Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | kshv-miR-K12-11-3p | DSTYK |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0002181 | 25778 |
Organism | Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | CAKUT1//DustyPK//HDCMD38P//RIP5//RIPK5//SPG23 |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | DSTYK |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | DSTYK |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | DSTYK |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID |
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RNALocate | DSTYK |
Interactor1: kshv-miR-K12-11-3p | Interactor2: DSTYK |
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Weak-Evidence | Microarray | |
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Prediction-Evidence | PicTar//Targetscan | |
Support Database | ViRBase//VmiReg |
PMID | 18075594 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase//VmiReg | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | BJAB cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | Cytoplasmic RNA was isolated from BJAB cells and analyzed on microarrays in three independent experiments. Expression of miR-K12-11 resulted in the downregulation of 181 mRNAs and the upregulation of 86 mRNAs (|T-score| ≥2.86, p≤0.01).Downregulated mRNAs carrying a >6 nt seed match to miR-K12-11 were considered candidate direct targets and are listed in Suppl. Table 1. |