Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00406225

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART19-5p:  MIMAT0004836          QKI:  NM_206855     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART19-5p	QKI
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004836	9444
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	Hqk//hqkI//QK//QK1//QK3

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	QKI	chr6:163854601(+) A-I      intronic chr6:163844173(+) A-I      intronic chr6:163854626(+) A-I      intronic chr6:163949692(+) A-I      intronic chr6:163854615(+) A-I      intronic chr6:163854611(+) A-I      intronic chr6:163854610(+) A-I      intronic chr6:163970623(+) A-I      intronic chr6:163970617(+) A-I      intronic chr6:163843545(+) A-I      intronic chr6:163843478(+) A-I      intronic chr6:163844205(+) A-I      intronic chr6:163844152(+) A-I      intronic chr6:163857662(+) A-I      intronic chr6:163857650(+) A-I      intronic chr6:163973380(+) A-I      intronic chr6:163854754(+) A-I      intronic chr6:163871190(+) A-I      intronic chr6:163871159(+) A-I      intronic chr6:163854719(+) A-I      intronic chr6:163842816(+) A-I      intronic chr6:163842918(+) A-I      intronic chr6:163857675(+) A-I      intronic chr6:163854678(+) A-I      intronic chr6:163864339(+) A-I      intronic chr6:163864347(+) A-I      intronic chr6:163853512(+) A-I      intronic chr6:163845781(+) A-I      intronic chr6:163845768(+) A-I      intronic chr6:163845763(+) A-I      intronic chr6:163844232(+) A-I      intronic chr6:163844229(+) A-I      intronic chr6:163844226(+) A-I      intronic chr6:163973327(+) A-I      intronic chr6:163973320(+) A-I      intronic chr6:163971900(+) A-I      intronic chr6:163971839(+) A-I      intronic chr6:163971824(+) A-I      intronic chr6:163864348(+) A-I      intronic chr6:163864424(+) A-I      intronic chr6:163864425(+) A-I      intronic chr6:163864445(+) A-I      intronic chr6:163864549(+) A-I      intronic chr6:163866759(+) A-I      intronic chr6:163871207(+) A-I      intronic chr6:163871219(+) A-I      intronic chr6:163873877(+) A-I      intronic chr6:163971795(+) A-I      intronic chr6:163971770(+) A-I      intronic chr6:163970624(+) A-I      intronic chr6:163874040(+) A-I      intronic chr6:163900521(+) A-I      intronic chr6:163900645(+) A-I      intronic chr6:163914615(+) A-I      intronic chr6:163930021(+) A-I      intronic chr6:163946571(+) A-I      intronic chr6:163946574(+) A-I      intronic chr6:163946600(+) A-I      intronic chr6:163946671(+) A-I      intronic chr6:163843583(+) A-I      intronic chr6:163900543(+) A-I      intronic chr6:163853490(+) A-I      intronic chr6:163929701(+) A-I      intronic chr6:163864423(+) A-I      intronic chr6:163930120(+) A-I      intronic chr6:163853635(+) A-I      intronic chr6:163857742(+) A-I      intronic chr6:163970561(+) A-I      intronic chr6:163866053(+) A-I      intronic chr6:163854652(+) A-I      intronic chr6:163930064(+) A-I      intronic chr6:163903009(+) A-I      intronic chr6:163900443(+) A-I      intronic chr6:163931543(+) A-I      intronic chr6:163929719(+) A-I      intronic chr6:163974355(+) A-I      intronic chr6:163973271(+) A-I      intronic chr6:163883171(+) A-I      intronic chr6:163929688(+) A-I      intronic chr6:163914371(+) A-I      intronic chr6:163900613(+) A-I      intronic chr6:163866721(+) A-I      intronic chr6:163929656(+) A-I      intronic chr6:163866020(+) A-I      intronic chr6:163900063(+) A-I      intronic chr6:163900210(+) A-I      intronic chr6:163864531(+) A-I      intronic chr6:163929829(+) A-I      intronic chr6:163842880(+) A-I      intronic chr6:163842894(+) A-I      intronic chr6:163866929(+) A-I      intronic chr6:163864401(+) A-I      intronic chr6:163971724(+) A-I      intronic chr6:163854688(+) A-I      intronic chr6:163857645(+) A-I      intronic chr6:163914384(+) A-I      intronic chr6:163900438(+) A-I      intronic chr6:163977424(+) A-I      intronic chr6:163930122(+) A-I      intronic chr6:163869488(+) A-I      intronic chr6:163843527(+) A-I      intronic chr6:163853573(+) A-I      intronic chr6:163979561(+) A-I      intronic chr6:163864415(+) A-I      intronic chr6:163973393(+) A-I      intronic chr6:163857771(+) A-I      intronic chr6:163974236(+) A-I      intronic chr6:163845868(+) A-I      intronic chr6:163845764(+) A-I      intronic chr6:163929626(+) A-I      intronic chr6:163845793(+) A-I      intronic chr6:163844075(+) A-I      intronic chr6:163931482(+) A-I      intronic chr6:163973449(+) A-I      intronic chr6:163864485(+) A-I      intronic chr6:163973303(+) A-I      intronic chr6:163844119(+) A-I      intronic chr6:163843602(+) A-I      intronic chr6:163979705(+) A-I      intronic chr6:163857591(+) A-I      intronic chr6:163900604(+) A-I      intronic chr6:163845848(+) A-I      intronic chr6:163977423(+) A-I      intronic chr6:163866908(+) A-I      intronic chr6:163866027(+) A-I      intronic chr6:163843526(+) A-I      intronic chr6:163930051(+) A-I      intronic chr6:163854579(+) A-I      intronic chr6:163977461(+) A-I      intronic chr6:163971778(+) A-I      intronic chr6:163869527(+) A-I      intronic chr6:163845937(+) A-I      intronic chr6:163971730(+) A-I      intronic chr6:163864454(+) A-I      intronic chr6:163844141(+) A-I      intronic chr6:163854720(+) A-I      intronic chr6:163974269(+) A-I      intronic chr6:163845803(+) A-I      intronic chr6:163929662(+) A-I      intronic chr6:163979571(+) A-I      intronic chr6:163844197(+) A-I      intronic chr6:163845744(+) A-I      intronic chr6:163864440(+) A-I      intronic chr6:163929592(+) A-I      intronic chr6:163903154(+) A-I      intronic chr6:163844074(+) A-I      intronic chr6:163866893(+) A-I      intronic chr6:163929648(+) A-I      intronic chr6:163900223(+) A-I      intronic chr6:163930050(+) A-I      intronic chr6:163929665(+) A-I      intronic chr6:163973370(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	QKI	chr6:163842857(+) A-G intron -    22484847 chr6:163842877(+) A-G intron -    22484847 chr6:163842878(+) A-G intron -    22484847 chr6:163842880(+) A-G intron -    22484847 chr6:163842894(+) A-G intron -    22484847 chr6:163843527(+) A-G intron -    22484847 chr6:163844074(+) A-G intron -    22484847 chr6:163844075(+) A-G intron -    22484847 chr6:163845803(+) A-G intron -    22484847 chr6:163845868(+) A-G intron -    22484847 chr6:163845915(+) A-G intron -    22484847 chr6:163853490(+) A-G intron -    22484847 chr6:163853635(+) A-G intron -    22484847 chr6:163854652(+) A-G intron -    22484847 chr6:163864401(+) A-G intron -    22484847 chr6:163864423(+) A-G intron -    22484847 chr6:163864440(+) A-G intron -    22484847 chr6:163864506(+) A-G intron -    22484847 chr6:163864531(+) A-G intron -    22484847 chr6:163866776(+) A-G intron -    22484847 chr6:163866853(+) A-G intron -    22484847 chr6:163871325(+) A-G intron -    22484847 chr6:163900127(+) A-G intron -    22484847 chr6:163900210(+) A-G intron -    22484847 chr6:163900223(+) A-G intron -    22484847 chr6:163900291(+) A-G intron -    22484847 chr6:163900438(+) A-G intron -    22484847 chr6:163900443(+) A-G intron -    22484847 chr6:163900533(+) A-G intron -    22484847 chr6:163900543(+) A-G intron -    22484847 chr6:163900545(+) A-G intron -    22484847 chr6:163900592(+) T-C intron -    22484847 chr6:163900613(+) A-G intron -    22484847 chr6:163905247(+) C-T intron -    22484847 chr6:163929626(+) A-G intron -    22484847 chr6:163929656(+) A-G intron -    22484847 chr6:163929665(+) A-G intron -    22484847 chr6:163929723(+) A-G intron -    22484847 chr6:163929953(+) C-T intron -    22484847 chr6:163930064(+) A-G intron -    22484847 chr6:163930120(+) A-G intron -    22484847 chr6:163971724(+) A-G intron -    22484847 chr6:163979436(+) C-T intron -    22484847 chr6:163979502(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	QKI	chr6:163835677-163835678(+) m6A 5'UTR       24284625//25456834//24981863//27371828//27773536//22608085 chr6:163835687-163835688(+) m6A 5'UTR       24284625//25456834//24981863//27371828//27773536//22608085 chr6:163835792-163835793(+) m6A 5'UTR       24209618//25456834//24981863//27371828//27773536 chr6:163835806-163835807(+) m6A 5'UTR       24209618//25456834//24981863//27371828//27773536 chr6:163835936-163835937(+) m6A 5'UTR       24209618//27773536 chr6:163876331-163876332(+) m6A 5'UTR//CDS//intron       24981863//27773535 chr6:163876398-163876399(+) m6A CDS//intron       24981863//27773535 chr6:163876422-163876423(+) m6A CDS//intron       24981863//27773535 chr6:163878434-163878435(+) m6A 3'UTR//intron       24981863//27773535 chr6:163878575-163878576(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr6:163899837-163899838(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863 chr6:163899846-163899847(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863//27773535 chr6:163899858-163899859(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863//27773535 chr6:163899874-163899875(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863//27773535 chr6:163956095-163956096(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863 chr6:163983026-163983027(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863 chr6:163984594-163984595(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942 chr6:163984615-163984616(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942 chr6:163991167-163991168(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr6:163991476-163991477(+) Y intron       26075521 chr6:163991764-163991765(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863 chr6:163991890-163991891(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//26404942//22608085 chr6:163991897-163991898(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//26404942//22608085 chr6:163991970-163991971(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085 chr6:163992082-163992083(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085 chr6:163992129-163992130(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//26404942//27773535//22608085 chr6:163993518-163993519(+) m6A 3'UTR       24981863 chr6:163993589-163993590(+) m6A 3'UTR       24981863 chr6:163993638-163993639(+) m6A 3'UTR       24981863 chr6:163993701-163993702(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ebv-miR-BART19-5p	Exosome B cell line (Raji)     21505438
	QKI	Chromatin HeLa-S3 cells|K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART19-5p
Interactor2: QKI

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg