Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00465168

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      kshv-miR-K12-4-3p:           BDP1:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol kshv-miR-K12-4-3p BDP1
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0002192 55814
Organism Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - DFNB112//HSA238520//TAF3B1//TFC5//TFIIIB''//TFIIIB150//TFIIIB90//TFNR

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR BDP1
chr5:70800927(+) A-I      ncRNA
chr5:70769948(+) A-I      intronic
chr5:70769946(+) A-I      intronic
chr5:70769936(+) A-I      intronic
chr5:70769863(+) A-I      intronic
chr5:70768173(+) A-I      intronic
chr5:70842479(+) A-I      intronic
chr5:70842478(+) A-I      intronic
chr5:70842477(+) A-I      intronic
chr5:70842475(+) A-I      intronic
chr5:70761487(+) A-I      intronic
chr5:70816909(+) A-I      intronic
chr5:70816872(+) A-I      intronic
chr5:70816868(+) A-I      intronic
chr5:70816839(+) A-I      intronic
chr5:70802330(+) A-I      intronic
chr5:70800938(+) A-I      intronic
chr5:70800935(+) A-I      intronic
chr5:70800934(+) A-I      intronic
chr5:70800020(+) A-I      intronic
chr5:70768168(+) A-I      intronic
chr5:70768132(+) A-I      intronic
chr5:70768096(+) A-I      intronic
chr5:70768087(+) A-I      intronic
chr5:70768086(+) A-I      intronic
chr5:70768059(+) A-I      intronic
chr5:70768054(+) A-I      intronic
chr5:70768032(+) A-I      intronic
chr5:70768024(+) A-I      intronic
chr5:70768014(+) A-I      intronic
chr5:70766617(+) A-I      intronic
chr5:70766496(+) A-I      intronic
chr5:70763766(+) A-I      intronic
chr5:70763562(+) A-I      intronic
chr5:70763546(+) A-I      intronic
chr5:70761593(+) A-I      intronic
chr5:70800006(+) A-I      intronic
chr5:70799942(+) A-I      intronic
chr5:70799937(+) A-I      intronic
chr5:70799891(+) A-I      intronic
chr5:70799888(+) A-I      intronic
chr5:70799076(+) A-I      intronic
chr5:70799035(+) A-I      intronic
chr5:70799034(+) A-I      intronic
chr5:70796748(+) A-I      intronic
chr5:70775822(+) A-I      intronic
chr5:70822775(+) A-I      intronic
chr5:70822948(+) A-I      intronic
chr5:70822968(+) A-I      intronic
chr5:70822982(+) A-I      intronic
chr5:70824945(+) A-I      intronic
chr5:70817219(+) A-I      intronic
chr5:70824955(+) A-I      intronic
chr5:70824963(+) A-I      intronic
chr5:70774031(+) A-I      intronic
chr5:70774027(+) A-I      intronic
chr5:70773927(+) A-I      intronic
chr5:70772737(+) A-I      intronic
chr5:70796340(+) A-I      intronic
chr5:70796289(+) A-I      intronic
chr5:70795331(+) A-I      intronic
chr5:70795124(+) A-I      intronic
chr5:70795027(+) A-I      intronic
chr5:70794644(+) A-I      intronic
chr5:70793976(+) A-I      intronic
chr5:70793871(+) A-I      intronic
chr5:70824964(+) A-I      intronic
chr5:70825067(+) A-I      intronic
chr5:70825106(+) A-I      intronic
chr5:70825113(+) A-I      intronic
chr5:70825142(+) A-I      intronic
chr5:70825329(+) A-I      intronic
chr5:70825371(+) A-I      intronic
chr5:70825443(+) A-I      intronic
chr5:70825498(+) A-I      intronic
chr5:70826081(+) A-I      intronic
chr5:70772648(+) A-I      intronic
chr5:70772508(+) A-I      intronic
chr5:70770625(+) A-I      intronic
chr5:70770547(+) A-I      intronic
chr5:70770522(+) A-I      intronic
chr5:70793855(+) A-I      intronic
chr5:70793768(+) A-I      intronic
chr5:70792662(+) A-I      intronic
chr5:70791808(+) A-I      intronic
chr5:70784244(+) A-I      intronic
chr5:70784147(+) A-I      intronic
chr5:70826252(+) A-I      intronic
chr5:70770254(+) A-I      intronic
chr5:70770253(+) A-I      intronic
chr5:70770250(+) A-I      intronic
chr5:70770224(+) A-I      intronic
chr5:70770076(+) A-I      intronic
chr5:70756999(+) A-I      intronic
chr5:70770075(+) A-I      intronic
chr5:70769989(+) A-I      intronic
chr5:70826307(+) A-I      intronic
chr5:70826345(+) A-I      intronic
chr5:70761587(+) A-I      intronic
chr5:70761241(+) A-I      intronic
chr5:70761234(+) A-I      intronic
chr5:70760963(+) A-I      intronic
chr5:70760950(+) A-I      intronic
chr5:70760932(+) A-I      intronic
chr5:70826479(+) A-I      intronic
chr5:70826671(+) A-I      intronic
chr5:70826758(+) A-I      intronic
chr5:70827510(+) A-I      intronic
chr5:70827579(+) A-I      intronic
chr5:70832582(+) A-I      intronic
chr5:70832778(+) A-I      intronic
chr5:70836174(+) A-I      intronic
chr5:70836194(+) A-I      intronic
chr5:70836255(+) A-I      intronic
chr5:70836294(+) A-I      intronic
chr5:70836389(+) A-I      intronic
chr5:70836429(+) A-I      intronic
chr5:70836496(+) A-I      intronic
chr5:70836510(+) A-I      intronic
chr5:70836526(+) A-I      intronic
chr5:70836554(+) A-I      intronic
chr5:70836725(+) A-I      intronic
chr5:70760927(+) A-I      intronic
chr5:70760438(+) A-I      intronic
chr5:70760434(+) A-I      intronic
chr5:70760274(+) A-I      intronic
chr5:70760113(+) A-I      intronic
chr5:70760076(+) A-I      intronic
chr5:70760051(+) A-I      intronic
chr5:70758442(+) A-I      intronic
chr5:70758434(+) A-I      intronic
chr5:70758419(+) A-I      intronic
chr5:70758405(+) A-I      intronic
chr5:70840473(+) A-I      intronic
chr5:70841324(+) A-I      intronic
chr5:70842275(+) A-I      intronic
chr5:70842386(+) A-I      intronic
chr5:70842395(+) A-I      intronic
chr5:70842415(+) A-I      intronic
chr5:70842432(+) A-I      intronic
chr5:70842433(+) A-I      intronic
chr5:70842942(+) A-I      intronic
chr5:70843569(+) A-I      intronic
chr5:70843591(+) A-I      intronic
chr5:70843615(+) A-I      intronic
chr5:70843660(+) A-I      intronic
chr5:70843860(+) A-I      intronic
chr5:70843900(+) A-I      intronic
chr5:70845823(+) A-I      intronic
chr5:70853110(+) A-I      intronic
chr5:70853122(+) A-I      intronic
chr5:70854491(+) A-I      intronic
chr5:70826093(+) A-I      intronic
chr5:70854585(+) A-I      intronic
chr5:70854605(+) A-I      intronic
chr5:70854704(+) A-I      intronic
chr5:70854893(+) A-I      intronic
chr5:70859175(+) A-I      intronic
chr5:70859651(+) A-I      intronic
chr5:70826131(+) A-I      intronic
chr5:70795001(+) A-I      intronic
chr5:70795029(+) A-I      intronic
chr5:70817261(+) A-I      intronic
chr5:70817285(+) A-I      intronic
chr5:70817302(+) A-I      intronic
chr5:70822254(+) A-I      intronic
chr5:70822257(+) A-I      intronic
chr5:70822258(+) A-I      intronic
chr5:70822260(+) A-I      intronic
chr5:70822279(+) A-I      intronic
chr5:70822283(+) A-I      intronic
chr5:70822290(+) A-I      intronic
chr5:70822291(+) A-I      intronic
chr5:70822292(+) A-I      intronic
chr5:70832866(+) A-I      intronic
chr5:70832867(+) A-I      intronic
chr5:70832880(+) A-I      intronic
chr5:70832888(+) A-I      intronic
chr5:70841380(+) A-I      intronic
chr5:70841418(+) A-I      intronic
chr5:70841420(+) A-I      intronic
chr5:70842221(+) A-I      intronic
chr5:70842244(+) A-I      intronic
chr5:70842248(+) A-I      intronic
chr5:70842250(+) A-I      intronic
chr5:70842262(+) A-I      intronic
chr5:70842287(+) A-I      intronic
chr5:70842295(+) A-I      intronic
chr5:70842302(+) A-I      intronic
chr5:70842452(+) A-I      intronic
chr5:70842469(+) A-I      intronic
chr5:70842470(+) A-I      intronic
chr5:70842471(+) A-I      intronic
chr5:70859587(+) A-I      intronic
chr5:70859596(+) A-I      intronic
chr5:70826155(+) A-I      intronic
chr5:70826161(+) A-I      intronic
chr5:70826162(+) A-I      intronic
chr5:70826165(+) A-I      intronic
chr5:70826166(+) A-I      intronic
chr5:70859694(+) A-I      intronic
chr5:70775901(+) A-I      intronic
chr5:70826174(+) A-I      intronic
chr5:70769968(+) A-I      intronic
chr5:70769956(+) A-I      intronic
chr5:70816997(+) A-I      intronic
chr5:70773612(+) A-I      intronic
chr5:70842260(+) A-I      intronic
chr5:70799610(+) A-I      intronic
chr5:70832645(+) A-I      intronic
chr5:70773698(+) A-I      intronic
chr5:70859485(+) A-I      intronic
chr5:70766597(+) A-I      intronic
chr5:70773682(+) A-I      intronic
chr5:70776983(+) A-I      intronic
chr5:70773548(+) A-I      intronic
chr5:70795353(+) A-I      intronic
chr5:70841333(+) A-I      intronic
chr5:70843506(+) A-I      intronic
chr5:70809543(+) A-I      intronic
chr5:70756461(+) A-I      intronic
chr5:70816936(+) A-I      intronic
chr5:70826667(+) A-I      intronic
chr5:70843589(+) A-I      intronic
chr5:70796359(+) A-I      intronic
chr5:70770230(+) A-I      intronic
chr5:70776818(+) A-I      intronic
chr5:70854861(+) A-I      intronic
chr5:70776770(+) A-I      intronic
chr5:70826432(+) A-I      intronic
chr5:70798185(+) A-I      intronic
chr5:70816904(+) A-I      intronic
chr5:70776823(+) A-I      intronic
chr5:70768209(+) A-I      intronic
chr5:70825457(+) A-I      intronic
chr5:70836512(+) A-I      intronic
chr5:70843654(+) A-I      intronic
chr5:70842324(+) A-I      intronic
chr5:70795397(+) A-I      intronic
chr5:70843877(+) A-I      intronic
chr5:70846338(+) A-I      intronic
chr5:70859561(+) A-I      intronic
chr5:70770518(+) A-I      intronic
chr5:70859562(+) A-I      intronic
chr5:70842190(+) A-I      intronic
chr5:70776933(+) A-I      intronic
chr5:70796797(+) A-I      intronic
chr5:70842263(+) A-I      intronic
chr5:70777341(+) A-I      intronic
chr5:70854834(+) A-I      intronic
chr5:70853115(+) A-I      intronic
chr5:70770619(+) A-I      intronic
chr5:70776850(+) A-I      intronic
chr5:70841401(+) A-I      intronic
chr5:70854304(+) A-I      intronic
chr5:70776886(+) A-I      intronic
chr5:70846011(+) A-I      intronic
chr5:70842394(+) A-I      intronic
chr5:70859244(+) A-I      intronic
chr5:70776842(+) A-I      intronic
chr5:70842860(+) A-I      intronic
chr5:70817269(+) A-I      intronic
chr5:70816895(+) A-I      intronic
chr5:70776820(+) A-I      intronic
chr5:70760685(+) A-I      intronic
chr5:70845957(+) A-I      intronic
chr5:70842814(+) A-I      intronic
chr5:70776800(+) A-I      intronic
chr5:70844967(+) A-I      intronic
chr5:70825096(+) A-I      intronic
chr5:70760885(+) A-I      intronic
chr5:70802346(+) A-I      intronic
chr5:70826487(+) A-I      intronic
chr5:70770581(+) A-I      intronic
chr5:70859055(+) A-I      intronic
chr5:70792377(+) A-I      intronic
chr5:70775820(+) A-I      intronic
chr5:70853148(+) A-I      intronic
chr5:70773141(+) A-I      intronic
chr5:70832546(+) A-I      intronic
chr5:70770553(+) A-I      intronic
chr5:70816996(+) A-I      intronic
chr5:70795061(+) A-I      intronic
chr5:70769182(+) A-I      intronic
chr5:70773685(+) A-I      intronic
chr5:70829337(+) A-I      intronic
chr5:70770620(+) A-I      intronic
chr5:70761597(+) A-I      intronic
chr5:70760646(+) A-I      intronic
chr5:70841397(+) A-I      intronic
chr5:70775911(+) A-I      intronic
chr5:70825097(+) A-I      intronic
chr5:70853105(+) A-I      intronic
chr5:70776922(+) A-I      intronic
chr5:70760268(+) A-I      intronic
chr5:70841720(+) A-I      intronic
chr5:70832753(+) A-I      intronic
chr5:70843973(+) A-I      intronic
chr5:70817340(+) A-I      intronic
chr5:70793745(+) A-I      intronic
chr5:70757406(+) A-I      intronic
chr5:70802402(+) A-I      intronic
chr5:70776667(+) A-I      intronic
chr5:70799612(+) A-I      intronic
chr5:70795355(+) A-I      intronic
chr5:70797120(+) A-I      intronic
chr5:70757375(+) A-I      intronic
chr5:70768102(+) A-I      intronic
chr5:70842177(+) A-I      intronic
chr5:70825462(+) A-I      intronic
chr5:70768200(+) A-I      intronic
chr5:70826142(+) A-I      intronic
chr5:70773551(+) A-I      intronic
chr5:70776754(+) A-I      intronic
chr5:70842245(+) A-I      intronic
chr5:70764643(+) A-I      intronic
chr5:70843668(+) A-I      intronic
chr5:70767152(+) A-I      intronic
chr5:70769308(+) A-I      intronic
chr5:70797186(+) A-I      intronic
chr5:70799014(+) A-I      intronic
chr5:70756833(+) A-I      intronic
chr5:70773926(+) A-I      intronic
chr5:70760215(+) A-I      intronic
chr5:70795117(+) A-I      intronic
chr5:70826440(+) A-I      intronic
chr5:70768849(+) A-I      intronic
chr5:70776841(+) A-I      intronic
chr5:70793672(+) A-I      intronic
chr5:70773477(+) A-I      intronic
chr5:70859225(+) A-I      intronic
chr5:70825375(+) A-I      intronic
chr5:70760160(+) A-I      intronic
chr5:70836258(+) A-I      intronic
chr5:70853175(+) A-I      intronic
chr5:70766600(+) A-I      intronic
chr5:70822340(+) A-I      intronic
chr5:70770649(+) A-I      intronic
chr5:70836211(+) A-I      intronic
chr5:70859235(+) A-I      intronic
chr5:70843931(+) A-I      intronic
chr5:70842370(+) A-I      intronic
chr5:70857733(+) A-I      intronic
chr5:70799914(+) A-I      intronic
chr5:70842231(+) A-I      intronic
chr5:70799568(+) A-I      intronic
chr5:70776835(+) A-I      intronic
chr5:70841339(+) A-I      intronic
chr5:70807353(+) A-I      intronic
chr5:70854337(+) A-I      intronic
chr5:70758339(+) A-I      intronic
chr5:70853630(+) A-I      intronic
chr5:70843522(+) A-I      intronic
chr5:70859238(+) A-I      intronic
chr5:70770433(+) A-I      intronic
chr5:70843599(+) A-I      intronic
chr5:70854913(+) A-I      intronic
chr5:70773828(+) A-I      intronic
chr5:70859160(+) A-I      intronic
chr5:70792539(+) A-I      intronic
chr5:70859226(+) A-I      intronic
chr5:70859234(+) A-I      intronic
chr5:70761588(+) A-I      intronic
chr5:70796292(+) A-I      intronic
chr5:70826333(+) A-I      intronic
chr5:70816754(+) A-I      intronic
chr5:70842430(+) A-I      intronic
chr5:70799082(+) A-I      intronic
chr5:70832701(+) A-I      intronic
chr5:70763556(+) A-I      intronic
chr5:70794946(+) A-I      intronic
chr5:70842698(+) A-I      intronic
chr5:70854902(+) A-I      intronic
chr5:70817341(+) A-I      intronic
chr5:70761218(+) A-I      intronic
chr5:70764210(+) A-I      intronic
chr5:70842325(+) A-I      intronic
chr5:70796803(+) A-I      intronic
chr5:70843664(+) A-I      intronic
chr5:70845874(+) A-I      intronic
chr5:70853129(+) A-I      intronic
chr5:70776659(+) A-I      intronic
chr5:70832856(+) A-I      intronic
chr5:70793984(+) A-I      intronic
chr5:70796765(+) A-I      intronic
chr5:70825144(+) A-I      intronic
chr5:70857734(+) A-I      intronic
chr5:70842357(+) A-I      intronic
chr5:70822322(+) A-I      intronic
chr5:70796665(+) A-I      intronic
chr5:70841342(+) A-I      intronic
chr5:70792584(+) A-I      intronic
chr5:70836562(+) A-I      intronic
chr5:70761130(+) A-I      intronic
chr5:70832876(+) A-I      intronic
chr5:70798820(+) A-I      intronic
chr5:70836699(+) A-I      intronic
chr5:70826680(+) A-I      intronic
chr5:70846334(+) A-I      intronic
chr5:70857817(+) A-I      intronic
chr5:70854203(+) A-I      intronic
chr5:70854178(+) A-I      intronic
chr5:70791886(+) A-I      intronic
chr5:70795396(+) A-I      intronic
chr5:70859628(+) A-I      intronic
chr5:70796672(+) A-I      intronic
chr5:70760726(+) A-I      intronic
chr5:70853097(+) A-I      intronic
chr5:70768167(+) A-I      intronic
chr5:70853059(+) A-I      intronic
chr5:70764055(+) A-I      intronic
chr5:70795299(+) A-I      intronic
chr5:70824941(+) A-I      intronic
chr5:70854256(+) A-I      intronic
chr5:70817286(+) A-I      intronic
chr5:70845905(+) A-I      intronic
chr5:70822622(+) A-I      intronic
chr5:70842704(+) A-I      intronic
chr5:70773925(+) A-I      intronic
chr5:70763690(+) A-I      intronic
chr5:70842954(+) A-I      intronic
chr5:70854838(+) A-I      intronic
chr5:70816830(+) A-I      intronic
chr5:70777318(+) A-I      intronic
chr5:70846771(+) A-I      intronic
chr5:70832930(+) A-I      intronic
chr5:70775865(+) A-I      intronic
chr5:70836605(+) A-I      intronic
chr5:70842289(+) A-I      intronic
chr5:70843961(+) A-I      intronic
chr5:70799979(+) A-I      intronic
chr5:70831125(+) A-I      intronic
chr5:70770243(+) A-I      intronic
chr5:70760277(+) A-I      intronic
chr5:70859476(+) A-I      intronic
chr5:70764617(+) A-I      intronic
chr5:70799651(+) A-I      intronic
chr5:70770606(+) A-I      intronic
chr5:70760085(+) A-I      intronic
chr5:70836748(+) A-I      intronic
chr5:70816840(+) A-I      intronic
chr5:70842356(+) A-I      intronic
chr5:70777168(+) A-I      intronic
chr5:70755106(+) A-I      intronic
chr5:70760408(+) A-I      intronic
chr5:70822696(+) A-I      intronic
chr5:70796839(+) A-I      intronic
chr5:70799850(+) A-I      intronic
chr5:70829370(+) A-I      intronic
chr5:70816761(+) A-I      intronic
chr5:70846255(+) A-I      intronic
chr5:70859030(+) A-I      intronic
chr5:70842766(+) A-I      intronic
chr5:70816815(+) A-I      intronic
chr5:70841393(+) A-I      intronic
chr5:70773085(+) A-I      intronic
chr5:70842863(+) A-I      intronic
chr5:70845958(+) A-I      intronic
chr5:70859075(+) A-I      intronic
chr5:70843681(+) A-I      intronic
chr5:70826300(+) A-I      intronic
chr5:70777116(+) A-I      intronic
chr5:70846398(+) A-I      intronic
chr5:70859484(+) A-I      intronic
chr5:70817319(+) A-I      intronic
chr5:70763563(+) A-I      intronic
chr5:70826291(+) A-I      intronic
chr5:70760878(+) A-I      intronic
chr5:70768123(+) A-I      intronic
chr5:70756865(+) A-I      intronic
chr5:70843958(+) A-I      intronic
chr5:70842915(+) A-I      intronic
chr5:70822687(+) A-I      intronic
chr5:70859646(+) A-I      intronic
chr5:70770474(+) A-I      intronic
chr5:70822268(+) A-I      intronic
chr5:70801613(+) A-I      intronic
chr5:70841438(+) A-I      intronic
chr5:70859660(+) A-I      intronic
chr5:70766495(+) A-I      intronic
chr5:70796817(+) A-I      intronic
chr5:70766477(+) A-I      intronic
chr5:70853625(+) A-I      intronic
chr5:70758718(+) A-I      intronic
chr5:70843527(+) A-I      intronic
chr5:70768245(+) A-I      intronic
chr5:70842281(+) A-I      intronic
chr5:70773547(+) A-I      intronic
chr5:70832835(+) A-I      intronic
chr5:70831197(+) A-I      intronic
chr5:70777277(+) A-I      intronic
chr5:70793716(+) A-I      intronic
chr5:70832698(+) A-I      intronic
chr5:70766518(+) A-I      intronic
chr5:70842712(+) A-I      intronic
chr5:70853627(+) A-I      intronic
chr5:70799844(+) A-I      intronic
chr5:70826762(+) A-I      intronic
chr5:70760164(+) A-I      intronic
chr5:70775795(+) A-I      intronic
chr5:70816921(+) A-I      intronic
chr5:70814921(+) A-I      intronic
chr5:70836662(+) A-I      intronic
chr5:70816760(+) A-I      intronic
chr5:70840613(+) A-I      intronic
chr5:70795182(+) A-I      intronic
chr5:70859490(+) A-I      intronic
chr5:70796731(+) A-I      intronic
chr5:70822296(+) A-I      intronic
chr5:70766692(+) A-I      intronic
chr5:70842259(+) A-I      intronic
chr5:70797198(+) A-I      intronic
chr5:70823709(+) A-I      intronic
chr5:70816782(+) A-I      intronic
chr5:70845869(+) A-I      intronic
chr5:70814299(+) A-I      intronic
chr5:70795056(+) A-I      intronic
chr5:70770090(+) A-I      intronic
chr5:70816793(+) A-I      intronic
chr5:70817272(+) A-I      intronic
chr5:70760926(+) A-I      intronic
chr5:70842292(+) A-I      intronic
chr5:70795326(+) A-I      intronic
chr5:70832889(+) A-I      intronic
chr5:70841712(+) A-I      intronic
chr5:70794761(+) A-I      intronic
chr5:70770266(+) A-I      intronic
chr5:70842247(+) A-I      intronic
chr5:70842294(+) A-I      intronic
chr5:70797128(+) A-I      intronic
chr5:70817380(+) A-I      intronic
chr5:70859054(+) A-I      intronic
chr5:70761557(+) A-I      intronic
chr5:70829341(+) A-I      intronic
chr5:70764172(+) A-I      intronic
chr5:70857760(+) A-I      intronic
chr5:70853617(+) A-I      intronic
chr5:70776634(+) A-I      intronic
chr5:70853600(+) A-I      intronic
chr5:70816801(+) A-I      intronic
chr5:70798816(+) A-I      intronic
chr5:70816783(+) A-I      intronic
chr5:70774064(+) A-I      intronic
chr5:70843939(+) A-I      intronic
chr5:70760966(+) A-I      intronic
chr5:70822261(+) A-I      intronic
chr5:70766515(+) A-I      intronic
chr5:70795044(+) A-I      intronic
chr5:70770965(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED BDP1
chr5:70776667(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776754(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776755(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776770(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776792(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776800(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776818(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776820(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776823(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776824(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776835(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776841(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776842(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776850(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776854(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776880(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776886(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776922(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776933(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776983(+) A-I intron -    22028664
chr5:70776988(+) A-I intron -    22028664
chr5:70760113(+) A-I intron -    21960545
chr5:70760162(+) A-I intron -    21960545
chr5:70760215(+) A-I intron -    21960545
chr5:70761130(+) A-I intron -    21960545
chr5:70766515(+) A-I intron -    21960545
chr5:70777269(+) A-I intron -    21960545
chr5:70799612(+) A-I intron -    21960545
chr5:70802349(+) A-I intron -    21960545
chr5:70823375(+) A-I intron -    21960545
chr5:70841316(+) A-I intron -    21960545
chr5:70841324(+) A-I intron -    21960545
chr5:70841342(+) A-I intron -    21960545
chr5:70841360(+) A-I intron -    21960545
chr5:70843668(+) A-I intron -    21960545
chr5:70859075(+) A-I intron -    21960545
chr5:70859092(+) A-I intron -    21960545
chr5:70756478(+) T-C intron -    22484847
chr5:70756494(+) T-C intron -    22484847
chr5:70756495(+) T-C intron -    22484847
chr5:70756500(+) T-C intron -    22484847
chr5:70756832(+) A-G intron -    22484847
chr5:70756865(+) A-G intron -    22484847
chr5:70758307(+) A-G intron -    22484847
chr5:70758339(+) A-G intron -    22484847
chr5:70758718(+) A-G intron -    22484847
chr5:70760085(+) A-G intron -    22484847
chr5:70760160(+) A-G intron -    22484847
chr5:70760215(+) A-G intron -    22484847
chr5:70760885(+) A-G intron -    22484847
chr5:70760966(+) A-G intron -    22484847
chr5:70761130(+) A-G intron -    22484847
chr5:70761557(+) A-G intron -    22484847
chr5:70761588(+) A-G intron -    22484847
chr5:70763556(+) A-G intron -    22484847
chr5:70763690(+) A-G intron -    22484847
chr5:70764055(+) A-G intron -    22484847
chr5:70765085(+) T-C intron -    22484847
chr5:70766515(+) A-G intron -    22484847
chr5:70766554(+) A-G intron -    22484847
chr5:70766988(+) G-T intron -    22484847
chr5:70766989(+) A-T intron -    22484847
chr5:70768101(+) A-G intron -    22484847
chr5:70768102(+) A-G intron -    22484847
chr5:70768123(+) A-G intron -    22484847
chr5:70768167(+) A-G intron -    22484847
chr5:70769308(+) A-G intron -    22484847
chr5:70770014(+) A-G intron -    22484847
chr5:70770243(+) A-G intron -    22484847
chr5:70770433(+) A-G intron -    22484847
chr5:70770553(+) A-G intron -    22484847
chr5:70770581(+) A-G intron -    22484847
chr5:70773547(+) A-G intron -    22484847
chr5:70773548(+) A-G intron -    22484847
chr5:70773926(+) A-G intron -    22484847
chr5:70773930(+) A-G intron -    22484847
chr5:70774097(+) G-A intron -    22484847
chr5:70775795(+) A-G intron -    22484847
chr5:70775820(+) A-G intron -    22484847
chr5:70775865(+) A-G intron -    22484847
chr5:70775911(+) A-G intron -    22484847
chr5:70776792(+) A-G intron -    22484847
chr5:70776880(+) A-G intron -    22484847
chr5:70791815(+) A-G intron -    22484847
chr5:70791886(+) A-G intron -    22484847
chr5:70792610(+) A-G intron -    22484847
chr5:70793642(+) A-G intron -    22484847
chr5:70793959(+) A-G intron -    22484847
chr5:70793962(+) A-G intron -    22484847
chr5:70793984(+) A-G intron -    22484847
chr5:70794946(+) A-G intron -    22484847
chr5:70795044(+) A-G intron -    22484847
chr5:70795056(+) A-G intron -    22484847
chr5:70795061(+) A-G intron -    22484847
chr5:70795066(+) A-G intron -    22484847
chr5:70795182(+) A-G intron -    22484847
chr5:70795279(+) A-G intron -    22484847
chr5:70795299(+) A-G intron -    22484847
chr5:70795353(+) A-G intron -    22484847
chr5:70795354(+) A-G intron -    22484847
chr5:70795355(+) A-G intron -    22484847
chr5:70795396(+) A-G intron -    22484847
chr5:70796228(+) A-T intron -    22484847
chr5:70796270(+) A-G intron -    22484847
chr5:70796359(+) A-G intron -    22484847
chr5:70798767(+) A-G intron -    22484847
chr5:70798969(+) A-G intron -    22484847
chr5:70799014(+) A-G intron -    22484847
chr5:70799082(+) A-G intron -    22484847
chr5:70801591(+) A-G intron -    22484847
chr5:70801613(+) A-G intron -    22484847
chr5:70802346(+) A-G intron -    22484847
chr5:70802671(+) A-G intron -    22484847
chr5:70816783(+) A-G intron -    22484847
chr5:70816834(+) A-G intron -    22484847
chr5:70817206(+) A-G intron -    22484847
chr5:70817220(+) A-G intron -    22484847
chr5:70817281(+) A-G intron -    22484847
chr5:70817319(+) A-G intron -    22484847
chr5:70822261(+) A-G intron -    22484847
chr5:70822268(+) A-G intron -    22484847
chr5:70822296(+) A-G intron -    22484847
chr5:70822322(+) A-G intron -    22484847
chr5:70822696(+) A-G intron -    22484847
chr5:70822748(+) A-G intron -    22484847
chr5:70822787(+) A-G intron -    22484847
chr5:70824941(+) A-G intron -    22484847
chr5:70824957(+) A-G intron -    22484847
chr5:70825097(+) A-G intron -    22484847
chr5:70825457(+) A-G intron -    22484847
chr5:70826098(+) A-G intron -    22484847
chr5:70826142(+) A-G intron -    22484847
chr5:70826291(+) A-G intron -    22484847
chr5:70826300(+) A-G intron -    22484847
chr5:70826333(+) A-G intron -    22484847
chr5:70826440(+) A-G intron -    22484847
chr5:70826633(+) A-G intron -    22484847
chr5:70826667(+) A-G intron -    22484847
chr5:70826714(+) A-G intron -    22484847
chr5:70826883(+) A-G intron -    22484847
chr5:70831125(+) A-G intron -    22484847
chr5:70836211(+) A-G intron -    22484847
chr5:70836258(+) A-G intron -    22484847
chr5:70836281(+) A-G intron -    22484847
chr5:70836562(+) A-G intron -    22484847
chr5:70836586(+) G-A intron -    22484847
chr5:70836605(+) A-G intron -    22484847
chr5:70836644(+) A-G intron -    22484847
chr5:70836662(+) A-G intron -    22484847
chr5:70836699(+) A-G intron -    22484847
chr5:70841207(+) A-G intron -    22484847
chr5:70841252(+) A-G intron -    22484847
chr5:70841276(+) A-G intron -    22484847
chr5:70841284(+) A-G intron -    22484847
chr5:70841285(+) A-G intron -    22484847
chr5:70841288(+) A-G intron -    22484847
chr5:70841298(+) A-G intron -    22484847
chr5:70841342(+) A-G intron -    22484847
chr5:70841360(+) A-G intron -    22484847
chr5:70841393(+) A-G intron -    22484847
chr5:70841401(+) A-G intron -    22484847
chr5:70841438(+) A-G intron -    22484847
chr5:70841720(+) A-G intron -    22484847
chr5:70842698(+) A-G intron -    22484847
chr5:70842704(+) A-G intron -    22484847
chr5:70842712(+) A-G intron -    22484847
chr5:70842766(+) A-G intron -    22484847
chr5:70842812(+) A-G intron -    22484847
chr5:70842814(+) A-G intron -    22484847
chr5:70842915(+) A-G intron -    22484847
chr5:70843522(+) A-G intron -    22484847
chr5:70843566(+) A-G intron -    22484847
chr5:70843599(+) A-G intron -    22484847
chr5:70843654(+) A-G intron -    22484847
chr5:70843664(+) A-G intron -    22484847
chr5:70843668(+) A-G intron -    22484847
chr5:70843681(+) A-G intron -    22484847
chr5:70843852(+) A-G intron -    22484847
chr5:70844009(+) A-G intron -    22484847
chr5:70844041(+) A-G intron -    22484847
chr5:70845957(+) A-G intron -    22484847
chr5:70845958(+) A-G intron -    22484847
chr5:70846716(+) A-G intron -    22484847
chr5:70853059(+) A-G intron -    22484847
chr5:70853067(+) A-G intron -    22484847
chr5:70853097(+) A-G intron -    22484847
chr5:70853100(+) A-G intron -    22484847
chr5:70853105(+) A-G intron -    22484847
chr5:70853115(+) A-G intron -    22484847
chr5:70853129(+) A-G intron -    22484847
chr5:70853418(+) A-G intron -    22484847
chr5:70854173(+) A-G intron -    22484847
chr5:70854178(+) A-G intron -    22484847
chr5:70854229(+) A-G intron -    22484847
chr5:70854230(+) A-G intron -    22484847
chr5:70854532(+) A-G intron -    22484847
chr5:70854533(+) A-G intron -    22484847
chr5:70854902(+) A-G intron -    22484847
chr5:70859055(+) A-G intron -    22484847
chr5:70859075(+) A-G intron -    22484847
chr5:70859092(+) A-G intron -    22484847
chr5:70859155(+) A-G intron -    22484847
chr5:70859238(+) A-G intron -    22484847
chr5:70859476(+) A-G intron -    22484847
chr5:70859484(+) A-G intron -    22484847
chr5:70859485(+) A-G intron -    22484847
chr5:70859561(+) A-G intron -    22484847
chr5:70859618(+) A-G intron -    22484847
chr5:70859646(+) A-G intron -    22484847
chr5:70859659(+) A-G intron -    22484847
chr5:70859660(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase BDP1
chr5:70751566-70751567(+) m6A 5'UTR//exon       24981863
chr5:70754600-70754601(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70754614-70754615(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70754642-70754643(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70757645-70757646(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70757656-70757657(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70757716-70757717(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr5:70759896-70759897(+) m6A CDS//exon       24981863
chr5:70759909-70759910(+) m6A CDS//exon       24981863
chr5:70759936-70759937(+) m6A CDS//exon       24981863
chr5:70761974-70761975(+) m6A CDS//exon       24981863//22575960
chr5:70782434-70782435(+) m6A CDS//exon       24981863
chr5:70785296-70785297(+) m6A CDS//exon       24981863
chr5:70785325-70785326(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr5:70785389-70785390(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr5:70785438-70785439(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr5:70785449-70785450(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr5:70785501-70785502(+) m6A CDS//exon       24981863
chr5:70797422-70797423(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr5:70797439-70797440(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr5:70797469-70797470(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr5:70798476-70798477(+) m6A CDS//exon       27773535
chr5:70805318-70805319(+) m6A CDS//exon       24284625//22608085
chr5:70805343-70805344(+) m6A CDS//exon       24284625//27773535//22608085
chr5:70805357-70805358(+) m6A CDS//exon       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085
chr5:70805382-70805383(+) m6A CDS//exon       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085
chr5:70805466-70805467(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr5:70805474-70805475(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr5:70805479-70805480(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr5:70805547-70805548(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr5:70805616-70805617(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr5:70805695-70805696(+) m6A CDS//exon       24981863
chr5:70805781-70805782(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70805826-70805827(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70805860-70805861(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70805877-70805878(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70805946-70805947(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70805991-70805992(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70806036-70806037(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70806068-70806069(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70806127-70806128(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70806147-70806148(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70806198-70806199(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70806264-70806265(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70806309-70806310(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70806343-70806344(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70806360-70806361(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70806429-70806430(+) m6A CDS//exon       24209618//24981863//27773535//22608085
chr5:70806441-70806442(+) m6A CDS//exon       24209618//24981863//27773535//22608085
chr5:70806474-70806475(+) m6A CDS//exon       24209618//24981863//27773535//22608085
chr5:70806510-70806511(+) m6A CDS//exon       24209618//24981863//27773535//22608085
chr5:70806525-70806526(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085
chr5:70806591-70806592(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085
chr5:70806687-70806688(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085
chr5:70806700-70806701(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085
chr5:70806771-70806772(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085
chr5:70806845-70806846(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr5:70806849-70806850(+) m6A CDS//exon       24284625
chr5:70806858-70806859(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr5:70806894-70806895(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr5:70806908-70806909(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70809083-70809084(+) m6A CDS//exon       27773535
chr5:70809089-70809090(+) m6A CDS//exon       27773535
chr5:70809094-70809095(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70809123-70809124(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70809165-70809166(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70809180-70809181(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70809206-70809207(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr5:70810804-70810805(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr5:70810854-70810855(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr5:70810864-70810865(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr5:70810889-70810890(+) m6A CDS//exon       22608085
chr5:70811901-70811902(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr5:70811939-70811940(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr5:70811971-70811972(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr5:70811977-70811978(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr5:70811993-70811994(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr5:70811998-70811999(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr5:70812015-70812016(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr5:70812074-70812075(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr5:70813166-70813167(+) m6A CDS//exon       24981863
chr5:70813201-70813202(+) m6A CDS//exon       24981863
chr5:70813245-70813246(+) m6A CDS//exon       24981863
chr5:70813262-70813263(+) m6A CDS//exon       24981863
chr5:70813271-70813272(+) m6A CDS//exon       24981863
chr5:70818127-70818128(+) m6A CDS//exon       24981863
chr5:70818217-70818218(+) m6A CDS//exon       24981863
chr5:70828184-70828185(+) m6A CDS//exon       22575960
chr5:70828198-70828199(+) m6A CDS//exon       22575960
chr5:70828226-70828227(+) m6A CDS//exon       22575960
chr5:70834885-70834886(+) m6A CDS//exon       24981863//22575960
chr5:70834900-70834901(+) m6A CDS//exon       24981863
chr5:70837991-70837992(+) m6A CDS//exon       27773535
chr5:70838007-70838008(+) m6A CDS//exon       27773535
chr5:70838016-70838017(+) m6A CDS//exon       27773535
chr5:70838082-70838083(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr5:70840185-70840186(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr5:70840228-70840229(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr5:70840235-70840236(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr5:70840299-70840300(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr5:70852748-70852749(+) m6A 3'UTR//CDS       27773535//22608085
chr5:70855824-70855825(+) m6A 3'UTR//CDS       27773535//22608085
chr5:70855869-70855870(+) m6A 3'UTR//CDS       22608085
chr5:70855878-70855879(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//22575960//22608085
chr5:70855937-70855938(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//22575960//22608085
chr5:70855996-70855997(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//22575960//22608085
chr5:70856035-70856036(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//22575960//22608085
chr5:70858112-70858113(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//22608085
chr5:70858166-70858167(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//22608085
chr5:70858169-70858170(+) Y 3'UTR//CDS       26075521
chr5:70858199-70858200(+) m6A 3'UTR//CDS       22608085
chr5:70858662-70858663(+) m6A 3'UTR//intron       24981863//22608085
chr5:70858670-70858671(+) m6A 3'UTR//intron       24981863//22608085
chr5:70860779-70860780(+) m6A 3'UTR       22608085
chr5:70860875-70860876(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr5:70860937-70860938(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22575960//22608085
chr5:70860950-70860951(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22575960//22608085
chr5:70861006-70861007(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22575960//22608085
chr5:70861055-70861056(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22575960//22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate BDP1
Chromatin K562 cells     -
Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus Colon cancer cells     24393600
Nucleus HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -

Related Drug Information:


Resource Symbol Drug Name PubChem ID
RNAactDrug kshv-miR-K12-4-3p

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: kshv-miR-K12-4-3p
Interactor2: BDP1

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...