Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00446720

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      kshv-miR-K12-8-3p:           KDM3B:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol kshv-miR-K12-8-3p KDM3B
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0002186 51780
Organism Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - 5qNCA//C5orf7//DIJOS//JMJD1B//NET22

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR KDM3B
chr5:137703608(+) A-I      intronic
chr5:137720971(+) A-I      intronic
chr5:137720775(+) A-I      intronic
chr5:137720766(+) A-I      intronic
chr5:137720348(+) A-I      intronic
chr5:137720307(+) A-I      intronic
chr5:137720266(+) A-I      intronic
chr5:137720262(+) A-I      intronic
chr5:137720251(+) A-I      intronic
chr5:137720232(+) A-I      intronic
chr5:137720225(+) A-I      intronic
chr5:137719559(+) A-I      intronic
chr5:137719518(+) A-I      intronic
chr5:137719492(+) A-I      intronic
chr5:137719488(+) A-I      intronic
chr5:137769016(+) A-I      intronic
chr5:137769000(+) A-I      intronic
chr5:137768984(+) A-I      intronic
chr5:137769368(+) A-I      intronic
chr5:137769359(+) A-I      intronic
chr5:137769295(+) A-I      intronic
chr5:137769226(+) A-I      intronic
chr5:137769044(+) A-I      intronic
chr5:137769037(+) A-I      intronic
chr5:137768905(+) A-I      intronic
chr5:137768901(+) A-I      intronic
chr5:137768709(+) A-I      intronic
chr5:137768983(+) A-I      intronic
chr5:137768966(+) A-I      intronic
chr5:137693170(+) A-I      intronic
chr5:137693179(+) A-I      intronic
chr5:137693192(+) A-I      intronic
chr5:137694950(+) A-I      intronic
chr5:137694951(+) A-I      intronic
chr5:137697759(+) A-I      intronic
chr5:137697789(+) A-I      intronic
chr5:137697832(+) A-I      intronic
chr5:137697833(+) A-I      intronic
chr5:137697915(+) A-I      intronic
chr5:137699723(+) A-I      intronic
chr5:137699791(+) A-I      intronic
chr5:137699842(+) A-I      intronic
chr5:137701454(+) A-I      intronic
chr5:137701487(+) A-I      intronic
chr5:137701565(+) A-I      intronic
chr5:137701568(+) A-I      intronic
chr5:137701607(+) A-I      intronic
chr5:137702132(+) A-I      intronic
chr5:137702145(+) A-I      intronic
chr5:137758294(+) A-I      intronic
chr5:137758286(+) A-I      intronic
chr5:137703515(+) A-I      intronic
chr5:137703516(+) A-I      intronic
chr5:137703550(+) A-I      intronic
chr5:137731937(+) A-I      intronic
chr5:137706559(+) A-I      intronic
chr5:137706647(+) A-I      intronic
chr5:137706916(+) A-I      intronic
chr5:137707681(+) A-I      intronic
chr5:137707757(+) A-I      intronic
chr5:137708850(+) A-I      intronic
chr5:137708864(+) A-I      intronic
chr5:137708873(+) A-I      intronic
chr5:137758279(+) A-I      intronic
chr5:137758278(+) A-I      intronic
chr5:137748858(+) A-I      intronic
chr5:137725610(+) A-I      intronic
chr5:137718945(+) A-I      intronic
chr5:137706598(+) A-I      intronic
chr5:137708968(+) A-I      intronic
chr5:137758274(+) A-I      intronic
chr5:137768147(+) A-I      intronic
chr5:137767639(+) A-I      intronic
chr5:137758264(+) A-I      intronic
chr5:137758261(+) A-I      intronic
chr5:137739503(+) A-I      intronic
chr5:137739500(+) A-I      intronic
chr5:137739496(+) A-I      intronic
chr5:137739472(+) A-I      intronic
chr5:137736292(+) A-I      intronic
chr5:137736288(+) A-I      intronic
chr5:137736256(+) A-I      intronic
chr5:137736249(+) A-I      intronic
chr5:137736239(+) A-I      intronic
chr5:137719429(+) A-I      intronic
chr5:137719424(+) A-I      intronic
chr5:137717998(+) A-I      intronic
chr5:137717984(+) A-I      intronic
chr5:137709714(+) A-I      intronic
chr5:137768618(+) A-I      intronic
chr5:137768595(+) A-I      intronic
chr5:137768573(+) A-I      intronic
chr5:137768551(+) A-I      intronic
chr5:137768186(+) A-I      intronic
chr5:137767606(+) A-I      intronic
chr5:137766341(+) A-I      intronic
chr5:137758698(+) A-I      intronic
chr5:137755223(+) A-I      intronic
chr5:137752710(+) A-I      intronic
chr5:137752690(+) A-I      intronic
chr5:137752671(+) A-I      intronic
chr5:137752603(+) A-I      intronic
chr5:137752184(+) A-I      intronic
chr5:137752174(+) A-I      intronic
chr5:137752093(+) A-I      intronic
chr5:137717961(+) A-I      intronic
chr5:137717947(+) A-I      intronic
chr5:137717935(+) A-I      intronic
chr5:137717931(+) A-I      intronic
chr5:137751239(+) A-I      intronic
chr5:137751166(+) A-I      intronic
chr5:137719480(+) A-I      intronic
chr5:137719477(+) A-I      intronic
chr5:137719457(+) A-I      intronic
chr5:137719437(+) A-I      intronic
chr5:137719410(+) A-I      intronic
chr5:137750531(+) A-I      intronic
chr5:137750499(+) A-I      intronic
chr5:137750474(+) A-I      intronic
chr5:137750410(+) A-I      intronic
chr5:137750380(+) A-I      intronic
chr5:137750128(+) A-I      intronic
chr5:137750061(+) A-I      intronic
chr5:137749924(+) A-I      intronic
chr5:137749560(+) A-I      intronic
chr5:137749541(+) A-I      intronic
chr5:137749465(+) A-I      intronic
chr5:137749423(+) A-I      intronic
chr5:137749022(+) A-I      intronic
chr5:137748529(+) A-I      intronic
chr5:137748284(+) A-I      intronic
chr5:137748263(+) A-I      intronic
chr5:137748258(+) A-I      intronic
chr5:137748236(+) A-I      intronic
chr5:137748183(+) A-I      intronic
chr5:137747950(+) A-I      intronic
chr5:137747910(+) A-I      intronic
chr5:137747904(+) A-I      intronic
chr5:137747875(+) A-I      intronic
chr5:137747874(+) A-I      intronic
chr5:137747873(+) A-I      intronic
chr5:137747554(+) A-I      intronic
chr5:137747458(+) A-I      intronic
chr5:137747453(+) A-I      intronic
chr5:137745629(+) A-I      intronic
chr5:137741824(+) A-I      intronic
chr5:137742248(+) A-I      intronic
chr5:137742104(+) A-I      intronic
chr5:137742078(+) A-I      intronic
chr5:137741954(+) A-I      intronic
chr5:137741949(+) A-I      intronic
chr5:137741856(+) A-I      intronic
chr5:137741855(+) A-I      intronic
chr5:137741852(+) A-I      intronic
chr5:137741819(+) A-I      intronic
chr5:137741814(+) A-I      intronic
chr5:137740898(+) A-I      intronic
chr5:137740826(+) A-I      intronic
chr5:137740812(+) A-I      intronic
chr5:137740776(+) A-I      intronic
chr5:137740706(+) A-I      intronic
chr5:137740664(+) A-I      intronic
chr5:137740652(+) A-I      intronic
chr5:137740651(+) A-I      intronic
chr5:137740490(+) A-I      intronic
chr5:137740281(+) A-I      intronic
chr5:137740245(+) A-I      intronic
chr5:137740158(+) A-I      intronic
chr5:137719013(+) A-I      intronic
chr5:137719008(+) A-I      intronic
chr5:137719002(+) A-I      intronic
chr5:137718994(+) A-I      intronic
chr5:137718927(+) A-I      intronic
chr5:137718902(+) A-I      intronic
chr5:137740082(+) A-I      intronic
chr5:137718847(+) A-I      intronic
chr5:137718452(+) A-I      intronic
chr5:137711929(+) A-I      intronic
chr5:137711495(+) A-I      intronic
chr5:137711470(+) A-I      intronic
chr5:137711466(+) A-I      intronic
chr5:137711329(+) A-I      intronic
chr5:137711298(+) A-I      intronic
chr5:137711136(+) A-I      intronic
chr5:137709426(+) A-I      intronic
chr5:137709409(+) A-I      intronic
chr5:137709408(+) A-I      intronic
chr5:137709357(+) A-I      intronic
chr5:137768181(+) A-I      intronic
chr5:137739420(+) A-I      intronic
chr5:137737730(+) A-I      intronic
chr5:137737721(+) A-I      intronic
chr5:137737718(+) A-I      intronic
chr5:137736403(+) A-I      intronic
chr5:137736332(+) A-I      intronic
chr5:137736328(+) A-I      intronic
chr5:137736318(+) A-I      intronic
chr5:137768161(+) A-I      intronic
chr5:137709251(+) A-I      intronic
chr5:137719549(+) A-I      intronic
chr5:137736296(+) A-I      intronic
chr5:137736264(+) A-I      intronic
chr5:137736202(+) A-I      intronic
chr5:137736173(+) A-I      intronic
chr5:137735987(+) A-I      intronic
chr5:137735080(+) A-I      intronic
chr5:137735025(+) A-I      intronic
chr5:137735017(+) A-I      intronic
chr5:137734838(+) A-I      intronic
chr5:137734768(+) A-I      intronic
chr5:137734664(+) A-I      intronic
chr5:137734641(+) A-I      intronic
chr5:137734639(+) A-I      intronic
chr5:137733394(+) A-I      intronic
chr5:137733290(+) A-I      intronic
chr5:137733287(+) A-I      intronic
chr5:137731958(+) A-I      intronic
chr5:137719025(+) A-I      intronic
chr5:137731924(+) A-I      intronic
chr5:137731914(+) A-I      intronic
chr5:137731911(+) A-I      intronic
chr5:137731902(+) A-I      intronic
chr5:137731559(+) A-I      intronic
chr5:137729965(+) A-I      intronic
chr5:137729942(+) A-I      intronic
chr5:137729911(+) A-I      intronic
chr5:137729866(+) A-I      intronic
chr5:137729847(+) A-I      intronic
chr5:137725688(+) A-I      intronic
chr5:137725685(+) A-I      intronic
chr5:137725648(+) A-I      intronic
chr5:137724483(+) A-I      intronic
chr5:137724429(+) A-I      intronic
chr5:137724394(+) A-I      intronic
chr5:137724309(+) A-I      intronic
chr5:137724290(+) A-I      intronic
chr5:137724262(+) A-I      intronic
chr5:137724171(+) A-I      intronic
chr5:137724164(+) A-I      intronic
chr5:137723711(+) A-I      intronic
chr5:137723611(+) A-I      intronic
chr5:137723607(+) A-I      intronic
chr5:137723604(+) A-I      intronic
chr5:137723568(+) A-I      intronic
chr5:137721181(+) A-I      intronic
chr5:137721142(+) A-I      intronic
chr5:137720991(+) A-I      intronic
chr5:137720973(+) A-I      intronic
chr5:137758729(+) A-I      intronic
chr5:137699787(+) A-I      intronic
chr5:137767609(+) A-I      intronic
chr5:137747528(+) A-I      intronic
chr5:137770149(+) A-I      intronic
chr5:137742511(+) A-I      intronic
chr5:137708814(+) A-I      intronic
chr5:137734851(+) A-I      intronic
chr5:137740228(+) A-I      intronic
chr5:137740872(+) A-I      intronic
chr5:137748518(+) A-I      intronic
chr5:137742572(+) A-I      intronic
chr5:137748176(+) A-I      intronic
chr5:137702160(+) A-I      intronic
chr5:137706708(+) A-I      intronic
chr5:137769196(+) A-I      intronic
chr5:137740553(+) A-I      intronic
chr5:137696555(+) A-I      intronic
chr5:137740266(+) A-I      intronic
chr5:137721061(+) A-I      intronic
chr5:137740185(+) A-I      intronic
chr5:137769901(+) A-I      intronic
chr5:137750030(+) A-I      intronic
chr5:137769909(+) A-I      intronic
chr5:137719439(+) A-I      intronic
chr5:137731218(+) A-I      intronic
chr5:137740261(+) A-I      intronic
chr5:137748185(+) A-I      intronic
chr5:137736014(+) A-I      intronic
chr5:137752163(+) A-I      intronic
chr5:137747522(+) A-I      intronic
chr5:137741928(+) A-I      intronic
chr5:137701599(+) A-I      intronic
chr5:137732601(+) A-I      intronic
chr5:137720171(+) A-I      intronic
chr5:137747555(+) A-I      intronic
chr5:137750388(+) A-I      intronic
chr5:137724058(+) A-I      intronic
chr5:137768211(+) A-I      intronic
chr5:137725694(+) A-I      intronic
chr5:137720510(+) A-I      intronic
chr5:137748857(+) A-I      intronic
chr5:137769691(+) A-I      intronic
chr5:137701156(+) A-I      intronic
chr5:137725649(+) A-I      intronic
chr5:137704022(+) A-I      intronic
chr5:137769372(+) A-I      intronic
chr5:137708813(+) A-I      intronic
chr5:137724200(+) A-I      intronic
chr5:137740650(+) A-I      intronic
chr5:137749452(+) A-I      intronic
chr5:137740833(+) A-I      intronic
chr5:137732626(+) A-I      intronic
chr5:137766310(+) A-I      intronic
chr5:137750510(+) A-I      intronic
chr5:137706991(+) A-I      intronic
chr5:137740222(+) A-I      intronic
chr5:137748566(+) A-I      intronic
chr5:137725678(+) A-I      intronic
chr5:137768514(+) A-I      intronic
chr5:137740543(+) A-I      intronic
chr5:137769692(+) A-I      intronic
chr5:137720811(+) A-I      intronic
chr5:137720907(+) A-I      intronic
chr5:137768707(+) A-I      intronic
chr5:137752636(+) A-I      intronic
chr5:137740930(+) A-I      intronic
chr5:137749972(+) A-I      intronic
chr5:137748081(+) A-I      intronic
chr5:137724053(+) A-I      intronic
chr5:137709272(+) A-I      intronic
chr5:137703542(+) A-I      intronic
chr5:137720202(+) A-I      intronic
chr5:137740598(+) A-I      intronic
chr5:137740517(+) A-I      intronic
chr5:137750525(+) A-I      intronic
chr5:137703449(+) A-I      intronic
chr5:137750382(+) A-I      intronic
chr5:137742801(+) A-I      intronic
chr5:137748951(+) A-I      intronic
chr5:137719088(+) A-I      intronic
chr5:137768640(+) A-I      intronic
chr5:137742147(+) A-I      intronic
chr5:137703945(+) A-I      intronic
chr5:137769881(+) A-I      intronic
chr5:137719629(+) A-I      intronic
chr5:137752005(+) A-I      intronic
chr5:137747982(+) A-I      intronic
chr5:137751659(+) A-I      intronic
chr5:137739109(+) A-I      intronic
chr5:137737735(+) A-I      intronic
chr5:137752253(+) A-I      intronic
chr5:137740850(+) A-I      intronic
chr5:137750547(+) A-I      intronic
chr5:137752609(+) A-I      intronic
chr5:137720380(+) A-I      intronic
chr5:137718967(+) A-I      intronic
chr5:137725739(+) A-I      intronic
chr5:137719512(+) A-I      intronic
chr5:137736395(+) A-I      intronic
chr5:137721039(+) A-I      intronic
chr5:137768201(+) A-I      intronic
chr5:137751646(+) A-I      intronic
chr5:137767500(+) A-I      intronic
chr5:137724295(+) A-I      intronic
chr5:137740692(+) A-I      intronic
chr5:137736042(+) A-I      intronic
chr5:137719011(+) A-I      intronic
chr5:137732597(+) A-I      intronic
chr5:137769984(+) A-I      intronic
chr5:137701221(+) A-I      intronic
chr5:137724110(+) A-I      intronic
chr5:137729988(+) A-I      intronic
chr5:137749424(+) A-I      intronic
chr5:137748184(+) A-I      intronic
chr5:137769197(+) A-I      intronic
chr5:137751266(+) A-I      intronic
chr5:137731270(+) A-I      intronic
chr5:137741195(+) A-I      intronic
chr5:137750493(+) A-I      intronic
chr5:137740682(+) A-I      intronic
chr5:137766921(+) A-I      intronic
chr5:137748935(+) A-I      intronic
chr5:137732046(+) A-I      intronic
chr5:137724142(+) A-I      intronic
chr5:137768155(+) A-I      intronic
chr5:137742530(+) A-I      intronic
chr5:137742855(+) A-I      intronic
chr5:137750609(+) A-I      intronic
chr5:137745369(+) A-I      intronic
chr5:137748350(+) A-I      intronic
chr5:137768563(+) A-I      intronic
chr5:137720948(+) A-I      intronic
chr5:137708774(+) A-I      intronic
chr5:137769983(+) A-I      intronic
chr5:137769152(+) A-I      intronic
chr5:137750020(+) A-I      intronic
chr5:137720985(+) A-I      intronic
chr5:137769618(+) A-I      intronic
chr5:137736021(+) A-I      intronic
chr5:137706967(+) A-I      intronic
chr5:137742849(+) A-I      intronic
chr5:137766360(+) A-I      intronic
chr5:137749427(+) A-I      intronic
chr5:137751715(+) A-I      intronic
chr5:137749426(+) A-I      intronic
chr5:137719814(+) A-I      intronic
chr5:137740201(+) A-I      intronic
chr5:137767508(+) A-I      intronic
chr5:137758844(+) A-I      intronic
chr5:137697847(+) A-I      intronic
chr5:137752117(+) A-I      intronic
chr5:137751681(+) A-I      intronic
chr5:137752126(+) A-I      intronic
chr5:137720482(+) A-I      intronic
chr5:137750635(+) A-I      intronic
chr5:137768142(+) A-I      intronic
chr5:137736196(+) A-I      intronic
chr5:137752643(+) A-I      intronic
chr5:137731435(+) A-I      intronic
chr5:137721048(+) A-I      intronic
chr5:137718969(+) A-I      intronic
chr5:137718128(+) A-I      intronic
chr5:137739219(+) A-I      intronic
chr5:137730008(+) A-I      intronic
chr5:137752024(+) A-I      intronic
chr5:137752610(+) A-I      intronic
chr5:137762502(+) A-I      intronic
chr5:137769360(+) A-I      intronic
chr5:137701567(+) A-I      intronic
chr5:137734839(+) A-I      intronic
chr5:137716839(+) A-I      intronic
chr5:137719788(+) A-I      intronic
chr5:137739498(+) A-I      intronic
chr5:137719050(+) A-I      intronic
chr5:137708868(+) A-I      intronic
chr5:137708882(+) A-I      intronic
chr5:137769925(+) A-I      intronic
chr5:137742561(+) A-I      intronic
chr5:137749435(+) A-I      intronic
chr5:137742814(+) A-I      intronic
chr5:137768156(+) A-I      intronic
chr5:137768599(+) A-I      intronic
chr5:137740159(+) A-I      intronic
chr5:137740555(+) A-I      intronic
chr5:137769586(+) A-I      intronic
chr5:137742949(+) A-I      intronic
chr5:137699336(+) A-I      intronic
chr5:137770090(+) A-I      intronic
chr5:137706995(+) A-I      intronic
chr5:137697850(+) A-I      intronic
chr5:137708886(+) A-I      intronic
chr5:137770157(+) A-I      intronic
chr5:137724075(+) A-I      intronic
chr5:137739491(+) A-I      intronic
chr5:137768197(+) A-I      intronic
chr5:137731226(+) A-I      intronic
chr5:137720226(+) A-I      intronic
chr5:137769528(+) A-I      intronic
chr5:137766882(+) A-I      intronic
chr5:137748819(+) A-I      intronic
chr5:137769698(+) A-I      intronic
chr5:137704034(+) A-I      intronic
chr5:137703622(+) A-I      intronic
chr5:137719487(+) A-I      intronic
chr5:137740992(+) A-I      intronic
chr5:137739466(+) A-I      intronic
chr5:137699881(+) A-I      intronic
chr5:137718020(+) A-I      intronic
chr5:137709872(+) A-I      intronic
chr5:137736160(+) A-I      intronic
chr5:137725576(+) A-I      intronic
chr5:137748141(+) A-I      intronic
chr5:137719770(+) A-I      intronic
chr5:137703448(+) A-I      intronic
chr5:137750488(+) A-I      intronic
chr5:137752784(+) A-I      intronic
chr5:137742936(+) A-I      intronic
chr5:137701616(+) A-I      intronic
chr5:137750389(+) A-I      intronic
chr5:137706572(+) A-I      intronic
chr5:137725800(+) A-I      intronic
chr5:137736377(+) A-I      intronic
chr5:137701541(+) A-I      intronic
chr5:137702295(+) A-I      intronic
chr5:137697799(+) A-I      intronic
chr5:137719691(+) A-I      intronic
chr5:137720944(+) A-I      intronic
chr5:137736345(+) A-I      intronic
chr5:137768171(+) A-I      intronic
chr5:137747660(+) A-I      intronic
chr5:137751196(+) A-I      intronic
chr5:137704185(+) A-I      intronic
chr5:137741798(+) A-I      intronic
chr5:137739189(+) A-I      intronic
chr5:137720103(+) A-I      intronic
chr5:137709252(+) A-I      intronic
chr5:137752563(+) A-I      intronic
chr5:137758182(+) A-I      intronic
chr5:137750602(+) A-I      intronic
chr5:137752573(+) A-I      intronic
chr5:137720027(+) A-I      intronic
chr5:137750485(+) A-I      intronic
chr5:137742157(+) A-I      intronic
chr5:137718434(+) A-I      intronic
chr5:137724381(+) A-I      intronic
chr5:137720791(+) A-I      intronic
chr5:137769989(+) A-I      intronic
chr5:137748882(+) A-I      intronic
chr5:137724390(+) A-I      intronic
chr5:137742858(+) A-I      intronic
chr5:137737848(+) A-I      intronic
chr5:137708804(+) A-I      intronic
chr5:137749516(+) A-I      intronic
chr5:137717960(+) A-I      intronic
chr5:137699667(+) A-I      intronic
chr5:137723649(+) A-I      intronic
chr5:137708918(+) A-I      intronic
chr5:137703543(+) A-I      intronic
chr5:137707711(+) A-I      intronic
chr5:137707691(+) A-I      intronic
chr5:137748432(+) A-I      intronic
chr5:137768196(+) A-I      intronic
chr5:137720074(+) A-I      intronic
chr5:137718928(+) A-I      intronic
chr5:137709880(+) A-I      intronic
chr5:137751260(+) A-I      intronic
chr5:137731183(+) A-I      intronic
chr5:137742937(+) A-I      intronic
chr5:137720899(+) A-I      intronic
chr5:137742775(+) A-I      intronic
chr5:137749582(+) A-I      intronic
chr5:137749346(+) A-I      intronic
chr5:137721022(+) A-I      intronic
chr5:137718993(+) A-I      intronic
chr5:137719452(+) A-I      intronic
chr5:137697895(+) A-I      intronic
chr5:137729916(+) A-I      intronic
chr5:137752571(+) A-I      intronic
chr5:137720972(+) A-I      intronic
chr5:137769281(+) A-I      intronic
chr5:137750053(+) A-I      intronic
chr5:137769838(+) A-I      intronic
chr5:137711341(+) A-I      intronic
chr5:137740463(+) A-I      intronic
chr5:137752730(+) A-I      intronic
chr5:137740152(+) A-I      intronic
chr5:137742174(+) A-I      intronic
chr5:137768170(+) A-I      intronic
chr5:137752596(+) A-I      intronic
chr5:137724451(+) A-I      intronic
chr5:137735000(+) A-I      intronic
chr5:137755090(+) A-I      intronic
chr5:137735144(+) A-I      intronic
chr5:137751361(+) A-I      intronic
chr5:137752164(+) A-I      intronic
chr5:137723499(+) A-I      intronic
chr5:137719473(+) A-I      intronic
chr5:137751701(+) A-I      intronic
chr5:137741758(+) A-I      intronic
chr5:137699654(+) A-I      intronic
chr5:137742836(+) A-I      intronic
chr5:137729983(+) A-I      intronic
chr5:137755132(+) A-I      intronic
chr5:137741049(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED KDM3B
chr5:137740463(+) A-I intron -    22327324
chr5:137741049(+) A-I intron -    21960545   //22327324
chr5:137735942(+) A-I intron -    21960545
chr5:137735943(+) A-I intron -    21960545
chr5:137736042(+) A-I intron -    21960545
chr5:137736173(+) A-I intron -    21960545
chr5:137736395(+) A-I intron -    21960545
chr5:137737096(+) A-I intron -    21960545
chr5:137738836(+) A-I intron -    21960545
chr5:137741053(+) A-I intron -    21960545
chr5:137741758(+) A-I intron -    21960545
chr5:137741852(+) A-I intron -    21960545
chr5:137748391(+) A-I intron -    21960545
chr5:137748566(+) A-I intron -    21960545
chr5:137748567(+) A-I intron -    21960545
chr5:137750525(+) A-I intron -    21960545
chr5:137750547(+) A-I intron -    21960545
chr5:137751339(+) A-I intron -    21960545
chr5:137752784(+) A-I intron -    21960545
chr5:137758182(+) A-I intron -    21960545
chr5:137693860(+) T-C intron -    22484847
