Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00387044

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART20-5p:  MIMAT0003719          MOB1B:  NM_001244767     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART20-5p	MOB1B
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003719	92597
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	MATS2//MOB4A//MOBKL1A

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	MOB1B	chr4:71774253(+) A-I      intronic chr4:71774328(+) A-I      intronic chr4:71774331(+) A-I      intronic chr4:71774340(+) A-I      intronic chr4:71774341(+) A-I      intronic chr4:71774345(+) A-I      intronic chr4:71854625(+) A-I      intronic chr4:71774565(+) A-I      intronic chr4:71774591(+) A-I      intronic chr4:71774674(+) A-I      intronic chr4:71774678(+) A-I      intronic chr4:71774689(+) A-I      intronic chr4:71775091(+) A-I      intronic chr4:71801903(+) A-I      intronic chr4:71825701(+) A-I      intronic chr4:71790319(+) A-I      intronic chr4:71824048(+) A-I      intronic chr4:71775121(+) A-I      intronic chr4:71776545(+) A-I      intronic chr4:71815547(+) A-I      intronic chr4:71806097(+) A-I      intronic chr4:71769800(+) A-I      intronic chr4:71801894(+) A-I      intronic chr4:71801891(+) A-I      intronic chr4:71800425(+) A-I      intronic chr4:71800288(+) A-I      intronic chr4:71778578(+) A-I      intronic chr4:71779107(+) A-I      intronic chr4:71779113(+) A-I      intronic chr4:71779117(+) A-I      intronic chr4:71819557(+) A-I      intronic chr4:71769717(+) A-I      intronic chr4:71836956(+) A-I      intronic chr4:71836964(+) A-I      intronic chr4:71779125(+) A-I      intronic chr4:71779131(+) A-I      intronic chr4:71779210(+) A-I      intronic chr4:71779230(+) A-I      intronic chr4:71837950(+) A-I      intronic chr4:71787326(+) A-I      intronic chr4:71787460(+) A-I      intronic chr4:71787486(+) A-I      intronic chr4:71789412(+) A-I      intronic chr4:71789417(+) A-I      intronic chr4:71791731(+) A-I      intronic chr4:71791892(+) A-I      intronic chr4:71792593(+) A-I      intronic chr4:71793000(+) A-I      intronic chr4:71800402(+) A-I      intronic chr4:71793099(+) A-I      intronic chr4:71793101(+) A-I      intronic chr4:71793104(+) A-I      intronic chr4:71799702(+) A-I      intronic chr4:71800055(+) A-I      intronic chr4:71801900(+) A-I      intronic chr4:71771984(+) A-I      intronic chr4:71771974(+) A-I      intronic chr4:71771945(+) A-I      intronic chr4:71819567(+) A-I      intronic chr4:71819563(+) A-I      intronic chr4:71819510(+) A-I      intronic chr4:71818239(+) A-I      intronic chr4:71824976(+) A-I      intronic chr4:71817459(+) A-I      intronic chr4:71817432(+) A-I      intronic chr4:71769839(+) A-I      intronic chr4:71769961(+) A-I      intronic chr4:71822184(+) A-I      intronic chr4:71822200(+) A-I      intronic chr4:71770298(+) A-I      intronic chr4:71815556(+) A-I      intronic chr4:71770314(+) A-I      intronic chr4:71770329(+) A-I      intronic chr4:71770338(+) A-I      intronic chr4:71824979(+) A-I      intronic chr4:71827663(+) A-I      intronic chr4:71800394(+) A-I      intronic chr4:71770388(+) A-I      intronic chr4:71770417(+) A-I      intronic chr4:71770975(+) A-I      intronic chr4:71819576(+) A-I      intronic chr4:71828918(+) A-I      intronic chr4:71828966(+) A-I      intronic chr4:71828992(+) A-I      intronic chr4:71832148(+) A-I      intronic chr4:71832161(+) A-I      intronic chr4:71832192(+) A-I      intronic chr4:71832237(+) A-I      intronic chr4:71832313(+) A-I      intronic chr4:71832343(+) A-I      intronic chr4:71832353(+) A-I      intronic chr4:71833646(+) A-I      intronic chr4:71805125(+) A-I      intronic chr4:71833726(+) A-I      intronic chr4:71833784(+) A-I      intronic chr4:71834090(+) A-I      intronic chr4:71771839(+) A-I      intronic chr4:71823945(+) A-I      intronic chr4:71834122(+) A-I      intronic chr4:71834898(+) A-I      intronic chr4:71834908(+) A-I      intronic chr4:71819610(+) A-I      intronic chr4:71772009(+) A-I      intronic chr4:71815552(+) A-I      intronic chr4:71772015(+) A-I      intronic chr4:71772044(+) A-I      intronic chr4:71773336(+) A-I      intronic chr4:71773360(+) A-I      intronic chr4:71773884(+) A-I      intronic chr4:71773888(+) A-I      intronic chr4:71823946(+) A-I      intronic chr4:71823976(+) A-I      intronic chr4:71823982(+) A-I      intronic chr4:71773976(+) A-I      intronic chr4:71774236(+) A-I      intronic chr4:71833698(+) A-I      intronic chr4:71774218(+) A-I      intronic chr4:71819603(+) A-I      intronic chr4:71769881(+) A-I      intronic chr4:71833034(+) A-I      intronic chr4:71769898(+) A-I      intronic chr4:71832424(+) A-I      intronic chr4:71830485(+) A-I      intronic chr4:71779114(+) A-I      intronic chr4:71769962(+) A-I      intronic chr4:71771975(+) A-I      intronic chr4:71774371(+) A-I      intronic chr4:71779065(+) A-I      intronic chr4:71774412(+) A-I      intronic chr4:71833085(+) A-I      intronic chr4:71770345(+) A-I      intronic chr4:71794976(+) A-I      intronic chr4:71834907(+) A-I      intronic chr4:71770355(+) A-I      intronic chr4:71832497(+) A-I      intronic chr4:71827680(+) A-I      intronic chr4:71793046(+) A-I      intronic chr4:71833651(+) A-I      intronic chr4:71829465(+) A-I      intronic chr4:71833696(+) A-I      intronic chr4:71822073(+) A-I      intronic chr4:71794989(+) A-I      intronic chr4:71830813(+) A-I      intronic chr4:71774237(+) A-I      intronic chr4:71833048(+) A-I      intronic chr4:71804634(+) A-I      intronic chr4:71771107(+) A-I      intronic chr4:71832071(+) A-I      intronic chr4:71778620(+) A-I      intronic chr4:71800829(+) A-I      intronic chr4:71828554(+) A-I      intronic chr4:71818836(+) A-I      intronic chr4:71837101(+) A-I      intronic chr4:71771746(+) A-I      intronic chr4:71771586(+) A-I      intronic chr4:71832448(+) A-I      intronic chr4:71818785(+) A-I      intronic chr4:71832036(+) A-I      intronic chr4:71817501(+) A-I      intronic chr4:71771948(+) A-I      intronic chr4:71833702(+) A-I      intronic chr4:71771221(+) A-I      intronic chr4:71830894(+) A-I      intronic chr4:71830588(+) A-I      intronic chr4:71774304(+) A-I      intronic chr4:71771049(+) A-I      intronic chr4:71851321(+) A-I      3'UTR chr4:71843533(+) A-I      intronic chr4:71838049(+) A-I      intronic chr4:71770228(+) A-I      intronic chr4:71856537(+) A-I      intronic chr4:71773290(+) A-I      intronic chr4:71856569(+) A-I      intronic chr4:71771055(+) A-I      intronic chr4:71771127(+) A-I      intronic chr4:71828452(+) A-I      intronic chr4:71771199(+) A-I      intronic chr4:71805128(+) A-I      intronic chr4:71792536(+) A-I      intronic chr4:71832968(+) A-I      intronic chr4:71789404(+) A-I      intronic chr4:71838061(+) A-I      intronic chr4:71775562(+) A-I      intronic chr4:71822290(+) A-I      intronic chr4:71772005(+) A-I      intronic chr4:71773432(+) A-I      intronic chr4:71819648(+) A-I      intronic chr4:71792635(+) A-I      intronic chr4:71818182(+) A-I      intronic chr4:71819524(+) A-I      intronic chr4:71799675(+) A-I      intronic chr4:71779045(+) A-I      intronic chr4:71770987(+) A-I      intronic chr4:71770391(+) A-I      intronic chr4:71789450(+) A-I      intronic chr4:71830482(+) A-I      intronic chr4:71775584(+) A-I      intronic chr4:71774583(+) A-I      intronic chr4:71832185(+) A-I      intronic chr4:71776575(+) A-I      intronic chr4:71833040(+) A-I      intronic chr4:71779118(+) A-I      intronic chr4:71828551(+) A-I      intronic chr4:71854991(+) A-I      intronic chr4:71774621(+) A-I      intronic chr4:71792526(+) A-I      intronic chr4:71774647(+) A-I      intronic chr4:71856629(+) A-I      intronic chr4:71832080(+) A-I      intronic chr4:71789111(+) A-I      intronic chr4:71771105(+) A-I      intronic chr4:71832028(+) A-I      intronic chr4:71773882(+) A-I      intronic chr4:71839112(+) A-I      intronic chr4:71832930(+) A-I      intronic chr4:71809972(+) A-I      intronic chr4:71805142(+) A-I      intronic chr4:71791832(+) A-I      intronic chr4:71775105(+) A-I      intronic chr4:71834243(+) A-I      intronic chr4:71771745(+) A-I      intronic chr4:71830867(+) A-I      intronic chr4:71801505(+) A-I      intronic chr4:71832371(+) A-I      intronic chr4:71773952(+) A-I      intronic chr4:71833774(+) A-I      intronic chr4:71829462(+) A-I      intronic chr4:71779153(+) A-I      intronic chr4:71799983(+) A-I      intronic chr4:71773872(+) A-I      intronic chr4:71833568(+) A-I      intronic chr4:71793097(+) A-I      intronic chr4:71818213(+) A-I      intronic chr4:71779088(+) A-I      intronic chr4:71774648(+) A-I      intronic chr4:71769804(+) A-I      intronic chr4:71771942(+) A-I      intronic chr4:71771943(+) A-I      intronic chr4:71791774(+) A-I      intronic chr4:71791903(+) A-I      intronic chr4:71830746(+) A-I      intronic chr4:71832221(+) A-I      intronic chr4:71791728(+) A-I      intronic chr4:71830549(+) A-I      intronic chr4:71815443(+) A-I      intronic chr4:71771972(+) A-I      intronic chr4:71818183(+) A-I      intronic chr4:71789181(+) A-I      intronic chr4:71824145(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	MOB1B	chr4:71771221(+) A-I intron -    22327324 chr4:71769799(+) A-G intron -    22484847 chr4:71769804(+) A-G intron -    22484847 chr4:71769883(+) A-G intron -    22484847 chr4:71769898(+) A-G intron -    22484847 chr4:71770228(+) A-G intron -    22484847 chr4:71770300(+) A-G intron -    22484847 chr4:71770345(+) A-G intron -    22484847 chr4:71770391(+) A-G intron -    22484847 chr4:71770987(+) A-G intron -    22484847 chr4:71771055(+) A-G intron -    22484847 chr4:71771107(+) A-G intron -    22484847 chr4:71771127(+) A-G intron -    22484847 chr4:71771149(+) A-G intron -    22484847 chr4:71771199(+) A-G intron -    22484847 chr4:71771221(+) A-G intron -    22484847 chr4:71771533(+) A-G intron -    22484847 chr4:71771586(+) A-G intron -    22484847 chr4:71771637(+) A-G intron -    22484847 chr4:71771948(+) A-G intron -    22484847 chr4:71773290(+) A-G intron -    22484847 chr4:71773432(+) A-G intron -    22484847 chr4:71773433(+) A-G intron -    22484847 chr4:71773872(+) A-G intron -    22484847 chr4:71773882(+) A-G intron -    22484847 chr4:71773952(+) A-G intron -    22484847 chr4:71774237(+) A-G intron -    22484847 chr4:71774304(+) A-G intron -    22484847 chr4:71774371(+) A-G intron -    22484847 chr4:71774412(+) A-G intron -    22484847 chr4:71774447(+) A-G intron -    22484847 chr4:71774492(+) A-T intron -    22484847 chr4:71774647(+) A-G intron -    22484847 chr4:71774648(+) A-G intron -    22484847 chr4:71775082(+) A-G intron -    22484847 chr4:71775104(+) A-G intron -    22484847 chr4:71775105(+) A-G intron -    22484847 chr4:71775946(+) T-C intron -    22484847 chr4:71776517(+) G-T intron -    22484847 chr4:71776552(+) T-C intron -    22484847 chr4:71776575(+) A-G intron -    22484847 chr4:71779065(+) A-G intron -    22484847 chr4:71779088(+) A-G intron -    22484847 chr4:71779114(+) A-G intron -    22484847 chr4:71779118(+) A-G intron -    22484847 chr4:71782478(+) G-A intron -    22484847 chr4:71789111(+) A-G intron -    22484847 chr4:71789404(+) A-G intron -    22484847 chr4:71791728(+) A-G intron -    22484847 chr4:71791736(+) A-G intron -    22484847 chr4:71791756(+) A-G intron -    22484847 chr4:71791774(+) A-G intron -    22484847 chr4:71791832(+) A-G intron -    22484847 chr4:71791903(+) A-G intron -    22484847 chr4:71792526(+) A-G intron -    22484847 chr4:71792635(+) A-G intron -    22484847 chr4:71793046(+) A-G intron -    22484847 chr4:71793097(+) A-G intron -    22484847 chr4:71794976(+) A-G intron -    22484847 chr4:71797585(+) G-T intron -    22484847 chr4:71799983(+) A-G intron -    22484847 chr4:71800395(+) A-G intron -    22484847 chr4:71800401(+) A-G intron -    22484847 chr4:71802763(+) A-G intron -    22484847 chr4:71819496(+) A-G intron -    22484847 chr4:71819524(+) A-G intron -    22484847 chr4:71822290(+) A-G intron -    22484847 chr4:71822996(+) C-A intron -    22484847 chr4:71823885(+) C-T intron -    22484847 chr4:71827680(+) A-G intron -    22484847 chr4:71832185(+) A-G intron -    22484847 chr4:71832221(+) A-G intron -    22484847 chr4:71832497(+) A-G intron -    22484847 chr4:71833053(+) A-G intron -    22484847 chr4:71833696(+) A-G intron -    22484847 chr4:71833702(+) A-G intron -    22484847 chr4:71834873(+) G-C intron -    22484847 chr4:71834907(+) A-G intron -    22484847 chr4:71851284(+) G-A intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	MOB1B	chr4:71768091-71768092(+) m6A 5'UTR//exon       25456834//24981863 chr4:71768105-71768106(+) m6A 5'UTR//exon       25456834//24981863 chr4:71848751-71848752(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr4:71853771-71853772(+) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr4:71859283-71859284(+) m6A intron       24981863 chr4:71859399-71859400(+) m6A intron       24981863 chr4:71859544-71859545(+) m6A intron       24284625 chr4:71859606-71859607(+) m6A intron       24284625

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	MOB1B	Chromatin K562 cells     - Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Nucleus K562 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART20-5p
Interactor2: MOB1B

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg