Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00397351

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.6002

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART9-5p:  MIMAT0004816          ATXN1:  NR_152112     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART9-5p	ATXN1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0004816	6310
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	ATX1//D6S504E//SCA1

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	ATXN1	chr6:16619558(-) A-I      intronic chr6:16619596(-) A-I      intronic chr6:16725024(-) A-I      intronic chr6:16722977(-) A-I      intronic chr6:16722979(-) A-I      intronic chr6:16722973(-) A-I      intronic chr6:16619604(-) A-I      intronic chr6:16619623(-) A-I      intronic chr6:16722989(-) A-I      intronic chr6:16725034(-) A-I      intronic chr6:16725036(-) A-I      intronic chr6:16722994(-) A-I      intronic chr6:16725046(-) A-I      intronic chr6:16725048(-) A-I      intronic chr6:16725063(-) A-I      intronic chr6:16607468(-) A-I      intronic chr6:16725033(-) A-I      intronic chr6:16619589(-) A-I      intronic chr6:16689728(-) A-I      intronic chr6:16689718(-) A-I      intronic chr6:16310099(-) A-I      intronic chr6:16308385(-) A-I      intronic chr6:16310897(-) A-I      intronic chr6:16353822(-) A-I      intronic chr6:16372927(-) A-I      intronic chr6:16470086(-) A-I      intronic chr6:16602909(-) A-I      intronic chr6:16627792(-) A-I      intronic chr6:16689607(-) A-I      intronic chr6:16444183(-) A-I      intronic chr6:16444271(-) A-I      intronic chr6:16444278(-) A-I      intronic chr6:16447584(-) A-I      intronic chr6:16447659(-) A-I      intronic chr6:16447701(-) A-I      intronic chr6:16447874(-) A-I      intronic chr6:16465576(-) A-I      intronic chr6:16646331(-) A-I      intronic chr6:16411273(-) A-I      intronic chr6:16411244(-) A-I      intronic chr6:16411199(-) A-I      intronic chr6:16411151(-) A-I      intronic chr6:16409832(-) A-I      intronic chr6:16409802(-) A-I      intronic chr6:16409801(-) A-I      intronic chr6:16409772(-) A-I      intronic chr6:16409762(-) A-I      intronic chr6:16409128(-) A-I      intronic chr6:16409064(-) A-I      intronic chr6:16403808(-) A-I      intronic chr6:16401644(-) A-I      intronic chr6:16585402(-) A-I      intronic chr6:16401607(-) A-I      intronic chr6:16626705(-) A-I      intronic chr6:16627810(-) A-I      intronic chr6:16397722(-) A-I      intronic chr6:16397694(-) A-I      intronic chr6:16397609(-) A-I      intronic chr6:16397567(-) A-I      intronic chr6:16397534(-) A-I      intronic chr6:16585416(-) A-I      intronic chr6:16594810(-) A-I      intronic chr6:16594825(-) A-I      intronic chr6:16627842(-) A-I      intronic chr6:16627875(-) A-I      intronic chr6:16627876(-) A-I      intronic chr6:16629631(-) A-I      intronic chr6:16612229(-) A-I      intronic chr6:16629687(-) A-I      intronic chr6:16629696(-) A-I      intronic chr6:16629706(-) A-I      intronic chr6:16395467(-) A-I      intronic chr6:16395418(-) A-I      intronic chr6:16733724(-) A-I      intronic chr6:16733995(-) A-I      intronic chr6:16733996(-) A-I      intronic chr6:16734157(-) A-I      intronic chr6:16393739(-) A-I      intronic chr6:16393732(-) A-I      intronic chr6:16734260(-) A-I      intronic chr6:16392978(-) A-I      intronic chr6:16734921(-) A-I      intronic chr6:16629818(-) A-I      intronic chr6:16629921(-) A-I      intronic chr6:16640797(-) A-I      intronic chr6:16647403(-) A-I      intronic chr6:16647505(-) A-I      intronic chr6:16647528(-) A-I      intronic chr6:16648122(-) A-I      intronic chr6:16648141(-) A-I      intronic chr6:16648159(-) A-I      intronic chr6:16392925(-) A-I      intronic chr6:16392906(-) A-I      intronic chr6:16612255(-) A-I      intronic chr6:16392897(-) A-I      intronic chr6:16392823(-) A-I      intronic chr6:16391317(-) A-I      intronic chr6:16391271(-) A-I      intronic chr6:16391269(-) A-I      intronic chr6:16734976(-) A-I      intronic chr6:16612296(-) A-I      intronic chr6:16612369(-) A-I      intronic chr6:16612978(-) A-I      intronic chr6:16387189(-) A-I      intronic chr6:16387176(-) A-I      intronic chr6:16387175(-) A-I      intronic chr6:16613000(-) A-I      intronic chr6:16613010(-) A-I      intronic chr6:16648268(-) A-I      intronic chr6:16601962(-) A-I      intronic chr6:16602037(-) A-I      intronic chr6:16650183(-) A-I      intronic chr6:16651557(-) A-I      intronic chr6:16491464(-) A-I      intronic chr6:16480330(-) A-I      intronic chr6:16480283(-) A-I      intronic chr6:16447523(-) A-I      intronic chr6:16447547(-) A-I      intronic chr6:16480180(-) A-I      intronic chr6:16468692(-) A-I      intronic chr6:16468615(-) A-I      intronic chr6:16468555(-) A-I      intronic chr6:16465579(-) A-I      intronic chr6:16651635(-) A-I      intronic chr6:16651692(-) A-I      intronic chr6:16651712(-) A-I      intronic chr6:16447548(-) A-I      intronic chr6:16387167(-) A-I      intronic chr6:16602050(-) A-I      intronic chr6:16602811(-) A-I      intronic chr6:16604900(-) A-I      intronic chr6:16480301(-) A-I      intronic chr6:16612265(-) A-I      intronic chr6:16612129(-) A-I      intronic chr6:16650279(-) A-I      intronic chr6:16650287(-) A-I      intronic chr6:16444103(-) A-I      intronic chr6:16444180(-) A-I      intronic chr6:16314882(-) A-I      intronic chr6:16317694(-) A-I      intronic chr6:16694606(-) A-I      intronic chr6:16566965(-) A-I      intronic chr6:16566704(-) A-I      intronic chr6:16558450(-) A-I      intronic chr6:16539091(-) A-I      intronic chr6:16613014(-) A-I      intronic chr6:16539077(-) A-I      intronic chr6:16314943(-) A-I      intronic chr6:16447488(-) A-I      intronic chr6:16613022(-) A-I      intronic chr6:16613948(-) A-I      intronic chr6:16616588(-) A-I      intronic chr6:16626692(-) A-I      intronic chr6:16447502(-) A-I      intronic chr6:16447513(-) A-I      intronic chr6:16626698(-) A-I      intronic chr6:16549140(-) A-I      intronic chr6:16447518(-) A-I      intronic chr6:16571815(-) A-I      intronic chr6:16612187(-) A-I      intronic chr6:16585350(-) A-I      intronic chr6:16429755(-) A-I      intronic chr6:16411304(-) A-I      intronic chr6:16411280(-) A-I      intronic chr6:16411274(-) A-I      intronic chr6:16480326(-) A-I      intronic chr6:16310810(-) A-I      intronic chr6:16310117(-) A-I      intronic chr6:16721839(-) A-I      intronic chr6:16694617(-) A-I      intronic chr6:16696162(-) A-I      intronic chr6:16730257(-) A-I      intronic chr6:16730270(-) A-I      intronic chr6:16730279(-) A-I      intronic chr6:16730297(-) A-I      intronic chr6:16712050(-) A-I      intronic chr6:16710897(-) A-I      intronic chr6:16648062(-) A-I      intronic chr6:16721806(-) A-I      intronic chr6:16721775(-) A-I      intronic chr6:16721742(-) A-I      intronic chr6:16711023(-) A-I      intronic chr6:16711018(-) A-I      intronic chr6:16651723(-) A-I      intronic chr6:16655636(-) A-I      intronic chr6:16674696(-) A-I      intronic chr6:16674713(-) A-I      intronic chr6:16429944(-) A-I      intronic chr6:16674718(-) A-I      intronic chr6:16674719(-) A-I      intronic chr6:16674755(-) A-I      intronic chr6:16674838(-) A-I      intronic chr6:16696112(-) A-I      intronic chr6:16696083(-) A-I      intronic chr6:16696018(-) A-I      intronic chr6:16694678(-) A-I      intronic chr6:16694600(-) A-I      intronic chr6:16373038(-) A-I      intronic chr6:16373031(-) A-I      intronic chr6:16372942(-) A-I      intronic chr6:16371936(-) A-I      intronic chr6:16371908(-) A-I      intronic chr6:16366998(-) A-I      intronic chr6:16366990(-) A-I      intronic chr6:16366955(-) A-I      intronic chr6:16366943(-) A-I      intronic chr6:16366925(-) A-I      intronic chr6:16366912(-) A-I      intronic chr6:16366890(-) A-I      intronic chr6:16366848(-) A-I      intronic chr6:16365532(-) A-I      intronic chr6:16365480(-) A-I      intronic chr6:16356067(-) A-I      intronic chr6:16354672(-) A-I      intronic chr6:16354554(-) A-I      intronic chr6:16353829(-) A-I      intronic chr6:16353793(-) A-I      intronic chr6:16353742(-) A-I      intronic chr6:16353735(-) A-I      intronic chr6:16351920(-) A-I      intronic chr6:16351813(-) A-I      intronic chr6:16351811(-) A-I      intronic chr6:16351232(-) A-I      intronic chr6:16351207(-) A-I      intronic chr6:16349677(-) A-I      intronic chr6:16349634(-) A-I      intronic chr6:16348745(-) A-I      intronic chr6:16348432(-) A-I      intronic chr6:16343549(-) A-I      intronic chr6:16343523(-) A-I      intronic chr6:16343341(-) A-I      intronic chr6:16340291(-) A-I      intronic chr6:16340119(-) A-I      intronic chr6:16329072(-) A-I      intronic chr6:16326110(-) A-I      intronic chr6:16325622(-) A-I      intronic chr6:16325487(-) A-I      intronic chr6:16325486(-) A-I      intronic chr6:16325481(-) A-I      intronic chr6:16324570(-) A-I      intronic chr6:16324563(-) A-I      intronic chr6:16319373(-) A-I      intronic chr6:16319324(-) A-I      intronic chr6:16316854(-) A-I      intronic chr6:16316850(-) A-I      intronic chr6:16316804(-) A-I      intronic chr6:16316771(-) A-I      intronic chr6:16316052(-) A-I      intronic chr6:16316001(-) A-I      intronic chr6:16692479(-) A-I      intronic chr6:16692469(-) A-I      intronic chr6:16315978(-) A-I      intronic chr6:16315088(-) A-I      intronic chr6:16315020(-) A-I      intronic chr6:16315019(-) A-I      intronic chr6:16314901(-) A-I      intronic chr6:16313269(-) A-I      intronic chr6:16312912(-) A-I      intronic chr6:16312877(-) A-I      intronic chr6:16312587(-) A-I      intronic chr6:16311011(-) A-I      intronic chr6:16310898(-) A-I      intronic chr6:16310825(-) A-I      intronic chr6:16675962(-) A-I      intronic chr6:16689753(-) A-I      intronic chr6:16689743(-) A-I      intronic chr6:16585396(-) A-I      intronic chr6:16732636(-) A-I      intronic chr6:16397569(-) A-I      intronic chr6:16572125(-) A-I      intronic chr6:16651699(-) A-I      intronic chr6:16392757(-) A-I      intronic chr6:16325421(-) A-I      intronic chr6:16696192(-) A-I      intronic chr6:16343319(-) A-I      intronic chr6:16330393(-) A-I      intronic chr6:16613899(-) A-I      intronic chr6:16557350(-) A-I      intronic chr6:16436257(-) A-I      intronic chr6:16674860(-) A-I      intronic chr6:16322235(-) A-I      intronic chr6:16606373(-) A-I      intronic chr6:16689653(-) A-I      intronic chr6:16557436(-) A-I      intronic chr6:16613801(-) A-I      intronic chr6:16662631(-) A-I      intronic chr6:16316712(-) A-I      intronic chr6:16470980(-) A-I      intronic chr6:16480235(-) A-I      intronic chr6:16588099(-) A-I      intronic chr6:16470029(-) A-I      intronic chr6:16604945(-) A-I      intronic chr6:16315977(-) A-I      intronic chr6:16428488(-) A-I      intronic chr6:16657424(-) A-I      intronic chr6:16711964(-) A-I      intronic chr6:16690375(-) A-I      intronic chr6:16674798(-) A-I      intronic chr6:16571876(-) A-I      intronic chr6:16353858(-) A-I      intronic chr6:16689637(-) A-I      intronic chr6:16655631(-) A-I      intronic chr6:16549107(-) A-I      intronic chr6:16403746(-) A-I      intronic chr6:16415693(-) A-I      intronic chr6:16382392(-) A-I      intronic chr6:16447594(-) A-I      intronic chr6:16558822(-) A-I      intronic chr6:16309349(-) A-I      intronic chr6:16310829(-) A-I      intronic chr6:16646453(-) A-I      intronic chr6:16428487(-) A-I      intronic chr6:16353721(-) A-I      intronic chr6:16734799(-) A-I      intronic chr6:16357597(-) A-I      intronic chr6:16602793(-) A-I      intronic chr6:16393635(-) A-I      intronic chr6:16356076(-) A-I      intronic chr6:16326091(-) A-I      intronic chr6:16373065(-) A-I      intronic chr6:16734920(-) A-I      intronic chr6:16648267(-) A-I      intronic chr6:16606233(-) A-I      intronic chr6:16539038(-) A-I      intronic chr6:16351147(-) A-I      intronic chr6:16391181(-) A-I      intronic chr6:16348864(-) A-I      intronic chr6:16605050(-) A-I      intronic chr6:16307861(-) A-I      intronic chr6:16447593(-) A-I      intronic chr6:16734015(-) A-I      intronic chr6:16357773(-) A-I      intronic chr6:16349479(-) A-I      intronic chr6:16734926(-) A-I      intronic chr6:16357677(-) A-I      intronic chr6:16338452(-) A-I      intronic chr6:16733699(-) A-I      intronic chr6:16351702(-) A-I      intronic chr6:16371853(-) A-I      intronic chr6:16391245(-) A-I      intronic chr6:16429709(-) A-I      intronic chr6:16326088(-) A-I      intronic chr6:16734867(-) A-I      intronic chr6:16353783(-) A-I      intronic chr6:16317610(-) A-I      intronic chr6:16310842(-) A-I      intronic chr6:16734863(-) A-I      intronic chr6:16734899(-) A-I      intronic chr6:16310182(-) A-I      intronic chr6:16673159(-) A-I      intronic chr6:16674794(-) A-I      intronic chr6:16480210(-) A-I      intronic chr6:16480138(-) A-I      intronic chr6:16316186(-) A-I      intronic chr6:16365407(-) A-I      intronic chr6:16655508(-) A-I      intronic chr6:16316721(-) A-I      intronic chr6:16447580(-) A-I      intronic chr6:16675924(-) A-I      intronic chr6:16392887(-) A-I      intronic chr6:16711222(-) A-I      intronic chr6:16558449(-) A-I      intronic chr6:16523352(-) A-I      intronic chr6:16734836(-) A-I      intronic chr6:16403777(-) A-I      intronic chr6:16734992(-) A-I      intronic chr6:16468417(-) A-I      intronic chr6:16734850(-) A-I      intronic chr6:16348562(-) A-I      intronic chr6:16466527(-) A-I      intronic chr6:16343512(-) A-I      intronic chr6:16393708(-) A-I      intronic chr6:16354734(-) A-I      intronic chr6:16349616(-) A-I      intronic chr6:16674861(-) A-I      intronic chr6:16346929(-) A-I      intronic chr6:16348863(-) A-I      intronic chr6:16630036(-) A-I      intronic chr6:16342163(-) A-I      intronic chr6:16443369(-) A-I      intronic chr6:16324566(-) A-I      intronic chr6:16648265(-) A-I      intronic chr6:16312825(-) A-I      intronic chr6:16391244(-) A-I      intronic chr6:16351637(-) A-I      intronic chr6:16558890(-) A-I      intronic chr6:16734149(-) A-I      intronic chr6:16351191(-) A-I      intronic chr6:16340240(-) A-I      intronic chr6:16310991(-) A-I      intronic chr6:16733533(-) A-I      intronic chr6:16313397(-) A-I      intronic chr6:16539055(-) A-I      intronic chr6:16397570(-) A-I      intronic chr6:16657423(-) A-I      intronic chr6:16315006(-) A-I      intronic chr6:16322207(-) A-I      intronic chr6:16734804(-) A-I      intronic chr6:16353903(-) A-I      intronic chr6:16316026(-) A-I      intronic chr6:16316208(-) A-I      intronic chr6:16694584(-) A-I      intronic chr6:16630000(-) A-I      intronic chr6:16316784(-) A-I      intronic chr6:16726489(-) A-I      intronic chr6:16340307(-) A-I      intronic chr6:16601837(-) A-I      intronic chr6:16694613(-) A-I      intronic chr6:16558703(-) A-I      intronic chr6:16650320(-) A-I      intronic chr6:16316058(-) A-I      intronic chr6:16393590(-) A-I      intronic chr6:16465437(-) A-I      intronic chr6:16692238(-) A-I      intronic chr6:16675877(-) A-I      intronic chr6:16353757(-) A-I      intronic chr6:16626816(-) A-I      intronic chr6:16571946(-) A-I      intronic chr6:16382428(-) A-I      intronic chr6:16692375(-) A-I      intronic chr6:16346594(-) A-I      intronic chr6:16316733(-) A-I      intronic chr6:16674630(-) A-I      intronic chr6:16640750(-) A-I      intronic chr6:16626800(-) A-I      intronic chr6:16397633(-) A-I      intronic chr6:16349671(-) A-I      intronic chr6:16480217(-) A-I      intronic chr6:16692329(-) A-I      intronic chr6:16655625(-) A-I      intronic chr6:16626625(-) A-I      intronic chr6:16613039(-) A-I      intronic chr6:16696095(-) A-I      intronic chr6:16397578(-) A-I      intronic chr6:16357708(-) A-I      intronic chr6:16312865(-) A-I      intronic chr6:16395380(-) A-I      intronic chr6:16657447(-) A-I      intronic chr6:16373064(-) A-I      intronic chr6:16443337(-) A-I      intronic chr6:16342275(-) A-I      intronic chr6:16372005(-) A-I      intronic chr6:16629984(-) A-I      intronic chr6:16315114(-) A-I      intronic chr6:16316025(-) A-I      intronic chr6:16694593(-) A-I      intronic chr6:16325445(-) A-I      intronic chr6:16366841(-) A-I      intronic chr6:16734815(-) A-I      intronic chr6:16373157(-) A-I      intronic chr6:16696181(-) A-I      intronic chr6:16733535(-) A-I      intronic chr6:16313357(-) A-I      intronic chr6:16606265(-) A-I      intronic chr6:16403628(-) A-I      intronic chr6:16648195(-) A-I      intronic chr6:16629802(-) A-I      intronic chr6:16640725(-) A-I      intronic chr6:16612918(-) A-I      intronic chr6:16389456(-) A-I      intronic chr6:16403849(-) A-I      intronic chr6:16480275(-) A-I      intronic chr6:16734997(-) A-I      intronic chr6:16353853(-) A-I      intronic chr6:16626799(-) A-I      intronic chr6:16447648(-) A-I      intronic chr6:16736015(-) A-I      intronic chr6:16454209(-) A-I      intronic chr6:16343464(-) A-I      intronic chr6:16308219(-) A-I      intronic chr6:16585207(-) A-I      intronic chr6:16604504(-) A-I      intronic chr6:16612930(-) A-I      intronic chr6:16368235(-) A-I      intronic chr6:16392896(-) A-I      intronic chr6:16323668(-) A-I      intronic chr6:16316112(-) A-I      intronic chr6:16696079(-) A-I      intronic chr6:16650256(-) A-I      intronic chr6:16539045(-) A-I      intronic chr6:16392954(-) A-I      intronic chr6:16447529(-) A-I      intronic chr6:16393630(-) A-I      intronic chr6:16310938(-) A-I      intronic chr6:16574771(-) A-I      intronic chr6:16734957(-) A-I      intronic chr6:16324558(-) A-I      intronic chr6:16567024(-) A-I      intronic chr6:16676106(-) A-I      intronic chr6:16611052(-) A-I      intronic chr6:16354722(-) A-I      intronic chr6:16310852(-) A-I      intronic chr6:16317641(-) A-I      intronic chr6:16351860(-) A-I      intronic chr6:16647400(-) A-I      intronic chr6:16633104(-) A-I      intronic chr6:16539013(-) A-I      intronic chr6:16734793(-) A-I      intronic chr6:16733599(-) A-I      intronic chr6:16325460(-) A-I      intronic chr6:16312915(-) A-I      intronic chr6:16351712(-) A-I      intronic chr6:16694596(-) A-I      intronic chr6:16650275(-) A-I      intronic chr6:16348379(-) A-I      intronic chr6:16733911(-) A-I      intronic chr6:16674020(-) A-I      intronic chr6:16351701(-) A-I      intronic chr6:16314939(-) A-I      intronic chr6:16537770(-) A-I      intronic chr6:16409104(-) A-I      intronic chr6:16309407(-) A-I      intronic chr6:16351126(-) A-I      intronic chr6:16392959(-) A-I      intronic chr6:16650323(-) A-I      intronic chr6:16690368(-) A-I      intronic chr6:16558660(-) A-I      intronic chr6:16343500(-) A-I      intronic chr6:16357609(-) A-I      intronic chr6:16611140(-) A-I      intronic chr6:16357704(-) A-I      intronic chr6:16447805(-) A-I      intronic chr6:16348374(-) A-I      intronic chr6:16572093(-) A-I      intronic chr6:16734835(-) A-I      intronic chr6:16711973(-) A-I      intronic chr6:16322450(-) A-I      intronic chr6:16692310(-) A-I      intronic chr6:16392789(-) A-I      intronic chr6:16314020(-) A-I      intronic chr6:16315121(-) A-I      intronic chr6:16606871(-) A-I      intronic chr6:16539120(-) A-I      intronic chr6:16630066(-) A-I      intronic chr6:16351190(-) A-I      intronic chr6:16353859(-) A-I      intronic chr6:16308285(-) A-I      intronic chr6:16662791(-) A-I      intronic chr6:16313344(-) A-I      intronic chr6:16403705(-) A-I      intronic chr6:16648259(-) A-I      intronic chr6:16476197(-) A-I      intronic chr6:16647374(-) A-I      intronic chr6:16537701(-) A-I      intronic chr6:16696164(-) A-I      intronic chr6:16316977(-) A-I      intronic chr6:16466466(-) A-I      intronic chr6:16604925(-) A-I      intronic chr6:16629655(-) A-I      intronic chr6:16557446(-) A-I      intronic chr6:16342204(-) A-I      intronic chr6:16560633(-) A-I      intronic chr6:16639747(-) A-I      intronic chr6:16734034(-) A-I      intronic chr6:16322281(-) A-I      intronic chr6:16325446(-) A-I      intronic chr6:16597818(-) A-I      intronic chr6:16560621(-) A-I      intronic chr6:16365546(-) A-I      intronic chr6:16454206(-) A-I      intronic chr6:16712095(-) A-I      intronic chr6:16353739(-) A-I      intronic chr6:16480139(-) A-I      intronic chr6:16371904(-) A-I      intronic chr6:16308495(-) A-I      intronic chr6:16692404(-) A-I      intronic chr6:16673068(-) A-I      intronic chr6:16605066(-) A-I      intronic chr6:16393649(-) A-I      intronic chr6:16409850(-) A-I      intronic chr6:16447758(-) A-I      intronic chr6:16736010(-) A-I      intronic chr6:16308263(-) A-I      intronic chr6:16312897(-) A-I      intronic chr6:16647430(-) A-I      intronic chr6:16309210(-) A-I      intronic chr6:16316895(-) A-I      intronic chr6:16324416(-) A-I      intronic chr6:16696189(-) A-I      intronic chr6:16470012(-) A-I      intronic chr6:16629755(-) A-I      intronic chr6:16734122(-) A-I      intronic chr6:16351900(-) A-I      intronic chr6:16655641(-) A-I      intronic chr6:16629613(-) A-I      intronic chr6:16325411(-) A-I      intronic chr6:16443326(-) A-I      intronic chr6:16604615(-) A-I      intronic chr6:16313289(-) A-I      intronic chr6:16389446(-) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	ATXN1	chr6:16326110(-) A-I intron -    21960545 chr6:16397114(-) A-I intron -    21960545 chr6:16397146(-) A-I intron -    21960545 chr6:16409110(-) A-I intron -    21960545 chr6:16654767(-) A-I intron -    21960545 chr6:16689637(-) A-I intron -    21960545 chr6:16696079(-) A-I intron -    21960545 chr6:16722924(-) A-I intron -    21960545 chr6:16725033(-) A-I intron -    21960545 chr6:16727194(-) A-I intron -    21960545 chr6:16736010(-) A-I intron -    21960545 chr6:16736015(-) A-I intron -    21960545 chr6:16736016(-) A-I intron -    21960545 chr6:16562736(-) C-T intron -    22484847 chr6:16562738(-) T-C intron -    22484847 chr6:16607520(-) A-G intron -    22484847 chr6:16308391(-) A-G intron -    22484847 chr6:16310811(-) A-G intron -    22484847 chr6:16312825(-) A-G intron -    22484847 chr6:16312865(-) A-G intron -    22484847 chr6:16312897(-) A-G intron -    22484847 chr6:16315101(-) A-G intron -    22484847 chr6:16316733(-) A-G intron -    22484847 chr6:16316895(-) A-G intron -    22484847 chr6:16322235(-) A-G intron -    22484847 chr6:16326091(-) A-G intron -    22484847 chr6:16340240(-) A-G intron -    22484847 chr6:16343319(-) A-G intron -    22484847 chr6:16343386(-) A-G intron -    22484847 chr6:16343411(-) A-G intron -    22484847 chr6:16343500(-) A-G intron -    22484847 chr6:16343512(-) A-G intron -    22484847 chr6:16343569(-) A-G intron -    22484847 chr6:16346594(-) A-G intron -    22484847 chr6:16348455(-) A-G intron -    22484847 chr6:16348863(-) A-G intron -    22484847 chr6:16348864(-) A-G intron -    22484847 chr6:16349616(-) A-G intron -    22484847 chr6:16349671(-) A-G intron -    22484847 chr6:16349672(-) A-G intron -    22484847 chr6:16351126(-) A-G intron -    22484847 chr6:16351190(-) A-G intron -    22484847 chr6:16351262(-) A-G intron -    22484847 chr6:16351268(-) A-G intron -    22484847 chr6:16351701(-) A-G intron -    22484847 chr6:16351860(-) A-G intron -    22484847 chr6:16351900(-) A-G intron -    22484847 chr6:16353739(-) A-G intron -    22484847 chr6:16353757(-) A-G intron -    22484847 chr6:16353783(-) A-G intron -    22484847 chr6:16353853(-) A-G intron -    22484847 chr6:16353858(-) A-G intron -    22484847 chr6:16353859(-) A-G intron -    22484847 chr6:16353903(-) A-G intron -    22484847 chr6:16354666(-) A-G intron -    22484847 chr6:16354722(-) A-G intron -    22484847 chr6:16391181(-) A-G intron -    22484847 chr6:16391244(-) A-G intron -    22484847 chr6:16391245(-) A-G intron -    22484847 chr6:16391249(-) A-G intron -    22484847 chr6:16391281(-) A-G intron -    22484847 chr6:16391346(-) A-G intron -    22484847 chr6:16391347(-) A-G intron -    22484847 chr6:16392757(-) A-G intron -    22484847 chr6:16392789(-) A-G intron -    22484847 chr6:16392819(-) A-G intron -    22484847 chr6:16392887(-) A-G intron -    22484847 chr6:16392891(-) A-G intron -    22484847 chr6:16392896(-) A-G intron -    22484847 chr6:16392954(-) A-G intron -    22484847 chr6:16392959(-) A-G intron -    22484847 chr6:16397569(-) A-G intron -    22484847 chr6:16397632(-) A-G intron -    22484847 chr6:16397633(-) A-G intron -    22484847 chr6:16401606(-) A-G intron -    22484847 chr6:16409096(-) A-G intron -    22484847 chr6:16409110(-) A-G intron -    22484847 chr6:16409784(-) A-G intron -    22484847 chr6:16411377(-) C-T intron -    22484847 chr6:16415585(-) G-A intron -    22484847 chr6:16415586(-) C-T intron -    22484847 chr6:16443305(-) A-G intron -    22484847 chr6:16443313(-) A-G intron -    22484847 chr6:16443326(-) A-G intron -    22484847 chr6:16443337(-) A-G intron -    22484847 chr6:16447758(-) A-G intron -    22484847 chr6:16447805(-) A-G intron -    22484847 chr6:16447867(-) A-G intron -    22484847 chr6:16465680(-) A-G intron -    22484847 chr6:16466434(-) A-G intron -    22484847 chr6:16466446(-) A-G intron -    22484847 chr6:16466527(-) A-G intron -    22484847 chr6:16468541(-) A-G intron -    22484847 chr6:16468679(-) A-G intron -    22484847 chr6:16523352(-) A-G intron -    22484847 chr6:16537701(-) A-G intron -    22484847 chr6:16539038(-) A-G intron -    22484847 chr6:16539055(-) A-G intron -    22484847 chr6:16539120(-) A-G intron -    22484847 chr6:16558822(-) A-G intron -    22484847 chr6:16558890(-) A-G intron -    22484847 chr6:16569759(-) C-T intron -    22484847 chr6:16572125(-) A-G intron -    22484847 chr6:16577584(-) T-C intron -    22484847 chr6:16602793(-) A-G intron -    22484847 chr6:16606233(-) A-G intron -    22484847 chr6:16606298(-) A-G intron -    22484847 chr6:16606871(-) A-G intron -    22484847 chr6:16612930(-) A-G intron -    22484847 chr6:16613039(-) A-G intron -    22484847 chr6:16626799(-) A-G intron -    22484847 chr6:16626800(-) A-G intron -    22484847 chr6:16626816(-) A-G intron -    22484847 chr6:16629655(-) A-G intron -    22484847 chr6:16629755(-) A-G intron -    22484847 chr6:16629802(-) A-G intron -    22484847 chr6:16629984(-) A-G intron -    22484847 chr6:16630000(-) A-G intron -    22484847 chr6:16630026(-) A-G intron -    22484847 chr6:16630036(-) A-G intron -    22484847 chr6:16630065(-) A-G intron -    22484847 chr6:16630066(-) A-G intron -    22484847 chr6:16630148(-) G-T intron -    22484847 chr6:16639682(-) A-G intron -    22484847 chr6:16643619(-) T-C intron -    22484847 chr6:16644575(-) T-C intron -    22484847 chr6:16646453(-) A-G intron -    22484847 chr6:16647374(-) A-G intron -    22484847 chr6:16647400(-) A-G intron -    22484847 chr6:16647430(-) A-G intron -    22484847 chr6:16648041(-) A-G intron -    22484847 chr6:16648259(-) A-G intron -    22484847 chr6:16648265(-) A-G intron -    22484847 chr6:16648267(-) A-G intron -    22484847 chr6:16650256(-) A-G intron -    22484847 chr6:16650275(-) A-G intron -    22484847 chr6:16650323(-) A-G intron -    22484847 chr6:16651699(-) A-G intron -    22484847 chr6:16655625(-) A-G intron -    22484847 chr6:16655631(-) A-G intron -    22484847 chr6:16657423(-) A-G intron -    22484847 chr6:16673159(-) A-G intron -    22484847 chr6:16673162(-) A-G intron -    22484847 chr6:16673252(-) T-G intron -    22484847 chr6:16674798(-) A-G intron -    22484847 chr6:16674830(-) A-G intron -    22484847 chr6:16675877(-) A-G intron -    22484847 chr6:16675929(-) A-G intron -    22484847 chr6:16675971(-) A-G intron -    22484847 chr6:16676106(-) A-G intron -    22484847 chr6:16692404(-) A-G intron -    22484847 chr6:16694622(-) A-G intron -    22484847 chr6:16696079(-) A-G intron -    22484847 chr6:16696143(-) A-G intron -    22484847 chr6:16696164(-) A-G intron -    22484847 chr6:16696181(-) A-G intron -    22484847 chr6:16696189(-) A-G intron -    22484847 chr6:16712095(-) A-G intron -    22484847 chr6:16734034(-) A-G intron -    22484847 chr6:16734039(-) A-G intron -    22484847 chr6:16734240(-) A-G intron -    22484847 chr6:16734793(-) A-G intron -    22484847 chr6:16734804(-) A-G intron -    22484847 chr6:16734811(-) A-G intron -    22484847 chr6:16734815(-) A-G intron -    22484847 chr6:16734836(-) A-G intron -    22484847 chr6:16734863(-) A-G intron -    22484847 chr6:16734867(-) A-G intron -    22484847 chr6:16734957(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	ATXN1	chr6:16299684-16299685(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16299773-16299774(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16299798-16299799(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16299821-16299822(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16299833-16299834(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16299901-16299902(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16299952-16299953(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16302871-16302872(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16302877-16302878(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16302885-16302886(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16302944-16302945(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16302979-16302980(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16303119-16303120(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16303267-16303268(-) m6A 3'UTR       24284625//22608085 chr6:16303356-16303357(-) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//22608085 chr6:16303526-16303527(-) m6A 3'UTR       24284625 chr6:16303539-16303540(-) m6A 3'UTR       24284625 chr6:16303887-16303888(-) m6A 3'UTR       27773535//22608085 chr6:16303912-16303913(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085 chr6:16303932-16303933(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085 chr6:16303985-16303986(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085 chr6:16303995-16303996(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085 chr6:16304035-16304036(-) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr6:16304952-16304953(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16305039-16305040(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085 chr6:16305050-16305051(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085 chr6:16305115-16305116(-) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr6:16305220-16305221(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085 chr6:16305335-16305336(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535 chr6:16305344-16305345(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16305350-16305351(-) m6A 3'UTR       27773535 chr6:16306399-16306400(-) m6A 3'UTR       24284625//27773535 chr6:16306643-16306644(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960//22608085 chr6:16306664-16306665(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960//22608085 chr6:16306721-16306722(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085 chr6:16306778-16306779(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085 chr6:16306847-16306848(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085 chr6:16306941-16306942(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27371828//27773536//22608085 chr6:16306982-16306983(-) m6A CDS       24284625//24981863//27371828//22608085 chr6:16307014-16307015(-) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr6:16307045-16307046(-) m6A CDS       - chr6:16326682-16326683(-) m6A CDS       24209618 chr6:16326758-16326759(-) m6A CDS       27773535 chr6:16326766-16326767(-) m6A CDS       24284625//27773535 chr6:16326946-16326947(-) m6A CDS       24284625 chr6:16327172-16327173(-) m6A CDS       24284625 chr6:16327200-16327201(-) m6A CDS       24284625 chr6:16327235-16327236(-) m6A CDS       24284625 chr6:16327435-16327436(-) m6A CDS       24284625//27371828 chr6:16327774-16327775(-) m6A CDS       24284625//28052920 chr6:16327807-16327808(-) m6A CDS       24981863 chr6:16328129-16328130(-) m6A CDS       24284625 chr6:16328204-16328205(-) m6A CDS       24284625 chr6:16328284-16328285(-) m6A CDS       24284625//24981863 chr6:16328348-16328349(-) m6A CDS       24284625//24981863//27371828//27773536 chr6:16328570-16328571(-) m6A 5'UTR       24284625//24981863//28052920//27773535//27371828//22608085 chr6:16328578-16328579(-) m6A 5'UTR       24284625//24981863//28052920//27773535//27371828//22608085 chr6:16328599-16328600(-) m6A 5'UTR       24284625//24981863//27773535//27371828//22608085 chr6:16432841-16432842(-) m6A exon//intron       24284625 chr6:16615650-16615651(-) m6A exon//intron       - chr6:16739321-16739322(-) m6A exon//intron       27773535 chr6:16739977-16739978(-) m6A exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:16740048-16740049(-) m6A exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:16740081-16740082(-) m6A exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr6:16740123-16740124(-) m6A exon//intron       24284625//27773535//22608085 chr6:16740140-16740141(-) m6A exon//intron       24284625//27773535//22608085 chr6:16750225-16750226(-) m6A exon//intron       27773535 chr6:16754305-16754306(-) m6A 5'UTR//exon//intron       24284625//27773535 chr6:16761590-16761591(-) m6A 5'UTR//exon       24284625//24981863//27773535 chr6:16761633-16761634(-) m6A 5'UTR//exon       24284625//24981863//27773535 chr6:16761660-16761661(-) m6A 5'UTR//exon       24284625//24981863//27773535 chr6:16761695-16761696(-) m6A 5'UTR//exon       24284625//24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ATXN1	Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART9-5p
Interactor2: ATXN1

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Prediction-Evidence	miRanda//PARalyzer//Targetscan
Support Database	ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg

References:

PMID	22100165	Target region	3'UTR
Source	ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	BC-1 cells	Interactor2 expression	Downregulation
Description	Using PAR-CLIP, a technology which allows the direct and transcriptome-wide identification of miRNA targets, we delineate the target sites for all viral and cellular miRNAs expressed in PEL cell lines. The resulting data set revealed that KSHV miRNAs directly target more than 2000 cellular mRNAs, including many involved in pathways relevant to KSHV pathogenesis. Moreover, 58% of these mRNAs are also targeted by EBV miRNAs, via distinct binding sites.Clusters with seed matches to expressed miRNAs were considered candidate target sites. Of the clusters mapping to human 3'UTRs, 69% (BC-1) and 70% (BC-3) had seed matches to expressed miRNAs (Tables S6).Table S6A BC-1 derived 3'UTR clusters with seed matches to expressed miRNAs.