Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | kshv-miR-K12-4-3p | SPP1 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0002192 | 6696 |
Organism | Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | BNSP//BSPI//ETA-1//OPN |
Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | SPP1 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||
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RNALocate | SPP1 |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
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RNAactDrug | kshv-miR-K12-4-3p |
Interactor1: kshv-miR-K12-4-3p | Interactor2: SPP1 |
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Prediction-Evidence | miRanda | |
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Support Database | ViRBase |
PMID | 17500590 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | 293 cells//BJAB cells | Interactor2 expression | None |
Description | 3'UTRs of SPP1, PRG1, ITM2A, S100A2, RAB27A, and THBS1 were also scanned by miRanda, which predicted high probability miRNA binding sites (scores above 190 and/or free energy values below 20 kcal/mol) within their 3'UTRs (Figure S3). |