Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00388706

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART20-3p:  MIMAT0003720          PEX13:  NM_002618     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART20-3p	PEX13
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003720	5194
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	NALD//PBD11A//PBD11B//ZWS

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	PEX13	chr2:61247179(+) A-I      intronic chr2:61247201(+) A-I      intronic chr2:61247246(+) A-I      intronic chr2:61247267(+) A-I      intronic chr2:61247931(+) A-I      intronic chr2:61251690(+) A-I      intronic chr2:61251784(+) A-I      intronic chr2:61251785(+) A-I      intronic chr2:61251787(+) A-I      intronic chr2:61247955(+) A-I      intronic chr2:61247970(+) A-I      intronic chr2:61247973(+) A-I      intronic chr2:61254232(+) A-I      intronic chr2:61252773(+) A-I      intronic chr2:61252674(+) A-I      intronic chr2:61249764(+) A-I      intronic chr2:61249770(+) A-I      intronic chr2:61249796(+) A-I      intronic chr2:61254184(+) A-I      intronic chr2:61249797(+) A-I      intronic chr2:61249814(+) A-I      intronic chr2:61249826(+) A-I      intronic chr2:61249843(+) A-I      intronic chr2:61249844(+) A-I      intronic chr2:61251005(+) A-I      intronic chr2:61251010(+) A-I      intronic chr2:61251024(+) A-I      intronic chr2:61252651(+) A-I      intronic chr2:61252668(+) A-I      intronic chr2:61254358(+) A-I      intronic chr2:61254362(+) A-I      intronic chr2:61258229(+) A-I      intronic chr2:61258248(+) A-I      intronic chr2:61258254(+) A-I      intronic chr2:61258260(+) A-I      intronic chr2:61258263(+) A-I      intronic chr2:61258265(+) A-I      intronic chr2:61258276(+) A-I      intronic chr2:61258283(+) A-I      intronic chr2:61276722(+) A-I      3'UTR chr2:61251058(+) A-I      intronic chr2:61247929(+) A-I      intronic chr2:61250279(+) A-I      intronic chr2:61250414(+) A-I      intronic chr2:61250995(+) A-I      intronic chr2:61250998(+) A-I      intronic chr2:61251167(+) A-I      intronic chr2:61247919(+) A-I      intronic chr2:61247999(+) A-I      intronic chr2:61249742(+) A-I      intronic chr2:61249748(+) A-I      intronic chr2:61249802(+) A-I      intronic chr2:61249891(+) A-I      intronic chr2:61249928(+) A-I      intronic chr2:61249937(+) A-I      intronic chr2:61274149(+) A-I      intronic chr2:61271663(+) A-I      intronic chr2:61271661(+) A-I      intronic chr2:61253733(+) A-I      intronic chr2:61253649(+) A-I      intronic chr2:61251712(+) A-I      intronic chr2:61251192(+) A-I      intronic chr2:61268366(+) A-I      intronic chr2:61249944(+) A-I      intronic chr2:61263075(+) A-I      intronic chr2:61251073(+) A-I      intronic chr2:61251031(+) A-I      intronic chr2:61250416(+) A-I      intronic chr2:61250266(+) A-I      intronic chr2:61250007(+) A-I      intronic chr2:61250179(+) A-I      intronic chr2:61250163(+) A-I      intronic chr2:61252737(+) A-I      intronic chr2:61252660(+) A-I      intronic chr2:61254375(+) A-I      intronic chr2:61252635(+) A-I      intronic chr2:61252333(+) A-I      intronic chr2:61268193(+) A-I      intronic chr2:61254224(+) A-I      intronic chr2:61252304(+) A-I      intronic chr2:61252297(+) A-I      intronic chr2:61252284(+) A-I      intronic chr2:61252259(+) A-I      intronic chr2:61250008(+) A-I      intronic chr2:61252247(+) A-I      intronic chr2:61251909(+) A-I      intronic chr2:61251904(+) A-I      intronic chr2:61251899(+) A-I      intronic chr2:61251889(+) A-I      intronic chr2:61251869(+) A-I      intronic chr2:61251793(+) A-I      intronic chr2:61254318(+) A-I      intronic chr2:61254262(+) A-I      intronic chr2:61254258(+) A-I      intronic chr2:61254248(+) A-I      intronic chr2:61254243(+) A-I      intronic chr2:61252714(+) A-I      intronic chr2:61254196(+) A-I      intronic chr2:61274133(+) A-I      intronic chr2:61247254(+) A-I      intronic chr2:61247281(+) A-I      intronic chr2:61253743(+) A-I      intronic chr2:61251790(+) A-I      intronic chr2:61263073(+) A-I      intronic chr2:61261341(+) A-I      intronic chr2:61247316(+) A-I      intronic chr2:61261315(+) A-I      intronic chr2:61258319(+) A-I      intronic chr2:61254439(+) A-I      intronic chr2:61247343(+) A-I      intronic chr2:61276710(+) A-I      3'UTR chr2:61276684(+) A-I      3'UTR chr2:61277256(+) A-I      3'UTR chr2:61276659(+) A-I      3'UTR chr2:61276635(+) A-I      3'UTR chr2:61278016(+) A-I      3'UTR chr2:61277945(+) A-I      3'UTR chr2:61277920(+) A-I      3'UTR chr2:61277910(+) A-I      3'UTR chr2:61277907(+) A-I      3'UTR chr2:61276829(+) A-I      3'UTR chr2:61277261(+) A-I      3'UTR chr2:61277884(+) A-I      3'UTR chr2:61277301(+) A-I      3'UTR chr2:61277324(+) A-I      3'UTR chr2:61277327(+) A-I      3'UTR chr2:61277872(+) A-I      3'UTR chr2:61277859(+) A-I      3'UTR chr2:61277834(+) A-I      3'UTR chr2:61277798(+) A-I      3'UTR chr2:61277471(+) A-I      3'UTR chr2:61277407(+) A-I      3'UTR chr2:61277463(+) A-I      3'UTR chr2:61277432(+) A-I      3'UTR chr2:61277361(+) A-I      3'UTR chr2:61277426(+) A-I      3'UTR chr2:61277423(+) A-I      3'UTR chr2:61276854(+) A-I      3'UTR chr2:61277396(+) A-I      3'UTR chr2:61277400(+) A-I      3'UTR chr2:61276810(+) A-I      3'UTR chr2:61276793(+) A-I      3'UTR chr2:61276749(+) A-I      3'UTR chr2:61276732(+) A-I      3'UTR chr2:61277417(+) A-I      3'UTR chr2:61251782(+) A-I      intronic chr2:61255651(+) A-I      intronic chr2:61254271(+) A-I      intronic chr2:61250171(+) A-I      intronic chr2:61247854(+) A-I      intronic chr2:61252370(+) A-I      intronic chr2:61254294(+) A-I      intronic chr2:61250375(+) A-I      intronic chr2:61247964(+) A-I      intronic chr2:61262841(+) A-I      intronic chr2:61247214(+) A-I      intronic chr2:61252633(+) A-I      intronic chr2:61247250(+) A-I      intronic chr2:61249990(+) A-I      intronic chr2:61247924(+) A-I      intronic chr2:61274118(+) A-I      intronic chr2:61247853(+) A-I      intronic chr2:61256135(+) A-I      intronic chr2:61247971(+) A-I      intronic chr2:61247311(+) A-I      intronic chr2:61247181(+) A-I      intronic chr2:61277835(+) A-I      3'UTR chr2:61277819(+) A-I      3'UTR chr2:61278017(+) A-I      3'UTR chr2:61277498(+) A-I      3'UTR chr2:61277938(+) A-I      3'UTR chr2:61277486(+) A-I      3'UTR chr2:61276654(+) A-I      3'UTR chr2:61276761(+) A-I      3'UTR chr2:61276707(+) A-I      3'UTR chr2:61277364(+) A-I      3'UTR chr2:61277350(+) A-I      3'UTR chr2:61277776(+) A-I      3'UTR chr2:61277466(+) A-I      3'UTR chr2:61276653(+) A-I      3'UTR chr2:61277255(+) A-I      3'UTR chr2:61276814(+) A-I      3'UTR chr2:61276738(+) A-I      3'UTR chr2:61277349(+) A-I      3'UTR chr2:61277277(+) A-I      3'UTR chr2:61276757(+) A-I      3'UTR chr2:61276788(+) A-I      3'UTR chr2:61277894(+) A-I      3'UTR chr2:61276670(+) A-I      3'UTR chr2:61277941(+) A-I      3'UTR chr2:61278030(+) A-I      3'UTR chr2:61277786(+) A-I      3'UTR chr2:61277390(+) A-I      3'UTR chr2:61277352(+) A-I      3'UTR chr2:61276744(+) A-I      3'UTR chr2:61277963(+) A-I      3'UTR chr2:61276751(+) A-I      3'UTR chr2:61277335(+) A-I      3'UTR chr2:61276750(+) A-I      3'UTR chr2:61276797(+) A-I      3'UTR chr2:61276733(+) A-I      3'UTR chr2:61277955(+) A-I      3'UTR chr2:61278018(+) A-I      3'UTR chr2:61277443(+) A-I      3'UTR chr2:61276723(+) A-I      3'UTR chr2:61277333(+) A-I      3'UTR chr2:61276834(+) A-I      3'UTR chr2:61276765(+) A-I      3'UTR chr2:61276753(+) A-I      3'UTR chr2:61277384(+) A-I      3'UTR chr2:61276645(+) A-I      3'UTR chr2:61251071(+) A-I      intronic chr2:61251097(+) A-I      intronic chr2:61254229(+) A-I      intronic chr2:61249859(+) A-I      intronic chr2:61251183(+) A-I      intronic chr2:61252389(+) A-I      intronic chr2:61256136(+) A-I      intronic chr2:61255607(+) A-I      intronic chr2:61271576(+) A-I      intronic chr2:61252756(+) A-I      intronic chr2:61254203(+) A-I      intronic chr2:61254202(+) A-I      intronic chr2:61250349(+) A-I      intronic chr2:61252683(+) A-I      intronic chr2:61247798(+) A-I      intronic chr2:61251106(+) A-I      intronic chr2:61254352(+) A-I      intronic chr2:61255750(+) A-I      intronic chr2:61251823(+) A-I      intronic chr2:61251044(+) A-I      intronic chr2:61254431(+) A-I      intronic chr2:61249837(+) A-I      intronic chr2:61252356(+) A-I      intronic chr2:61247240(+) A-I      intronic chr2:61251049(+) A-I      intronic chr2:61251206(+) A-I      intronic chr2:61247180(+) A-I      intronic chr2:61268299(+) A-I      intronic chr2:61252268(+) A-I      intronic chr2:61254419(+) A-I      intronic chr2:61247951(+) A-I      intronic chr2:61250994(+) A-I      intronic chr2:61250379(+) A-I      intronic chr2:61252343(+) A-I      intronic chr2:61254277(+) A-I      intronic chr2:61251115(+) A-I      intronic chr2:61247142(+) A-I      intronic chr2:61250269(+) A-I      intronic chr2:61251193(+) A-I      intronic chr2:61268192(+) A-I      intronic chr2:61249765(+) A-I      intronic chr2:61268341(+) A-I      intronic chr2:61254299(+) A-I      intronic chr2:61251208(+) A-I      intronic chr2:61249842(+) A-I      intronic chr2:61247282(+) A-I      intronic chr2:61252746(+) A-I      intronic chr2:61252377(+) A-I      intronic chr2:61252623(+) A-I      intronic chr2:61251152(+) A-I      intronic chr2:61251797(+) A-I      intronic chr2:61251032(+) A-I      intronic chr2:61249881(+) A-I      intronic chr2:61247147(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	PEX13	chr2:61251106(+) A-I intron -    22327324 chr2:61251115(+) A-I intron -    22327324 chr2:61268341(+) A-I intron -    22327324 chr2:61268343(+) A-I intron -    22327324 chr2:61278018(+) A-I intron -    21960545   //22327324 chr2:61278030(+) A-I intron -    21960545 chr2:61276670(+) A-I intron -    21960545 chr2:61276756(+) A-I intron -    21960545 chr2:61277390(+) A-G intron -    21725310   //22484847 chr2:61247142(+) A-G intron -    22484847 chr2:61247147(+) A-G intron -    22484847 chr2:61247214(+) A-G intron -    22484847 chr2:61247282(+) A-G intron -    22484847 chr2:61247853(+) A-G intron -    22484847 chr2:61247924(+) A-G intron -    22484847 chr2:61247964(+) A-G intron -    22484847 chr2:61250269(+) A-G intron -    22484847 chr2:61250349(+) A-G intron -    22484847 chr2:61250379(+) A-G intron -    22484847 chr2:61251044(+) A-G intron -    22484847 chr2:61251097(+) A-G intron -    22484847 chr2:61251106(+) A-G intron -    22484847 chr2:61251115(+) A-G intron -    22484847 chr2:61251179(+) A-G intron -    22484847 chr2:61251183(+) A-G intron -    22484847 chr2:61251194(+) A-G intron -    22484847 chr2:61251823(+) A-G intron -    22484847 chr2:61252343(+) A-G intron -    22484847 chr2:61252746(+) A-G intron -    22484847 chr2:61254225(+) A-G intron -    22484847 chr2:61254229(+) A-G intron -    22484847 chr2:61254352(+) A-G intron -    22484847 chr2:61254370(+) A-G intron -    22484847 chr2:61268341(+) A-G intron -    22484847 chr2:61268343(+) A-G intron -    22484847 chr2:61268349(+) A-G intron -    22484847 chr2:61276631(+) A-G intron -    22484847 chr2:61276751(+) A-G intron -    22484847 chr2:61276757(+) A-G intron -    22484847 chr2:61276758(+) A-G intron -    22484847 chr2:61276761(+) A-G intron -    22484847 chr2:61276765(+) A-G intron -    22484847 chr2:61276787(+) A-G intron -    22484847 chr2:61276788(+) A-G intron -    22484847 chr2:61277325(+) A-G intron -    22484847 chr2:61277384(+) A-G intron -    22484847 chr2:61277404(+) A-G intron -    22484847 chr2:61277443(+) A-G intron -    22484847 chr2:61277466(+) A-G intron -    22484847 chr2:61277486(+) A-G intron -    22484847 chr2:61277775(+) A-G intron -    22484847 chr2:61277932(+) A-G intron -    22484847 chr2:61277938(+) A-G intron -    22484847 chr2:61277941(+) A-G intron -    22484847 chr2:61277963(+) A-G intron -    22484847 chr2:61277967(+) A-G intron -    22484847 chr2:61277998(+) A-G intron -    22484847 chr2:61278017(+) A-G intron -    22484847 chr2:61278018(+) A-G intron -    22484847 chr2:61278030(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	PEX13	chr2:61244852-61244853(+) m6A 5'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr2:61244923-61244924(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr2:61244933-61244934(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr2:61244956-61244957(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr2:61244962-61244963(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr2:61244968-61244969(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr2:61245323-61245324(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr2:61245451-61245452(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr2:61245565-61245566(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr2:61245649-61245650(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr2:61245666-61245667(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr2:61245723-61245724(+) m6A 3'UTR//intron       24209618//22608085 chr2:61245794-61245795(+) m6A 3'UTR//intron       24209618//22608085 chr2:61258586-61258587(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//22608085 chr2:61258592-61258593(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//22608085 chr2:61258647-61258648(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//22575960//22608085 chr2:61258666-61258667(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//26404942//22575960//22608085 chr2:61258676-61258677(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//26404942//22575960//22608085 chr2:61259019-61259020(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:61259086-61259087(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:61259109-61259110(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:61259134-61259135(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:61259216-61259217(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr2:61272971-61272972(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr2:61275656-61275657(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr2:61275664-61275665(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr2:61275808-61275809(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085 chr2:61275842-61275843(+) m6A CDS       24284625//24981863//22575960//22608085 chr2:61275931-61275932(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr2:61275996-61275997(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr2:61276104-61276105(+) m6A 3'UTR       22608085 chr2:61276113-61276114(+) m6A 3'UTR       22608085 chr2:61276147-61276148(+) m6A 3'UTR       22608085 chr2:61276207-61276208(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61278419-61278420(+) m6A 3'UTR       27773535 chr2:61278435-61278436(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	PEX13	Chromatin K562 cells     - Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Nucleus HCC cell line (HepG2)     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Related Drug Information:

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID
RNAactDrug	ebv-miR-BART20-3p	Crizotinib       11626560

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART20-3p
Interactor2: PEX13

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg