Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | kshv-miR-K12-4-5p | DNMT1 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0002191 | 1786 |
Organism | Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | ADCADN//AIM//CXXC9//DNMT//HSN1E//m.HsaI//MCMT |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | DNMT1 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | DNMT1 |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | DNMT1 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | DNMT1 |
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Interactor1: kshv-miR-K12-4-5p | Interactor2: DNMT1 |
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Strong-Evidence | Luciferase reporter assay//RT-PCR//Western blot | |
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Weak-Evidence | HITS-CLIP//PAR-CLIP | |
Prediction-Evidence | PARalyzer | |
Support Database | ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg |
PMID | 20071580 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | 293 cells//293T cells | Interactor2 expression | Upregulation |
Description | One viral miRNA, K12-4-5p, was found to have a sequence targeting retinoblastoma (Rb)-like protein 2 (Rbl2), which is a known repressor of DNA methyl transferase 3a and 3b mRNA transcription. We show that ectopic expression of miR-K12-4-5p reduces Rbl2 protein expression and increases DNMT1, -3a, and -3b mRNA levels relative to the levels for control cells. |