Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00465562

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      kshv-miR-K12-4-3p:  MIMAT0002192          CARF:  NM_001282912     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	kshv-miR-K12-4-3p	CARF
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0002192	79800
Organism	Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	ALS2CR8//NYD-SP24

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	CARF	chr2:203811651(+) A-I      intronic chr2:203811659(+) A-I      intronic chr2:203811698(+) A-I      intronic chr2:203811699(+) A-I      intronic chr2:203829120(+) A-I      intronic chr2:203815823(+) A-I      intronic chr2:203815828(+) A-I      intronic chr2:203810308(+) A-I      intronic chr2:203810316(+) A-I      intronic chr2:203810317(+) A-I      intronic chr2:203810322(+) A-I      intronic chr2:203810325(+) A-I      intronic chr2:203815849(+) A-I      intronic chr2:203810332(+) A-I      intronic chr2:203810350(+) A-I      intronic chr2:203815894(+) A-I      intronic chr2:203810355(+) A-I      intronic chr2:203829144(+) A-I      intronic chr2:203844864(+) A-I      intronic chr2:203800328(+) A-I      intronic chr2:203844340(+) A-I      intronic chr2:203811620(+) A-I      intronic chr2:203844368(+) A-I      intronic chr2:203844348(+) A-I      intronic chr2:203844338(+) A-I      intronic chr2:203811635(+) A-I      intronic chr2:203844385(+) A-I      intronic chr2:203811636(+) A-I      intronic chr2:203811637(+) A-I      intronic chr2:203811638(+) A-I      intronic chr2:203811654(+) A-I      intronic chr2:203786949(+) A-I      intronic chr2:203786941(+) A-I      intronic chr2:203786814(+) A-I      intronic chr2:203786661(+) A-I      intronic chr2:203786002(+) A-I      intronic chr2:203844943(+) A-I      intronic chr2:203844920(+) A-I      intronic chr2:203844916(+) A-I      intronic chr2:203844855(+) A-I      intronic chr2:203844734(+) A-I      intronic chr2:203844712(+) A-I      intronic chr2:203844366(+) A-I      intronic chr2:203844364(+) A-I      intronic chr2:203844363(+) A-I      intronic chr2:203844359(+) A-I      intronic chr2:203843940(+) A-I      intronic chr2:203843824(+) A-I      intronic chr2:203843821(+) A-I      intronic chr2:203843820(+) A-I      intronic chr2:203843818(+) A-I      intronic chr2:203843804(+) A-I      intronic chr2:203843794(+) A-I      intronic chr2:203843751(+) A-I      intronic chr2:203843746(+) A-I      intronic chr2:203843718(+) A-I      intronic chr2:203842831(+) A-I      intronic chr2:203842803(+) A-I      intronic chr2:203841668(+) A-I      intronic chr2:203841578(+) A-I      intronic chr2:203841574(+) A-I      intronic chr2:203841537(+) A-I      intronic chr2:203841534(+) A-I      intronic chr2:203785986(+) A-I      intronic chr2:203841482(+) A-I      intronic chr2:203841458(+) A-I      intronic chr2:203841456(+) A-I      intronic chr2:203841157(+) A-I      intronic chr2:203841037(+) A-I      intronic chr2:203841015(+) A-I      intronic chr2:203840689(+) A-I      intronic chr2:203840647(+) A-I      intronic chr2:203840645(+) A-I      intronic chr2:203840637(+) A-I      intronic chr2:203840621(+) A-I      intronic chr2:203840608(+) A-I      intronic chr2:203840586(+) A-I      intronic chr2:203829243(+) A-I      intronic chr2:203829242(+) A-I      intronic chr2:203829169(+) A-I      intronic chr2:203829164(+) A-I      intronic chr2:203829132(+) A-I      intronic chr2:203829103(+) A-I      intronic chr2:203829102(+) A-I      intronic chr2:203829046(+) A-I      intronic chr2:203828006(+) A-I      intronic chr2:203785985(+) A-I      intronic chr2:203827991(+) A-I      intronic chr2:203785854(+) A-I      intronic chr2:203785825(+) A-I      intronic chr2:203827962(+) A-I      intronic chr2:203785015(+) A-I      intronic chr2:203827961(+) A-I      intronic chr2:203827926(+) A-I      intronic chr2:203827920(+) A-I      intronic chr2:203827894(+) A-I      intronic chr2:203825235(+) A-I      intronic chr2:203824497(+) A-I      intronic chr2:203824486(+) A-I      intronic chr2:203784977(+) A-I      intronic chr2:203784947(+) A-I      intronic chr2:203784936(+) A-I      intronic chr2:203784899(+) A-I      intronic chr2:203781061(+) A-I      intronic chr2:203781037(+) A-I      intronic chr2:203779881(+) A-I      intronic chr2:203779879(+) A-I      intronic chr2:203779869(+) A-I      intronic chr2:203779452(+) A-I      intronic chr2:203779447(+) A-I      intronic chr2:203779326(+) A-I      intronic chr2:203785931(+) A-I      intronic chr2:203813963(+) A-I      intronic chr2:203813946(+) A-I      intronic chr2:203813906(+) A-I      intronic chr2:203813875(+) A-I      intronic chr2:203806977(+) A-I      intronic chr2:203806835(+) A-I      intronic chr2:203806833(+) A-I      intronic chr2:203803571(+) A-I      intronic chr2:203803566(+) A-I      intronic chr2:203803565(+) A-I      intronic chr2:203800391(+) A-I      intronic chr2:203800337(+) A-I      intronic chr2:203827996(+) A-I      intronic chr2:203824479(+) A-I      intronic chr2:203824477(+) A-I      intronic chr2:203824412(+) A-I      intronic chr2:203824287(+) A-I      intronic chr2:203824286(+) A-I      intronic chr2:203823489(+) A-I      intronic chr2:203822594(+) A-I      intronic chr2:203822544(+) A-I      intronic chr2:203822531(+) A-I      intronic chr2:203822518(+) A-I      intronic chr2:203821746(+) A-I      intronic chr2:203821701(+) A-I      intronic chr2:203821673(+) A-I      intronic chr2:203821651(+) A-I      intronic chr2:203821605(+) A-I      intronic chr2:203821176(+) A-I      intronic chr2:203815909(+) A-I      intronic chr2:203815794(+) A-I      intronic chr2:203815789(+) A-I      intronic chr2:203814547(+) A-I      intronic chr2:203814535(+) A-I      intronic chr2:203814493(+) A-I      intronic chr2:203814454(+) A-I      intronic chr2:203814343(+) A-I      intronic chr2:203813989(+) A-I      intronic chr2:203813978(+) A-I      intronic chr2:203813972(+) A-I      intronic chr2:203800334(+) A-I      intronic chr2:203800292(+) A-I      intronic chr2:203800288(+) A-I      intronic chr2:203800283(+) A-I      intronic chr2:203799367(+) A-I      intronic chr2:203799346(+) A-I      intronic chr2:203792655(+) A-I      intronic chr2:203792639(+) A-I      intronic chr2:203791728(+) A-I      intronic chr2:203791709(+) A-I      intronic chr2:203791610(+) A-I      intronic chr2:203787443(+) A-I      intronic chr2:203787271(+) A-I      intronic chr2:203787270(+) A-I      intronic chr2:203787268(+) A-I      intronic chr2:203827888(+) A-I      3'UTR chr2:203827886(+) A-I      3'UTR chr2:203841653(+) A-I      intronic chr2:203829077(+) A-I      intronic chr2:203829072(+) A-I      intronic chr2:203822502(+) A-I      intronic chr2:203829266(+) A-I      intronic chr2:203779446(+) A-I      intronic chr2:203780382(+) A-I      intronic chr2:203780297(+) A-I      intronic chr2:203844793(+) A-I      intronic chr2:203813950(+) A-I      intronic chr2:203829177(+) A-I      intronic chr2:203841642(+) A-I      intronic chr2:203841572(+) A-I      intronic chr2:203841533(+) A-I      intronic chr2:203780997(+) A-I      intronic chr2:203780521(+) A-I      intronic chr2:203799204(+) A-I      intronic chr2:203844871(+) A-I      intronic chr2:203779359(+) A-I      intronic chr2:203780517(+) A-I      intronic chr2:203829105(+) A-I      intronic chr2:203841546(+) A-I      intronic chr2:203829256(+) A-I      intronic chr2:203799446(+) A-I      intronic chr2:203779381(+) A-I      intronic chr2:203841460(+) A-I      intronic chr2:203799203(+) A-I      intronic chr2:203829056(+) A-I      intronic chr2:203822519(+) A-I      intronic chr2:203829278(+) A-I      intronic chr2:203825175(+) A-I      intronic chr2:203844430(+) A-I      intronic

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	CARF	chr2:203789660-203789661(+) m6A intron       - chr2:203789708-203789709(+) m6A intron       - chr2:203789722-203789723(+) m6A intron       22608085 chr2:203789771-203789772(+) m6A intron       22608085 chr2:203789816-203789817(+) m6A intron       22608085 chr2:203789853-203789854(+) m6A intron       22608085 chr2:203789871-203789872(+) m6A intron       22608085 chr2:203789882-203789883(+) m6A intron       22608085 chr2:203846883-203846884(+) m6A CDS       22608085 chr2:203846978-203846979(+) m6A CDS       22608085 chr2:203847015-203847016(+) m6A CDS       22608085 chr2:203847091-203847092(+) m6A CDS       22608085 chr2:203847124-203847125(+) m6A CDS       22608085 chr2:203847146-203847147(+) m6A CDS       22608085 chr2:203848271-203848272(+) m6A CDS       24981863//22608085 chr2:203848277-203848278(+) m6A CDS       24981863//22608085 chr2:203848286-203848287(+) m6A CDS       24981863//22608085 chr2:203848314-203848315(+) m6A CDS       24981863//22608085 chr2:203848321-203848322(+) m6A CDS       24981863//22608085 chr2:203848442-203848443(+) m6A 3'UTR       22608085 chr2:203848449-203848450(+) m6A 3'UTR       22608085 chr2:203848478-203848479(+) m6A 3'UTR       22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	CARF	Exosome Blood     - Nucleus HeLa-S3 cells     -

Related Drug Information:

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID
RNAactDrug	kshv-miR-K12-4-3p	Panobinostat       6918837 Nilotinib       644241 Irinotecan       60838 Topotecan       60700 l-685,458       5479543 Palbociclib       5330286 Dovitinib       135398510 Crizotinib       11626560 Nvp-aew541       11476171 Pha-665752       10461815

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: kshv-miR-K12-4-3p
Interactor2: CARF

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda
Support Database	RepTar//VmiReg