Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00397954

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.5711

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART9-5p:  MIMAT0004816          EIF3L:  NM_001363785     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART9-5p	EIF3L
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004816	51386
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	EIF3EIP//EIF3S11//EIF3S6IP//HSPC021//HSPC025//MSTP005

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	EIF3L	chr22:38268249(+) A-I      intronic chr22:38284888(+) A-I      3'UTR chr22:38268730(+) A-I      intronic chr22:38276577(+) A-I      intronic chr22:38276541(+) A-I      intronic chr22:38268700(+) A-I      intronic chr22:38268229(+) A-I      intronic chr22:38267817(+) A-I      intronic chr22:38267715(+) A-I      intronic chr22:38267714(+) A-I      intronic chr22:38263571(+) A-I      intronic chr22:38263559(+) A-I      intronic chr22:38285268(+) A-I      3'UTR chr22:38285264(+) A-I      3'UTR chr22:38276537(+) A-I      intronic chr22:38263546(+) A-I      intronic chr22:38263510(+) A-I      intronic chr22:38285232(+) A-I      3'UTR chr22:38268284(+) A-I      intronic chr22:38275999(+) A-I      intronic chr22:38275993(+) A-I      intronic chr22:38282488(+) A-I      intronic chr22:38267282(+) A-I      ncRNA chr22:38283458(+) A-I      intronic chr22:38283451(+) A-I      intronic chr22:38275984(+) A-I      intronic chr22:38283450(+) A-I      intronic chr22:38275381(+) A-I      intronic chr22:38282482(+) A-I      intronic chr22:38282433(+) A-I      intronic chr22:38282420(+) A-I      intronic chr22:38281752(+) A-I      intronic chr22:38281725(+) A-I      intronic chr22:38279862(+) A-I      intronic chr22:38278788(+) A-I      intronic chr22:38278781(+) A-I      intronic chr22:38278755(+) A-I      intronic chr22:38276551(+) A-I      intronic chr22:38278754(+) A-I      intronic chr22:38278771(+) A-I      intronic chr22:38277345(+) A-I      intronic chr22:38276578(+) A-I      intronic chr22:38276758(+) A-I      intronic chr22:38277316(+) A-I      intronic chr22:38277545(+) A-I      intronic chr22:38277569(+) A-I      intronic chr22:38277578(+) A-I      intronic chr22:38277596(+) A-I      intronic chr22:38277638(+) A-I      intronic chr22:38277650(+) A-I      intronic chr22:38277902(+) A-I      intronic chr22:38277972(+) A-I      intronic chr22:38278104(+) A-I      intronic chr22:38278138(+) A-I      intronic chr22:38278167(+) A-I      intronic chr22:38278183(+) A-I      intronic chr22:38278194(+) A-I      intronic chr22:38278229(+) A-I      intronic chr22:38278503(+) A-I      intronic chr22:38278545(+) A-I      intronic chr22:38278625(+) A-I      intronic chr22:38278760(+) A-I      intronic chr22:38278806(+) A-I      intronic chr22:38278847(+) A-I      intronic chr22:38278948(+) A-I      intronic chr22:38278951(+) A-I      intronic chr22:38278956(+) A-I      intronic chr22:38278616(+) A-I      intronic chr22:38279529(+) A-I      intronic chr22:38279532(+) A-I      intronic chr22:38279533(+) A-I      intronic chr22:38279800(+) A-I      intronic chr22:38279801(+) A-I      intronic chr22:38279810(+) A-I      intronic chr22:38279830(+) A-I      intronic chr22:38279833(+) A-I      intronic chr22:38279846(+) A-I      intronic chr22:38280664(+) A-I      intronic chr22:38281710(+) A-I      intronic chr22:38281855(+) A-I      intronic chr22:38281942(+) A-I      intronic chr22:38282058(+) A-I      intronic chr22:38282080(+) A-I      intronic chr22:38282429(+) A-I      intronic chr22:38282455(+) A-I      intronic chr22:38282473(+) A-I      intronic chr22:38282562(+) A-I      intronic chr22:38282564(+) A-I      intronic chr22:38283114(+) A-I      intronic chr22:38283345(+) A-I      intronic chr22:38247704(+) A-I      intronic chr22:38247784(+) A-I      intronic chr22:38247875(+) A-I      intronic chr22:38249557(+) A-I      intronic chr22:38250604(+) A-I      intronic chr22:38252250(+) A-I      intronic chr22:38252271(+) A-I      intronic chr22:38252331(+) A-I      intronic chr22:38252364(+) A-I      intronic chr22:38252389(+) A-I      intronic chr22:38252602(+) A-I      intronic chr22:38252704(+) A-I      intronic chr22:38252740(+) A-I      intronic chr22:38252757(+) A-I      intronic chr22:38252766(+) A-I      intronic chr22:38252803(+) A-I      intronic chr22:38253114(+) A-I      intronic chr22:38253309(+) A-I      intronic chr22:38253364(+) A-I      intronic chr22:38253631(+) A-I      intronic chr22:38253750(+) A-I      intronic chr22:38253803(+) A-I      intronic chr22:38254032(+) A-I      intronic chr22:38254311(+) A-I      intronic chr22:38255442(+) A-I      intronic chr22:38255458(+) A-I      intronic chr22:38255482(+) A-I      intronic chr22:38255571(+) A-I      intronic chr22:38255663(+) A-I      intronic chr22:38255898(+) A-I      intronic chr22:38255908(+) A-I      intronic chr22:38255915(+) A-I      intronic chr22:38255948(+) A-I      intronic chr22:38255964(+) A-I      intronic chr22:38257443(+) A-I      intronic chr22:38259817(+) A-I      intronic chr22:38259818(+) A-I      intronic chr22:38259869(+) A-I      intronic chr22:38259885(+) A-I      intronic chr22:38259906(+) A-I      intronic chr22:38259961(+) A-I      intronic chr22:38260058(+) A-I      intronic chr22:38260092(+) A-I      intronic chr22:38260133(+) A-I      intronic chr22:38260163(+) A-I      intronic chr22:38260577(+) A-I      intronic chr22:38260707(+) A-I      intronic chr22:38260806(+) A-I      intronic chr22:38261286(+) A-I      intronic chr22:38262576(+) A-I      intronic chr22:38262581(+) A-I      intronic chr22:38262615(+) A-I      intronic chr22:38262699(+) A-I      intronic chr22:38262713(+) A-I      intronic chr22:38262714(+) A-I      intronic chr22:38262743(+) A-I      intronic chr22:38262745(+) A-I      intronic chr22:38262780(+) A-I      intronic chr22:38263100(+) A-I      intronic chr22:38263272(+) A-I      intronic chr22:38263605(+) A-I      intronic chr22:38263619(+) A-I      intronic chr22:38263750(+) A-I      intronic chr22:38263751(+) A-I      intronic chr22:38263776(+) A-I      intronic chr22:38263784(+) A-I      intronic chr22:38263804(+) A-I      intronic chr22:38263868(+) A-I      intronic chr22:38263887(+) A-I      intronic chr22:38264743(+) A-I      intronic chr22:38264750(+) A-I      intronic chr22:38264754(+) A-I      intronic chr22:38265159(+) A-I      intronic chr22:38265319(+) A-I      intronic chr22:38266981(+) A-I      intronic chr22:38267024(+) A-I      intronic chr22:38267064(+) A-I      intronic chr22:38267620(+) A-I      intronic chr22:38267704(+) A-I      intronic chr22:38267723(+) A-I      intronic chr22:38283494(+) A-I      intronic chr22:38283501(+) A-I      intronic chr22:38283511(+) A-I      intronic chr22:38283550(+) A-I      intronic chr22:38279876(+) A-I      intronic chr22:38267725(+) A-I      intronic chr22:38267749(+) A-I      intronic chr22:38267761(+) A-I      intronic chr22:38267765(+) A-I      intronic chr22:38267772(+) A-I      intronic chr22:38267782(+) A-I      intronic chr22:38267796(+) A-I      intronic chr22:38267808(+) A-I      intronic chr22:38267821(+) A-I      intronic chr22:38267826(+) A-I      intronic chr22:38267881(+) A-I      intronic chr22:38267882(+) A-I      intronic chr22:38268287(+) A-I      intronic chr22:38268365(+) A-I      intronic chr22:38268690(+) A-I      intronic chr22:38268755(+) A-I      intronic chr22:38268775(+) A-I      intronic chr22:38269039(+) A-I      intronic chr22:38269090(+) A-I      intronic chr22:38269122(+) A-I      intronic chr22:38269369(+) A-I      intronic chr22:38269370(+) A-I      intronic chr22:38269380(+) A-I      intronic chr22:38269386(+) A-I      intronic chr22:38269507(+) A-I      intronic chr22:38270791(+) A-I      intronic chr22:38270835(+) A-I      intronic chr22:38270865(+) A-I      intronic chr22:38270962(+) A-I      intronic chr22:38271166(+) A-I      intronic chr22:38271300(+) A-I      intronic chr22:38271340(+) A-I      intronic chr22:38274496(+) A-I      intronic chr22:38274522(+) A-I      intronic chr22:38274564(+) A-I      intronic chr22:38274600(+) A-I      intronic chr22:38274616(+) A-I      intronic chr22:38274679(+) A-I      intronic chr22:38275014(+) A-I      intronic chr22:38275160(+) A-I      intronic chr22:38275344(+) A-I      intronic chr22:38275363(+) A-I      intronic chr22:38275387(+) A-I      intronic chr22:38275391(+) A-I      intronic chr22:38275408(+) A-I      intronic chr22:38275443(+) A-I      intronic chr22:38275483(+) A-I      intronic chr22:38275826(+) A-I      intronic chr22:38275881(+) A-I      intronic chr22:38275887(+) A-I      intronic chr22:38275946(+) A-I      intronic chr22:38276068(+) A-I      intronic chr22:38276237(+) A-I      intronic chr22:38276302(+) A-I      intronic chr22:38276327(+) A-I      intronic chr22:38276342(+) A-I      intronic chr22:38276434(+) A-I      intronic chr22:38276486(+) A-I      intronic chr22:38276524(+) A-I      intronic chr22:38276546(+) A-I      intronic chr22:38276734(+) A-I      intronic chr22:38276749(+) A-I      intronic chr22:38276750(+) A-I      intronic chr22:38284955(+) A-I      3'UTR chr22:38284967(+) A-I      3'UTR chr22:38285150(+) A-I      3'UTR chr22:38285297(+) A-I      3'UTR chr22:38284873(+) A-I      3'UTR chr22:38284864(+) A-I      3'UTR chr22:38284908(+) A-I      3'UTR chr22:38284904(+) A-I      3'UTR chr22:38264789(+) A-I      intronic chr22:38271114(+) A-I      intronic chr22:38254062(+) A-I      intronic chr22:38263162(+) A-I      intronic chr22:38267636(+) A-I      intronic chr22:38255801(+) A-I      intronic chr22:38252128(+) A-I      intronic chr22:38281772(+) A-I      intronic chr22:38265205(+) A-I      intronic chr22:38277916(+) A-I      intronic chr22:38252258(+) A-I      intronic chr22:38253632(+) A-I      intronic chr22:38267205(+) A-I      intronic chr22:38267699(+) A-I      intronic chr22:38252497(+) A-I      intronic chr22:38281109(+) A-I      intronic chr22:38269831(+) A-I      intronic chr22:38270836(+) A-I      intronic chr22:38252249(+) A-I      intronic chr22:38252084(+) A-I      intronic chr22:38269176(+) A-I      intronic chr22:38259978(+) A-I      intronic chr22:38268823(+) A-I      intronic chr22:38283077(+) A-I      intronic chr22:38255984(+) A-I      intronic chr22:38267756(+) A-I      intronic chr22:38267726(+) A-I      intronic chr22:38268194(+) A-I      intronic chr22:38260650(+) A-I      intronic chr22:38268738(+) A-I      intronic chr22:38253724(+) A-I      intronic chr22:38282020(+) A-I      intronic chr22:38279314(+) A-I      intronic chr22:38253802(+) A-I      intronic chr22:38254306(+) A-I      intronic chr22:38274326(+) A-I      intronic chr22:38274653(+) A-I      intronic chr22:38269561(+) A-I      intronic chr22:38275990(+) A-I      intronic chr22:38279325(+) A-I      intronic chr22:38265373(+) A-I      intronic chr22:38260645(+) A-I      intronic chr22:38275936(+) A-I      intronic chr22:38269125(+) A-I      intronic chr22:38269060(+) A-I      intronic chr22:38261347(+) A-I      intronic chr22:38253721(+) A-I      intronic chr22:38260729(+) A-I      intronic chr22:38255825(+) A-I      intronic chr22:38274610(+) A-I      intronic chr22:38262638(+) A-I      intronic chr22:38279841(+) A-I      intronic chr22:38268273(+) A-I      intronic chr22:38271121(+) A-I      intronic chr22:38275427(+) A-I      intronic chr22:38271120(+) A-I      intronic chr22:38268225(+) A-I      intronic chr22:38253995(+) A-I      intronic chr22:38268712(+) A-I      intronic chr22:38279148(+) A-I      intronic chr22:38275512(+) A-I      intronic chr22:38253726(+) A-I      intronic chr22:38271220(+) A-I      intronic chr22:38267755(+) A-I      intronic chr22:38277678(+) A-I      intronic chr22:38282054(+) A-I      intronic chr22:38269057(+) A-I      intronic chr22:38274489(+) A-I      intronic chr22:38281193(+) A-I      intronic chr22:38281788(+) A-I      intronic chr22:38281943(+) A-I      intronic chr22:38275417(+) A-I      intronic chr22:38252681(+) A-I      intronic chr22:38268315(+) A-I      intronic chr22:38254103(+) A-I      intronic chr22:38252632(+) A-I      intronic chr22:38254312(+) A-I      intronic chr22:38253191(+) A-I      intronic chr22:38252145(+) A-I      intronic chr22:38260176(+) A-I      intronic chr22:38269059(+) A-I      intronic chr22:38276082(+) A-I      intronic chr22:38264248(+) A-I      intronic chr22:38264994(+) A-I      intronic chr22:38265327(+) A-I      intronic chr22:38252201(+) A-I      intronic chr22:38277945(+) A-I      intronic chr22:38275346(+) A-I      intronic chr22:38269005(+) A-I      intronic chr22:38283362(+) A-I      intronic chr22:38275341(+) A-I      intronic chr22:38277359(+) A-I      intronic chr22:38252783(+) A-I      intronic chr22:38267092(+) A-I      intronic chr22:38266971(+) A-I      intronic chr22:38267020(+) A-I      intronic chr22:38275423(+) A-I      intronic chr22:38260100(+) A-I      intronic chr22:38281714(+) A-I      intronic chr22:38255969(+) A-I      intronic chr22:38253651(+) A-I      intronic chr22:38277935(+) A-I      intronic chr22:38268181(+) A-I      intronic chr22:38265187(+) A-I      intronic chr22:38264247(+) A-I      intronic chr22:38252486(+) A-I      intronic chr22:38271223(+) A-I      intronic chr22:38284808(+) A-I      3'UTR chr22:38284843(+) A-I      3'UTR chr22:38284968(+) A-I      3'UTR chr22:38285022(+) A-I      3'UTR chr22:38284927(+) A-I      3'UTR chr22:38285088(+) A-I      3'UTR chr22:38285239(+) A-I      3'UTR chr22:38285076(+) A-I      3'UTR chr22:38285016(+) A-I      3'UTR chr22:38285323(+) A-I      3'UTR chr22:38285186(+) A-I      3'UTR chr22:38284886(+) A-I      3'UTR chr22:38285354(+) A-I      3'UTR chr22:38284819(+) A-I      3'UTR chr22:38284872(+) A-I      3'UTR chr22:38262560(+) A-I      intronic chr22:38252126(+) A-I      intronic chr22:38253741(+) A-I      intronic chr22:38252114(+) A-I      intronic chr22:38257666(+) A-I      intronic chr22:38257438(+) A-I      intronic chr22:38277515(+) A-I      intronic chr22:38275131(+) A-I      intronic chr22:38263271(+) A-I      intronic chr22:38269562(+) A-I      intronic chr22:38281038(+) A-I      intronic chr22:38252144(+) A-I      intronic chr22:38274329(+) A-I      intronic chr22:38263148(+) A-I      intronic chr22:38283016(+) A-I      intronic chr22:38271190(+) A-I      intronic chr22:38253189(+) A-I      intronic chr22:38269486(+) A-I      intronic chr22:38255756(+) A-I      intronic chr22:38255824(+) A-I      intronic chr22:38253183(+) A-I      intronic chr22:38266972(+) A-I      intronic chr22:38276019(+) A-I      intronic chr22:38252393(+) A-I      intronic chr22:38279803(+) A-I      intronic chr22:38252118(+) A-I      intronic chr22:38256364(+) A-I      intronic chr22:38254266(+) A-I      intronic chr22:38258063(+) A-I      intronic chr22:38276076(+) A-I      intronic chr22:38263285(+) A-I      intronic chr22:38279128(+) A-I      intronic chr22:38275315(+) A-I      intronic chr22:38270815(+) A-I      intronic chr22:38267674(+) A-I      intronic chr22:38277677(+) A-I      intronic chr22:38281025(+) A-I      intronic chr22:38252196(+) A-I      intronic chr22:38275031(+) A-I      intronic chr22:38269264(+) A-I      intronic chr22:38261448(+) A-I      intronic chr22:38281803(+) A-I      intronic chr22:38252352(+) A-I      intronic chr22:38269547(+) A-I      intronic chr22:38252465(+) A-I      intronic chr22:38268689(+) A-I      intronic chr22:38282521(+) A-I      intronic chr22:38268830(+) A-I      intronic chr22:38281695(+) A-I      intronic chr22:38275350(+) A-I      intronic chr22:38278246(+) A-I      intronic chr22:38279315(+) A-I      intronic chr22:38282338(+) A-I      intronic chr22:38252223(+) A-I      intronic chr22:38267833(+) A-I      intronic chr22:38267014(+) A-I      intronic chr22:38253681(+) A-I      intronic chr22:38269216(+) A-I      intronic chr22:38254092(+) A-I      intronic chr22:38264208(+) A-I      intronic chr22:38263545(+) A-I      intronic chr22:38269435(+) A-I      intronic chr22:38277259(+) A-I      intronic chr22:38269470(+) A-I      intronic chr22:38267673(+) A-I      intronic chr22:38252336(+) A-I      intronic chr22:38253281(+) A-I      intronic chr22:38278240(+) A-I      intronic chr22:38267797(+) A-I      intronic chr22:38278471(+) A-I      intronic chr22:38267031(+) A-I      intronic chr22:38275964(+) A-I      intronic chr22:38275322(+) A-I      intronic chr22:38253283(+) A-I      intronic chr22:38279774(+) A-I      intronic chr22:38260675(+) A-I      intronic chr22:38274532(+) A-I      intronic chr22:38281924(+) A-I      intronic chr22:38253987(+) A-I      intronic chr22:38267055(+) A-I      intronic chr22:38271264(+) A-I      intronic chr22:38271265(+) A-I      intronic chr22:38275054(+) A-I      intronic chr22:38277265(+) A-I      intronic chr22:38279342(+) A-I      intronic chr22:38256509(+) A-I      intronic chr22:38282426(+) A-I      intronic chr22:38260685(+) A-I      intronic chr22:38257459(+) A-I      intronic chr22:38270840(+) A-I      intronic chr22:38283075(+) A-I      intronic chr22:38276715(+) A-I      intronic chr22:38267665(+) A-I      intronic chr22:38252687(+) A-I      intronic chr22:38255596(+) A-I      intronic chr22:38259915(+) A-I      intronic chr22:38281750(+) A-I      intronic chr22:38252696(+) A-I      intronic chr22:38269179(+) A-I      intronic chr22:38253921(+) A-I      intronic chr22:38271229(+) A-I      intronic chr22:38268819(+) A-I      intronic chr22:38253266(+) A-I      intronic chr22:38277556(+) A-I      intronic chr22:38281682(+) A-I      intronic chr22:38275375(+) A-I      intronic chr22:38253256(+) A-I      intronic chr22:38253250(+) A-I      intronic chr22:38255834(+) A-I      intronic chr22:38263555(+) A-I      intronic chr22:38275134(+) A-I      intronic chr22:38283498(+) A-I      intronic chr22:38282397(+) A-I      intronic chr22:38269096(+) A-I      intronic chr22:38252580(+) A-I      intronic chr22:38260808(+) A-I      intronic chr22:38253656(+) A-I      intronic chr22:38252693(+) A-I      intronic chr22:38266973(+) A-I      intronic chr22:38279871(+) A-I      intronic chr22:38283404(+) A-I      intronic chr22:38268180(+) A-I      intronic chr22:38275330(+) A-I      intronic chr22:38252158(+) A-I      intronic chr22:38283484(+) A-I      intronic chr22:38275044(+) A-I      intronic chr22:38260117(+) A-I      intronic chr22:38259912(+) A-I      intronic chr22:38265301(+) A-I      intronic chr22:38283361(+) A-I      intronic chr22:38276748(+) A-I      intronic chr22:38264600(+) A-I      intronic chr22:38279849(+) A-I      intronic chr22:38276538(+) A-I      intronic chr22:38269444(+) A-I      intronic chr22:38253190(+) A-I      intronic chr22:38252306(+) A-I      intronic chr22:38277583(+) A-I      intronic chr22:38268657(+) A-I      intronic chr22:38258139(+) A-I      intronic chr22:38271226(+) A-I      intronic chr22:38270805(+) A-I      intronic chr22:38252491(+) A-I      intronic chr22:38266870(+) A-I      intronic chr22:38260646(+) A-I      intronic chr22:38283485(+) A-I      intronic chr22:38263157(+) A-I      intronic chr22:38252637(+) A-I      intronic chr22:38250575(+) A-I      intronic chr22:38260181(+) A-I      intronic chr22:38254332(+) A-I      intronic chr22:38265321(+) A-I      intronic chr22:38270875(+) A-I      intronic chr22:38267791(+) A-I      intronic chr22:38276684(+) A-I      intronic chr22:38254112(+) A-I      intronic chr22:38255835(+) A-I      intronic chr22:38253922(+) A-I      intronic chr22:38277590(+) A-I      intronic chr22:38257437(+) A-I      intronic chr22:38263706(+) A-I      intronic chr22:38267221(+) A-I      ncRNA

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	EIF3L	chr22:38265338(+) A-I intron -    22327324 chr22:38268181(+) A-I intron -    22327324 chr22:38268194(+) A-I intron -    22327324 chr22:38268224(+) A-I intron -    22327324 chr22:38268225(+) A-I intron -    22327324 chr22:38268366(+) A-I intron -    22327324 chr22:38268657(+) A-I intron -    21960545 chr22:38269804(+) A-I intron -    21960545 chr22:38252345(+) A-G intron -    22484847 chr22:38252352(+) A-G intron -    22484847 chr22:38252681(+) A-G intron -    22484847 chr22:38252690(+) A-G intron -    22484847 chr22:38253939(+) A-G intron -    22484847 chr22:38254266(+) A-G intron -    22484847 chr22:38260100(+) A-G intron -    22484847 chr22:38262537(+) A-G intron -    22484847 chr22:38262560(+) A-G intron -    22484847 chr22:38267665(+) A-G intron -    22484847 chr22:38268181(+) A-G intron -    22484847 chr22:38268194(+) A-G intron -    22484847 chr22:38268224(+) A-G intron -    22484847 chr22:38268225(+) A-G intron -    22484847 chr22:38268366(+) A-G intron -    22484847 chr22:38268657(+) A-G intron -    22484847 chr22:38268687(+) A-G intron -    22484847 chr22:38268689(+) A-G intron -    22484847 chr22:38269125(+) A-G intron -    22484847 chr22:38271264(+) A-G intron -    22484847 chr22:38271265(+) A-G intron -    22484847 chr22:38278516(+) A-G intron -    22484847 chr22:38278846(+) A-G intron -    22484847 chr22:38278848(+) A-G intron -    22484847 chr22:38282019(+) A-G intron -    22484847 chr22:38282020(+) A-G intron -    22484847 chr22:38282054(+) A-G intron -    22484847 chr22:38283075(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	EIF3L	chr22:38245214-38245215(+) m6A 5'UTR       24209618//24981863 chr22:38245260-38245261(+) m6A 5'UTR       24209618//24981863 chr22:38245383-38245384(+) m6A 5'UTR//CDS       24981863 chr22:38245540-38245541(+) m6A 5'UTR//intron       - chr22:38247364-38247365(+) m6A 3'UTR//5'UTR//CDS//exon       27773535 chr22:38247387-38247388(+) m6A 3'UTR//5'UTR//CDS//exon       27773535 chr22:38271896-38271897(+) Y CDS//exon       26075521 chr22:38271997-38271998(+) m6A CDS//exon       22575960//22608085 chr22:38273789-38273790(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr22:38273835-38273836(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085 chr22:38273845-38273846(+) Y CDS//exon       26075521 chr22:38274041-38274042(+) m6A CDS//exon       22575960 chr22:38282790-38282791(+) m6A CDS//exon       27773535 chr22:38284441-38284442(+) m6A CDS//exon       27773535 chr22:38284458-38284459(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535 chr22:38284464-38284465(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535 chr22:38284493-38284494(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr22:38284540-38284541(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr22:38284591-38284592(+) m6A 3'UTR//exon       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	EIF3L	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol K562 cells     - Exosome Blood     - Membrane K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     - Ribosome-free cytosol Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART9-5p
Interactor2: EIF3L

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Prediction-Evidence	PARalyzer
Support Database	ViRBase//VIRmiRNA

References:

PMID	22100165	Target region	3'UTR
Source	ViRBase//VIRmiRNA	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	BC-1 cells	Interactor2 expression	Downregulation
Description	Using PAR-CLIP, a technology which allows the direct and transcriptome-wide identification of miRNA targets, we delineate the target sites for all viral and cellular miRNAs expressed in PEL cell lines. The resulting data set revealed that KSHV miRNAs directly target more than 2000 cellular mRNAs, including many involved in pathways relevant to KSHV pathogenesis. Moreover, 58% of these mRNAs are also targeted by EBV miRNAs, via distinct binding sites.Clusters with seed matches to expressed miRNAs were considered candidate target sites. Of the clusters mapping to human 3'UTRs, 69% (BC-1) and 70% (BC-3) had seed matches to expressed miRNAs (Tables S6).Table S6A BC-1 derived 3'UTR clusters with seed matches to expressed miRNAs.