Detail Information
Binding sites in PDB | ||
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PDB | 1NFI//2LSP//2N22//2O61//3GUT//3QXY//3RC0//4KV1//4KV4 |
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | kshv-miR-K12-1-5p | RELA |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0002182 | 5970 |
Organism | Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV) | Homo sapiens |
Category | miRNA | protein |
Alias | - | CMCU//NFKB3//p65 |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | RELA |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | RELA |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | RELA |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | RELA |
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Interactor1: kshv-miR-K12-1-5p | Interactor2: RELA |
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Strong-Evidence | Northern blot//RT-PCR | |
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Support Database | VIRmiRNA |
PMID | 20081837 | Target region | 3'UTR |
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Source | VIRmiRNA | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | BCP-1 cells//HEK293T cells | Interactor2 expression | None |
Description | Expression of miR-K1 is sufficient to rescue the NF-kaapaB activity and inhibit viral lytic replication while inhibition of miR-K1 in KSHV-infected PEL cells has the opposite effects. Thus, KSHV encodes a miR to control viral replication by activating NF-kappaB pathway. These results illustrate an important role for KSHV miRs in regulating viral latency and lytic replication by manipulating a host survival pathway. |