chr5:137696441(+) T-C intron -    22484847
chr5:137697794(+) A-G intron -    22484847
chr5:137697799(+) A-G intron -    22484847
chr5:137697844(+) A-G intron -    22484847
chr5:137697847(+) A-G intron -    22484847
chr5:137699336(+) A-G intron -    22484847
chr5:137699654(+) A-G intron -    22484847
chr5:137699667(+) A-G intron -    22484847
chr5:137701130(+) A-G intron -    22484847
chr5:137701156(+) A-G intron -    22484847
chr5:137701599(+) A-G intron -    22484847
chr5:137702089(+) A-G intron -    22484847
chr5:137702248(+) A-G intron -    22484847
chr5:137703448(+) A-G intron -    22484847
chr5:137703449(+) A-G intron -    22484847
chr5:137703542(+) A-G intron -    22484847
chr5:137703543(+) A-G intron -    22484847
chr5:137703581(+) A-G intron -    22484847
chr5:137703622(+) A-G intron -    22484847
chr5:137703945(+) A-G intron -    22484847
chr5:137703975(+) A-G intron -    22484847
chr5:137704022(+) A-G intron -    22484847
chr5:137704034(+) A-G intron -    22484847
chr5:137704185(+) A-G intron -    22484847
chr5:137706572(+) A-G intron -    22484847
chr5:137706578(+) A-G intron -    22484847
chr5:137706708(+) A-G intron -    22484847
chr5:137707722(+) A-G intron -    22484847
chr5:137708813(+) A-G intron -    22484847
chr5:137708882(+) A-G intron -    22484847
chr5:137709252(+) A-G intron -    22484847
chr5:137709272(+) A-G intron -    22484847
chr5:137711341(+) A-G intron -    22484847
chr5:137718020(+) A-G intron -    22484847
chr5:137718424(+) A-G intron -    22484847
chr5:137718434(+) A-G intron -    22484847
chr5:137718928(+) A-G intron -    22484847
chr5:137718967(+) A-G intron -    22484847
chr5:137718969(+) A-G intron -    22484847
chr5:137718993(+) A-G intron -    22484847
chr5:137719011(+) A-G intron -    22484847
chr5:137719030(+) A-G intron -    22484847
chr5:137719452(+) A-G intron -    22484847
chr5:137719473(+) A-G intron -    22484847
chr5:137719476(+) A-G intron -    22484847
chr5:137719478(+) A-G intron -    22484847
chr5:137719483(+) A-G intron -    22484847
chr5:137719502(+) A-G intron -    22484847
chr5:137719512(+) A-G intron -    22484847
chr5:137719519(+) A-G intron -    22484847
chr5:137719788(+) A-G intron -    22484847
chr5:137720103(+) A-G intron -    22484847
chr5:137720171(+) A-G intron -    22484847
chr5:137720202(+) A-G intron -    22484847
chr5:137720510(+) A-G intron -    22484847
chr5:137720811(+) A-G intron -    22484847
chr5:137720850(+) A-G intron -    22484847
chr5:137720884(+) A-G intron -    22484847
chr5:137720899(+) A-G intron -    22484847
chr5:137720944(+) A-G intron -    22484847
chr5:137720963(+) A-G intron -    22484847
chr5:137720972(+) A-G intron -    22484847
chr5:137721022(+) A-G intron -    22484847
chr5:137721039(+) A-G intron -    22484847
chr5:137721048(+) A-G intron -    22484847
chr5:137721061(+) A-G intron -    22484847
chr5:137721102(+) A-G intron -    22484847
chr5:137721105(+) A-G intron -    22484847
chr5:137723499(+) A-G intron -    22484847
chr5:137723502(+) A-G intron -    22484847
chr5:137723649(+) A-G intron -    22484847
chr5:137725576(+) A-G intron -    22484847
chr5:137725649(+) A-G intron -    22484847
chr5:137725653(+) A-G intron -    22484847
chr5:137725666(+) A-G intron -    22484847
chr5:137725678(+) A-G intron -    22484847
chr5:137725694(+) A-G intron -    22484847
chr5:137725733(+) A-G intron -    22484847
chr5:137725739(+) A-G intron -    22484847
chr5:137725800(+) A-G intron -    22484847
chr5:137731183(+) A-G intron -    22484847
chr5:137732626(+) A-G intron -    22484847
chr5:137735000(+) A-G intron -    22484847
chr5:137735144(+) A-G intron -    22484847
chr5:137736014(+) A-G intron -    22484847
chr5:137736042(+) A-G intron -    22484847
chr5:137736377(+) A-G intron -    22484847
chr5:137736395(+) A-G intron -    22484847
chr5:137737735(+) A-G intron -    22484847
chr5:137739466(+) A-G intron -    22484847
chr5:137739519(+) C-A intron -    22484847
chr5:137740185(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740205(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740261(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740462(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740463(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740543(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740650(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740682(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740692(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740704(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740797(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740800(+) T-C intron -    22484847
chr5:137740820(+) T-C intron -    22484847
chr5:137740832(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740833(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740850(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740872(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740916(+) A-G intron -    22484847
chr5:137740992(+) A-G intron -    22484847
chr5:137741049(+) A-G intron -    22484847
chr5:137741116(+) A-G intron -    22484847
chr5:137741201(+) G-A intron -    22484847
chr5:137741758(+) A-G intron -    22484847
chr5:137741798(+) A-G intron -    22484847
chr5:137741832(+) A-G intron -    22484847
chr5:137742147(+) A-G intron -    22484847
chr5:137742530(+) A-G intron -    22484847
chr5:137742736(+) A-G intron -    22484847
chr5:137742744(+) A-G intron -    22484847
chr5:137742775(+) A-G intron -    22484847
chr5:137742800(+) A-G intron -    22484847
chr5:137742836(+) A-G intron -    22484847
chr5:137742936(+) A-G intron -    22484847
chr5:137742937(+) A-G intron -    22484847
chr5:137742949(+) A-G intron -    22484847
chr5:137747528(+) A-G intron -    22484847
chr5:137747878(+) A-G intron -    22484847
chr5:137748184(+) A-G intron -    22484847
chr5:137748935(+) A-G intron -    22484847
chr5:137748951(+) A-G intron -    22484847
chr5:137748992(+) A-G intron -    22484847
chr5:137749422(+) A-G intron -    22484847
chr5:137749426(+) A-G intron -    22484847
chr5:137749427(+) A-G intron -    22484847
chr5:137749435(+) A-G intron -    22484847
chr5:137749516(+) A-G intron -    22484847
chr5:137749582(+) A-G intron -    22484847
chr5:137749972(+) A-G intron -    22484847
chr5:137750020(+) A-G intron -    22484847
chr5:137750053(+) A-G intron -    22484847
chr5:137750370(+) A-G intron -    22484847
chr5:137750382(+) A-G intron -    22484847
chr5:137750388(+) A-G intron -    22484847
chr5:137750389(+) A-G intron -    22484847
chr5:137750406(+) A-G intron -    22484847
chr5:137750485(+) A-G intron -    22484847
chr5:137750493(+) A-G intron -    22484847
chr5:137750525(+) A-G intron -    22484847
chr5:137750547(+) A-G intron -    22484847
chr5:137750600(+) C-A intron -    22484847
chr5:137750602(+) A-G intron -    22484847
chr5:137750609(+) A-G intron -    22484847
chr5:137750635(+) A-G intron -    22484847
chr5:137751260(+) A-G intron -    22484847
chr5:137751646(+) A-G intron -    22484847
chr5:137751681(+) A-G intron -    22484847
chr5:137751701(+) A-G intron -    22484847
chr5:137751715(+) A-G intron -    22484847
chr5:137752164(+) A-G intron -    22484847
chr5:137752563(+) A-G intron -    22484847
chr5:137752573(+) A-G intron -    22484847
chr5:137752574(+) A-G intron -    22484847
chr5:137752596(+) A-G intron -    22484847
chr5:137752609(+) A-G intron -    22484847
chr5:137752610(+) A-G intron -    22484847
chr5:137752636(+) A-G intron -    22484847
chr5:137752643(+) A-G intron -    22484847
chr5:137752784(+) A-G intron -    22484847
chr5:137755132(+) A-G intron -    22484847
chr5:137758064(+) A-G intron -    22484847
chr5:137764065(+) T-C intron -    22484847
chr5:137766360(+) A-G intron -    22484847
chr5:137766365(+) A-G intron -    22484847
chr5:137768155(+) A-G intron -    22484847
chr5:137768208(+) A-G intron -    22484847
chr5:137768237(+) A-G intron -    22484847
chr5:137768904(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase KDM3B
chr5:137688539-137688540(+) m6A CDS       24209618
chr5:137688668-137688669(+) m6A CDS       24209618
chr5:137713427-137713428(+) m6A CDS//exon       -
chr5:137713443-137713444(+) m6A CDS//exon       -
chr5:137713462-137713463(+) m6A CDS//exon       -
chr5:137717233-137717234(+) m6A CDS//exon//intron       27773535
chr5:137717291-137717292(+) m6A exon//intron       24981863//27773535
chr5:137717308-137717309(+) m6A exon//intron       24981863//27773535
chr5:137721752-137721753(+) m1A CDS//intron       26863196
chr5:137721804-137721805(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr5:137721843-137721844(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr5:137721858-137721859(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr5:137721981-137721982(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr5:137722025-137722026(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr5:137722059-137722060(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr5:137722103-137722104(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr5:137722137-137722138(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085
chr5:137722154-137722155(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085
chr5:137722162-137722163(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085
chr5:137722224-137722225(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr5:137722242-137722243(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr5:137722262-137722263(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr5:137722276-137722277(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr5:137726819-137726820(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085
chr5:137726823-137726824(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863
chr5:137726873-137726874(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr5:137726891-137726892(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr5:137726917-137726918(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr5:137726984-137726985(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr5:137726994-137726995(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr5:137727049-137727050(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//25456834//24981863//26404942//22608085
chr5:137727089-137727090(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//25456834//24981863//26404942//22608085
chr5:137727255-137727256(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618
chr5:137727390-137727391(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625
chr5:137727593-137727594(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//24981863//22608085
chr5:137727610-137727611(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085
chr5:137727680-137727681(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr5:137727741-137727742(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr5:137727746-137727747(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr5:137727752-137727753(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr5:137727814-137727815(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr5:137727934-137727935(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr5:137729025-137729026(+) Y 3'UTR//5'UTR//CDS       25219674
chr5:137750887-137750888(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863
chr5:137754763-137754764(+) Cm 3'UTR//CDS//exon       -
chr5:137754914-137754915(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625
chr5:137756451-137756452(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625
chr5:137756540-137756541(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625
chr5:137756562-137756563(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625
chr5:137756587-137756588(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625
chr5:137756597-137756598(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625
chr5:137756607-137756608(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625
chr5:137765525-137765526(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863
chr5:137765948-137765949(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863
chr5:137765962-137765963(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863
chr5:137766007-137766008(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863
chr5:137771514-137771515(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22575960//22608085
chr5:137771597-137771598(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085
chr5:137771658-137771659(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate kshv-miR-K12-8-3p
Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
KDM3B
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus Colon cancer cells     24393600
Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: kshv-miR-K12-8-3p
Interactor2: KDM3B

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...