Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00404336

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART13-5p:  MIMAT0004818          ZNF793:  NM_001013659     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART13-5p	ZNF793
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004818	390927
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	ZNF793	chr19:38032366(+) A-I      3'UTR chr19:38032371(+) A-I      3'UTR chr19:38032421(+) A-I      3'UTR chr19:38032422(+) A-I      3'UTR chr19:38032429(+) A-I      3'UTR chr19:38032430(+) A-I      3'UTR chr19:38032431(+) A-I      3'UTR chr19:38031039(+) A-I      3'UTR chr19:38033031(+) A-I      3'UTR chr19:38005308(+) A-I      intronic chr19:38031003(+) A-I      3'UTR chr19:38030997(+) A-I      3'UTR chr19:38029212(+) A-I      3'UTR chr19:38005281(+) A-I      intronic chr19:38033236(+) A-I      NonSyn:Gln->Arg chr19:38033220(+) A-I      NonSyn:Arg->Gly chr19:38033207(+) A-I      Syn:Glu->Glu chr19:38033210(+) A-I      Syn:Ser->Ser chr19:38032404(+) A-I      3'UTR chr19:38033216(+) A-I      Syn:Glu->Glu chr19:38031037(+) A-I      3'UTR chr19:38031017(+) A-I      3'UTR chr19:38001851(+) A-I      intronic chr19:38005279(+) A-I      intronic chr19:38005302(+) A-I      intronic chr19:38026076(+) A-I      intronic chr19:38001242(+) A-I      intronic chr19:38001231(+) A-I      intronic chr19:38017220(+) A-I      intronic chr19:38023033(+) A-I      intronic chr19:38023028(+) A-I      intronic chr19:38017250(+) A-I      intronic chr19:38017249(+) A-I      intronic chr19:38017217(+) A-I      intronic chr19:38009581(+) A-I      intronic chr19:38009579(+) A-I      intronic chr19:38009559(+) A-I      intronic chr19:38005329(+) A-I      intronic chr19:38005354(+) A-I      intronic chr19:38008264(+) A-I      intronic chr19:38008270(+) A-I      intronic chr19:38009131(+) A-I      intronic chr19:38009157(+) A-I      intronic chr19:38009219(+) A-I      intronic chr19:38009167(+) A-I      intronic chr19:38023042(+) A-I      intronic chr19:38029338(+) A-I      3'UTR chr19:38029028(+) A-I      3'UTR chr19:38033134(+) A-I      3'UTR chr19:38028999(+) A-I      3'UTR chr19:38031057(+) A-I      3'UTR chr19:38033135(+) A-I      3'UTR chr19:38032416(+) A-I      3'UTR chr19:38032420(+) A-I      3'UTR chr19:38033136(+) A-I      3'UTR chr19:38032423(+) A-I      3'UTR chr19:38033143(+) A-I      3'UTR chr19:38033145(+) A-I      3'UTR chr19:38033148(+) A-I      3'UTR chr19:38032587(+) A-I      3'UTR chr19:38033164(+) A-I      3'UTR chr19:38032466(+) A-I      3'UTR chr19:38033175(+) A-I      3'UTR chr19:38033201(+) A-I      3'UTR chr19:38032493(+) A-I      3'UTR chr19:38031125(+) A-I      3'UTR chr19:38033197(+) A-I      3'UTR chr19:38032502(+) A-I      3'UTR chr19:38032546(+) A-I      3'UTR chr19:38032560(+) A-I      3'UTR chr19:38029078(+) A-I      3'UTR chr19:38029324(+) A-I      3'UTR chr19:38033048(+) A-I      3'UTR chr19:38033247(+) A-I      3'UTR chr19:38007136(+) A-I      intronic chr19:38005282(+) A-I      intronic chr19:38009438(+) A-I      intronic chr19:38009645(+) A-I      intronic chr19:38005335(+) A-I      intronic chr19:38026700(+) A-I      intronic chr19:37999533(+) A-I      intronic chr19:38001034(+) A-I      intronic chr19:38022996(+) A-I      intronic chr19:38031047(+) A-I      3'UTR chr19:38032395(+) A-I      3'UTR chr19:38029226(+) A-I      3'UTR chr19:38033118(+) A-I      3'UTR chr19:38033266(+) A-I      3'UTR chr19:38032513(+) A-I      3'UTR chr19:38030976(+) A-I      3'UTR chr19:38031021(+) A-I      3'UTR chr19:38029349(+) A-I      3'UTR chr19:38031008(+) A-I      3'UTR chr19:38032434(+) A-I      3'UTR chr19:38029423(+) A-I      3'UTR chr19:38033039(+) A-I      3'UTR chr19:38031009(+) A-I      3'UTR chr19:38029471(+) A-I      3'UTR chr19:38031096(+) A-I      3'UTR chr19:38032483(+) A-I      3'UTR chr19:38009128(+) A-I      intronic chr19:38029348(+) A-I      3'UTR chr19:38032425(+) A-I      3'UTR chr19:38029079(+) A-I      3'UTR chr19:38014783(+) A-I      intronic chr19:38033184(+) A-I      3'UTR chr19:38022980(+) A-I      intronic chr19:38029002(+) A-I      3'UTR chr19:38028833(+) A-I      3'UTR chr19:38029247(+) A-I      3'UTR chr19:38018749(+) A-I      intronic chr19:38029357(+) A-I      3'UTR chr19:38029093(+) A-I      3'UTR chr19:38029263(+) A-I      3'UTR chr19:38008237(+) A-I      intronic chr19:38029470(+) A-I      3'UTR chr19:38029363(+) A-I      3'UTR chr19:38025715(+) A-I      intronic chr19:38030973(+) A-I      3'UTR chr19:38029410(+) A-I      3'UTR chr19:38033244(+) A-I      3'UTR chr19:38031172(+) A-I      3'UTR chr19:38032394(+) A-I      3'UTR chr19:38030956(+) A-I      3'UTR chr19:38029300(+) A-I      3'UTR chr19:38032309(+) A-I      3'UTR chr19:38032487(+) A-I      3'UTR chr19:38001783(+) A-I      intronic chr19:38032352(+) A-I      3'UTR chr19:38032325(+) A-I      3'UTR chr19:38030929(+) A-I      3'UTR chr19:38033108(+) A-I      3'UTR chr19:38032355(+) A-I      3'UTR chr19:38018933(+) A-I      intronic chr19:38033180(+) A-I      3'UTR chr19:38032379(+) A-I      3'UTR chr19:38031081(+) A-I      3'UTR chr19:38031087(+) A-I      3'UTR chr19:38029276(+) A-I      3'UTR chr19:38029489(+) A-I      3'UTR chr19:38033119(+) A-I      3'UTR chr19:38030990(+) A-I      3'UTR chr19:38002387(+) A-I      intronic chr19:38025716(+) A-I      intronic chr19:38029312(+) A-I      3'UTR chr19:38031015(+) A-I      3'UTR chr19:38029239(+) A-I      3'UTR chr19:38032569(+) A-I      3'UTR chr19:38029244(+) A-I      3'UTR chr19:38028845(+) A-I      3'UTR chr19:38033033(+) A-I      3'UTR chr19:38031012(+) A-I      3'UTR chr19:38029286(+) A-I      3'UTR chr19:38032428(+) A-I      3'UTR chr19:38029257(+) A-I      3'UTR chr19:38032405(+) A-I      3'UTR chr19:38008290(+) A-I      intronic chr19:38032419(+) A-I      3'UTR chr19:38029016(+) A-I      3'UTR chr19:38032460(+) A-I      3'UTR chr19:38029091(+) A-I      3'UTR chr19:38006290(+) A-I      intronic chr19:38028894(+) A-I      3'UTR chr19:38030921(+) A-I      3'UTR chr19:38029483(+) A-I      3'UTR chr19:38009500(+) A-I      intronic chr19:38001806(+) A-I      intronic chr19:38029100(+) A-I      3'UTR chr19:38031100(+) A-I      3'UTR chr19:38033096(+) A-I      3'UTR chr19:38033066(+) A-I      3'UTR chr19:38031041(+) A-I      3'UTR chr19:38031159(+) A-I      3'UTR chr19:38008247(+) A-I      intronic chr19:38005337(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	ZNF793	chr19:38028483(+) A-I exon CDS    15342557 chr19:38028840(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38028845(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38028894(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38028943(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38029002(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38029016(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38029024(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38029079(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38029091(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38029100(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38029257(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38029268(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38029276(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38029300(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38029348(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38029357(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38029363(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38029366(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38030929(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38031009(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38031010(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38031012(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38031015(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38031021(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38031047(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38031100(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38031172(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr19:38029349(+) A-I intron -    21960545 chr19:38029276(+) A-G intron -    22484847 chr19:38029471(+) A-G intron -    22484847 chr19:38030921(+) A-G intron -    22484847 chr19:38030929(+) A-G intron -    22484847 chr19:38030930(+) A-G intron -    22484847 chr19:38030956(+) A-G intron -    22484847 chr19:38031047(+) A-G intron -    22484847 chr19:38031100(+) A-G intron -    22484847 chr19:38032309(+) A-G intron -    22484847 chr19:38032419(+) A-G intron -    22484847 chr19:38032460(+) A-G intron -    22484847 chr19:38032533(+) A-G intron -    22484847 chr19:38032538(+) A-G intron -    22484847 chr19:38033033(+) A-G intron -    22484847 chr19:38033040(+) A-G intron -    22484847 chr19:38033108(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	ZNF793	chr19:38027978-38027979(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863 chr19:38027999-38028000(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863 chr19:38028011-38028012(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863 chr19:38028032-38028033(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863 chr19:38028158-38028159(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863 chr19:38028177-38028178(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24981863 chr19:38028375-38028376(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       25456834 chr19:38028402-38028403(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       25456834 chr19:38028459-38028460(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       25456834//24981863 chr19:38028469-38028470(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       25456834//24981863 chr19:38028486-38028487(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       25456834//24981863 chr19:38028570-38028571(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       25456834//24981863 chr19:38028627-38028628(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       25456834//24981863 chr19:38028637-38028638(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       25456834//24981863 chr19:38028701-38028702(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       25456834//24981863 chr19:38028711-38028712(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       25456834//24981863 chr19:38028755-38028756(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       25456834 chr19:38032745-38032746(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr19:38032756-38032757(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr19:38032827-38032828(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr19:38039564-38039565(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:38039570-38039571(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:38039652-38039653(+) m6A 3'UTR       25456834

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ZNF793	Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Exosome Blood     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART13-5p
Interactor2: ZNF793

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//Targetscan
Support Database	VmiReg