Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00421317

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART22:  MIMAT0010132          COQ10B:  NM_001320819     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART22	COQ10B
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0010132	80219
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	COQ10B	chr2:198339351(+) A-I      3'UTR chr2:198339214(+) A-I      3'UTR chr2:198339190(+) A-I      3'UTR chr2:198339211(+) A-I      3'UTR chr2:198331788(+) A-I      intronic chr2:198332195(+) A-I      intronic chr2:198333040(+) A-I      intronic chr2:198333108(+) A-I      intronic chr2:198336127(+) A-I      intronic chr2:198336128(+) A-I      intronic chr2:198336470(+) A-I      intronic chr2:198323913(+) A-I      intronic chr2:198329883(+) A-I      intronic chr2:198324090(+) A-I      intronic chr2:198325158(+) A-I      intronic chr2:198336489(+) A-I      intronic chr2:198326465(+) A-I      intronic chr2:198326617(+) A-I      intronic chr2:198332925(+) A-I      intronic chr2:198329711(+) A-I      intronic chr2:198323909(+) A-I      intronic chr2:198329800(+) A-I      intronic chr2:198329817(+) A-I      intronic chr2:198325082(+) A-I      intronic chr2:198325151(+) A-I      intronic chr2:198326810(+) A-I      intronic chr2:198329845(+) A-I      intronic chr2:198329861(+) A-I      intronic chr2:198330405(+) A-I      intronic chr2:198330467(+) A-I      intronic chr2:198330632(+) A-I      intronic chr2:198330737(+) A-I      intronic chr2:198326832(+) A-I      intronic chr2:198339319(+) A-I      3'UTR chr2:198339330(+) A-I      3'UTR chr2:198339233(+) A-I      3'UTR chr2:198339289(+) A-I      3'UTR chr2:198339232(+) A-I      3'UTR chr2:198339331(+) A-I      3'UTR chr2:198339359(+) A-I      3'UTR chr2:198339252(+) A-I      3'UTR chr2:198339172(+) A-I      3'UTR chr2:198339154(+) A-I      3'UTR chr2:198339148(+) A-I      3'UTR chr2:198339389(+) A-I      3'UTR chr2:198339263(+) A-I      3'UTR chr2:198339254(+) A-I      3'UTR chr2:198339426(+) A-I      3'UTR chr2:198339411(+) A-I      3'UTR chr2:198339390(+) A-I      3'UTR chr2:198339239(+) A-I      3'UTR chr2:198339209(+) A-I      3'UTR chr2:198339299(+) A-I      3'UTR chr2:198339200(+) A-I      3'UTR chr2:198339234(+) A-I      3'UTR chr2:198339185(+) A-I      3'UTR chr2:198334041(+) A-I      intronic chr2:198326842(+) A-I      intronic chr2:198333073(+) A-I      intronic chr2:198328547(+) A-I      intronic chr2:198330514(+) A-I      intronic chr2:198332243(+) A-I      intronic chr2:198330736(+) A-I      intronic chr2:198330353(+) A-I      intronic chr2:198328295(+) A-I      intronic chr2:198330658(+) A-I      intronic chr2:198335941(+) A-I      intronic chr2:198336075(+) A-I      intronic chr2:198336049(+) A-I      intronic chr2:198330114(+) A-I      intronic chr2:198330615(+) A-I      intronic chr2:198328424(+) A-I      intronic chr2:198330463(+) A-I      intronic chr2:198336012(+) A-I      intronic chr2:198339290(+) A-I      3'UTR chr2:198339245(+) A-I      3'UTR chr2:198330693(+) A-I      intronic chr2:198330630(+) A-I      intronic chr2:198329629(+) A-I      intronic chr2:198336516(+) A-I      intronic chr2:198333056(+) A-I      intronic chr2:198332171(+) A-I      intronic chr2:198333046(+) A-I      intronic chr2:198330554(+) A-I      intronic chr2:198325026(+) A-I      intronic chr2:198332375(+) A-I      intronic chr2:198331800(+) A-I      intronic chr2:198328089(+) A-I      intronic chr2:198335228(+) A-I      intronic chr2:198326846(+) A-I      intronic chr2:198332903(+) A-I      intronic chr2:198333020(+) A-I      intronic chr2:198327965(+) A-I      intronic chr2:198330037(+) A-I      intronic chr2:198326565(+) A-I      intronic chr2:198325028(+) A-I      intronic chr2:198328012(+) A-I      intronic chr2:198326507(+) A-I      intronic chr2:198324125(+) A-I      intronic chr2:198333943(+) A-I      intronic chr2:198328271(+) A-I      intronic chr2:198336510(+) A-I      intronic chr2:198330555(+) A-I      intronic chr2:198328287(+) A-I      intronic chr2:198332119(+) A-I      intronic chr2:198330506(+) A-I      intronic chr2:198335769(+) A-I      intronic chr2:198332165(+) A-I      intronic chr2:198333567(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	COQ10B	chr2:198337928(+) A-I intron -    21960545 chr2:198323900(+) C-T intron -    22484847 chr2:198325026(+) A-G intron -    22484847 chr2:198325028(+) A-G intron -    22484847 chr2:198326507(+) A-G intron -    22484847 chr2:198328012(+) A-G intron -    22484847 chr2:198329783(+) A-G intron -    22484847 chr2:198329816(+) A-G intron -    22484847 chr2:198330037(+) A-G intron -    22484847 chr2:198330114(+) A-G intron -    22484847 chr2:198330362(+) A-G intron -    22484847 chr2:198330421(+) A-G intron -    22484847 chr2:198330463(+) A-G intron -    22484847 chr2:198330630(+) A-G intron -    22484847 chr2:198330658(+) A-G intron -    22484847 chr2:198330693(+) A-G intron -    22484847 chr2:198330695(+) A-G intron -    22484847 chr2:198330696(+) A-G intron -    22484847 chr2:198330736(+) A-G intron -    22484847 chr2:198330741(+) A-G intron -    22484847 chr2:198330748(+) A-G intron -    22484847 chr2:198332165(+) A-G intron -    22484847 chr2:198332171(+) A-G intron -    22484847 chr2:198332243(+) A-G intron -    22484847 chr2:198333020(+) A-G intron -    22484847 chr2:198333046(+) A-G intron -    22484847 chr2:198334041(+) A-G intron -    22484847 chr2:198335215(+) A-G intron -    22484847 chr2:198335281(+) T-C intron -    22484847 chr2:198335941(+) A-G intron -    22484847 chr2:198336506(+) A-G intron -    22484847 chr2:198339245(+) A-G intron -    22484847 chr2:198339290(+) A-G intron -    22484847 chr2:198339334(+) C-T intron -    22484847 chr2:198339360(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	COQ10B	chr2:198318197-198318198(+) m6A 5'UTR       24981863 chr2:198318296-198318297(+) m6A CDS       - chr2:198338600-198338601(+) m6A CDS       24981863 chr2:198338660-198338661(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942 chr2:198338767-198338768(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942 chr2:198338802-198338803(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942 chr2:198338853-198338854(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	COQ10B	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART22
Interactor2: COQ10B

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg