Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | kshv-miR-K12-11-3p | RAPGEF2 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0002181 | 9693 |
Organism | Human gammaherpesvirus 8 (Kaposi's sarcoma herpesvirus, KSHV) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | CNrasGEF//nRap GEP//NRAPGEP//PDZ-GEF1//PDZGEF1//RA-GEF//RA-GEF-1//RAGEF//Rap-GEP |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | RAPGEF2 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | RAPGEF2 |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | RAPGEF2 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID |
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RNALocate | RAPGEF2 |
Interactor1: kshv-miR-K12-11-3p | Interactor2: RAPGEF2 |
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Weak-Evidence | PAR-CLIP | |
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Prediction-Evidence | PARalyzer | |
Support Database | ViRBase//VIRmiRNA |
PMID | 22100165 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase//VIRmiRNA | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | BC-1 cells//BJAB cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | Table S10C Genes that contribute to the enrichments of PAR-CLIP targets of miR-K11 from BC-1 libraries in downregulated mRNAs in BJAB/miR-K11 cells.Table S10F Genes that contribute to the enrichments of PAR-CLIP targets of miR-K11 from BC-3 libraries in downregulated mRNAs in BJAB/miR-K11 cells. |