) A-I      intronic chr17:61756189(+) A-I      intronic chr17:61721320(+) A-I      intronic chr17:61741201(+) A-I      intronic chr17:61736466(+) A-I      intronic chr17:61746995(+) A-I      intronic chr17:61703194(+) A-I      intronic chr17:61742544(+) A-I      intronic chr17:61720769(+) A-I      intronic chr17:61756866(+) A-I      intronic chr17:61747312(+) A-I      intronic chr17:61737592(+) A-I      intronic chr17:61740607(+) A-I      intronic chr17:61740812(+) A-I      intronic chr17:61720301(+) A-I      intronic chr17:61740234(+) A-I      intronic chr17:61707909(+) A-I      intronic chr17:61721649(+) A-I      intronic chr17:61747284(+) A-I      intronic chr17:61749459(+) A-I      intronic chr17:61740657(+) A-I      intronic chr17:61751670(+) A-I      intronic chr17:61756545(+) A-I      intronic chr17:61756859(+) A-I      intronic chr17:61728819(+) A-I      intronic chr17:61749485(+) A-I      intronic chr17:61751669(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	MAP3K3	chr17:61746928(+) A-I intron -    22327324 chr17:61751319(+) A-I intron -    22327324 chr17:61746928(+) A-G intron -    22484847 chr17:61746929(+) A-G intron -    22484847 chr17:61747298(+) A-G intron -    22484847 chr17:61749564(+) A-G intron -    22484847 chr17:61751319(+) A-G intron -    22484847 chr17:61751320(+) A-G intron -    22484847 chr17:61756528(+) A-G intron -    22484847 chr17:61756545(+) A-G intron -    22484847 chr17:61756554(+) A-G intron -    22484847 chr17:61756866(+) A-G intron -    22484847 chr17:61756879(+) A-G intron -    22484847 chr17:61757035(+) A-G intron -    22484847 chr17:61757105(+) A-G intron -    22484847 chr17:61757115(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	MAP3K3	chr17:61699823-61699824(+) m6A 5'UTR//intron       24209618//25456834 chr17:61699839-61699840(+) m6A 5'UTR//intron       24209618//25456834 chr17:61700089-61700090(+) m6A 5'UTR       24209618 chr17:61710044-61710045(+) m6A CDS       - chr17:61710058-61710059(+) m6A CDS       - chr17:61710094-61710095(+) m6A CDS       - chr17:61710123-61710124(+) m6A CDS       - chr17:61710133-61710134(+) m6A CDS       - chr17:61710139-61710140(+) m6A CDS       - chr17:61712073-61712074(+) m6A CDS//intron       - chr17:61714194-61714195(+) m6A intron       - chr17:61714228-61714229(+) m6A intron       - chr17:61714243-61714244(+) m6A intron       - chr17:61714251-61714252(+) m6A intron       - chr17:61729948-61729949(+) Am 3'UTR//CDS       - chr17:61729982-61729983(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863 chr17:61730008-61730009(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863 chr17:61767311-61767312(+) m6A exon//intron       - chr17:61767707-61767708(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr17:61767720-61767721(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr17:61768546-61768547(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr17:61768560-61768561(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr17:61769105-61769106(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr17:61769213-61769214(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625 chr17:61769619-61769620(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618 chr17:61769646-61769647(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618 chr17:61770947-61770948(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr17:61771037-61771038(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr17:61771048-61771049(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr17:61771085-61771086(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr17:61771236-61771237(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr17:61771324-61771325(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr17:61771398-61771399(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr17:61771489-61771490(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085 chr17:61771561-61771562(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863 chr17:61772878-61772879(+) m6A 3'UTR       24284625 chr17:61773160-61773161(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr17:61773172-61773173(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr17:61773195-61773196(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085 chr17:61773222-61773223(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085 chr17:61773229-61773230(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085 chr17:61773253-61773254(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085 chr17:61773462-61773463(+) m6A 3'UTR       25456834//27371828 chr17:61773557-61773558(+) m6A 3'UTR       24209618//25456834//27773535 chr17:61773565-61773566(+) m6A 3'UTR       24209618//25456834//27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	kshv-miR-K12-12-5p	Exosome Primary dendritic cells     21505438
	MAP3K3	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: kshv-miR-K12-12-5p
Interactor2: MAP3K3

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg