Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00381119

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART19-3p:  MIMAT0003718          SLC30A6:  NM_001330476     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART19-3p	SLC30A6
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003718	55676
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	MST103//MSTP103//ZNT6

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	SLC30A6	chr2:32402316(+) A-I      intronic chr2:32430882(+) A-I      intronic chr2:32433294(+) A-I      intronic chr2:32433300(+) A-I      intronic chr2:32433304(+) A-I      intronic chr2:32433349(+) A-I      intronic chr2:32446468(+) A-I      3'UTR chr2:32446481(+) A-I      3'UTR chr2:32402277(+) A-I      intronic chr2:32430028(+) A-I      intronic chr2:32446490(+) A-I      3'UTR chr2:32425037(+) A-I      intronic chr2:32449330(+) A-I      3'UTR chr2:32425028(+) A-I      intronic chr2:32430411(+) A-I      intronic chr2:32425026(+) A-I      intronic chr2:32446491(+) A-I      3'UTR chr2:32425073(+) A-I      intronic chr2:32402318(+) A-I      intronic chr2:32430836(+) A-I      intronic chr2:32430030(+) A-I      intronic chr2:32430013(+) A-I      intronic chr2:32425087(+) A-I      intronic chr2:32425023(+) A-I      intronic chr2:32444159(+) A-I      intronic chr2:32440994(+) A-I      intronic chr2:32436924(+) A-I      intronic chr2:32436826(+) A-I      intronic chr2:32436791(+) A-I      intronic chr2:32436787(+) A-I      intronic chr2:32433863(+) A-I      intronic chr2:32424983(+) A-I      intronic chr2:32424982(+) A-I      intronic chr2:32423782(+) A-I      intronic chr2:32422086(+) A-I      intronic chr2:32422059(+) A-I      intronic chr2:32421979(+) A-I      intronic chr2:32421374(+) A-I      intronic chr2:32421336(+) A-I      intronic chr2:32421329(+) A-I      intronic chr2:32421068(+) A-I      intronic chr2:32421012(+) A-I      intronic chr2:32415794(+) A-I      intronic chr2:32414604(+) A-I      intronic chr2:32414575(+) A-I      intronic chr2:32413715(+) A-I      intronic chr2:32413661(+) A-I      intronic chr2:32413586(+) A-I      intronic chr2:32413508(+) A-I      intronic chr2:32413507(+) A-I      intronic chr2:32411676(+) A-I      intronic chr2:32411646(+) A-I      intronic chr2:32411640(+) A-I      intronic chr2:32409672(+) A-I      intronic chr2:32409624(+) A-I      intronic chr2:32409584(+) A-I      intronic chr2:32409578(+) A-I      intronic chr2:32408472(+) A-I      intronic chr2:32408184(+) A-I      intronic chr2:32407286(+) A-I      intronic chr2:32407102(+) A-I      intronic chr2:32406817(+) A-I      intronic chr2:32406726(+) A-I      intronic chr2:32405764(+) A-I      intronic chr2:32405711(+) A-I      intronic chr2:32405702(+) A-I      intronic chr2:32405667(+) A-I      intronic chr2:32405406(+) A-I      intronic chr2:32405329(+) A-I      intronic chr2:32405289(+) A-I      intronic chr2:32405238(+) A-I      intronic chr2:32405233(+) A-I      intronic chr2:32404168(+) A-I      intronic chr2:32404150(+) A-I      intronic chr2:32404070(+) A-I      intronic chr2:32404033(+) A-I      intronic chr2:32403731(+) A-I      intronic chr2:32403726(+) A-I      intronic chr2:32403631(+) A-I      intronic chr2:32403572(+) A-I      intronic chr2:32403528(+) A-I      intronic chr2:32402089(+) A-I      intronic chr2:32401985(+) A-I      intronic chr2:32401981(+) A-I      intronic chr2:32401941(+) A-I      intronic chr2:32401659(+) A-I      intronic chr2:32401576(+) A-I      intronic chr2:32401574(+) A-I      intronic chr2:32414876(+) A-I      intronic chr2:32401540(+) A-I      intronic chr2:32401525(+) A-I      intronic chr2:32401473(+) A-I      intronic chr2:32401450(+) A-I      intronic chr2:32400967(+) A-I      intronic chr2:32400789(+) A-I      intronic chr2:32394435(+) A-I      intronic chr2:32392327(+) A-I      intronic chr2:32430369(+) A-I      intronic chr2:32430379(+) A-I      intronic chr2:32430392(+) A-I      intronic chr2:32430857(+) A-I      intronic chr2:32430878(+) A-I      intronic chr2:32430917(+) A-I      intronic chr2:32430991(+) A-I      intronic chr2:32431021(+) A-I      intronic chr2:32431328(+) A-I      intronic chr2:32431336(+) A-I      intronic chr2:32431376(+) A-I      intronic chr2:32431417(+) A-I      intronic chr2:32431421(+) A-I      intronic chr2:32431435(+) A-I      intronic chr2:32433835(+) A-I      intronic chr2:32433848(+) A-I      intronic chr2:32444743(+) A-I      intronic chr2:32444629(+) A-I      intronic chr2:32444523(+) A-I      intronic chr2:32444303(+) A-I      intronic chr2:32410270(+) A-I      intronic chr2:32411222(+) A-I      intronic chr2:32430102(+) A-I      intronic chr2:32415811(+) A-I      intronic chr2:32432373(+) A-I      intronic chr2:32429957(+) A-I      intronic chr2:32411987(+) A-I      intronic chr2:32435464(+) A-I      intronic chr2:32413713(+) A-I      intronic chr2:32407267(+) A-I      intronic chr2:32421122(+) A-I      intronic chr2:32430370(+) A-I      intronic chr2:32401616(+) A-I      intronic chr2:32431260(+) A-I      intronic chr2:32405418(+) A-I      intronic chr2:32442936(+) A-I      intronic chr2:32405754(+) A-I      intronic chr2:32420276(+) A-I      intronic chr2:32408672(+) A-I      intronic chr2:32420249(+) A-I      intronic chr2:32402872(+) A-I      intronic chr2:32405641(+) A-I      intronic chr2:32415819(+) A-I      intronic chr2:32430339(+) A-I      intronic chr2:32411614(+) A-I      intronic chr2:32400790(+) A-I      intronic chr2:32435386(+) A-I      intronic chr2:32405654(+) A-I      intronic chr2:32429976(+) A-I      intronic chr2:32405321(+) A-I      intronic chr2:32405506(+) A-I      intronic chr2:32436889(+) A-I      intronic chr2:32406790(+) A-I      intronic chr2:32420278(+) A-I      intronic chr2:32436903(+) A-I      intronic chr2:32421217(+) A-I      intronic chr2:32403290(+) A-I      intronic chr2:32433318(+) A-I      intronic chr2:32394403(+) A-I      intronic chr2:32405312(+) A-I      intronic chr2:32403578(+) A-I      intronic chr2:32442058(+) A-I      intronic chr2:32421134(+) A-I      intronic chr2:32434806(+) A-I      intronic chr2:32401580(+) A-I      intronic chr2:32431464(+) A-I      intronic chr2:32420397(+) A-I      intronic chr2:32394448(+) A-I      intronic chr2:32405050(+) A-I      intronic chr2:32403514(+) A-I      intronic chr2:32414461(+) A-I      intronic chr2:32421221(+) A-I      intronic chr2:32442164(+) A-I      intronic chr2:32403466(+) A-I      intronic chr2:32430920(+) A-I      intronic chr2:32421166(+) A-I      intronic chr2:32440982(+) A-I      intronic chr2:32421339(+) A-I      intronic chr2:32404034(+) A-I      intronic chr2:32411568(+) A-I      intronic chr2:32414811(+) A-I      intronic chr2:32413635(+) A-I      intronic chr2:32430957(+) A-I      intronic chr2:32430866(+) A-I      intronic chr2:32400921(+) A-I      intronic chr2:32401911(+) A-I      intronic chr2:32421220(+) A-I      intronic chr2:32407274(+) A-I      intronic chr2:32443261(+) A-I      intronic chr2:32431365(+) A-I      intronic chr2:32411243(+) A-I      intronic chr2:32431355(+) A-I      intronic chr2:32406777(+) A-I      intronic chr2:32403581(+) A-I      intronic chr2:32405546(+) A-I      intronic chr2:32420846(+) A-I      intronic chr2:32409648(+) A-I      intronic chr2:32406663(+) A-I      intronic chr2:32409619(+) A-I      intronic chr2:32403488(+) A-I      intronic chr2:32402933(+) A-I      intronic chr2:32408070(+) A-I      intronic chr2:32414795(+) A-I      intronic chr2:32430854(+) A-I      intronic chr2:32402781(+) A-I      intronic chr2:32411576(+) A-I      intronic chr2:32431443(+) A-I      intronic chr2:32405237(+) A-I      intronic chr2:32430903(+) A-I      intronic chr2:32403589(+) A-I      intronic chr2:32404115(+) A-I      intronic chr2:32408244(+) A-I      intronic chr2:32431356(+) A-I      intronic chr2:32431436(+) A-I      intronic chr2:32441526(+) A-I      intronic chr2:32407142(+) A-I      intronic chr2:32415878(+) A-I      intronic chr2:32435473(+) A-I      intronic chr2:32441525(+) A-I      intronic chr2:32413612(+) A-I      intronic chr2:32411641(+) A-I      intronic chr2:32405559(+) A-I      intronic chr2:32420816(+) A-I      intronic chr2:32421172(+) A-I      intronic chr2:32401588(+) A-I      intronic chr2:32440403(+) A-I      intronic chr2:32403635(+) A-I      intronic chr2:32410160(+) A-I      intronic chr2:32411284(+) A-I      intronic chr2:32429995(+) A-I      intronic chr2:32410327(+) A-I      intronic chr2:32440874(+) A-I      intronic chr2:32407056(+) A-I      intronic chr2:32444527(+) A-I      intronic chr2:32439195(+) A-I      intronic chr2:32405325(+) A-I      intronic chr2:32441593(+) A-I      intronic chr2:32431261(+) A-I      intronic chr2:32423862(+) A-I      intronic chr2:32402424(+) A-I      intronic chr2:32405602(+) A-I      intronic chr2:32415823(+) A-I      intronic chr2:32435455(+) A-I      intronic chr2:32402887(+) A-I      intronic chr2:32435312(+) A-I      intronic chr2:32430363(+) A-I      intronic chr2:32408685(+) A-I      intronic chr2:32415797(+) A-I      intronic chr2:32411261(+) A-I      intronic chr2:32430144(+) A-I      intronic chr2:32442032(+) A-I      intronic chr2:32404112(+) A-I      intronic chr2:32421222(+) A-I      intronic chr2:32420320(+) A-I      intronic chr2:32440891(+) A-I      intronic chr2:32430143(+) A-I      intronic chr2:32411569(+) A-I      intronic chr2:32408109(+) A-I      intronic chr2:32415833(+) A-I      intronic chr2:32402489(+) A-I      intronic chr2:32405551(+) A-I      intronic chr2:32430067(+) A-I      intronic chr2:32407249(+) A-I      intronic chr2:32420801(+) A-I      intronic chr2:32430455(+) A-I      intronic chr2:32403534(+) A-I      intronic chr2:32404190(+) A-I      intronic chr2:32401946(+) A-I      intronic chr2:32444645(+) A-I      intronic chr2:32405330(+) A-I      intronic chr2:32407144(+) A-I      intronic chr2:32405322(+) A-I      intronic chr2:32431364(+) A-I      intronic chr2:32443216(+) A-I      intronic chr2:32394404(+) A-I      intronic chr2:32415900(+) A-I      intronic chr2:32408060(+) A-I      intronic chr2:32414778(+) A-I      intronic chr2:32402408(+) A-I      intronic chr2:32394701(+) A-I      intronic chr2:32441458(+) A-I      intronic chr2:32415880(+) A-I      intronic chr2:32405430(+) A-I      intronic chr2:32414881(+) A-I      intronic chr2:32405197(+) A-I      intronic chr2:32414867(+) A-I      intronic chr2:32405619(+) A-I      intronic chr2:32401942(+) A-I      intronic chr2:32430026(+) A-I      intronic chr2:32439278(+) A-I      intronic chr2:32430340(+) A-I      intronic chr2:32401612(+) A-I      intronic chr2:32420232(+) A-I      intronic chr2:32442214(+) A-I      intronic chr2:32408518(+) A-I      intronic chr2:32407280(+) A-I      intronic chr2:32431368(+) A-I      intronic chr2:32430235(+) A-I      intronic chr2:32430939(+) A-I      intronic chr2:32423709(+) A-I      intronic chr2:32402583(+) A-I      NonSyn:Thr->Ala chr2:32402596(+) A-I      NonSyn:Lys->Arg

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	SLC30A6	chr2:32426704(+) A-I intron -    22327324 chr2:32426888(+) A-I intron -    22327324 chr2:32426903(+) A-I intron -    22327324 chr2:32427972(+) A-I intron -    22327324 chr2:32428405(+) A-I intron -    22327324 chr2:32428414(+) A-I intron -    22327324 chr2:32400558(+) A-G intron -    22484847 chr2:32394448(+) A-G intron -    22484847 chr2:32401580(+) A-G intron -    22484847 chr2:32401606(+) A-G intron -    22484847 chr2:32401868(+) A-G intron -    22484847 chr2:32401911(+) A-G intron -    22484847 chr2:32401942(+) A-G intron -    22484847 chr2:32401946(+) A-G intron -    22484847 chr2:32402408(+) A-G intron -    22484847 chr2:32402424(+) A-G intron -    22484847 chr2:32402581(+) A-G exon CDS    22484847 chr2:32402596(+) A-G exon CDS    22484847 chr2:32402781(+) A-G intron -    22484847 chr2:32402887(+) A-G intron -    22484847 chr2:32403466(+) A-G intron -    22484847 chr2:32403488(+) A-G intron -    22484847 chr2:32403493(+) A-G intron -    22484847 chr2:32403509(+) A-G intron -    22484847 chr2:32403510(+) A-G intron -    22484847 chr2:32403514(+) A-G intron -    22484847 chr2:32403534(+) A-G intron -    22484847 chr2:32403582(+) A-G intron -    22484847 chr2:32403591(+) A-G intron -    22484847 chr2:32403592(+) A-G intron -    22484847 chr2:32403621(+) A-G intron -    22484847 chr2:32403635(+) A-G intron -    22484847 chr2:32404115(+) A-G intron -    22484847 chr2:32404164(+) A-G intron -    22484847 chr2:32405197(+) A-G intron -    22484847 chr2:32405199(+) A-G intron -    22484847 chr2:32405321(+) A-G intron -    22484847 chr2:32405322(+) A-G intron -    22484847 chr2:32405325(+) A-G intron -    22484847 chr2:32405330(+) A-G intron -    22484847 chr2:32405418(+) A-G intron -    22484847 chr2:32405559(+) A-G intron -    22484847 chr2:32405602(+) A-G intron -    22484847 chr2:32405619(+) A-G intron -    22484847 chr2:32405641(+) A-G intron -    22484847 chr2:32405654(+) A-G intron -    22484847 chr2:32405754(+) A-G intron -    22484847 chr2:32406663(+) A-G intron -    22484847 chr2:32406798(+) A-G intron -    22484847 chr2:32407056(+) A-G intron -    22484847 chr2:32407142(+) A-G intron -    22484847 chr2:32407144(+) A-G intron -    22484847 chr2:32407160(+) A-G intron -    22484847 chr2:32407274(+) A-G intron -    22484847 chr2:32407280(+) A-G intron -    22484847 chr2:32407996(+) A-G intron -    22484847 chr2:32408070(+) A-G intron -    22484847 chr2:32408109(+) A-G intron -    22484847 chr2:32409619(+) A-G intron -    22484847 chr2:32409648(+) A-G intron -    22484847 chr2:32410327(+) A-G intron -    22484847 chr2:32411568(+) A-G intron -    22484847 chr2:32411569(+) A-G intron -    22484847 chr2:32411576(+) A-G intron -    22484847 chr2:32413612(+) A-G intron -    22484847 chr2:32413713(+) A-G intron -    22484847 chr2:32414778(+) A-G intron -    22484847 chr2:32414795(+) A-G intron -    22484847 chr2:32414811(+) A-G intron -    22484847 chr2:32414881(+) A-G intron -    22484847 chr2:32415819(+) A-G intron -    22484847 chr2:32415823(+) A-G intron -    22484847 chr2:32415833(+) A-G intron -    22484847 chr2:32415878(+) A-G intron -    22484847 chr2:32415880(+) A-G intron -    22484847 chr2:32418424(+) G-A intron -    22484847 chr2:32420397(+) A-G intron -    22484847 chr2:32420846(+) A-G intron -    22484847 chr2:32420985(+) A-G intron -    22484847 chr2:32421122(+) A-G intron -    22484847 chr2:32421167(+) A-G intron -    22484847 chr2:32421217(+) A-G intron -    22484847 chr2:32421220(+) A-G intron -    22484847 chr2:32421339(+) A-G intron -    22484847 chr2:32423862(+) A-G intron -    22484847 chr2:32429900(+) A-T intron -    22484847 chr2:32429936(+) A-G intron -    22484847 chr2:32430020(+) A-G intron -    22484847 chr2:32430022(+) A-G intron -    22484847 chr2:32430026(+) A-G intron -    22484847 chr2:32430067(+) A-G intron -    22484847 chr2:32430235(+) A-G intron -    22484847 chr2:32430339(+) A-G intron -    22484847 chr2:32430340(+) A-G intron -    22484847 chr2:32430363(+) A-G intron -    22484847 chr2:32430370(+) A-G intron -    22484847 chr2:32430396(+) A-G intron -    22484847 chr2:32430435(+) A-G intron -    22484847 chr2:32430849(+) A-G intron -    22484847 chr2:32430854(+) A-G intron -    22484847 chr2:32431355(+) A-G intron -    22484847 chr2:32431356(+) A-G intron -    22484847 chr2:32431363(+) A-G intron -    22484847 chr2:32431364(+) A-G intron -    22484847 chr2:32431365(+) A-G intron -    22484847 chr2:32431368(+) A-G intron -    22484847 chr2:32431394(+) A-G intron -    22484847 chr2:32431464(+) A-G intron -    22484847 chr2:32432373(+) A-G intron -    22484847 chr2:32433261(+) A-G intron -    22484847 chr2:32433318(+) A-G intron -    22484847 chr2:32435312(+) A-G intron -    22484847 chr2:32435455(+) A-G intron -    22484847 chr2:32436889(+) A-G intron -    22484847 chr2:32436903(+) A-G intron -    22484847 chr2:32440867(+) A-G intron -    22484847 chr2:32440873(+) A-G intron -    22484847 chr2:32440874(+) A-G intron -    22484847 chr2:32442032(+) A-G intron -    22484847 chr2:32442058(+) A-G intron -    22484847 chr2:32442219(+) G-A intron -    22484847 chr2:32443216(+) A-G intron -    22484847 chr2:32443266(+) G-A intron -    22484847 chr2:32443591(+) T-C intron -    22484847 chr2:32443592(+) T-C intron -    22484847 chr2:32443594(+) G-C intron -    22484847 chr2:32443646(+) G-T intron -    22484847 chr2:32443647(+) A-T intron -    22484847 chr2:32444645(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	SLC30A6	chr2:32396358-32396359(+) m6A CDS//intron       24981863 chr2:32396378-32396379(+) m6A CDS//intron       24981863 chr2:32396420-32396421(+) m6A CDS//intron       24981863 chr2:32426679-32426680(+) m6A intron       25456834 chr2:32426703-32426704(+) m6A intron       25456834 chr2:32427957-32427958(+) m6A intron       22608085 chr2:32428060-32428061(+) m6A intron       22608085 chr2:32428104-32428105(+) m6A intron       22608085 chr2:32428130-32428131(+) m6A intron       22608085 chr2:32428166-32428167(+) m6A intron       22608085 chr2:32445322-32445323(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//22608085 chr2:32445450-32445451(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085 chr2:32445454-32445455(+) Y 3'UTR//CDS       26075521 chr2:32445507-32445508(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:32445532-32445533(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:32445585-32445586(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:32445603-32445604(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:32445611-32445612(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:32445643-32445644(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:32445676-32445677(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:32445716-32445717(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:32445749-32445750(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:32445766-32445767(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:32445775-32445776(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:32445785-32445786(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:32447386-32447387(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:32447558-32447559(+) m6A 3'UTR       24284625//22608085 chr2:32447826-32447827(+) Y 3'UTR       26075521

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ebv-miR-BART19-3p	Exosome Primary dendritic cells|T cell line (J77)     21505438
	SLC30A6	Chromatin K562 cells     - Cytosol K562 cells     - Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART19-3p
Interactor2: SLC30A6

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg