Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00389717

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART20-3p:  MIMAT0003720          IRAK3:  NM_007199     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART20-3p	IRAK3
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003720	11213
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	ASRT5//IRAKM

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	IRAK3	chr12:66589503(+) A-I      intronic chr12:66588456(+) A-I      intronic chr12:66592600(+) A-I      intronic chr12:66640939(+) A-I      intronic chr12:66592640(+) A-I      intronic chr12:66587821(+) A-I      intronic chr12:66592721(+) A-I      intronic chr12:66588537(+) A-I      intronic chr12:66615608(+) A-I      intronic chr12:66615613(+) A-I      intronic chr12:66588609(+) A-I      intronic chr12:66589585(+) A-I      intronic chr12:66594690(+) A-I      intronic chr12:66615718(+) A-I      intronic chr12:66596318(+) A-I      intronic chr12:66588543(+) A-I      intronic chr12:66592758(+) A-I      intronic chr12:66596302(+) A-I      intronic chr12:66617533(+) A-I      intronic chr12:66588455(+) A-I      intronic chr12:66615607(+) A-I      intronic chr12:66587907(+) A-I      intronic chr12:66587922(+) A-I      intronic chr12:66594865(+) A-I      intronic chr12:66594691(+) A-I      intronic chr12:66589504(+) A-I      intronic chr12:66588564(+) A-I      intronic chr12:66588447(+) A-I      intronic chr12:66596371(+) A-I      intronic chr12:66640850(+) A-I      intronic chr12:66589634(+) A-I      intronic chr12:66592711(+) A-I      intronic chr12:66596297(+) A-I      intronic chr12:66588489(+) A-I      intronic chr12:66600982(+) A-I      intronic chr12:66588430(+) A-I      intronic chr12:66587787(+) A-I      intronic chr12:66589540(+) A-I      intronic chr12:66592668(+) A-I      intronic chr12:66640951(+) A-I      intronic chr12:66589526(+) A-I      intronic chr12:66587782(+) A-I      intronic chr12:66589601(+) A-I      intronic chr12:66596430(+) A-I      intronic chr12:66592790(+) A-I      intronic chr12:66605892(+) A-I      intronic chr12:66620296(+) A-I      intronic chr12:66588462(+) A-I      intronic chr12:66588542(+) A-I      intronic chr12:66589557(+) A-I      intronic chr12:66596296(+) A-I      intronic chr12:66594671(+) A-I      intronic chr12:66592664(+) A-I      intronic chr12:66596555(+) A-I      intronic chr12:66596487(+) A-I      intronic chr12:66641005(+) A-I      intronic chr12:66592636(+) A-I      intronic chr12:66596382(+) A-I      intronic chr12:66587939(+) A-I      intronic chr12:66587838(+) A-I      intronic chr12:66587778(+) A-I      intronic chr12:66639478(+) A-I      intronic chr12:66596359(+) A-I      intronic chr12:66589602(+) A-I      intronic chr12:66596556(+) A-I      intronic chr12:66589539(+) A-I      intronic chr12:66588610(+) A-I      intronic chr12:66588353(+) A-I      intronic chr12:66594647(+) A-I      intronic chr12:66587836(+) A-I      intronic chr12:66587777(+) A-I      intronic chr12:66589711(+) A-I      intronic chr12:66596474(+) A-I      intronic chr12:66589458(+) A-I      intronic chr12:66594794(+) A-I      intronic chr12:66589575(+) A-I      intronic chr12:66640959(+) A-I      intronic chr12:66628196(+) A-I      intronic chr12:66588530(+) A-I      intronic chr12:66592759(+) A-I      intronic chr12:66589496(+) A-I      intronic chr12:66596379(+) A-I      intronic chr12:66596424(+) A-I      intronic chr12:66596283(+) A-I      intronic chr12:66592622(+) A-I      intronic chr12:66589637(+) A-I      intronic chr12:66640809(+) A-I      intronic chr12:66589684(+) A-I      intronic chr12:66596545(+) A-I      intronic chr12:66596481(+) A-I      intronic chr12:66588457(+) A-I      intronic chr12:66588422(+) A-I      intronic chr12:66588432(+) A-I      intronic chr12:66640995(+) A-I      intronic chr12:66602758(+) A-I      intronic chr12:66589457(+) A-I      intronic chr12:66594748(+) A-I      intronic chr12:66589671(+) A-I      intronic chr12:66587926(+) A-I      intronic chr12:66592674(+) A-I      intronic chr12:66642963(+) A-I      3'UTR

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	IRAK3	chr12:66592668(+) A-I intron -    22327324 chr12:66592790(+) A-I intron -    22327324 chr12:66596283(+) A-I intron -    22327324 chr12:66596296(+) A-I intron -    22327324 chr12:66596487(+) A-I intron -    22327324 chr12:66596556(+) A-I intron -    22327324 chr12:66627941(+) A-I intron -    22327324 chr12:66627962(+) A-I intron -    22327324 chr12:66628123(+) A-I intron -    22327324 chr12:66628154(+) A-I intron -    22327324 chr12:66628196(+) A-I intron -    22327324 chr12:66628404(+) A-I intron -    22327324 chr12:66628511(+) A-I intron -    22327324 chr12:66628798(+) A-I intron -    22327324 chr12:66587782(+) A-G intron -    22484847 chr12:66587787(+) A-G intron -    22484847 chr12:66587836(+) A-G intron -    22484847 chr12:66587838(+) A-G intron -    22484847 chr12:66587907(+) A-G intron -    22484847 chr12:66587939(+) A-G intron -    22484847 chr12:66592668(+) A-G intron -    22484847 chr12:66592790(+) A-G intron -    22484847 chr12:66594865(+) A-G intron -    22484847 chr12:66596283(+) A-G intron -    22484847 chr12:66596296(+) A-G intron -    22484847 chr12:66596297(+) A-G intron -    22484847 chr12:66596371(+) A-G intron -    22484847 chr12:66596474(+) A-G intron -    22484847 chr12:66596487(+) A-G intron -    22484847 chr12:66596556(+) A-G intron -    22484847 chr12:66600982(+) A-G intron -    22484847 chr12:66640850(+) A-G intron -    22484847 chr12:66587778(+) A-G intron -    22484847 chr12:66587922(+) A-G intron -    22484847 chr12:66587926(+) A-G intron -    22484847 chr12:66588457(+) A-G intron -    22484847 chr12:66588462(+) A-G intron -    22484847 chr12:66589457(+) A-G intron -    22484847 chr12:66589458(+) A-G intron -    22484847 chr12:66589496(+) A-G intron -    22484847 chr12:66589504(+) A-G intron -    22484847 chr12:66589540(+) A-G intron -    22484847 chr12:66589601(+) A-G intron -    22484847 chr12:66589602(+) A-G intron -    22484847 chr12:66589634(+) A-G intron -    22484847 chr12:66589684(+) A-G intron -    22484847 chr12:66589711(+) A-G intron -    22484847 chr12:66592587(+) C-G intron -    22484847 chr12:66592622(+) A-G intron -    22484847 chr12:66592636(+) A-G intron -    22484847 chr12:66592664(+) A-G intron -    22484847 chr12:66592674(+) A-G intron -    22484847 chr12:66594647(+) A-G intron -    22484847 chr12:66594691(+) A-G intron -    22484847 chr12:66594748(+) A-G intron -    22484847 chr12:66594794(+) A-G intron -    22484847 chr12:66596424(+) A-G intron -    22484847 chr12:66596545(+) A-G intron -    22484847 chr12:66627298(+) G-A intron -    22484847 chr12:66627299(+) G-A intron -    22484847 chr12:66640809(+) A-G intron -    22484847 chr12:66641005(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	IRAK3	chr12:66590823-66590824(+) m6A 3'UTR//intron       - chr12:66590846-66590847(+) m6A 3'UTR//intron       - chr12:66590859-66590860(+) m6A 3'UTR//intron       - chr12:66590882-66590883(+) m6A 3'UTR//intron       - chr12:66641655-66641656(+) m6A CDS       25456834 chr12:66641672-66641673(+) m6A CDS       25456834 chr12:66641718-66641719(+) m6A CDS       25456834 chr12:66641817-66641818(+) m6A CDS       - chr12:66641932-66641933(+) m6A CDS       - chr12:66642021-66642022(+) m6A 3'UTR       - chr12:66642083-66642084(+) m6A 3'UTR       - chr12:66642116-66642117(+) m6A 3'UTR       - chr12:66642124-66642125(+) m6A 3'UTR       - chr12:66642235-66642236(+) m6A 3'UTR       - chr12:66642240-66642241(+) m6A 3'UTR       - chr12:66642249-66642250(+) m6A 3'UTR       - chr12:66642264-66642265(+) m6A 3'UTR       - chr12:66642328-66642329(+) m6A 3'UTR       - chr12:66643723-66643724(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	IRAK3	Exosome Blood     -

Related Drug Information:

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID
RNAactDrug	ebv-miR-BART20-3p	Crizotinib       11626560

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART20-3p
Interactor2: IRAK3

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg