Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00391987

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.6040

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART20-3p:  MIMAT0003720          DPY19L4:  NM_181787     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART20-3p	DPY19L4
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003720	286148
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	DPY19L4	chr8:95785278(+) A-I      intronic chr8:95783390(+) A-I      intronic chr8:95783282(+) A-I      intronic chr8:95783260(+) A-I      intronic chr8:95783246(+) A-I      intronic chr8:95783243(+) A-I      intronic chr8:95783169(+) A-I      intronic chr8:95782981(+) A-I      intronic chr8:95782978(+) A-I      intronic chr8:95782972(+) A-I      intronic chr8:95781802(+) A-I      intronic chr8:95781402(+) A-I      intronic chr8:95781376(+) A-I      intronic chr8:95777709(+) A-I      intronic chr8:95777706(+) A-I      intronic chr8:95777689(+) A-I      intronic chr8:95777154(+) A-I      intronic chr8:95777093(+) A-I      intronic chr8:95777074(+) A-I      intronic chr8:95776654(+) A-I      intronic chr8:95776653(+) A-I      intronic chr8:95776652(+) A-I      intronic chr8:95776588(+) A-I      intronic chr8:95776585(+) A-I      intronic chr8:95776555(+) A-I      intronic chr8:95771198(+) A-I      intronic chr8:95771197(+) A-I      intronic chr8:95771026(+) A-I      intronic chr8:95770296(+) A-I      intronic chr8:95770260(+) A-I      intronic chr8:95769899(+) A-I      intronic chr8:95769898(+) A-I      intronic chr8:95769847(+) A-I      intronic chr8:95769772(+) A-I      intronic chr8:95769738(+) A-I      intronic chr8:95769737(+) A-I      intronic chr8:95769203(+) A-I      intronic chr8:95769082(+) A-I      intronic chr8:95769043(+) A-I      intronic chr8:95768088(+) A-I      intronic chr8:95767963(+) A-I      intronic chr8:95767936(+) A-I      intronic chr8:95767935(+) A-I      intronic chr8:95767290(+) A-I      intronic chr8:95767251(+) A-I      intronic chr8:95767197(+) A-I      intronic chr8:95767162(+) A-I      intronic chr8:95767110(+) A-I      intronic chr8:95752865(+) A-I      intronic chr8:95754891(+) A-I      intronic chr8:95755202(+) A-I      intronic chr8:95756091(+) A-I      intronic chr8:95756103(+) A-I      intronic chr8:95765993(+) A-I      intronic chr8:95756186(+) A-I      intronic chr8:95787566(+) A-I      intronic chr8:95766109(+) A-I      intronic chr8:95787552(+) A-I      intronic chr8:95787539(+) A-I      intronic chr8:95769872(+) A-I      intronic chr8:95766141(+) A-I      intronic chr8:95758138(+) A-I      intronic chr8:95755048(+) A-I      intronic chr8:95788632(+) A-I      intronic chr8:95764574(+) A-I      intronic chr8:95777122(+) A-I      intronic chr8:95755611(+) A-I      intronic chr8:95755834(+) A-I      intronic chr8:95755846(+) A-I      intronic chr8:95756074(+) A-I      intronic chr8:95752868(+) A-I      intronic chr8:95752874(+) A-I      intronic chr8:95754332(+) A-I      intronic chr8:95754760(+) A-I      intronic chr8:95752763(+) A-I      intronic chr8:95754861(+) A-I      intronic chr8:95755193(+) A-I      intronic chr8:95752840(+) A-I      intronic chr8:95752849(+) A-I      intronic chr8:95754867(+) A-I      intronic chr8:95752769(+) A-I      intronic chr8:95765872(+) A-I      intronic chr8:95741729(+) A-I      intronic chr8:95741944(+) A-I      intronic chr8:95786527(+) A-I      intronic chr8:95786465(+) A-I      intronic chr8:95752784(+) A-I      intronic chr8:95755317(+) A-I      intronic chr8:95742008(+) A-I      intronic chr8:95769881(+) A-I      intronic chr8:95755319(+) A-I      intronic chr8:95769877(+) A-I      intronic chr8:95769874(+) A-I      intronic chr8:95754890(+) A-I      intronic chr8:95769873(+) A-I      intronic chr8:95752839(+) A-I      intronic chr8:95749890(+) A-I      intronic chr8:95749601(+) A-I      intronic chr8:95749537(+) A-I      intronic chr8:95749469(+) A-I      intronic chr8:95749410(+) A-I      intronic chr8:95743762(+) A-I      intronic chr8:95743744(+) A-I      intronic chr8:95743731(+) A-I      intronic chr8:95743714(+) A-I      intronic chr8:95741747(+) A-I      intronic chr8:95741739(+) A-I      intronic chr8:95741504(+) A-I      intronic chr8:95741447(+) A-I      intronic chr8:95741443(+) A-I      intronic chr8:95738029(+) A-I      intronic chr8:95737944(+) A-I      intronic chr8:95737925(+) A-I      intronic chr8:95737005(+) A-I      intronic chr8:95734514(+) A-I      intronic chr8:95734286(+) A-I      intronic chr8:95790281(+) A-I      intronic chr8:95734435(+) A-I      intronic chr8:95790280(+) A-I      intronic chr8:95789569(+) A-I      intronic chr8:95789359(+) A-I      intronic chr8:95789180(+) A-I      intronic chr8:95789082(+) A-I      intronic chr8:95789032(+) A-I      intronic chr8:95788992(+) A-I      intronic chr8:95788987(+) A-I      intronic chr8:95788443(+) A-I      intronic chr8:95788400(+) A-I      intronic chr8:95752812(+) A-I      intronic chr8:95755752(+) A-I      intronic chr8:95756058(+) A-I      intronic chr8:95756123(+) A-I      intronic chr8:95756127(+) A-I      intronic chr8:95782849(+) A-I      intronic chr8:95788390(+) A-I      intronic chr8:95788378(+) A-I      intronic chr8:95788360(+) A-I      intronic chr8:95787829(+) A-I      intronic chr8:95787583(+) A-I      intronic chr8:95782876(+) A-I      intronic chr8:95785264(+) A-I      intronic chr8:95786043(+) A-I      intronic chr8:95786064(+) A-I      intronic chr8:95787504(+) A-I      intronic chr8:95787634(+) A-I      intronic chr8:95789364(+) A-I      intronic chr8:95789388(+) A-I      intronic chr8:95787529(+) A-I      intronic chr8:95787499(+) A-I      intronic chr8:95787039(+) A-I      intronic chr8:95786989(+) A-I      intronic chr8:95786972(+) A-I      intronic chr8:95786549(+) A-I      intronic chr8:95786339(+) A-I      intronic chr8:95786114(+) A-I      intronic chr8:95785800(+) A-I      intronic chr8:95785798(+) A-I      intronic chr8:95785753(+) A-I      intronic chr8:95785684(+) A-I      intronic chr8:95785344(+) A-I      intronic chr8:95785331(+) A-I      intronic chr8:95785327(+) A-I      intronic chr8:95785322(+) A-I      intronic chr8:95785295(+) A-I      intronic chr8:95785281(+) A-I      intronic chr8:95785279(+) A-I      intronic chr8:95734424(+) A-I      intronic chr8:95804924(+) A-I      3'UTR chr8:95805011(+) A-I      3'UTR chr8:95805004(+) A-I      3'UTR chr8:95804992(+) A-I      3'UTR chr8:95804989(+) A-I      3'UTR chr8:95804979(+) A-I      3'UTR chr8:95804934(+) A-I      3'UTR chr8:95804738(+) A-I      3'UTR chr8:95804759(+) A-I      3'UTR chr8:95804918(+) A-I      3'UTR chr8:95804930(+) A-I      3'UTR chr8:95804899(+) A-I      3'UTR chr8:95804925(+) A-I      3'UTR chr8:95804897(+) A-I      3'UTR chr8:95804628(+) A-I      3'UTR chr8:95804807(+) A-I      3'UTR chr8:95804813(+) A-I      3'UTR chr8:95804480(+) A-I      3'UTR chr8:95804821(+) A-I      3'UTR chr8:95804882(+) A-I      3'UTR chr8:95804873(+) A-I      3'UTR chr8:95804478(+) A-I      3'UTR chr8:95805053(+) A-I      3'UTR chr8:95804932(+) A-I      3'UTR chr8:95804933(+) A-I      3'UTR chr8:95805028(+) A-I      3'UTR chr8:95805035(+) A-I      3'UTR chr8:95805062(+) A-I      3'UTR chr8:95805083(+) A-I      3'UTR chr8:95805087(+) A-I      3'UTR chr8:95805093(+) A-I      3'UTR chr8:95805094(+) A-I      3'UTR chr8:95804715(+) A-I      3'UTR chr8:95804931(+) A-I      3'UTR chr8:95804503(+) A-I      3'UTR chr8:95804510(+) A-I      3'UTR chr8:95804516(+) A-I      3'UTR chr8:95804580(+) A-I      3'UTR chr8:95804593(+) A-I      3'UTR chr8:95804602(+) A-I      3'UTR chr8:95804723(+) A-I      3'UTR chr8:95804615(+) A-I      3'UTR chr8:95804621(+) A-I      3'UTR chr8:95804641(+) A-I      3'UTR chr8:95804663(+) A-I      3'UTR chr8:95804642(+) A-I      3'UTR chr8:95804650(+) A-I      3'UTR chr8:95804728(+) A-I      3'UTR chr8:95804905(+) A-I      3'UTR chr8:95804697(+) A-I      3'UTR chr8:95804737(+) A-I      3'UTR chr8:95804698(+) A-I      3'UTR chr8:95804712(+) A-I      3'UTR chr8:95775294(+) A-I      intronic chr8:95765078(+) A-I      intronic chr8:95783309(+) A-I      intronic chr8:95786923(+) A-I      intronic chr8:95759520(+) A-I      intronic chr8:95785241(+) A-I      intronic chr8:95775196(+) A-I      intronic chr8:95789424(+) A-I      intronic chr8:95783060(+) A-I      intronic chr8:95742826(+) A-I      intronic chr8:95783405(+) A-I      intronic chr8:95790227(+) A-I      intronic chr8:95755532(+) A-I      intronic chr8:95745312(+) A-I      intronic chr8:95789108(+) A-I      intronic chr8:95754409(+) A-I      intronic chr8:95774895(+) A-I      intronic chr8:95774946(+) A-I      intronic chr8:95786495(+) A-I      intronic chr8:95749937(+) A-I      intronic chr8:95769818(+) A-I      intronic chr8:95766053(+) A-I      intronic chr8:95787791(+) A-I      intronic chr8:95771096(+) A-I      intronic chr8:95786411(+) A-I      intronic chr8:95777067(+) A-I      intronic chr8:95775208(+) A-I      intronic chr8:95785687(+) A-I      intronic chr8:95789484(+) A-I      intronic chr8:95781469(+) A-I      intronic chr8:95767966(+) A-I      intronic chr8:95785391(+) A-I      intronic chr8:95782870(+) A-I      intronic chr8:95756113(+) A-I      intronic chr8:95749415(+) A-I      intronic chr8:95755610(+) A-I      intronic chr8:95777139(+) A-I      intronic chr8:95755312(+) A-I      intronic chr8:95787493(+) A-I      intronic chr8:95775406(+) A-I      intronic chr8:95788938(+) A-I      intronic chr8:95785392(+) A-I      intronic chr8:95785162(+) A-I      intronic chr8:95777096(+) A-I      intronic chr8:95764649(+) A-I      intronic chr8:95741752(+) A-I      intronic chr8:95755761(+) A-I      intronic chr8:95785920(+) A-I      intronic chr8:95741988(+) A-I      intronic chr8:95767116(+) A-I      intronic chr8:95754733(+) A-I      intronic chr8:95755991(+) A-I      intronic chr8:95775382(+) A-I      intronic chr8:95774886(+) A-I      intronic chr8:95767284(+) A-I      intronic chr8:95786375(+) A-I      intronic chr8:95755385(+) A-I      intronic chr8:95785212(+) A-I      intronic chr8:95741172(+) A-I      intronic chr8:95778612(+) A-I      intronic chr8:95778994(+) A-I      intronic chr8:95777138(+) A-I      intronic chr8:95776641(+) A-I      intronic chr8:95785321(+) A-I      intronic chr8:95786212(+) A-I      intronic chr8:95786077(+) A-I      intronic chr8:95754721(+) A-I      intronic chr8:95786935(+) A-I      intronic chr8:95776613(+) A-I      intronic chr8:95736891(+) A-I      intronic chr8:95754695(+) A-I      intronic chr8:95787740(+) A-I      intronic chr8:95787816(+) A-I      intronic chr8:95771032(+) A-I      intronic chr8:95783347(+) A-I      intronic chr8:95756033(+) A-I      intronic chr8:95755304(+) A-I      intronic chr8:95755467(+) A-I      intronic chr8:95755978(+) A-I      intronic chr8:95789547(+) A-I      intronic chr8:95786234(+) A-I      intronic chr8:95746404(+) A-I      intronic chr8:95786054(+) A-I      intronic chr8:95755439(+) A-I      intronic chr8:95777123(+) A-I      intronic chr8:95749604(+) A-I      intronic chr8:95782984(+) A-I      intronic chr8:95756057(+) A-I      intronic chr8:95754880(+) A-I      intronic chr8:95782975(+) A-I      intronic chr8:95804676(+) A-I      3'UTR chr8:95804963(+) A-I      3'UTR chr8:95804906(+) A-I      3'UTR chr8:95804986(+) A-I      3'UTR chr8:95804605(+) A-I      3'UTR chr8:95804973(+) A-I      3'UTR chr8:95804927(+) A-I      3'UTR chr8:95804719(+) A-I      3'UTR chr8:95804490(+) A-I      3'UTR chr8:95804469(+) A-I      3'UTR chr8:95804829(+) A-I      3'UTR chr8:95804860(+) A-I      3'UTR chr8:95804830(+) A-I      3'UTR chr8:95804662(+) A-I      3'UTR chr8:95804937(+) A-I      3'UTR chr8:95804969(+) A-I      3'UTR chr8:95805070(+) A-I      3'UTR chr8:95805038(+) A-I      3'UTR chr8:95804907(+) A-I      3'UTR chr8:95805065(+) A-I      3'UTR chr8:95782959(+) A-I      intronic chr8:95755717(+) A-I      intronic chr8:95786988(+) A-I      intronic chr8:95774922(+) A-I      intronic chr8:95766006(+) A-I      intronic chr8:95776981(+) A-I      intronic chr8:95755167(+) A-I      intronic chr8:95754886(+) A-I      intronic chr8:95766012(+) A-I      intronic chr8:95755725(+) A-I      intronic chr8:95749763(+) A-I      intronic chr8:95783125(+) A-I      intronic chr8:95741352(+) A-I      intronic chr8:95741453(+) A-I      intronic chr8:95752702(+) A-I      intronic chr8:95755194(+) A-I      intronic chr8:95755104(+) A-I      intronic chr8:95754465(+) A-I      intronic chr8:95788959(+) A-I      intronic chr8:95785759(+) A-I      intronic chr8:95775042(+) A-I      intronic chr8:95789118(+) A-I      intronic chr8:95734600(+) A-I      intronic chr8:95786555(+) A-I      intronic chr8:95755604(+) A-I      intronic chr8:95767117(+) A-I      intronic chr8:95770176(+) A-I      intronic chr8:95782953(+) A-I      intronic chr8:95787662(+) A-I      intronic chr8:95755637(+) A-I      intronic chr8:95785926(+) A-I      intronic chr8:95754750(+) A-I      intronic chr8:95755033(+) A-I      intronic chr8:95783083(+) A-I      intronic chr8:95777199(+) A-I      intronic chr8:95779247(+) A-I      intronic chr8:95783050(+) A-I      intronic chr8:95786475(+) A-I      intronic chr8:95785256(+) A-I      intronic chr8:95756056(+) A-I      intronic chr8:95741344(+) A-I      intronic chr8:95737018(+) A-I      intronic chr8:95783020(+) A-I      intronic chr8:95755320(+) A-I      intronic chr8:95785343(+) A-I      intronic chr8:95759516(+) A-I      intronic chr8:95755038(+) A-I      intronic chr8:95785938(+) A-I      intronic chr8:95771016(+) A-I      intronic chr8:95777218(+) A-I      intronic chr8:95789114(+) A-I      intronic chr8:95786537(+) A-I      intronic chr8:95776642(+) A-I      intronic chr8:95786458(+) A-I      intronic chr8:95789073(+) A-I      intronic chr8:95788580(+) A-I      intronic chr8:95786401(+) A-I      intronic chr8:95786472(+) A-I      intronic chr8:95786906(+) A-I      intronic chr8:95741706(+) A-I      intronic chr8:95776638(+) A-I      intronic chr8:95789072(+) A-I      intronic chr8:95776644(+) A-I      intronic chr8:95755769(+) A-I      intronic chr8:95779191(+) A-I      intronic chr8:95777157(+) A-I      intronic chr8:95758339(+) A-I      intronic chr8:95768045(+) A-I      intronic chr8:95774894(+) A-I      intronic chr8:95785184(+) A-I      intronic chr8:95785832(+) A-I      intronic chr8:95786336(+) A-I      intronic chr8:95786484(+) A-I      intronic chr8:95741155(+) A-I      intronic chr8:95786870(+) A-I      intronic chr8:95756218(+) A-I      intronic chr8:95754677(+) A-I      intronic chr8:95755395(+) A-I      intronic chr8:95774926(+) A-I      intronic chr8:95786905(+) A-I      intronic chr8:95789046(+) A-I      intronic chr8:95755130(+) A-I      intronic chr8:95741910(+) A-I      intronic chr8:95767040(+) A-I      intronic chr8:95783325(+) A-I      intronic chr8:95787744(+) A-I      intronic chr8:95786408(+) A-I      intronic chr8:95754701(+) A-I      intronic chr8:95755684(+) A-I      intronic chr8:95744678(+) A-I      intronic chr8:95783319(+) A-I      intronic chr8:95786892(+) A-I      intronic chr8:95788577(+) A-I      intronic chr8:95783334(+) A-I      intronic chr8:95783212(+) A-I      intronic chr8:95741736(+) A-I      intronic chr8:95788960(+) A-I      intronic chr8:95787769(+) A-I      intronic chr8:95771110(+) A-I      intronic chr8:95749534(+) A-I      intronic chr8:95774957(+) A-I      intronic chr8:95783272(+) A-I      intronic chr8:95777056(+) A-I      intronic chr8:95787790(+) A-I      intronic chr8:95776683(+) A-I      intronic chr8:95776643(+) A-I      intronic chr8:95764628(+) A-I      intronic chr8:95777179(+) A-I      intronic chr8:95786341(+) A-I      intronic chr8:95764735(+) A-I      intronic chr8:95788671(+) A-I      intronic chr8:95741978(+) A-I      intronic chr8:95777141(+) A-I      intronic chr8:95788617(+) A-I      intronic chr8:95776655(+) A-I      intronic chr8:95768025(+) A-I      intronic chr8:95777061(+) A-I      intronic chr8:95785185(+) A-I      intronic chr8:95770173(+) A-I      intronic chr8:95786124(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	DPY19L4	chr8:95804490(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr8:95804524(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr8:95804605(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95804659(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95804662(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95804676(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95804719(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95804750(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95804829(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95804830(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95804860(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95804906(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95804907(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95804927(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr8:95804937(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr8:95804963(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95804969(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95804973(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95804986(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr8:95805038(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95805065(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr8:95805070(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95805071(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr8:95805038(+) A-G intron -    21725310 chr8:95741706(+) A-G intron -    22484847 chr8:95741736(+) A-G intron -    22484847 chr8:95744678(+) A-G intron -    22484847 chr8:95749604(+) A-G intron -    22484847 chr8:95754733(+) A-G intron -    22484847 chr8:95754880(+) A-G intron -    22484847 chr8:95754886(+) A-G intron -    22484847 chr8:95754926(+) A-G intron -    22484847 chr8:95755038(+) A-G intron -    22484847 chr8:95755104(+) A-G intron -    22484847 chr8:95755304(+) A-G intron -    22484847 chr8:95755320(+) A-G intron -    22484847 chr8:95755385(+) A-G intron -    22484847 chr8:95755395(+) A-G intron -    22484847 chr8:95755604(+) A-G intron -    22484847 chr8:95755610(+) A-G intron -    22484847 chr8:95755684(+) A-G intron -    22484847 chr8:95764628(+) A-G intron -    22484847 chr8:95764649(+) A-G intron -    22484847 chr8:95764652(+) A-G intron -    22484847 chr8:95766053(+) A-G intron -    22484847 chr8:95767037(+) A-G intron -    22484847 chr8:95767040(+) A-G intron -    22484847 chr8:95767116(+) A-G intron -    22484847 chr8:95767117(+) A-G intron -    22484847 chr8:95767200(+) A-G intron -    22484847 chr8:95767966(+) A-G intron -    22484847 chr8:95769755(+) A-G intron -    22484847 chr8:95769818(+) A-G intron -    22484847 chr8:95770176(+) A-G intron -    22484847 chr8:95771016(+) A-G intron -    22484847 chr8:95771032(+) A-G intron -    22484847 chr8:95771096(+) A-G intron -    22484847 chr8:95771110(+) A-G intron -    22484847 chr8:95774872(+) A-G intron -    22484847 chr8:95774886(+) A-G intron -    22484847 chr8:95774894(+) A-G intron -    22484847 chr8:95774895(+) A-G intron -    22484847 chr8:95774922(+) A-G intron -    22484847 chr8:95774926(+) A-G intron -    22484847 chr8:95774957(+) A-G intron -    22484847 chr8:95775196(+) A-G intron -    22484847 chr8:95775246(+) A-G intron -    22484847 chr8:95775294(+) A-G intron -    22484847 chr8:95775366(+) A-G intron -    22484847 chr8:95775382(+) A-G intron -    22484847 chr8:95775406(+) A-G intron -    22484847 chr8:95776613(+) A-G intron -    22484847 chr8:95776638(+) A-G intron -    22484847 chr8:95776641(+) A-G intron -    22484847 chr8:95776642(+) A-G intron -    22484847 chr8:95776643(+) A-G intron -    22484847 chr8:95776644(+) A-G intron -    22484847 chr8:95776683(+) A-G intron -    22484847 chr8:95776689(+) A-G intron -    22484847 chr8:95776981(+) A-G intron -    22484847 chr8:95777061(+) A-G intron -    22484847 chr8:95777067(+) A-G intron -    22484847 chr8:95777096(+) A-G intron -    22484847 chr8:95777098(+) A-G intron -    22484847 chr8:95777138(+) A-G intron -    22484847 chr8:95777139(+) A-G intron -    22484847 chr8:95777141(+) A-G intron -    22484847 chr8:95777157(+) A-G intron -    22484847 chr8:95777179(+) A-G intron -    22484847 chr8:95782871(+) A-G intron -    22484847 chr8:95782893(+) A-G intron -    22484847 chr8:95782953(+) A-G intron -    22484847 chr8:95782959(+) A-G intron -    22484847 chr8:95782984(+) A-G intron -    22484847 chr8:95783053(+) A-G intron -    22484847 chr8:95783212(+) A-G intron -    22484847 chr8:95783236(+) A-G intron -    22484847 chr8:95783242(+) A-G intron -    22484847 chr8:95783325(+) A-G intron -    22484847 chr8:95783334(+) A-G intron -    22484847 chr8:95783347(+) A-G intron -    22484847 chr8:95783405(+) A-G intron -    22484847 chr8:95785185(+) A-G intron -    22484847 chr8:95785241(+) A-G intron -    22484847 chr8:95785256(+) A-G intron -    22484847 chr8:95785687(+) A-G intron -    22484847 chr8:95785776(+) A-G intron -    22484847 chr8:95785788(+) A-G intron -    22484847 chr8:95785832(+) A-G intron -    22484847 chr8:95785867(+) A-G intron -    22484847 chr8:95785938(+) A-G intron -    22484847 chr8:95786341(+) A-G intron -    22484847 chr8:95786472(+) A-G intron -    22484847 chr8:95786484(+) A-G intron -    22484847 chr8:95786495(+) A-G intron -    22484847 chr8:95786555(+) A-G intron -    22484847 chr8:95786892(+) A-G intron -    22484847 chr8:95786905(+) A-G intron -    22484847 chr8:95786906(+) A-G intron -    22484847 chr8:95786923(+) A-G intron -    22484847 chr8:95786935(+) A-G intron -    22484847 chr8:95786936(+) A-G intron -    22484847 chr8:95786945(+) A-G intron -    22484847 chr8:95786988(+) A-G intron -    22484847 chr8:95787430(+) A-G intron -    22484847 chr8:95787662(+) A-G intron -    22484847 chr8:95787790(+) A-G intron -    22484847 chr8:95787791(+) A-G intron -    22484847 chr8:95787817(+) A-G intron -    22484847 chr8:95788959(+) A-G intron -    22484847 chr8:95788960(+) A-G intron -    22484847 chr8:95789028(+) A-G intron -    22484847 chr8:95789078(+) A-G intron -    22484847 chr8:95804469(+) A-G intron -    22484847 chr8:95804490(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	DPY19L4	chr8:95732239-95732240(+) m1A CDS       26863196 chr8:95782768-95782769(+) Y CDS       26075521 chr8:95800263-95800264(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//22608085 chr8:95802085-95802086(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr8:95802164-95802165(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22575960//22608085 chr8:95802228-95802229(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22575960//22608085 chr8:95802357-95802358(+) m6A 3'UTR       24284625 chr8:95802796-95802797(+) Y 3'UTR       25219674

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	DPY19L4	Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -

Related Drug Information:

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID
RNAactDrug	ebv-miR-BART20-3p	Crizotinib       11626560

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART20-3p
Interactor2: DPY19L4

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Prediction-Evidence	miRanda//PARalyzer//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//ViRBase//VmiReg

References:

PMID	22100165	Target region	3'UTR
Source	RepTar//ViRBase//VmiReg	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	BC-1 cells	Interactor2 expression	None
Description	Using PAR-CLIP, a technology which allows the direct and transcriptome-wide identification of miRNA targets, we delineate the target sites for all viral and cellular miRNAs expressed in PEL cell lines. The resulting data set revealed that KSHV miRNAs directly target more than 2000 cellular mRNAs, including many involved in pathways relevant to KSHV pathogenesis. Moreover, 58% of these mRNAs are also targeted by EBV miRNAs, via distinct binding sites.Clusters with seed matches to expressed miRNAs were considered candidate target sites. Of the clusters mapping to human 3'UTRs, 69% (BC-1) and 70% (BC-3) had seed matches to expressed miRNAs (Tables S6).Table S6A BC-1 derived 3'UTR clusters with seed matches to expressed miRNAs.