Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00453784

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      kshv-miR-K12-6-5p:           TMTC2:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol kshv-miR-K12-6-5p TMTC2
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0002188 160335
Organism Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - IBDBP1

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR TMTC2
chr12:83218838(+) A-I      intronic
chr12:83172307(+) A-I      intronic
chr12:83159268(+) A-I      intronic
chr12:83096490(+) A-I      intronic
chr12:83218809(+) A-I      intronic
chr12:83218789(+) A-I      intronic
chr12:83218783(+) A-I      intronic
chr12:83381115(+) A-I      intronic
chr12:83381113(+) A-I      intronic
chr12:83381137(+) A-I      intronic
chr12:83381128(+) A-I      intronic
chr12:83381124(+) A-I      intronic
chr12:83381083(+) A-I      intronic
chr12:83218850(+) A-I      intronic
chr12:83381112(+) A-I      intronic
chr12:83218780(+) A-I      intronic
chr12:83303326(+) A-I      intronic
chr12:83172335(+) A-I      intronic
chr12:83218853(+) A-I      intronic
chr12:83172322(+) A-I      intronic
chr12:83172316(+) A-I      intronic
chr12:83172315(+) A-I      intronic
chr12:83381109(+) A-I      intronic
chr12:83172317(+) A-I      intronic
chr12:83172311(+) A-I      intronic
chr12:83286873(+) A-I      intronic
chr12:83258385(+) A-I      intronic
chr12:83245089(+) A-I      intronic
chr12:83245082(+) A-I      intronic
chr12:83245033(+) A-I      intronic
chr12:83245023(+) A-I      intronic
chr12:83245022(+) A-I      intronic
chr12:83244722(+) A-I      intronic
chr12:83244696(+) A-I      intronic
chr12:83244571(+) A-I      intronic
chr12:83240119(+) A-I      intronic
chr12:83240082(+) A-I      intronic
chr12:83237005(+) A-I      intronic
chr12:83236991(+) A-I      intronic
chr12:83236966(+) A-I      intronic
chr12:83236965(+) A-I      intronic
chr12:83228751(+) A-I      intronic
chr12:83218855(+) A-I      intronic
chr12:83218770(+) A-I      intronic
chr12:83217856(+) A-I      intronic
chr12:83217853(+) A-I      intronic
chr12:83215538(+) A-I      intronic
chr12:83214688(+) A-I      intronic
chr12:83211000(+) A-I      intronic
chr12:83210995(+) A-I      intronic
chr12:83210864(+) A-I      intronic
chr12:83205826(+) A-I      intronic
chr12:83205806(+) A-I      intronic
chr12:83204827(+) A-I      intronic
chr12:83204802(+) A-I      intronic
chr12:83204780(+) A-I      intronic
chr12:83191874(+) A-I      intronic
chr12:83191864(+) A-I      intronic
chr12:83191818(+) A-I      intronic
chr12:83191797(+) A-I      intronic
chr12:83186269(+) A-I      intronic
chr12:83170410(+) A-I      intronic
chr12:83168242(+) A-I      intronic
chr12:83167518(+) A-I      intronic
chr12:83167392(+) A-I      intronic
chr12:83167379(+) A-I      intronic
chr12:83164451(+) A-I      intronic
chr12:83163529(+) A-I      intronic
chr12:83163175(+) A-I      intronic
chr12:83163091(+) A-I      intronic
chr12:83161237(+) A-I      intronic
chr12:83161206(+) A-I      intronic
chr12:83160704(+) A-I      intronic
chr12:83160658(+) A-I      intronic
chr12:83160576(+) A-I      intronic
chr12:83159475(+) A-I      intronic
chr12:83159306(+) A-I      intronic
chr12:83155989(+) A-I      intronic
chr12:83155928(+) A-I      intronic
chr12:83146247(+) A-I      intronic
chr12:83146197(+) A-I      intronic
chr12:83146145(+) A-I      intronic
chr12:83146114(+) A-I      intronic
chr12:83146077(+) A-I      intronic
chr12:83142588(+) A-I      intronic
chr12:83142536(+) A-I      intronic
chr12:83141993(+) A-I      intronic
chr12:83138134(+) A-I      intronic
chr12:83138091(+) A-I      intronic
chr12:83137116(+) A-I      intronic
chr12:83137103(+) A-I      intronic
chr12:83137099(+) A-I      intronic
chr12:83137034(+) A-I      intronic
chr12:83137024(+) A-I      intronic
chr12:83137018(+) A-I      intronic
chr12:83137010(+) A-I      intronic
chr12:83136503(+) A-I      intronic
chr12:83136492(+) A-I      intronic
chr12:83136438(+) A-I      intronic
chr12:83136435(+) A-I      intronic
chr12:83136399(+) A-I      intronic
chr12:83136376(+) A-I      intronic
chr12:83136355(+) A-I      intronic
chr12:83136317(+) A-I      intronic
chr12:83135299(+) A-I      intronic
chr12:83135290(+) A-I      intronic
chr12:83135216(+) A-I      intronic
chr12:83135183(+) A-I      intronic
chr12:83135109(+) A-I      intronic
chr12:83129680(+) A-I      intronic
chr12:83129672(+) A-I      intronic
chr12:83129567(+) A-I      intronic
chr12:83129542(+) A-I      intronic
chr12:83129537(+) A-I      intronic
chr12:83129251(+) A-I      intronic
chr12:83129229(+) A-I      intronic
chr12:83129224(+) A-I      intronic
chr12:83129175(+) A-I      intronic
chr12:83129168(+) A-I      intronic
chr12:83126321(+) A-I      intronic
chr12:83126310(+) A-I      intronic
chr12:83126304(+) A-I      intronic
chr12:83126261(+) A-I      intronic
chr12:83126215(+) A-I      intronic
chr12:83113087(+) A-I      intronic
chr12:83113020(+) A-I      intronic
chr12:83112953(+) A-I      intronic
chr12:83112952(+) A-I      intronic
chr12:83112930(+) A-I      intronic
chr12:83111232(+) A-I      intronic
chr12:83111193(+) A-I      intronic
chr12:83111143(+) A-I      intronic
chr12:83111129(+) A-I      intronic
chr12:83110401(+) A-I      intronic
chr12:83110282(+) A-I      intronic
chr12:83108929(+) A-I      intronic
chr12:83097419(+) A-I      intronic
chr12:83097417(+) A-I      intronic
chr12:83097414(+) A-I      intronic
chr12:83097407(+) A-I      intronic
chr12:83097377(+) A-I      intronic
chr12:83097309(+) A-I      intronic
chr12:83097301(+) A-I      intronic
chr12:83096890(+) A-I      intronic
chr12:83096592(+) A-I      intronic
chr12:83096475(+) A-I      intronic
chr12:83091132(+) A-I      intronic
chr12:83091083(+) A-I      intronic
chr12:83090984(+) A-I      intronic
chr12:83090977(+) A-I      intronic
chr12:83398807(+) A-I      intronic
chr12:83398806(+) A-I      intronic
chr12:83398805(+) A-I      intronic
chr12:83395162(+) A-I      intronic
chr12:83381096(+) A-I      intronic
chr12:83379059(+) A-I      intronic
chr12:83341997(+) A-I      intronic
chr12:83340759(+) A-I      intronic
chr12:83340733(+) A-I      intronic
chr12:83340728(+) A-I      intronic
chr12:83340662(+) A-I      intronic
chr12:83340638(+) A-I      intronic
chr12:83338216(+) A-I      intronic
chr12:83338186(+) A-I      intronic
chr12:83338108(+) A-I      intronic
chr12:83323053(+) A-I      intronic
chr12:83323023(+) A-I      intronic
chr12:83312637(+) A-I      intronic
chr12:83312636(+) A-I      intronic
chr12:83305611(+) A-I      intronic
chr12:83305510(+) A-I      intronic
chr12:83305481(+) A-I      intronic
chr12:83305462(+) A-I      intronic
chr12:83305456(+) A-I      intronic
chr12:83305443(+) A-I      intronic
chr12:83301902(+) A-I      intronic
chr12:83301695(+) A-I      intronic
chr12:83301651(+) A-I      intronic
chr12:83299571(+) A-I      intronic
chr12:83286922(+) A-I      intronic
chr12:83163507(+) A-I      intronic
chr12:83306566(+) A-I      intronic
chr12:83183795(+) A-I      intronic
chr12:83258883(+) A-I      intronic
chr12:83342063(+) A-I      intronic
chr12:83148353(+) A-I      intronic
chr12:83159302(+) A-I      intronic
chr12:83136555(+) A-I      intronic
chr12:83341884(+) A-I      intronic
chr12:83096938(+) A-I      intronic
chr12:83160717(+) A-I      intronic
chr12:83136966(+) A-I      intronic
chr12:83305498(+) A-I      intronic
chr12:83163476(+) A-I      intronic
chr12:83305572(+) A-I      intronic
chr12:83350495(+) A-I      intronic
chr12:83394098(+) A-I      intronic
chr12:83237623(+) A-I      intronic
chr12:83234662(+) A-I      intronic
chr12:83161123(+) A-I      intronic
chr12:83306541(+) A-I      intronic
chr12:83238369(+) A-I      intronic
chr12:83159374(+) A-I      intronic
chr12:83217893(+) A-I      intronic
chr12:83135154(+) A-I      intronic
chr12:83237507(+) A-I      intronic
chr12:83169130(+) A-I      intronic
chr12:83155863(+) A-I      intronic
chr12:83087537(+) A-I      intronic
chr12:83096464(+) A-I      intronic
chr12:83129673(+) A-I      intronic
chr12:83350455(+) A-I      intronic
chr12:83136950(+) A-I      intronic
chr12:83121380(+) A-I      intronic
chr12:83192095(+) A-I      intronic
chr12:83159399(+) A-I      intronic
chr12:83096535(+) A-I      intronic
chr12:83162996(+) A-I      intronic
chr12:83116442(+) A-I      intronic
chr12:83155953(+) A-I      intronic
chr12:83205666(+) A-I      intronic
chr12:83236992(+) A-I      intronic
chr12:83159303(+) A-I      intronic
chr12:83096451(+) A-I      intronic
chr12:83112991(+) A-I      intronic
chr12:83387024(+) A-I      intronic
chr12:83306565(+) A-I      intronic
chr12:83135229(+) A-I      intronic
chr12:83395267(+) A-I      intronic
chr12:83215532(+) A-I      intronic
chr12:83108817(+) A-I      intronic
chr12:83099923(+) A-I      intronic
chr12:83161246(+) A-I      intronic
chr12:83138260(+) A-I      intronic
chr12:83129557(+) A-I      intronic
chr12:83158056(+) A-I      intronic
chr12:83432934(+) A-I      intronic
chr12:83168279(+) A-I      intronic
chr12:83291578(+) A-I      intronic
chr12:83160720(+) A-I      intronic
chr12:83306558(+) A-I      intronic
chr12:83158046(+) A-I      intronic
chr12:83161281(+) A-I      intronic
chr12:83135176(+) A-I      intronic
chr12:83163556(+) A-I      intronic
chr12:83426463(+) A-I      intronic
chr12:83217709(+) A-I      intronic
chr12:83186346(+) A-I      intronic
chr12:83136967(+) A-I      intronic
chr12:83186349(+) A-I      intronic
chr12:83295161(+) A-I      intronic
chr12:83238430(+) A-I      intronic
chr12:83116100(+) A-I      intronic
chr12:83163187(+) A-I      intronic
chr12:83386863(+) A-I      intronic
chr12:83218878(+) A-I      intronic
chr12:83367962(+) A-I      intronic
chr12:83186325(+) A-I      intronic
chr12:83167427(+) A-I      intronic
chr12:83138044(+) A-I      intronic
chr12:83215464(+) A-I      intronic
chr12:83168320(+) A-I      intronic
chr12:83258420(+) A-I      intronic
chr12:83116427(+) A-I      intronic
chr12:83168238(+) A-I      intronic
chr12:83136500(+) A-I      intronic
chr12:83132671(+) A-I      intronic
chr12:83163555(+) A-I      intronic
chr12:83129707(+) A-I      intronic
chr12:83096664(+) A-I      intronic
chr12:83158051(+) A-I      intronic
chr12:83394043(+) A-I      intronic
chr12:83398711(+) A-I      intronic
chr12:83126329(+) A-I      intronic
chr12:83099926(+) A-I      intronic
chr12:83148437(+) A-I      intronic
chr12:83191869(+) A-I      intronic
chr12:83138043(+) A-I      intronic
chr12:83163088(+) A-I      intronic
chr12:83096465(+) A-I      intronic
chr12:83217908(+) A-I      intronic
chr12:83192096(+) A-I      intronic
chr12:83395231(+) A-I      intronic
chr12:83191868(+) A-I      intronic
chr12:83282802(+) A-I      intronic
chr12:83205754(+) A-I      intronic
chr12:83168145(+) A-I      intronic
chr12:83168953(+) A-I      intronic
chr12:83205831(+) A-I      intronic
chr12:83108970(+) A-I      intronic
chr12:83395359(+) A-I      intronic
chr12:83282257(+) A-I      intronic
chr12:83159333(+) A-I      intronic
chr12:83087650(+) A-I      intronic
chr12:83096706(+) A-I      intronic
chr12:83168142(+) A-I      intronic
chr12:83398693(+) A-I      intronic
chr12:83163573(+) A-I      intronic
chr12:83306653(+) A-I      intronic
chr12:83218706(+) A-I      intronic
chr12:83215628(+) A-I      intronic
chr12:83205797(+) A-I      intronic
chr12:83426614(+) A-I      intronic
chr12:83087532(+) A-I      intronic
chr12:83282267(+) A-I      intronic
chr12:83315805(+) A-I      intronic
chr12:83301816(+) A-I      intronic
chr12:83163454(+) A-I      intronic
chr12:83350287(+) A-I      intronic
chr12:83215449(+) A-I      intronic
chr12:83183763(+) A-I      intronic
chr12:83108975(+) A-I      intronic
chr12:83129701(+) A-I      intronic
chr12:83129148(+) A-I      intronic
chr12:83160678(+) A-I      intronic
chr12:83395170(+) A-I      intronic
chr12:83159198(+) A-I      intronic
chr12:83306596(+) A-I      intronic
chr12:83239982(+) A-I      intronic
chr12:83306475(+) A-I      intronic
chr12:83311957(+) A-I      intronic
chr12:83295217(+) A-I      intronic
chr12:83157978(+) A-I      intronic
chr12:83367964(+) A-I      intronic
chr12:83087494(+) A-I      intronic
chr12:83186437(+) A-I      intronic
chr12:83395161(+) A-I      intronic
chr12:83160639(+) A-I      intronic
chr12:83306673(+) A-I      intronic
chr12:83096444(+) A-I      intronic
chr12:83215519(+) A-I      intronic
chr12:83159239(+) A-I      intronic
chr12:83135116(+) A-I      intronic
chr12:83426520(+) A-I      intronic
chr12:83335812(+) A-I      intronic
chr12:83163135(+) A-I      intronic
chr12:83183821(+) A-I      intronic
chr12:83295184(+) A-I      intronic
chr12:83218748(+) A-I      intronic
chr12:83096855(+) A-I      intronic
chr12:83291488(+) A-I      intronic
chr12:83237596(+) A-I      intronic
chr12:83168280(+) A-I      intronic
chr12:83301119(+) A-I      intronic
chr12:83218613(+) A-I      intronic
chr12:83395294(+) A-I      intronic
chr12:83135219(+) A-I      intronic
chr12:83158034(+) A-I      intronic
chr12:83306632(+) A-I      intronic
chr12:83380961(+) A-I      intronic
chr12:83237642(+) A-I      intronic
chr12:83215533(+) A-I      intronic
chr12:83129609(+) A-I      intronic
chr12:83214293(+) A-I      intronic
chr12:83108809(+) A-I      intronic
chr12:83335708(+) A-I      intronic
chr12:83218635(+) A-I      intronic
chr12:83163663(+) A-I      intronic
chr12:83350298(+) A-I      intronic
chr12:83096936(+) A-I      intronic
chr12:83163070(+) A-I      intronic
chr12:83218707(+) A-I      intronic
chr12:83246918(+) A-I      intronic
chr12:83184421(+) A-I      intronic
chr12:83136579(+) A-I      intronic
chr12:83300297(+) A-I      intronic
chr12:83192008(+) A-I      intronic
chr12:83395293(+) A-I      intronic
chr12:83126383(+) A-I      intronic
chr12:83159405(+) A-I      intronic
chr12:83258933(+) A-I      intronic
chr12:83238393(+) A-I      intronic
chr12:83191756(+) A-I      intronic
chr12:83218709(+) A-I      intronic
chr12:83160580(+) A-I      intronic
chr12:83137968(+) A-I      intronic
chr12:83168382(+) A-I      intronic
chr12:83163161(+) A-I      intronic
chr12:83258929(+) A-I      intronic
chr12:83096900(+) A-I      intronic
chr12:83158078(+) A-I      intronic
chr12:83160695(+) A-I      intronic
chr12:83311808(+) A-I      intronic
chr12:83238434(+) A-I      intronic
chr12:83215571(+) A-I      intronic
chr12:83091025(+) A-I      intronic
chr12:83315759(+) A-I      intronic
chr12:83170443(+) A-I      intronic
chr12:83170531(+) A-I      intronic
chr12:83142377(+) A-I      intronic
chr12:83334722(+) A-I      intronic
chr12:83135193(+) A-I      intronic
chr12:83096428(+) A-I      intronic
chr12:83113038(+) A-I      intronic
chr12:83394120(+) A-I      intronic
chr12:83205696(+) A-I      intronic
chr12:83137158(+) A-I      intronic
chr12:83295267(+) A-I      intronic
chr12:83300985(+) A-I      intronic
chr12:83334769(+) A-I      intronic
chr12:83218851(+) A-I      intronic
chr12:83334717(+) A-I      intronic
chr12:83160584(+) A-I      intronic
chr12:83146030(+) A-I      intronic
chr12:83315868(+) A-I      intronic
chr12:83214906(+) A-I      intronic
chr12:83087675(+) A-I      intronic
chr12:83334707(+) A-I      intronic
chr12:83137073(+) A-I      intronic
chr12:83168244(+) A-I      intronic
chr12:83162974(+) A-I      intronic
chr12:83096829(+) A-I      intronic
chr12:83214771(+) A-I      intronic
chr12:83258937(+) A-I      intronic
chr12:83301095(+) A-I      intronic
chr12:83137100(+) A-I      intronic
chr12:83217721(+) A-I      intronic
chr12:83159277(+) A-I      intronic
chr12:83120402(+) A-I      intronic
chr12:83108863(+) A-I      intronic
chr12:83129734(+) A-I      intronic
chr12:83109009(+) A-I      intronic
chr12:83300293(+) A-I      intronic
chr12:83159410(+) A-I      intronic
chr12:83129545(+) A-I      intronic
chr12:83106837(+) A-I      intronic
chr12:83162963(+) A-I      intronic
chr12:83167420(+) A-I      intronic
chr12:83158155(+) A-I      intronic
chr12:83501677(+) A-I      intronic
chr12:83129543(+) A-I      intronic
chr12:83148352(+) A-I      intronic
chr12:83276688(+) A-I      intronic
chr12:83367952(+) A-I      intronic
chr12:83161108(+) A-I      intronic
chr12:83159443(+) A-I      intronic
chr12:83215397(+) A-I      intronic
chr12:83191877(+) A-I      intronic
chr12:83106098(+) A-I      intronic
chr12:83167440(+) A-I      intronic
chr12:83334737(+) A-I      intronic
chr12:83503156(+) A-I      intronic
chr12:83246093(+) A-I      intronic
chr12:83247301(+) A-I      intronic
chr12:83159301(+) A-I      intronic
chr12:83192541(+) A-I      intronic
chr12:83305435(+) A-I      intronic
chr12:83311747(+) A-I      intronic
chr12:83136577(+) A-I      intronic
chr12:83091016(+) A-I      intronic
chr12:83137109(+) A-I      intronic
chr12:83096644(+) A-I      intronic
chr12:83214254(+) A-I      intronic
chr12:83109039(+) A-I      intronic
chr12:83168999(+) A-I      intronic
chr12:83129664(+) A-I      intronic
chr12:83215555(+) A-I      intronic
chr12:83218643(+) A-I      intronic
chr12:83096845(+) A-I      intronic
chr12:83111026(+) A-I      intronic
chr12:83148259(+) A-I      intronic
chr12:83381092(+) A-I      intronic
chr12:83215396(+) A-I      intronic
chr12:83218879(+) A-I      intronic
chr12:83182539(+) A-I      intronic
chr12:83169149(+) A-I      intronic
chr12:83282803(+) A-I      intronic
chr12:83135324(+) A-I      intronic
chr12:83136329(+) A-I      intronic
chr12:83159185(+) A-I      intronic
chr12:83163564(+) A-I      intronic
chr12:83303371(+) A-I      intronic
chr12:83168239(+) A-I      intronic
chr12:83192439(+) A-I      intronic
chr12:83137151(+) A-I      intronic
chr12:83315841(+) A-I      intronic
chr12:83315765(+) A-I      intronic
chr12:83163590(+) A-I      intronic
chr12:83442710(+) A-I      intronic
chr12:83304789(+) A-I      intronic
chr12:83186375(+) A-I      intronic
chr12:83097358(+) A-I      intronic
chr12:83136416(+) A-I      intronic
chr12:83138281(+) A-I      intronic
chr12:83426485(+) A-I      intronic
chr12:83137044(+) A-I      intronic
chr12:83172765(+) A-I      intronic
chr12:83170453(+) A-I      intronic
chr12:83192475(+) A-I      intronic
chr12:83159402(+) A-I      intronic
chr12:83159322(+) A-I      intronic
chr12:83341890(+) A-I      intronic
chr12:83279359(+) A-I      intronic
chr12:83287047(+) A-I      intronic
chr12:83158035(+) A-I      intronic
chr12:83159199(+) A-I      intronic
chr12:83395303(+) A-I      intronic
chr12:83263357(+) A-I      intronic
chr12:83096524(+) A-I      intronic
chr12:83258884(+) A-I      intronic
chr12:83160681(+) A-I      intronic
chr12:83306662(+) A-I      intronic
chr12:83132672(+) A-I      intronic
chr12:83238397(+) A-I      intronic
chr12:83218667(+) A-I      intronic
chr12:83192400(+) A-I      intronic
chr12:83192241(+) A-I      intronic
chr12:83162997(+) A-I      intronic
chr12:83163134(+) A-I      intronic
chr12:83159234(+) A-I      intronic
chr12:83381166(+) A-I      intronic
chr12:83155875(+) A-I      intronic
chr12:83218708(+) A-I      intronic
chr12:83126384(+) A-I      intronic
chr12:83129684(+) A-I      intronic
chr12:83159298(+) A-I      intronic
chr12:83341891(+) A-I      intronic
chr12:83281603(+) A-I      intronic
chr12:83129331(+) A-I      intronic
chr12:83173517(+) A-I      intronic
chr12:83258865(+) A-I      intronic
chr12:83141969(+) A-I      intronic
chr12:83159278(+) A-I      intronic
chr12:83136486(+) A-I      intronic
chr12:83129558(+) A-I      intronic
chr12:83301832(+) A-I      intronic
chr12:83167339(+) A-I      intronic
chr12:83161255(+) A-I      intronic
chr12:83159385(+) A-I      intronic
chr12:83299548(+) A-I      intronic
chr12:83095419(+) A-I      intronic
chr12:83204799(+) A-I      intronic
chr12:83163502(+) A-I      intronic
chr12:83161290(+) A-I      intronic
chr12:83160703(+) A-I      intronic
chr12:83306459(+) A-I      intronic
chr12:83161181(+) A-I      intronic
chr12:83168975(+) A-I      intronic
chr12:83305554(+) A-I      intronic
chr12:83213547(+) A-I      intronic
chr12:83276712(+) A-I      intronic
chr12:83097527(+) A-I      intronic
chr12:83170295(+) A-I      intronic
chr12:83160642(+) A-I      intronic
chr12:83381136(+) A-I      intronic
chr12:83136428(+) A-I      intronic
chr12:83129568(+) A-I      intronic
chr12:83237639(+) A-I      intronic
chr12:83120496(+) A-I      intronic
chr12:83305569(+) A-I      intronic
chr12:83096684(+) A-I      intronic
chr12:83113002(+) A-I      intronic
chr12:83159332(+) A-I      intronic
chr12:83258753(+) A-I      intronic
chr12:83142512(+) A-I      intronic
chr12:83218634(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED TMTC2
chr12:83096524(+) A-I intron -    22327324
chr12:83159239(+) A-I intron -    22327324
chr12:83501677(+) A-G intron -    22484847
chr12:83503156(+) A-G intron -    22484847
chr12:83096524(+) A-G intron -    22484847
chr12:83096855(+) A-G intron -    22484847
chr12:83096900(+) A-G intron -    22484847
chr12:83096938(+) A-G intron -    22484847
chr12:83136555(+) A-G intron -    22484847
chr12:83136577(+) A-G intron -    22484847
chr12:83137100(+) A-G intron -    22484847
chr12:83137109(+) A-G intron -    22484847
chr12:83157978(+) A-G intron -    22484847
chr12:83159185(+) A-G intron -    22484847
chr12:83159234(+) A-G intron -    22484847
chr12:83159239(+) A-G intron -    22484847
chr12:83160681(+) A-G intron -    22484847
chr12:83162996(+) A-G intron -    22484847
chr12:83162997(+) A-G intron -    22484847
chr12:83163135(+) A-G intron -    22484847
chr12:83168142(+) A-G intron -    22484847
chr12:83192475(+) A-G intron -    22484847
chr12:83258753(+) A-G intron -    22484847
chr12:83087650(+) A-G intron -    22484847
chr12:83096444(+) A-G intron -    22484847
chr12:83096684(+) A-G intron -    22484847
chr12:83096936(+) A-G intron -    22484847
chr12:83097358(+) A-G intron -    22484847
chr12:83097527(+) A-G intron -    22484847
chr12:83106837(+) A-G intron -    22484847
chr12:83108809(+) A-G intron -    22484847
chr12:83108817(+) A-G intron -    22484847
chr12:83109009(+) A-G intron -    22484847
chr12:83112991(+) A-G intron -    22484847
chr12:83113002(+) A-G intron -    22484847
chr12:83126329(+) A-G intron -    22484847
chr12:83129148(+) A-G intron -    22484847
chr12:83129331(+) A-G intron -    22484847
chr12:83129543(+) A-G intron -    22484847
chr12:83129545(+) A-G intron -    22484847
chr12:83129557(+) A-G intron -    22484847
chr12:83129558(+) A-G intron -    22484847
chr12:83129568(+) A-G intron -    22484847
chr12:83129673(+) A-G intron -    22484847
chr12:83129701(+) A-G intron -    22484847
chr12:83129734(+) A-G intron -    22484847
chr12:83135116(+) A-G intron -    22484847
chr12:83135219(+) A-G intron -    22484847
chr12:83135324(+) A-G intron -    22484847
chr12:83136329(+) A-G intron -    22484847
chr12:83136416(+) A-G intron -    22484847
chr12:83136428(+) A-G intron -    22484847
chr12:83136500(+) A-G intron -    22484847
chr12:83136579(+) A-G intron -    22484847
chr12:83136950(+) A-G intron -    22484847
chr12:83136967(+) A-G intron -    22484847
chr12:83142512(+) A-G intron -    22484847
chr12:83143535(+) G-T intron -    22484847
chr12:83143536(+) A-T intron -    22484847
chr12:83146030(+) A-G intron -    22484847
chr12:83155953(+) A-G intron -    22484847
chr12:83158034(+) A-G intron -    22484847
chr12:83158056(+) A-G intron -    22484847
chr12:83159198(+) A-G intron -    22484847
chr12:83159301(+) A-G intron -    22484847
chr12:83159332(+) A-G intron -    22484847
chr12:83159333(+) A-G intron -    22484847
chr12:83159405(+) A-G intron -    22484847
chr12:83160580(+) A-G intron -    22484847
chr12:83160584(+) A-G intron -    22484847
chr12:83160639(+) A-G intron -    22484847
chr12:83160642(+) A-G intron -    22484847
chr12:83160678(+) A-G intron -    22484847
chr12:83160695(+) A-G intron -    22484847
chr12:83160703(+) A-G intron -    22484847
chr12:83160717(+) A-G intron -    22484847
chr12:83160720(+) A-G intron -    22484847
chr12:83161123(+) A-G intron -    22484847
chr12:83161181(+) A-G intron -    22484847
chr12:83162974(+) A-G intron -    22484847
chr12:83163070(+) A-G intron -    22484847
chr12:83163454(+) A-G intron -    22484847
chr12:83163476(+) A-G intron -    22484847
chr12:83163502(+) A-G intron -    22484847
chr12:83163507(+) A-G intron -    22484847
chr12:83163556(+) A-G intron -    22484847
chr12:83163564(+) A-G intron -    22484847
chr12:83163573(+) A-G intron -    22484847
chr12:83163590(+) A-G intron -    22484847
chr12:83163663(+) A-G intron -    22484847
chr12:83167339(+) A-G intron -    22484847
chr12:83167420(+) A-G intron -    22484847
chr12:83167427(+) A-G intron -    22484847
chr12:83167440(+) A-G intron -    22484847
chr12:83168238(+) A-G intron -    22484847
chr12:83168239(+) A-G intron -    22484847
chr12:83168244(+) A-G intron -    22484847
chr12:83186325(+) A-G intron -    22484847
chr12:83186346(+) A-G intron -    22484847
chr12:83186349(+) A-G intron -    22484847
chr12:83191756(+) A-G intron -    22484847
chr12:83191868(+) A-G intron -    22484847
chr12:83191869(+) A-G intron -    22484847
chr12:83192541(+) A-G intron -    22484847
chr12:83205831(+) A-G intron -    22484847
chr12:83205840(+) A-T intron -    22484847
chr12:83214906(+) A-G intron -    22484847
chr12:83215397(+) A-G intron -    22484847
chr12:83215464(+) A-G intron -    22484847
chr12:83217709(+) A-G intron -    22484847
chr12:83217721(+) A-G intron -    22484847
chr12:83217893(+) A-G intron -    22484847
chr12:83217908(+) A-G intron -    22484847
chr12:83236992(+) A-G intron -    22484847
chr12:83246093(+) A-G intron -    22484847
chr12:83258419(+) T-C intron -    22484847
chr12:83258420(+) A-G intron -    22484847
chr12:83281603(+) A-G intron -    22484847
chr12:83282257(+) A-G intron -    22484847
chr12:83282267(+) A-G intron -    22484847
chr12:83282803(+) A-G intron -    22484847
chr12:83303309(+) T-C intron -    22484847
chr12:83305498(+) A-G intron -    22484847
chr12:83305572(+) A-G intron -    22484847
chr12:83341884(+) A-G intron -    22484847
chr12:83350287(+) A-G intron -    22484847
chr12:83350298(+) A-G intron -    22484847
chr12:83426484(+) C-A intron -    22484847
chr12:83426485(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase TMTC2
chr12:83081021-83081022(+) m6A 5'UTR//exon       25456834//24981863
chr12:83081062-83081063(+) m6A 5'UTR//exon       25456834//24981863
chr12:83081221-83081222(+) m6A 5'UTR//exon       25456834//24981863
chr12:83154674-83154675(+) m6A CDS//intron       -
chr12:83154685-83154686(+) m6A CDS//intron       -
chr12:83154692-83154693(+) m6A CDS//intron       -
chr12:83250801-83250802(+) m6A CDS//exon//intron       22608085
chr12:83250811-83250812(+) m6A CDS//exon//intron       22608085
chr12:83250825-83250826(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085
chr12:83250864-83250865(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085
chr12:83250931-83250932(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085
chr12:83251050-83251051(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085
chr12:83251175-83251176(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr12:83251206-83251207(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr12:83251232-83251233(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr12:83251265-83251266(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr12:83251334-83251335(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//22608085
chr12:83289603-83289604(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr12:83289684-83289685(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//22608085
chr12:83289688-83289689(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863
chr12:83289711-83289712(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//22608085
chr12:83289732-83289733(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085
chr12:83289780-83289781(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085
chr12:83289851-83289852(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr12:83289870-83289871(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr12:83289898-83289899(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr12:83289942-83289943(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr12:83289962-83289963(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr12:83289994-83289995(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr12:83290026-83290027(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr12:83290034-83290035(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr12:83290094-83290095(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr12:83290116-83290117(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22575960//22608085
chr12:83290170-83290171(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085
chr12:83290342-83290343(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863
chr12:83290349-83290350(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863
chr12:83290368-83290369(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863
chr12:83290413-83290414(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863
chr12:83526007-83526008(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863
chr12:83526038-83526039(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//22608085
chr12:83526119-83526120(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr12:83526127-83526128(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr12:83526140-83526141(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr12:83526153-83526154(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr12:83526162-83526163(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr12:83526223-83526224(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr12:83526228-83526229(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr12:83526264-83526265(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr12:83526272-83526273(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr12:83526366-83526367(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085
chr12:83526397-83526398(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085
chr12:83526404-83526405(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr12:83526419-83526420(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr12:83526424-83526425(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr12:83526520-83526521(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate TMTC2
Exosome Blood     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells     -

Related Drug Information:


Resource Symbol Drug Name PubChem ID
RNAactDrug kshv-miR-K12-6-5p

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: kshv-miR-K12-6-5p
Interactor2: TMTC2

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//Rep//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...