Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00438441

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.6002

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      kshv-miR-K12-2-5p:  MIMAT0002183          LUC7L2:  NM_016019     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	kshv-miR-K12-2-5p	LUC7L2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0002183	51631
Organism	Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CGI-59//CGI-74//LUC7B2

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	LUC7L2	chr7:139053330(+) A-I      intronic chr7:139053331(+) A-I      intronic chr7:139080945(+) A-I      intronic chr7:139080594(+) A-I      intronic chr7:139080410(+) A-I      intronic chr7:139078402(+) A-I      intronic chr7:139078329(+) A-I      intronic chr7:139078322(+) A-I      intronic chr7:139078266(+) A-I      intronic chr7:139077905(+) A-I      intronic chr7:139077837(+) A-I      intronic chr7:139103697(+) A-I      intronic chr7:139105170(+) A-I      intronic chr7:139103693(+) A-I      intronic chr7:139105169(+) A-I      intronic chr7:139103668(+) A-I      intronic chr7:139103663(+) A-I      intronic chr7:139077827(+) A-I      intronic chr7:139074818(+) A-I      intronic chr7:139072568(+) A-I      intronic chr7:139077863(+) A-I      intronic chr7:139053414(+) A-I      intronic chr7:139086328(+) A-I      intronic chr7:139086684(+) A-I      intronic chr7:139086737(+) A-I      intronic chr7:139087296(+) A-I      intronic chr7:139087408(+) A-I      intronic chr7:139087430(+) A-I      intronic chr7:139088994(+) A-I      intronic chr7:139089159(+) A-I      intronic chr7:139089180(+) A-I      intronic chr7:139103593(+) A-I      intronic chr7:139053363(+) A-I      intronic chr7:139053324(+) A-I      intronic chr7:139053301(+) A-I      intronic chr7:139067282(+) A-I      intronic chr7:139053283(+) A-I      intronic chr7:139053275(+) A-I      intronic chr7:139067223(+) A-I      intronic chr7:139067209(+) A-I      intronic chr7:139067168(+) A-I      intronic chr7:139085059(+) A-I      intronic chr7:139085053(+) A-I      intronic chr7:139085084(+) A-I      intronic chr7:139085096(+) A-I      intronic chr7:139053251(+) A-I      intronic chr7:139051957(+) A-I      intronic chr7:139051952(+) A-I      intronic chr7:139051947(+) A-I      intronic chr7:139051940(+) A-I      intronic chr7:139051939(+) A-I      intronic chr7:139051927(+) A-I      intronic chr7:139051859(+) A-I      intronic chr7:139051852(+) A-I      intronic chr7:139048953(+) A-I      intronic chr7:139064845(+) A-I      intronic chr7:139064838(+) A-I      intronic chr7:139063137(+) A-I      intronic chr7:139085108(+) A-I      intronic chr7:139085039(+) A-I      intronic chr7:139085024(+) A-I      intronic chr7:139084355(+) A-I      intronic chr7:139084345(+) A-I      intronic chr7:139081173(+) A-I      intronic chr7:139081130(+) A-I      intronic chr7:139055358(+) A-I      intronic chr7:139064746(+) A-I      intronic chr7:139051803(+) A-I      intronic chr7:139066457(+) A-I      intronic chr7:139105809(+) A-I      intronic chr7:139051802(+) A-I      intronic chr7:139105089(+) A-I      intronic chr7:139105050(+) A-I      intronic chr7:139105584(+) A-I      intronic chr7:139103746(+) A-I      intronic chr7:139103768(+) A-I      intronic chr7:139063128(+) A-I      intronic chr7:139063198(+) A-I      intronic chr7:139063105(+) A-I      intronic chr7:139062841(+) A-I      intronic chr7:139063982(+) A-I      intronic chr7:139063986(+) A-I      intronic chr7:139064069(+) A-I      intronic chr7:139064451(+) A-I      intronic chr7:139064478(+) A-I      intronic chr7:139053298(+) A-I      intronic chr7:139064765(+) A-I      intronic chr7:139064772(+) A-I      intronic chr7:139064778(+) A-I      intronic chr7:139064827(+) A-I      intronic chr7:139064831(+) A-I      intronic chr7:139064840(+) A-I      intronic chr7:139064858(+) A-I      intronic chr7:139103710(+) A-I      intronic chr7:139064877(+) A-I      intronic chr7:139105600(+) A-I      intronic chr7:139105603(+) A-I      intronic chr7:139105604(+) A-I      intronic chr7:139105644(+) A-I      intronic chr7:139105645(+) A-I      intronic chr7:139105662(+) A-I      intronic chr7:139065266(+) A-I      intronic chr7:139065298(+) A-I      intronic chr7:139062816(+) A-I      intronic chr7:139062713(+) A-I      intronic chr7:139062699(+) A-I      intronic chr7:139066422(+) A-I      intronic chr7:139066435(+) A-I      intronic chr7:139066448(+) A-I      intronic chr7:139105706(+) A-I      intronic chr7:139105674(+) A-I      intronic chr7:139085144(+) A-I      intronic chr7:139087504(+) A-I      intronic chr7:139085116(+) A-I      intronic chr7:139103736(+) A-I      intronic chr7:139105710(+) A-I      intronic chr7:139105564(+) A-I      intronic chr7:139105229(+) A-I      intronic chr7:139105212(+) A-I      intronic chr7:139062666(+) A-I      intronic chr7:139062595(+) A-I      intronic chr7:139105210(+) A-I      intronic chr7:139062257(+) A-I      intronic chr7:139062141(+) A-I      intronic chr7:139061989(+) A-I      intronic chr7:139055462(+) A-I      intronic chr7:139055373(+) A-I      intronic chr7:139105209(+) A-I      intronic chr7:139105692(+) A-I      intronic chr7:139105684(+) A-I      intronic chr7:139053328(+) A-I      intronic chr7:139103728(+) A-I      intronic chr7:139105183(+) A-I      intronic chr7:139103726(+) A-I      intronic chr7:139103701(+) A-I      intronic chr7:139063853(+) A-I      intronic chr7:139086419(+) A-I      intronic chr7:139078019(+) A-I      intronic chr7:139078390(+) A-I      intronic chr7:139053309(+) A-I      intronic chr7:139064753(+) A-I      intronic chr7:139053246(+) A-I      intronic chr7:139063667(+) A-I      intronic chr7:139105129(+) A-I      intronic chr7:139067260(+) A-I      intronic chr7:139094936(+) A-I      intronic chr7:139077851(+) A-I      intronic chr7:139064880(+) A-I      intronic chr7:139078030(+) A-I      intronic chr7:139053468(+) A-I      intronic chr7:139051898(+) A-I      intronic chr7:139068597(+) A-I      intronic chr7:139051883(+) A-I      intronic chr7:139062676(+) A-I      intronic chr7:139055422(+) A-I      intronic chr7:139099893(+) A-I      intronic chr7:139081138(+) A-I      intronic chr7:139066259(+) A-I      intronic chr7:139103718(+) A-I      intronic chr7:139055330(+) A-I      intronic chr7:139063992(+) A-I      intronic chr7:139055463(+) A-I      intronic chr7:139064486(+) A-I      intronic chr7:139055290(+) A-I      intronic chr7:139085167(+) A-I      intronic chr7:139080599(+) A-I      intronic chr7:139086338(+) A-I      intronic chr7:139078063(+) A-I      intronic chr7:139086292(+) A-I      intronic chr7:139053333(+) A-I      intronic chr7:139063190(+) A-I      intronic chr7:139055340(+) A-I      intronic chr7:139069507(+) A-I      intronic chr7:139101873(+) A-I      ncRNA chr7:139055227(+) A-I      intronic chr7:139062663(+) A-I      intronic chr7:139094832(+) A-I      intronic chr7:139064415(+) A-I      intronic chr7:139086420(+) A-I      intronic chr7:139051938(+) A-I      intronic chr7:139053405(+) A-I      intronic chr7:139051884(+) A-I      intronic chr7:139055284(+) A-I      intronic chr7:139066767(+) A-I      intronic chr7:139062754(+) A-I      intronic chr7:139077886(+) A-I      intronic chr7:139085140(+) A-I      intronic chr7:139064705(+) A-I      intronic chr7:139103644(+) A-I      intronic chr7:139063129(+) A-I      intronic chr7:139063138(+) A-I      intronic chr7:139103649(+) A-I      intronic chr7:139101904(+) A-I      ncRNA chr7:139055410(+) A-I      intronic chr7:139065226(+) A-I      intronic chr7:139055367(+) A-I      intronic chr7:139100523(+) A-I      intronic chr7:139074728(+) A-I      intronic chr7:139064521(+) A-I      intronic chr7:139064768(+) A-I      intronic chr7:139055406(+) A-I      intronic chr7:139051797(+) A-I      intronic chr7:139098468(+) A-I      intronic chr7:139064766(+) A-I      intronic chr7:139065085(+) A-I      intronic chr7:139080968(+) A-I      intronic chr7:139085135(+) A-I      intronic chr7:139065082(+) A-I      intronic chr7:139086720(+) A-I      intronic chr7:139078131(+) A-I      intronic chr7:139101987(+) A-I      ncRNA chr7:139099772(+) A-I      intronic chr7:139098299(+) A-I      intronic chr7:139077893(+) A-I      intronic chr7:139081141(+) A-I      intronic chr7:139078223(+) A-I      intronic chr7:139086382(+) A-I      intronic chr7:139051980(+) A-I      intronic chr7:139065129(+) A-I      intronic chr7:139057431(+) A-I      intronic chr7:139051844(+) A-I      intronic chr7:139053319(+) A-I      intronic chr7:139064666(+) A-I      intronic chr7:139074752(+) A-I      intronic chr7:139105005(+) A-I      intronic chr7:139063114(+) A-I      intronic chr7:139103662(+) A-I      intronic chr7:139066605(+) A-I      intronic chr7:139055362(+) A-I      intronic chr7:139103813(+) A-I      intronic chr7:139055401(+) A-I      intronic chr7:139086618(+) A-I      intronic chr7:139064804(+) A-I      intronic chr7:139099762(+) A-I      intronic chr7:139078097(+) A-I      intronic chr7:139057476(+) A-I      intronic chr7:139055297(+) A-I      intronic chr7:139084422(+) A-I      intronic chr7:139075107(+) A-I      intronic chr7:139065084(+) A-I      intronic chr7:139065134(+) A-I      intronic chr7:139064846(+) A-I      intronic chr7:139086724(+) A-I      intronic chr7:139062664(+) A-I      intronic chr7:139057453(+) A-I      intronic chr7:139053364(+) A-I      intronic chr7:139063990(+) A-I      intronic chr7:139103654(+) A-I      intronic chr7:139085148(+) A-I      intronic chr7:139081164(+) A-I      intronic chr7:139084397(+) A-I      intronic chr7:139099652(+) A-I      intronic chr7:139055366(+) A-I      intronic chr7:139098310(+) A-I      intronic chr7:139066273(+) A-I      intronic chr7:139064675(+) A-I      intronic chr7:139099745(+) A-I      intronic chr7:139105107(+) A-I      intronic chr7:139074784(+) A-I      intronic chr7:139064473(+) A-I      intronic chr7:139080438(+) A-I      intronic chr7:139065062(+) A-I      intronic chr7:139074731(+) A-I      intronic chr7:139100532(+) A-I      intronic chr7:139081035(+) A-I      intronic chr7:139064912(+) A-I      intronic chr7:139080988(+) A-I      intronic chr7:139064759(+) A-I      intronic chr7:139103737(+) A-I      intronic chr7:139098264(+) A-I      intronic chr7:139074801(+) A-I      intronic chr7:139062681(+) A-I      intronic chr7:139070233(+) A-I      intronic chr7:139051901(+) A-I      intronic chr7:139080442(+) A-I      intronic chr7:139085176(+) A-I      intronic chr7:139074699(+) A-I      intronic chr7:139074704(+) A-I      intronic chr7:139062184(+) A-I      intronic chr7:139053322(+) A-I      intronic chr7:139051817(+) A-I      intronic chr7:139063119(+) A-I      intronic chr7:139051857(+) A-I      intronic chr7:139078117(+) A-I      intronic chr7:139063226(+) A-I      intronic chr7:139072033(+) A-I      intronic chr7:139065231(+) A-I      intronic chr7:139074788(+) A-I      intronic chr7:139065265(+) A-I      intronic chr7:139055342(+) A-I      intronic chr7:139067130(+) A-I      intronic chr7:139077866(+) A-I      intronic chr7:139062690(+) A-I      intronic chr7:139068202(+) A-I      intronic chr7:139098374(+) A-I      intronic chr7:139053445(+) A-I      intronic chr7:139077954(+) A-I      intronic chr7:139105211(+) A-I      intronic chr7:139055381(+) A-I      intronic chr7:139055481(+) A-I      intronic chr7:139063281(+) A-I      intronic chr7:139086688(+) A-I      intronic chr7:139067252(+) A-I      intronic chr7:139053466(+) A-I      intronic chr7:139103816(+) A-I      intronic chr7:139062769(+) A-I      intronic chr7:139103609(+) A-I      intronic chr7:139053229(+) A-I      intronic chr7:139098445(+) A-I      intronic chr7:139055303(+) A-I      intronic chr7:139085069(+) A-I      intronic chr7:139098463(+) A-I      intronic chr7:139103805(+) A-I      intronic chr7:139099733(+) A-I      intronic chr7:139064429(+) A-I      intronic chr7:139099766(+) A-I      intronic chr7:139053404(+) A-I      intronic chr7:139105115(+) A-I      intronic chr7:139105049(+) A-I      intronic chr7:139100394(+) A-I      intronic chr7:139080925(+) A-I      intronic chr7:139051903(+) A-I      intronic chr7:139066255(+) A-I      intronic chr7:139063245(+) A-I      intronic chr7:139086379(+) A-I      intronic chr7:139098506(+) A-I      intronic chr7:139053284(+) A-I      intronic chr7:139099932(+) A-I      intronic chr7:139051953(+) A-I      intronic chr7:139086224(+) A-I      intronic chr7:139062703(+) A-I      intronic chr7:139077902(+) A-I      intronic chr7:139064377(+) A-I      intronic chr7:139076383(+) A-I      intronic chr7:139103750(+) A-I      intronic chr7:139053409(+) A-I      intronic chr7:139105075(+) A-I      intronic chr7:139103797(+) A-I      intronic chr7:139080629(+) A-I      intronic chr7:139055398(+) A-I      intronic chr7:139103606(+) A-I      intronic chr7:139103806(+) A-I      intronic chr7:139067208(+) A-I      intronic chr7:139077758(+) A-I      intronic chr7:139062399(+) A-I      intronic chr7:139099910(+) A-I      intronic chr7:139069111(+) A-I      intronic chr7:139103698(+) A-I      intronic chr7:139062015(+) A-I      intronic chr7:139085068(+) A-I      intronic chr7:139064882(+) A-I      intronic chr7:139051979(+) A-I      intronic chr7:139101809(+) A-I      ncRNA chr7:139100511(+) A-I      intronic chr7:139101316(+) A-I      ncRNA

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	LUC7L2	chr7:139059670(+) A-I intron -    19478186 chr7:139103698(+) A-I intron -    15258596 chr7:139103718(+) A-I intron -    15258596 chr7:139103778(+) A-I intron -    15258596 chr7:139103797(+) A-I intron -    15258596 chr7:139103805(+) A-I intron -    15258596 chr7:139103813(+) A-I intron -    15258596 chr7:139051883(+) A-I intron -    22327324 chr7:139055297(+) A-I intron -    21960545   //22327324 chr7:139055384(+) A-I intron -    21960545   //22327324 chr7:139055406(+) A-I intron -    21960545   //22327324 chr7:139055423(+) A-I intron -    21960545   //22327324 chr7:139055227(+) A-I intron -    21960545 chr7:139055362(+) A-I intron -    21960545 chr7:139053309(+) A-I intron -    21960545 chr7:139063667(+) A-I intron -    21960545 chr7:139070256(+) A-I intron -    21960545 chr7:139077538(+) A-I intron -    21960545 chr7:139077544(+) A-I intron -    21960545 chr7:139055223(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055225(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055227(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055290(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055297(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055303(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055304(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055353(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055362(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055366(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055367(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055381(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055384(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055398(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055401(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055406(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055410(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055422(+) A-G intron -    22484847 chr7:139055463(+) A-G intron -    22484847 chr7:139057531(+) T-C intron -    22484847 chr7:139062107(+) T-C intron -    22484847 chr7:139062184(+) A-G intron -    22484847 chr7:139062219(+) A-G intron -    22484847 chr7:139062338(+) T-C intron -    22484847 chr7:139062399(+) A-G intron -    22484847 chr7:139062663(+) A-G intron -    22484847 chr7:139062664(+) A-G intron -    22484847 chr7:139062676(+) A-G intron -    22484847 chr7:139062681(+) A-G intron -    22484847 chr7:139062690(+) A-G intron -    22484847 chr7:139062703(+) A-G intron -    22484847 chr7:139062705(+) A-G intron -    22484847 chr7:139062754(+) A-G intron -    22484847 chr7:139062769(+) A-G intron -    22484847 chr7:139063133(+) A-G intron -    22484847 chr7:139063190(+) A-G intron -    22484847 chr7:139063221(+) A-G intron -    22484847 chr7:139063853(+) A-G intron -    22484847 chr7:139063877(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064377(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064415(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064429(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064473(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064477(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064486(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064666(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064675(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064710(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064753(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064759(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064762(+) G-A intron -    22484847 chr7:139064766(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064768(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064771(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064788(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064804(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064805(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064822(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064846(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064880(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064882(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064907(+) A-G intron -    22484847 chr7:139064909(+) A-G intron -    22484847 chr7:139065062(+) A-G intron -    22484847 chr7:139065082(+) A-G intron -    22484847 chr7:139065084(+) A-G intron -    22484847 chr7:139065085(+) A-G intron -    22484847 chr7:139065158(+) A-G intron -    22484847 chr7:139065167(+) A-G intron -    22484847 chr7:139065226(+) A-G intron -    22484847 chr7:139065231(+) A-G intron -    22484847 chr7:139065238(+) C-T intron -    22484847 chr7:139065265(+) A-G intron -    22484847 chr7:139066255(+) A-G intron -    22484847 chr7:139066259(+) A-G intron -    22484847 chr7:139066273(+) A-G intron -    22484847 chr7:139066333(+) C-T intron -    22484847 chr7:139067130(+) A-G intron -    22484847 chr7:139067193(+) A-G intron -    22484847 chr7:139067252(+) A-G intron -    22484847 chr7:139067260(+) A-G intron -    22484847 chr7:139067374(+) A-G intron -    22484847 chr7:139067407(+) G-A intron -    22484847 chr7:139067938(+) C-T intron -    22484847 chr7:139068202(+) A-G intron -    22484847 chr7:139068597(+) A-G intron -    22484847 chr7:139069111(+) A-G intron -    22484847 chr7:139069137(+) G-A intron -    22484847 chr7:139072033(+) A-G intron -    22484847 chr7:139074704(+) A-G intron -    22484847 chr7:139074800(+) A-G intron -    22484847 chr7:139075084(+) A-G intron -    22484847 chr7:139075107(+) A-G intron -    22484847 chr7:139076383(+) A-G intron -    22484847 chr7:139077476(+) A-G intron -    22484847 chr7:139077538(+) A-G intron -    22484847 chr7:139077540(+) A-G intron -    22484847 chr7:139077544(+) A-G intron -    22484847 chr7:139077583(+) A-G intron -    22484847 chr7:139077607(+) T-C intron -    22484847 chr7:139077661(+) A-G intron -    22484847 chr7:139077662(+) A-G intron -    22484847 chr7:139077758(+) A-G intron -    22484847 chr7:139077866(+) A-G intron -    22484847 chr7:139077886(+) A-G intron -    22484847 chr7:139077892(+) A-G intron -    22484847 chr7:139077893(+) A-G intron -    22484847 chr7:139077954(+) A-G intron -    22484847 chr7:139078390(+) A-G intron -    22484847 chr7:139080438(+) A-G intron -    22484847 chr7:139080456(+) A-G intron -    22484847 chr7:139080539(+) A-G intron -    22484847 chr7:139080599(+) A-G intron -    22484847 chr7:139080628(+) A-G intron -    22484847 chr7:139080925(+) A-G intron -    22484847 chr7:139080969(+) A-G intron -    22484847 chr7:139080988(+) A-G intron -    22484847 chr7:139081138(+) A-G intron -    22484847 chr7:139081152(+) A-G intron -    22484847 chr7:139081164(+) A-G intron -    22484847 chr7:139085054(+) A-G intron -    22484847 chr7:139085068(+) A-G intron -    22484847 chr7:139085069(+) A-G intron -    22484847 chr7:139085134(+) A-G intron -    22484847 chr7:139085135(+) A-G intron -    22484847 chr7:139085140(+) A-G intron -    22484847 chr7:139085148(+) A-G intron -    22484847 chr7:139086247(+) A-G intron -    22484847 chr7:139086250(+) A-G intron -    22484847 chr7:139086292(+) A-G intron -    22484847 chr7:139086419(+) A-G intron -    22484847 chr7:139086420(+) A-G intron -    22484847 chr7:139086601(+) A-G intron -    22484847 chr7:139086618(+) A-G intron -    22484847 chr7:139097492(+) A-G intron -    22484847 chr7:139098277(+) T-A intron -    22484847 chr7:139098307(+) T-C intron -    22484847 chr7:139098367(+) C-T intron -    22484847 chr7:139098463(+) A-G intron -    22484847 chr7:139098506(+) A-G intron -    22484847 chr7:139099759(+) A-G intron -    22484847 chr7:139099766(+) A-G intron -    22484847 chr7:139099818(+) T-G intron -    22484847 chr7:139100460(+) T-C intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	LUC7L2	chr7:139025987-139025988(+) m6A intron       24981863 chr7:139026122-139026123(+) m6A intron       25456834//24981863 chr7:139026127-139026128(+) m6A intron       25456834//24981863 chr7:139026168-139026169(+) m6A intron       25456834//24981863 chr7:139044762-139044763(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24284625//25456834//27371828//27773536//22575960 chr7:139044846-139044847(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24284625//24981863//27371828//27773536//22575960 chr7:139044908-139044909(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24284625//22575960 chr7:139045041-139045042(+) m6A 5'UTR//CDS//exon//intron       27371828 chr7:139083418-139083419(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535 chr7:139083436-139083437(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535 chr7:139086927-139086928(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535 chr7:139086957-139086958(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535//22575960 chr7:139090445-139090446(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535//22575960 chr7:139091966-139091967(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535 chr7:139092002-139092003(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535 chr7:139092047-139092048(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535 chr7:139094339-139094340(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22608085 chr7:139097344-139097345(+) m6A exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22608085 chr7:139102186-139102187(+) m6A exon//intron       - chr7:139102259-139102260(+) m6A exon//intron       24981863 chr7:139102307-139102308(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536 chr7:139102347-139102348(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//27773535//27371828 chr7:139106931-139106932(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//26404942//27773535 chr7:139106937-139106938(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//26404942//27773535 chr7:139106958-139106959(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//26404942//27773535 chr7:139106973-139106974(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//26404942//27773535 chr7:139106991-139106992(+) Gm 3'UTR//CDS//exon       - chr7:139107045-139107046(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//26404942//27773535 chr7:139107678-139107679(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr7:139107794-139107795(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr7:139107890-139107891(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr7:139107913-139107914(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr7:139107944-139107945(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr7:139108016-139108017(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	LUC7L2	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     - Exosome Blood     - Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: kshv-miR-K12-2-5p
Interactor2: LUC7L2

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Prediction-Evidence	miRanda//PARalyzer//Targetscan
Support Database	ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg

References:

PMID	22100165	Target region	3'UTR
Source	ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	BC-1 cells	Interactor2 expression	None
Description	Using PAR-CLIP, a technology which allows the direct and transcriptome-wide identification of miRNA targets, we delineate the target sites for all viral and cellular miRNAs expressed in PEL cell lines. The resulting data set revealed that KSHV miRNAs directly target more than 2000 cellular mRNAs, including many involved in pathways relevant to KSHV pathogenesis. Moreover, 58% of these mRNAs are also targeted by EBV miRNAs, via distinct binding sites.Clusters with seed matches to expressed miRNAs were considered candidate target sites. Of the clusters mapping to human 3'UTRs, 69% (BC-1) and 70% (BC-3) had seed matches to expressed miRNAs (Tables S6).Table S6A BC-1 derived 3'UTR clusters with seed matches to expressed miRNAs.