Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00422472

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART22:  MIMAT0010132          YIPF6:  NM_173834     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART22	YIPF6
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0010132	286451
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	FinGER6

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	YIPF6	chrX:67734315(+) A-I      ncRNA chrX:67735809(+) A-I      intronic chrX:67734312(+) A-I      ncRNA chrX:67733615(+) A-I      ncRNA chrX:67733426(+) A-I      ncRNA chrX:67733559(+) A-I      ncRNA chrX:67735122(+) A-I      ncRNA chrX:67735007(+) A-I      ncRNA chrX:67735006(+) A-I      ncRNA chrX:67734991(+) A-I      ncRNA chrX:67733582(+) A-I      ncRNA chrX:67733591(+) A-I      ncRNA chrX:67736843(+) A-I      intronic chrX:67734981(+) A-I      ncRNA chrX:67742294(+) A-I      intronic chrX:67742293(+) A-I      intronic chrX:67733660(+) A-I      ncRNA chrX:67735818(+) A-I      intronic chrX:67733705(+) A-I      ncRNA chrX:67734417(+) A-I      ncRNA chrX:67723656(+) A-I      intronic chrX:67723700(+) A-I      intronic chrX:67734957(+) A-I      ncRNA chrX:67734952(+) A-I      ncRNA chrX:67733844(+) A-I      ncRNA chrX:67734837(+) A-I      ncRNA chrX:67734307(+) A-I      ncRNA chrX:67736899(+) A-I      intronic chrX:67733914(+) A-I      ncRNA chrX:67737029(+) A-I      intronic chrX:67723758(+) A-I      intronic chrX:67735822(+) A-I      intronic chrX:67734494(+) A-I      ncRNA chrX:67736818(+) A-I      intronic chrX:67726390(+) A-I      intronic chrX:67736741(+) A-I      intronic chrX:67737993(+) A-I      intronic chrX:67726599(+) A-I      intronic chrX:67737054(+) A-I      intronic chrX:67734380(+) A-I      ncRNA chrX:67742365(+) A-I      intronic chrX:67735788(+) A-I      intronic chrX:67742352(+) A-I      intronic chrX:67742323(+) A-I      intronic chrX:67742317(+) A-I      intronic chrX:67734343(+) A-I      ncRNA chrX:67735789(+) A-I      intronic chrX:67735790(+) A-I      intronic chrX:67735834(+) A-I      intronic chrX:67738046(+) A-I      intronic chrX:67737723(+) A-I      intronic chrX:67737639(+) A-I      intronic chrX:67737614(+) A-I      intronic chrX:67735922(+) A-I      intronic chrX:67736847(+) A-I      intronic chrX:67737251(+) A-I      intronic chrX:67737263(+) A-I      intronic chrX:67733534(+) A-I      ncRNA chrX:67737661(+) A-I      intronic chrX:67734720(+) A-I      ncRNA chrX:67735756(+) A-I      intronic chrX:67733926(+) A-I      ncRNA chrX:67736800(+) A-I      intronic chrX:67735886(+) A-I      intronic chrX:67734914(+) A-I      ncRNA chrX:67736778(+) A-I      intronic chrX:67733952(+) A-I      ncRNA chrX:67733939(+) A-I      ncRNA chrX:67734835(+) A-I      ncRNA chrX:67733547(+) A-I      ncRNA chrX:67735695(+) A-I      intronic chrX:67733863(+) A-I      ncRNA chrX:67723744(+) A-I      intronic chrX:67734824(+) A-I      ncRNA chrX:67736003(+) A-I      intronic chrX:67733911(+) A-I      ncRNA chrX:67737728(+) A-I      intronic chrX:67734432(+) A-I      ncRNA chrX:67734525(+) A-I      ncRNA chrX:67736672(+) A-I      intronic chrX:67736837(+) A-I      intronic chrX:67735623(+) A-I      intronic chrX:67735562(+) A-I      intronic chrX:67735948(+) A-I      intronic chrX:67735915(+) A-I      intronic chrX:67735580(+) A-I      intronic chrX:67728214(+) A-I      intronic chrX:67733596(+) A-I      ncRNA chrX:67737115(+) A-I      intronic chrX:67736676(+) A-I      intronic chrX:67725102(+) A-I      intronic chrX:67736795(+) A-I      intronic chrX:67737581(+) A-I      intronic chrX:67726280(+) A-I      intronic chrX:67725037(+) A-I      intronic chrX:67737888(+) A-I      intronic chrX:67735604(+) A-I      intronic chrX:67737936(+) A-I      intronic chrX:67733432(+) A-I      ncRNA chrX:67735814(+) A-I      intronic chrX:67734764(+) A-I      ncRNA chrX:67734817(+) A-I      ncRNA chrX:67733921(+) A-I      ncRNA chrX:67734451(+) A-I      ncRNA chrX:67735844(+) A-I      intronic chrX:67733606(+) A-I      ncRNA chrX:67723735(+) A-I      intronic chrX:67733533(+) A-I      ncRNA chrX:67736925(+) A-I      intronic chrX:67733569(+) A-I      ncRNA chrX:67735048(+) A-I      ncRNA chrX:67734350(+) A-I      ncRNA chrX:67733922(+) A-I      ncRNA chrX:67737975(+) A-I      intronic chrX:67734390(+) A-I      ncRNA chrX:67734368(+) A-I      ncRNA chrX:67738042(+) A-I      intronic chrX:67733915(+) A-I      ncRNA chrX:67734750(+) A-I      ncRNA chrX:67734743(+) A-I      ncRNA chrX:67733699(+) A-I      ncRNA chrX:67735528(+) A-I      intronic chrX:67733461(+) A-I      ncRNA chrX:67736761(+) A-I      intronic chrX:67733480(+) A-I      ncRNA chrX:67733453(+) A-I      ncRNA chrX:67734767(+) A-I      ncRNA chrX:67735216(+) A-I      intronic chrX:67733918(+) A-I      ncRNA chrX:67734749(+) A-I      ncRNA chrX:67734413(+) A-I      ncRNA chrX:67733912(+) A-I      ncRNA

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	YIPF6	chrX:67733533(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chrX:67733534(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chrX:67733606(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chrX:67733952(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chrX:67734390(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chrX:67734413(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chrX:67734451(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chrX:67734733(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chrX:67734767(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chrX:67735018(+) A-I intron -    15342557 chrX:67735048(+) A-I intron -    15342557 chrX:67736800(+) A-I intron -    22327324 chrX:67733530(+) A-G intron -    22484847 chrX:67733863(+) A-G intron -    22484847 chrX:67733952(+) A-G intron -    22484847 chrX:67734779(+) A-G intron -    22484847 chrX:67736800(+) A-G intron -    22484847 chrX:67736916(+) A-G intron -    22484847 chrX:67737661(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	YIPF6	chrX:67718483-67718484(+) m6A 5'UTR       24981863 chrX:67718873-67718874(+) m6A 5'UTR       25456834//24981863 chrX:67718936-67718937(+) m6A CDS//exon       25456834//24981863 chrX:67718944-67718945(+) m6A CDS//exon       25456834//24981863 chrX:67718992-67718993(+) m6A exon//intron       25456834//24981863 chrX:67754030-67754031(+) Y 3'UTR       26075521 chrX:67754554-67754555(+) m6A 3'UTR       22608085 chrX:67754652-67754653(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chrX:67754667-67754668(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chrX:67754688-67754689(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chrX:67754788-67754789(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22575960//22608085 chrX:67754794-67754795(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22575960//22608085 chrX:67754833-67754834(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chrX:67754864-67754865(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chrX:67755090-67755091(+) m6A 3'UTR       24981863 chrX:67755138-67755139(+) m6A 3'UTR       24981863 chrX:67755185-67755186(+) m6A 3'UTR       24981863 chrX:67756603-67756604(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	YIPF6	Chromatin K562 cells     - Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART22
Interactor2: YIPF6

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg