Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00381111

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART19-3p:  MIMAT0003718          INTS8:  NR_073445     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART19-3p	INTS8
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003718	55656
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	C8orf52//INT8//NEDCHS

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	INTS8	chr8:95873874(+) A-I      intronic chr8:95856797(+) A-I      intronic chr8:95856645(+) A-I      intronic chr8:95856638(+) A-I      intronic chr8:95856609(+) A-I      intronic chr8:95856447(+) A-I      intronic chr8:95856384(+) A-I      intronic chr8:95856371(+) A-I      intronic chr8:95856360(+) A-I      intronic chr8:95855707(+) A-I      intronic chr8:95855680(+) A-I      intronic chr8:95855665(+) A-I      intronic chr8:95855644(+) A-I      intronic chr8:95855610(+) A-I      intronic chr8:95846735(+) A-I      intronic chr8:95846716(+) A-I      intronic chr8:95846126(+) A-I      intronic chr8:95846125(+) A-I      intronic chr8:95846117(+) A-I      intronic chr8:95840531(+) A-I      intronic chr8:95838576(+) A-I      intronic chr8:95874040(+) A-I      intronic chr8:95874026(+) A-I      intronic chr8:95876735(+) A-I      intronic chr8:95873095(+) A-I      intronic chr8:95874431(+) A-I      intronic chr8:95874409(+) A-I      intronic chr8:95874326(+) A-I      intronic chr8:95873920(+) A-I      intronic chr8:95873837(+) A-I      intronic chr8:95873170(+) A-I      intronic chr8:95873148(+) A-I      intronic chr8:95873106(+) A-I      intronic chr8:95879807(+) A-I      intronic chr8:95873072(+) A-I      intronic chr8:95855701(+) A-I      intronic chr8:95872697(+) A-I      intronic chr8:95872622(+) A-I      intronic chr8:95871577(+) A-I      intronic chr8:95866216(+) A-I      intronic chr8:95866215(+) A-I      intronic chr8:95865472(+) A-I      intronic chr8:95865455(+) A-I      intronic chr8:95846801(+) A-I      intronic chr8:95873881(+) A-I      intronic chr8:95865382(+) A-I      intronic chr8:95865088(+) A-I      intronic chr8:95865000(+) A-I      intronic chr8:95864921(+) A-I      intronic chr8:95864891(+) A-I      intronic chr8:95864847(+) A-I      intronic chr8:95876760(+) A-I      intronic chr8:95860441(+) A-I      intronic chr8:95876815(+) A-I      intronic chr8:95876780(+) A-I      intronic chr8:95876778(+) A-I      intronic chr8:95876774(+) A-I      intronic chr8:95860307(+) A-I      intronic chr8:95859544(+) A-I      intronic chr8:95858559(+) A-I      intronic chr8:95857880(+) A-I      intronic chr8:95856792(+) A-I      intronic chr8:95860336(+) A-I      intronic chr8:95860354(+) A-I      intronic chr8:95856784(+) A-I      intronic chr8:95846817(+) A-I      intronic chr8:95891756(+) A-I      intronic chr8:95891755(+) A-I      intronic chr8:95865495(+) A-I      intronic chr8:95857191(+) A-I      intronic chr8:95857093(+) A-I      intronic chr8:95874041(+) A-I      intronic chr8:95876870(+) A-I      intronic chr8:95876847(+) A-I      intronic chr8:95876825(+) A-I      intronic chr8:95864202(+) A-I      intronic chr8:95883586(+) A-I      intronic chr8:95883576(+) A-I      intronic chr8:95883559(+) A-I      intronic chr8:95874452(+) A-I      intronic chr8:95856711(+) A-I      intronic chr8:95857182(+) A-I      intronic chr8:95873020(+) A-I      intronic chr8:95855737(+) A-I      intronic chr8:95881128(+) A-I      intronic chr8:95872577(+) A-I      intronic chr8:95865488(+) A-I      intronic chr8:95856541(+) A-I      intronic chr8:95873750(+) A-I      intronic chr8:95876893(+) A-I      intronic chr8:95865338(+) A-I      intronic chr8:95855648(+) A-I      intronic chr8:95846262(+) A-I      intronic chr8:95873842(+) A-I      intronic chr8:95874444(+) A-I      intronic chr8:95878727(+) A-I      intronic chr8:95846828(+) A-I      intronic chr8:95860367(+) A-I      intronic chr8:95872598(+) A-I      intronic chr8:95883517(+) A-I      intronic chr8:95857262(+) A-I      intronic chr8:95876703(+) A-I      intronic chr8:95873963(+) A-I      intronic chr8:95874269(+) A-I      intronic chr8:95872555(+) A-I      intronic chr8:95855540(+) A-I      intronic chr8:95846048(+) A-I      intronic chr8:95855750(+) A-I      intronic chr8:95872798(+) A-I      intronic chr8:95859368(+) A-I      intronic chr8:95872720(+) A-I      intronic chr8:95874294(+) A-I      intronic chr8:95857221(+) A-I      intronic chr8:95873164(+) A-I      intronic chr8:95865393(+) A-I      intronic chr8:95846726(+) A-I      intronic chr8:95879803(+) A-I      intronic chr8:95874262(+) A-I      intronic chr8:95846740(+) A-I      intronic chr8:95857229(+) A-I      intronic chr8:95872687(+) A-I      intronic chr8:95856441(+) A-I      intronic chr8:95874404(+) A-I      intronic chr8:95846069(+) A-I      intronic chr8:95876673(+) A-I      intronic chr8:95873671(+) A-I      intronic chr8:95857790(+) A-I      intronic chr8:95876829(+) A-I      intronic chr8:95874298(+) A-I      intronic chr8:95856496(+) A-I      intronic chr8:95873885(+) A-I      intronic chr8:95865349(+) A-I      intronic chr8:95871332(+) A-I      intronic chr8:95854038(+) A-I      intronic chr8:95846721(+) A-I      intronic chr8:95857120(+) A-I      intronic chr8:95865261(+) A-I      intronic chr8:95874310(+) A-I      intronic chr8:95881860(+) A-I      intronic chr8:95874432(+) A-I      intronic chr8:95855727(+) A-I      intronic chr8:95865419(+) A-I      intronic chr8:95876856(+) A-I      intronic chr8:95845081(+) A-I      intronic chr8:95864934(+) A-I      intronic chr8:95883485(+) A-I      intronic chr8:95874008(+) A-I      intronic chr8:95874358(+) A-I      intronic chr8:95855642(+) A-I      intronic chr8:95891778(+) A-I      intronic chr8:95854041(+) A-I      intronic chr8:95857820(+) A-I      intronic chr8:95874352(+) A-I      intronic chr8:95873028(+) A-I      intronic chr8:95869357(+) A-I      intronic chr8:95856467(+) A-I      intronic chr8:95872701(+) A-I      intronic chr8:95856367(+) A-I      intronic chr8:95839079(+) A-I      intronic chr8:95857166(+) A-I      intronic chr8:95865285(+) A-I      intronic chr8:95871312(+) A-I      intronic chr8:95876885(+) A-I      intronic chr8:95840543(+) A-I      intronic chr8:95857893(+) A-I      intronic chr8:95856432(+) A-I      intronic chr8:95846872(+) A-I      intronic chr8:95857808(+) A-I      intronic chr8:95872593(+) A-I      intronic chr8:95865378(+) A-I      intronic chr8:95859453(+) A-I      intronic chr8:95857081(+) A-I      intronic chr8:95855675(+) A-I      intronic chr8:95866429(+) A-I      intronic chr8:95882553(+) A-I      intronic chr8:95883509(+) A-I      intronic chr8:95838639(+) A-I      intronic chr8:95865358(+) A-I      intronic chr8:95855541(+) A-I      intronic chr8:95871316(+) A-I      intronic chr8:95855584(+) A-I      intronic chr8:95865290(+) A-I      intronic chr8:95855635(+) A-I      intronic chr8:95855549(+) A-I      intronic chr8:95854141(+) A-I      intronic chr8:95855806(+) A-I      intronic chr8:95876891(+) A-I      intronic chr8:95874053(+) A-I      intronic chr8:95855774(+) A-I      intronic chr8:95857243(+) A-I      intronic chr8:95837540(+) A-I      intronic chr8:95874230(+) A-I      intronic chr8:95865429(+) A-I      intronic chr8:95856528(+) A-I      intronic chr8:95856400(+) A-I      intronic chr8:95883519(+) A-I      intronic chr8:95846896(+) A-I      intronic chr8:95873665(+) A-I      intronic chr8:95860493(+) A-I      intronic chr8:95874389(+) A-I      intronic chr8:95856366(+) A-I      intronic chr8:95846056(+) A-I      intronic chr8:95860515(+) A-I      intronic chr8:95883440(+) A-I      intronic chr8:95883494(+) A-I      intronic chr8:95843307(+) A-I      intronic chr8:95855636(+) A-I      intronic chr8:95857256(+) A-I      intronic chr8:95874188(+) A-I      intronic chr8:95855777(+) A-I      intronic chr8:95855612(+) A-I      intronic chr8:95872740(+) A-I      intronic chr8:95872546(+) A-I      intronic chr8:95874286(+) A-I      intronic chr8:95882544(+) A-I      intronic chr8:95856807(+) A-I      intronic chr8:95846702(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	INTS8	chr8:95880954(+) A-I intron -    15258596 chr8:95880992(+) A-I intron -    15258596 chr8:95881016(+) A-I intron -    15258596 chr8:95846048(+) A-G intron -    22484847 chr8:95846056(+) A-G intron -    22484847 chr8:95846069(+) A-G intron -    22484847 chr8:95846828(+) A-G intron -    22484847 chr8:95853333(+) A-G intron -    22484847 chr8:95853430(+) T-C intron -    22484847 chr8:95854041(+) A-G intron -    22484847 chr8:95855540(+) A-G intron -    22484847 chr8:95855541(+) A-G intron -    22484847 chr8:95855612(+) A-G intron -    22484847 chr8:95855618(+) A-G intron -    22484847 chr8:95855629(+) A-G intron -    22484847 chr8:95855632(+) A-G intron -    22484847 chr8:95855675(+) A-G intron -    22484847 chr8:95855684(+) A-G intron -    22484847 chr8:95855727(+) A-G intron -    22484847 chr8:95855737(+) A-G intron -    22484847 chr8:95855747(+) A-G intron -    22484847 chr8:95855774(+) A-G intron -    22484847 chr8:95855777(+) A-G intron -    22484847 chr8:95856400(+) A-G intron -    22484847 chr8:95856406(+) A-G intron -    22484847 chr8:95856432(+) A-G intron -    22484847 chr8:95856710(+) A-G intron -    22484847 chr8:95856711(+) A-G intron -    22484847 chr8:95864288(+) A-G intron -    22484847 chr8:95864934(+) A-G intron -    22484847 chr8:95865261(+) A-G intron -    22484847 chr8:95865285(+) A-G intron -    22484847 chr8:95865290(+) A-G intron -    22484847 chr8:95865338(+) A-G intron -    22484847 chr8:95865349(+) A-G intron -    22484847 chr8:95865358(+) A-G intron -    22484847 chr8:95865378(+) A-G intron -    22484847 chr8:95865393(+) A-G intron -    22484847 chr8:95865419(+) A-G intron -    22484847 chr8:95865429(+) A-G intron -    22484847 chr8:95865488(+) A-G intron -    22484847 chr8:95872546(+) A-G intron -    22484847 chr8:95872687(+) A-G intron -    22484847 chr8:95873096(+) A-G intron -    22484847 chr8:95873164(+) A-G intron -    22484847 chr8:95873842(+) A-G intron -    22484847 chr8:95874230(+) A-G intron -    22484847 chr8:95874233(+) A-G intron -    22484847 chr8:95874262(+) A-G intron -    22484847 chr8:95874294(+) A-G intron -    22484847 chr8:95874295(+) A-G intron -    22484847 chr8:95874298(+) A-G intron -    22484847 chr8:95874308(+) A-G intron -    22484847 chr8:95874310(+) A-G intron -    22484847 chr8:95874432(+) A-G intron -    22484847 chr8:95880992(+) A-G intron -    22484847 chr8:95882486(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	INTS8	chr8:95835489-95835490(+) m6A CDS//intron       24981863 chr8:95835678-95835679(+) m6A 5'UTR//CDS//exon//intron       - chr8:95892449-95892450(+) m6A 3'UTR//CDS       27773535 chr8:95892494-95892495(+) m6A 3'UTR       27773535 chr8:95892512-95892513(+) m6A 3'UTR       27773535 chr8:95892576-95892577(+) m6A 3'UTR       27773535 chr8:95892589-95892590(+) m6A 3'UTR       27773535 chr8:95892607-95892608(+) m6A 3'UTR       27773535 chr8:95892623-95892624(+) m6A 3'UTR       27773535 chr8:95893787-95893788(+) m6A 3'UTR       24981863//27371828//22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ebv-miR-BART19-3p	Exosome Primary dendritic cells|T cell line (J77)     21505438
	INTS8	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Colon cancer cells     24393600 Nucleus HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART19-3p
Interactor2: INTS8

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg