Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00446867

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      kshv-miR-K12-8-3p:  MIMAT0002186          DNAL1:  NM_031427     

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Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	kshv-miR-K12-8-3p	DNAL1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0002186	83544
Organism	Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	C14orf168//CILD16//LC1

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	DNAL1	chr14:74164296(+) A-I      3'UTR chr14:74165334(+) A-I      3'UTR chr14:74165383(+) A-I      3'UTR chr14:74166984(+) A-I      3'UTR chr14:74140542(+) A-I      intronic chr14:74140521(+) A-I      intronic chr14:74158526(+) A-I      intronic chr14:74166904(+) A-I      3'UTR chr14:74165466(+) A-I      3'UTR chr14:74165407(+) A-I      3'UTR chr14:74166877(+) A-I      3'UTR chr14:74166893(+) A-I      3'UTR chr14:74166902(+) A-I      3'UTR chr14:74140547(+) A-I      intronic chr14:74164287(+) A-I      3'UTR chr14:74164293(+) A-I      3'UTR chr14:74116725(+) A-I      intronic chr14:74159173(+) A-I      intronic chr14:74139643(+) A-I      intronic chr14:74159748(+) A-I      intronic chr14:74142018(+) A-I      intronic chr14:74140473(+) A-I      intronic chr14:74125994(+) A-I      intronic chr14:74142944(+) A-I      intronic chr14:74114745(+) A-I      intronic chr14:74140485(+) A-I      intronic chr14:74113425(+) A-I      intronic chr14:74142534(+) A-I      intronic 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Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	DNAL1	chr14:74164191(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr14:74164226(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr14:74164245(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr14:74164325(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr14:74164332(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr14:74165276(+) A-I intron -    21960545 chr14:74165375(+) A-I intron -    21960545 chr14:74166869(+) A-I intron -    21960545 chr14:74166935(+) A-I intron -    21960545 chr14:74166936(+) A-I intron -    21960545 chr14:74165327(+) A-G intron -    22484847 chr14:74165330(+) A-G intron -    22484847 chr14:74165375(+) A-G intron -    22484847 chr14:74165376(+) A-G intron -    22484847 chr14:74166078(+) A-G intron -    22484847 chr14:74166138(+) A-G intron -    22484847 chr14:74166845(+) A-G intron -    22484847 chr14:74166927(+) A-G intron -    22484847 chr14:74166935(+) A-G intron -    22484847 chr14:74167043(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	DNAL1	chr14:74117906-74117907(+) m6A 5'UTR//intron       24981863 chr14:74125558-74125559(+) m6A 5'UTR//CDS//intron       24981863//22608085 chr14:74125593-74125594(+) m6A 5'UTR//CDS//intron       24981863 chr14:74128709-74128710(+) m6A 5'UTR//CDS//intron       24981863 chr14:74138247-74138248(+) m6A 5'UTR//CDS//intron       24981863 chr14:74166976-74166977(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	kshv-miR-K12-8-3p	Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
	DNAL1	Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Exosome Blood     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: kshv-miR-K12-8-3p
Interactor2: DNAL1

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg