Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00375608

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.8808

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART18-5p:  MIMAT0003717          EML4:  NM_019063     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART18-5p	EML4
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003717	27436
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	C2orf2//ELP120//EMAP-4//EMAPL4//ROPP120

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	EML4	chr2:42482432(+) A-I      intronic chr2:42405481(+) A-I      intronic chr2:42541563(+) A-I      intronic chr2:42481323(+) A-I      intronic chr2:42416427(+) A-I      intronic chr2:42485641(+) A-I      intronic chr2:42532139(+) A-I      intronic chr2:42508371(+) A-I      intronic chr2:42537554(+) A-I      intronic chr2:42419120(+) A-I      intronic chr2:42484720(+) A-I      intronic chr2:42450146(+) A-I      intronic chr2:42532138(+) A-I      intronic chr2:42532144(+) A-I      intronic chr2:42460050(+) A-I      intronic chr2:42521586(+) A-I      intronic chr2:42487077(+) A-I      intronic chr2:42401620(+) A-I      intronic chr2:42401631(+) A-I      intronic chr2:42426939(+) A-I      intronic chr2:42405499(+) A-I      intronic chr2:42405541(+) A-I      intronic chr2:42485682(+) A-I      intronic chr2:42402668(+) A-I      intronic chr2:42505453(+) A-I      intronic chr2:42504918(+) A-I      intronic chr2:42504813(+) A-I      intronic chr2:42504812(+) A-I      intronic chr2:42504789(+) A-I      intronic chr2:42504788(+) A-I      intronic chr2:42504741(+) A-I      intronic chr2:42504729(+) A-I      intronic chr2:42499697(+) A-I      intronic chr2:42499645(+) A-I      intronic chr2:42497543(+) A-I      intronic chr2:42497541(+) A-I      intronic chr2:42497521(+) A-I      intronic chr2:42497498(+) A-I      intronic chr2:42520334(+) A-I      intronic chr2:42497449(+) A-I      intronic chr2:42497444(+) A-I      intronic chr2:42495854(+) A-I      intronic chr2:42495798(+) A-I      intronic chr2:42495716(+) A-I      intronic chr2:42416281(+) A-I      intronic chr2:42518768(+) A-I      intronic chr2:42518685(+) A-I      intronic chr2:42517761(+) A-I      intronic chr2:42517138(+) A-I      intronic chr2:42419615(+) A-I      intronic chr2:42509735(+) A-I      intronic chr2:42419569(+) A-I      intronic chr2:42419552(+) A-I      intronic chr2:42419164(+) A-I      intronic chr2:42509673(+) A-I      intronic chr2:42419124(+) A-I      intronic chr2:42416665(+) A-I      intronic chr2:42509651(+) A-I      intronic chr2:42509634(+) A-I      intronic chr2:42508435(+) A-I      intronic chr2:42508412(+) A-I      intronic chr2:42506885(+) A-I      intronic chr2:42506727(+) A-I      intronic chr2:42462583(+) A-I      intronic chr2:42506724(+) A-I      intronic chr2:42506715(+) A-I      intronic chr2:42506691(+) A-I      intronic chr2:42506678(+) A-I      intronic chr2:42506653(+) A-I      intronic chr2:42505991(+) A-I      intronic chr2:42505961(+) A-I      intronic chr2:42505955(+) A-I      intronic chr2:42505903(+) A-I      intronic chr2:42505898(+) A-I      intronic chr2:42505873(+) A-I      intronic chr2:42505818(+) A-I      intronic chr2:42505494(+) A-I      intronic chr2:42505474(+) A-I      intronic chr2:42505458(+) A-I      intronic chr2:42536451(+) A-I      intronic chr2:42537625(+) A-I      intronic chr2:42537669(+) A-I      intronic chr2:42537675(+) A-I      intronic chr2:42537686(+) A-I      intronic chr2:42539749(+) A-I      intronic chr2:42540214(+) A-I      intronic chr2:42540218(+) A-I      intronic chr2:42424296(+) A-I      intronic chr2:42540264(+) A-I      intronic chr2:42506025(+) A-I      intronic chr2:42540922(+) A-I      intronic chr2:42540948(+) A-I      intronic chr2:42424302(+) A-I      intronic chr2:42425590(+) A-I      intronic chr2:42428980(+) A-I      intronic chr2:42493705(+) A-I      intronic chr2:42493704(+) A-I      intronic chr2:42493611(+) A-I      intronic chr2:42493564(+) A-I      intronic chr2:42487144(+) A-I      intronic chr2:42540958(+) A-I      intronic chr2:42541339(+) A-I      intronic chr2:42541343(+) A-I      intronic chr2:42542823(+) A-I      intronic chr2:42542948(+) A-I      intronic chr2:42542956(+) A-I      intronic chr2:42416216(+) A-I      intronic chr2:42416037(+) A-I      intronic chr2:42547398(+) A-I      intronic chr2:42429403(+) A-I      intronic chr2:42429442(+) A-I      intronic chr2:42436893(+) A-I      intronic chr2:42415913(+) A-I      intronic chr2:42415497(+) A-I      intronic chr2:42408538(+) A-I      intronic chr2:42408470(+) A-I      intronic chr2:42405545(+) A-I      intronic chr2:42405484(+) A-I      intronic chr2:42404718(+) A-I      intronic chr2:42404704(+) A-I      intronic chr2:42404620(+) A-I      intronic chr2:42404613(+) A-I      intronic chr2:42404601(+) A-I      intronic chr2:42404577(+) A-I      intronic chr2:42535417(+) A-I      intronic chr2:42535584(+) A-I      intronic chr2:42536351(+) A-I      intronic chr2:42487101(+) A-I      intronic chr2:42487100(+) A-I      intronic chr2:42487069(+) A-I      intronic chr2:42486999(+) A-I      intronic chr2:42486996(+) A-I      intronic chr2:42486995(+) A-I      intronic chr2:42486321(+) A-I      intronic chr2:42536406(+) A-I      intronic chr2:42486237(+) A-I      intronic chr2:42486236(+) A-I      intronic chr2:42486229(+) A-I      intronic chr2:42486226(+) A-I      intronic chr2:42486225(+) A-I      intronic chr2:42486211(+) A-I      intronic chr2:42486201(+) A-I      intronic chr2:42486200(+) A-I      intronic chr2:42486188(+) A-I      intronic chr2:42486177(+) A-I      intronic chr2:42485774(+) A-I      intronic chr2:42485729(+) A-I      intronic chr2:42484764(+) A-I      intronic chr2:42536442(+) A-I      intronic chr2:42404512(+) A-I      intronic chr2:42404037(+) A-I      intronic chr2:42403950(+) A-I      intronic chr2:42402901(+) A-I      intronic chr2:42402900(+) A-I      intronic chr2:42402773(+) A-I      intronic chr2:42437005(+) A-I      intronic chr2:42401548(+) A-I      intronic chr2:42401511(+) A-I      intronic chr2:42401500(+) A-I      intronic chr2:42437024(+) A-I      intronic chr2:42437090(+) A-I      intronic chr2:42439049(+) A-I      intronic chr2:42439085(+) A-I      intronic chr2:42439102(+) A-I      intronic chr2:42442300(+) A-I      intronic chr2:42448843(+) A-I      intronic chr2:42448844(+) A-I      intronic chr2:42454294(+) A-I      intronic chr2:42454329(+) A-I      intronic chr2:42454486(+) A-I      intronic chr2:42460515(+) A-I      intronic chr2:42460526(+) A-I      intronic chr2:42484756(+) A-I      intronic chr2:42460699(+) A-I      intronic chr2:42462063(+) A-I      intronic chr2:42462111(+) A-I      intronic chr2:42462119(+) A-I      intronic chr2:42462582(+) A-I      intronic chr2:42465636(+) A-I      intronic chr2:42465932(+) A-I      intronic chr2:42466003(+) A-I      intronic chr2:42466024(+) A-I      intronic chr2:42482245(+) A-I      intronic chr2:42482367(+) A-I      intronic chr2:42535413(+) A-I      intronic chr2:42535004(+) A-I      intronic chr2:42534887(+) A-I      intronic chr2:42533772(+) A-I      intronic chr2:42533759(+) A-I      intronic chr2:42533758(+) A-I      intronic chr2:42533689(+) A-I      intronic chr2:42533677(+) A-I      intronic chr2:42521745(+) A-I      intronic chr2:42521725(+) A-I      intronic chr2:42520915(+) A-I      intronic chr2:42520852(+) A-I      intronic chr2:42520826(+) A-I      intronic chr2:42520815(+) A-I      intronic chr2:42520775(+) A-I      intronic chr2:42520771(+) A-I      intronic chr2:42520385(+) A-I      intronic chr2:42520376(+) A-I      intronic chr2:42521580(+) A-I      intronic chr2:42506821(+) A-I      intronic chr2:42537585(+) A-I      intronic chr2:42484846(+) A-I      intronic chr2:42538559(+) A-I      intronic chr2:42506836(+) A-I      intronic chr2:42418942(+) A-I      intronic chr2:42442279(+) A-I      intronic chr2:42517215(+) A-I      intronic chr2:42497497(+) A-I      intronic chr2:42404648(+) A-I      intronic chr2:42505633(+) A-I      intronic chr2:42536501(+) A-I      intronic chr2:42506799(+) A-I      intronic chr2:42539900(+) A-I      intronic chr2:42453717(+) A-I      intronic chr2:42497571(+) A-I      intronic chr2:42538594(+) A-I      intronic chr2:42485802(+) A-I      intronic chr2:42509709(+) A-I      intronic chr2:42481476(+) A-I      intronic chr2:42521645(+) A-I      intronic chr2:42505623(+) A-I      intronic chr2:42533907(+) A-I      intronic chr2:42537766(+) A-I      intronic chr2:42415940(+) A-I      intronic chr2:42518709(+) A-I      intronic chr2:42539823(+) A-I      intronic chr2:42486375(+) A-I      intronic chr2:42482424(+) A-I      intronic chr2:42535505(+) A-I      intronic chr2:42419580(+) A-I      intronic chr2:42517006(+) A-I      intronic chr2:42405425(+) A-I      intronic chr2:42536284(+) A-I      intronic chr2:42487009(+) A-I      intronic chr2:42516974(+) A-I      intronic chr2:42419660(+) A-I      intronic chr2:42408539(+) A-I      intronic chr2:42520443(+) A-I      intronic chr2:42537635(+) A-I      intronic chr2:42408506(+) A-I      intronic chr2:42401611(+) A-I      intronic chr2:42419509(+) A-I      intronic chr2:42505571(+) A-I      intronic chr2:42521678(+) A-I      intronic chr2:42542832(+) A-I      intronic chr2:42504802(+) A-I      intronic chr2:42542835(+) A-I      intronic chr2:42486131(+) A-I      intronic chr2:42431086(+) A-I      intronic chr2:42517781(+) A-I      intronic chr2:42534858(+) A-I      intronic chr2:42536364(+) A-I      intronic chr2:42508305(+) A-I      intronic chr2:42521689(+) A-I      intronic chr2:42517751(+) A-I      intronic chr2:42485740(+) A-I      intronic chr2:42516936(+) A-I      intronic chr2:42551738(+) A-I      intronic chr2:42505872(+) A-I      intronic chr2:42509659(+) A-I      intronic chr2:42506737(+) A-I      intronic chr2:42536317(+) A-I      intronic chr2:42416586(+) A-I      intronic chr2:42486339(+) A-I      intronic chr2:42429423(+) A-I      intronic chr2:42486227(+) A-I      intronic chr2:42453677(+) A-I      intronic chr2:42540270(+) A-I      intronic chr2:42481439(+) A-I      intronic chr2:42486374(+) A-I      intronic chr2:42427195(+) A-I      intronic chr2:42541488(+) A-I      intronic chr2:42504838(+) A-I      intronic chr2:42521011(+) A-I      intronic chr2:42517096(+) A-I      intronic chr2:42404081(+) A-I      intronic chr2:42517603(+) A-I      intronic chr2:42539112(+) A-I      intronic chr2:42520281(+) A-I      intronic chr2:42424342(+) A-I      intronic chr2:42517148(+) A-I      intronic chr2:42416662(+) A-I      intronic chr2:42418951(+) A-I      intronic chr2:42520318(+) A-I      intronic chr2:42534924(+) A-I      intronic chr2:42497465(+) A-I      intronic chr2:42491478(+) A-I      intronic chr2:42538522(+) A-I      intronic chr2:42520384(+) A-I      intronic chr2:42535501(+) A-I      intronic chr2:42539758(+) A-I      intronic chr2:42416014(+) A-I      intronic chr2:42508355(+) A-I      intronic chr2:42517687(+) A-I      intronic chr2:42535030(+) A-I      intronic chr2:42534855(+) A-I      intronic chr2:42541449(+) A-I      intronic chr2:42497553(+) A-I      intronic chr2:42540996(+) A-I      intronic chr2:42419642(+) A-I      intronic chr2:42497461(+) A-I      intronic chr2:42430070(+) A-I      intronic chr2:42537611(+) A-I      intronic chr2:42508439(+) A-I      intronic chr2:42520383(+) A-I      intronic chr2:42540206(+) A-I      intronic chr2:42497569(+) A-I      intronic chr2:42517139(+) A-I      intronic chr2:42518673(+) A-I      intronic chr2:42505836(+) A-I      intronic chr2:42404612(+) A-I      intronic chr2:42431130(+) A-I      intronic chr2:42505888(+) A-I      intronic chr2:42446833(+) A-I      intronic chr2:42517788(+) A-I      intronic chr2:42551054(+) A-I      intronic chr2:42520868(+) A-I      intronic chr2:42509633(+) A-I      intronic chr2:42542759(+) A-I      intronic chr2:42486328(+) A-I      intronic chr2:42539713(+) A-I      intronic chr2:42521737(+) A-I      intronic chr2:42505451(+) A-I      intronic chr2:42508488(+) A-I      intronic chr2:42539794(+) A-I      intronic chr2:42520821(+) A-I      intronic chr2:42497523(+) A-I      intronic chr2:42535523(+) A-I      intronic chr2:42416537(+) A-I      intronic chr2:42540158(+) A-I      intronic chr2:42497557(+) A-I      intronic chr2:42539040(+) A-I      intronic chr2:42535575(+) A-I      intronic chr2:42482365(+) A-I      intronic chr2:42495840(+) A-I      intronic chr2:42486240(+) A-I      intronic chr2:42446946(+) A-I      intronic chr2:42486216(+) A-I      intronic chr2:42415863(+) A-I      intronic chr2:42537628(+) A-I      intronic chr2:42517133(+) A-I      intronic chr2:42495846(+) A-I      intronic chr2:42505593(+) A-I      intronic chr2:42538523(+) A-I      intronic chr2:42404114(+) A-I      intronic chr2:42539869(+) A-I      intronic chr2:42449015(+) A-I      intronic chr2:42534819(+) A-I      intronic chr2:42485605(+) A-I      intronic chr2:42538540(+) A-I      intronic chr2:42419028(+) A-I      intronic chr2:42542972(+) A-I      intronic chr2:42465677(+) A-I      intronic chr2:42416517(+) A-I      intronic chr2:42484721(+) A-I      intronic chr2:42472506(+) A-I      intronic chr2:42540940(+) A-I      intronic chr2:42439118(+) A-I      intronic chr2:42520323(+) A-I      intronic chr2:42537586(+) A-I      intronic chr2:42542900(+) A-I      intronic chr2:42405540(+) A-I      intronic chr2:42487113(+) A-I      intronic chr2:42486317(+) A-I      intronic chr2:42505594(+) A-I      intronic chr2:42485814(+) A-I      intronic chr2:42509747(+) A-I      intronic chr2:42536362(+) A-I      intronic chr2:42505956(+) A-I      intronic chr2:42520312(+) A-I      intronic chr2:42509801(+) A-I      intronic chr2:42505527(+) A-I      intronic chr2:42497520(+) A-I      intronic chr2:42508413(+) A-I      intronic chr2:42532243(+) A-I      intronic chr2:42497550(+) A-I      intronic chr2:42403995(+) A-I      intronic chr2:42520855(+) A-I      intronic chr2:42533750(+) A-I      intronic chr2:42485768(+) A-I      intronic chr2:42485726(+) A-I      intronic chr2:42431257(+) A-I      intronic chr2:42520348(+) A-I      intronic chr2:42419119(+) A-I      intronic chr2:42405421(+) A-I      intronic chr2:42517715(+) A-I      intronic chr2:42505500(+) A-I      intronic chr2:42404091(+) A-I      intronic chr2:42402719(+) A-I      intronic chr2:42416015(+) A-I      intronic chr2:42537604(+) A-I      intronic chr2:42521785(+) A-I      intronic chr2:42415866(+) A-I      intronic chr2:42487482(+) A-I      intronic chr2:42484898(+) A-I      intronic chr2:42509753(+) A-I      intronic chr2:42517609(+) A-I      intronic chr2:42535529(+) A-I      intronic chr2:42535387(+) A-I      intronic chr2:42498059(+) A-I      intronic chr2:42505457(+) A-I      intronic chr2:42521791(+) A-I      intronic chr2:42486362(+) A-I      intronic chr2:42405501(+) A-I      intronic chr2:42534934(+) A-I      intronic chr2:42415500(+) A-I      intronic chr2:42532323(+) A-I      intronic chr2:42505449(+) A-I      intronic chr2:42486266(+) A-I      intronic chr2:42539089(+) A-I      intronic chr2:42521023(+) A-I      intronic chr2:42405604(+) A-I      intronic chr2:42419115(+) A-I      intronic chr2:42505626(+) A-I      intronic chr2:42486132(+) A-I      intronic chr2:42402756(+) A-I      intronic chr2:42404683(+) A-I      intronic chr2:42419168(+) A-I      intronic chr2:42542937(+) A-I      intronic chr2:42485670(+) A-I      intronic chr2:42402841(+) A-I      intronic chr2:42551289(+) A-I      intronic chr2:42410236(+) A-I      intronic chr2:42504848(+) A-I      intronic chr2:42542843(+) A-I      intronic chr2:42518683(+) A-I      intronic chr2:42419029(+) A-I      intronic chr2:42406922(+) A-I      intronic chr2:42541487(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	EML4	chr2:42505449(+) A-I intron -    15258596 chr2:42505451(+) A-I intron -    15258596 chr2:42505528(+) A-I intron -    15258596 chr2:42506821(+) A-I intron -    15258596 chr2:42506836(+) A-I intron -    15258596 chr2:42506888(+) A-I intron -    15258596 chr2:42517007(+) A-I intron -    21960545 chr2:42539229(+) A-I intron -    21960545 chr2:42539284(+) A-I intron -    21960545 chr2:42539288(+) A-I intron -    21960545 chr2:42539298(+) A-I intron -    21960545 chr2:42401456(+) A-G intron -    22484847 chr2:42401531(+) A-G intron -    22484847 chr2:42401611(+) A-G intron -    22484847 chr2:42402719(+) A-G intron -    22484847 chr2:42402841(+) A-G intron -    22484847 chr2:42403957(+) A-G intron -    22484847 chr2:42403995(+) A-G intron -    22484847 chr2:42404034(+) A-G intron -    22484847 chr2:42404091(+) A-G intron -    22484847 chr2:42404114(+) A-G intron -    22484847 chr2:42404117(+) A-G intron -    22484847 chr2:42404612(+) A-G intron -    22484847 chr2:42404616(+) A-G intron -    22484847 chr2:42404648(+) A-G intron -    22484847 chr2:42404657(+) A-G intron -    22484847 chr2:42404683(+) A-G intron -    22484847 chr2:42405419(+) A-G intron -    22484847 chr2:42405421(+) A-G intron -    22484847 chr2:42405425(+) A-G intron -    22484847 chr2:42405489(+) T-C intron -    22484847 chr2:42405604(+) A-G intron -    22484847 chr2:42406922(+) A-G intron -    22484847 chr2:42408539(+) A-G intron -    22484847 chr2:42410236(+) A-G intron -    22484847 chr2:42415490(+) A-G intron -    22484847 chr2:42415500(+) A-G intron -    22484847 chr2:42415784(+) A-G intron -    22484847 chr2:42415806(+) A-G intron -    22484847 chr2:42415863(+) A-G intron -    22484847 chr2:42415866(+) A-G intron -    22484847 chr2:42415940(+) A-G intron -    22484847 chr2:42416014(+) A-G intron -    22484847 chr2:42416015(+) A-G intron -    22484847 chr2:42416586(+) A-G intron -    22484847 chr2:42416662(+) A-G intron -    22484847 chr2:42418942(+) A-G intron -    22484847 chr2:42418951(+) A-G intron -    22484847 chr2:42419022(+) A-G intron -    22484847 chr2:42419028(+) A-G intron -    22484847 chr2:42419029(+) A-G intron -    22484847 chr2:42419115(+) A-G intron -    22484847 chr2:42419119(+) A-G intron -    22484847 chr2:42419168(+) A-G intron -    22484847 chr2:42419179(+) T-C intron -    22484847 chr2:42419185(+) A-G intron -    22484847 chr2:42419509(+) A-G intron -    22484847 chr2:42419580(+) A-G intron -    22484847 chr2:42419642(+) A-G intron -    22484847 chr2:42419654(+) A-G intron -    22484847 chr2:42419660(+) A-G intron -    22484847 chr2:42431130(+) A-G intron -    22484847 chr2:42431257(+) A-G intron -    22484847 chr2:42437018(+) A-G intron -    22484847 chr2:42439086(+) A-G intron -    22484847 chr2:42446833(+) A-G intron -    22484847 chr2:42446946(+) A-G intron -    22484847 chr2:42459990(+) T-A intron -    22484847 chr2:42460629(+) A-G intron -    22484847 chr2:42472455(+) C-G intron -    22484847 chr2:42482365(+) A-G intron -    22484847 chr2:42482424(+) A-G intron -    22484847 chr2:42484721(+) A-G intron -    22484847 chr2:42484846(+) A-G intron -    22484847 chr2:42484856(+) A-G intron -    22484847 chr2:42485597(+) A-G intron -    22484847 chr2:42485605(+) A-G intron -    22484847 chr2:42485680(+) A-G intron -    22484847 chr2:42485720(+) A-G intron -    22484847 chr2:42485726(+) A-G intron -    22484847 chr2:42485740(+) A-G intron -    22484847 chr2:42485768(+) A-G intron -    22484847 chr2:42485814(+) A-G intron -    22484847 chr2:42486131(+) A-G intron -    22484847 chr2:42486132(+) A-G intron -    22484847 chr2:42486158(+) A-G intron -    22484847 chr2:42486227(+) A-G intron -    22484847 chr2:42486228(+) A-G intron -    22484847 chr2:42486240(+) A-G intron -    22484847 chr2:42486267(+) A-G intron -    22484847 chr2:42486307(+) A-G intron -    22484847 chr2:42486308(+) A-G intron -    22484847 chr2:42486328(+) A-G intron -    22484847 chr2:42486339(+) A-G intron -    22484847 chr2:42486362(+) A-G intron -    22484847 chr2:42486374(+) A-G intron -    22484847 chr2:42486375(+) A-G intron -    22484847 chr2:42486869(+) T-C intron -    22484847 chr2:42487113(+) A-G intron -    22484847 chr2:42492512(+) A-T intron -    22484847 chr2:42495840(+) A-G intron -    22484847 chr2:42495846(+) A-G intron -    22484847 chr2:42495865(+) G-A intron -    22484847 chr2:42497461(+) A-G intron -    22484847 chr2:42497465(+) A-G intron -    22484847 chr2:42497497(+) A-G intron -    22484847 chr2:42497520(+) A-G intron -    22484847 chr2:42497523(+) A-G intron -    22484847 chr2:42497553(+) A-G intron -    22484847 chr2:42497557(+) A-G intron -    22484847 chr2:42497569(+) A-G intron -    22484847 chr2:42497571(+) A-G intron -    22484847 chr2:42498059(+) A-G intron -    22484847 chr2:42504802(+) A-G intron -    22484847 chr2:42504838(+) A-G intron -    22484847 chr2:42504848(+) A-G intron -    22484847 chr2:42504892(+) A-G intron -    22484847 chr2:42504900(+) G-A intron -    22484847 chr2:42505872(+) A-G intron -    22484847 chr2:42505888(+) A-G intron -    22484847 chr2:42505956(+) A-G intron -    22484847 chr2:42506737(+) A-G intron -    22484847 chr2:42506821(+) A-G intron -    22484847 chr2:42508305(+) A-G intron -    22484847 chr2:42508439(+) A-G intron -    22484847 chr2:42509633(+) A-G intron -    22484847 chr2:42509646(+) A-G intron -    22484847 chr2:42509659(+) A-G intron -    22484847 chr2:42509709(+) A-G intron -    22484847 chr2:42512737(+) C-T intron -    22484847 chr2:42512745(+) C-T intron -    22484847 chr2:42512746(+) T-C intron -    22484847 chr2:42512975(+) A-G intron -    22484847 chr2:42517603(+) A-G intron -    22484847 chr2:42517781(+) A-G intron -    22484847 chr2:42518673(+) A-G intron -    22484847 chr2:42518766(+) A-G intron -    22484847 chr2:42520260(+) T-C intron -    22484847 chr2:42520261(+) C-T intron -    22484847 chr2:42520312(+) A-G intron -    22484847 chr2:42520348(+) A-G intron -    22484847 chr2:42520349(+) A-G intron -    22484847 chr2:42520350(+) A-G intron -    22484847 chr2:42520383(+) A-G intron -    22484847 chr2:42520384(+) A-G intron -    22484847 chr2:42520443(+) A-G intron -    22484847 chr2:42520821(+) A-G intron -    22484847 chr2:42520855(+) A-G intron -    22484847 chr2:42520856(+) A-G intron -    22484847 chr2:42520880(+) A-G intron -    22484847 chr2:42521565(+) A-G intron -    22484847 chr2:42521580(+) A-G intron -    22484847 chr2:42521581(+) A-G intron -    22484847 chr2:42521645(+) A-G intron -    22484847 chr2:42521677(+) A-G intron -    22484847 chr2:42521678(+) A-G intron -    22484847 chr2:42521689(+) A-G intron -    22484847 chr2:42521721(+) A-G intron -    22484847 chr2:42521756(+) A-G intron -    22484847 chr2:42521757(+) A-G intron -    22484847 chr2:42521785(+) A-G intron -    22484847 chr2:42532243(+) A-G intron -    22484847 chr2:42533833(+) A-G intron -    22484847 chr2:42533907(+) A-G intron -    22484847 chr2:42534855(+) A-G intron -    22484847 chr2:42534858(+) A-G intron -    22484847 chr2:42534872(+) T-C intron -    22484847 chr2:42534912(+) A-G intron -    22484847 chr2:42534924(+) A-G intron -    22484847 chr2:42535505(+) A-G intron -    22484847 chr2:42535523(+) A-G intron -    22484847 chr2:42535529(+) A-G intron -    22484847 chr2:42535575(+) A-G intron -    22484847 chr2:42535592(+) A-G intron -    22484847 chr2:42536284(+) A-G intron -    22484847 chr2:42536364(+) A-G intron -    22484847 chr2:42537585(+) A-G intron -    22484847 chr2:42537586(+) A-G intron -    22484847 chr2:42537603(+) A-G intron -    22484847 chr2:42537611(+) A-G intron -    22484847 chr2:42537627(+) A-G intron -    22484847 chr2:42537628(+) A-G intron -    22484847 chr2:42537635(+) A-G intron -    22484847 chr2:42537696(+) A-G intron -    22484847 chr2:42537766(+) A-G intron -    22484847 chr2:42538445(+) A-G intron -    22484847 chr2:42538675(+) T-C intron -    22484847 chr2:42539085(+) A-G intron -    22484847 chr2:42539713(+) A-G intron -    22484847 chr2:42539794(+) A-G intron -    22484847 chr2:42539795(+) A-G intron -    22484847 chr2:42539823(+) A-G intron -    22484847 chr2:42539833(+) A-G intron -    22484847 chr2:42539869(+) A-G intron -    22484847 chr2:42539892(+) A-G intron -    22484847 chr2:42539900(+) A-G intron -    22484847 chr2:42540262(+) A-G intron -    22484847 chr2:42540270(+) A-G intron -    22484847 chr2:42541379(+) A-G intron -    22484847 chr2:42542835(+) A-G intron -    22484847 chr2:42542843(+) A-G intron -    22484847 chr2:42542899(+) T-C intron -    22484847 chr2:42542937(+) A-G intron -    22484847 chr2:42551054(+) A-G intron -    22484847 chr2:42551391(+) T-C intron -    22484847 chr2:42551738(+) A-G intron -    22484847 chr2:42539226(+) A-G intron -    22484847 chr2:42539229(+) A-G intron -    22484847 chr2:42541592(+) A-G intron -    22484847 chr2:42541593(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	EML4	chr2:42472680-42472681(+) Am CDS//exon       - chr2:42483700-42483701(+) m6A CDS//exon       24981863 chr2:42483707-42483708(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863 chr2:42483747-42483748(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863 chr2:42488284-42488285(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535 chr2:42488293-42488294(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr2:42488395-42488396(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chr2:42488632-42488633(+) m6A exon//intron       24981863 chr2:42511832-42511833(+) Am CDS//exon       - chr2:42522619-42522620(+) m6A CDS//exon       27773535 chr2:42522648-42522649(+) m6A CDS//exon       27773535 chr2:42528399-42528400(+) m6A CDS//exon       27773535 chr2:42544645-42544646(+) Cm CDS//exon       - chr2:42556051-42556052(+) m6A CDS//exon       24284625//27773535 chr2:42556967-42556968(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085 chr2:42556989-42556990(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085 chr2:42557023-42557024(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085 chr2:42557125-42557126(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:42557174-42557175(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:42557184-42557185(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:42557207-42557208(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:42557243-42557244(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:42557318-42557319(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22608085 chr2:42557327-42557328(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22608085 chr2:42557553-42557554(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085 chr2:42557571-42557572(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085 chr2:42557636-42557637(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:42557642-42557643(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:42557666-42557667(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:42557687-42557688(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:42557704-42557705(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:42557723-42557724(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085 chr2:42557749-42557750(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr2:42557787-42557788(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr2:42557862-42557863(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr2:42558733-42558734(+) m6A 3'UTR//exon       22608085 chr2:42558804-42558805(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:42558878-42558879(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:42558888-42558889(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:42558898-42558899(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:42558966-42558967(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:42559270-42559271(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//26404942 chr2:42559356-42559357(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//26404942//27773535 chr2:42559431-42559432(+) m6A 3'UTR//exon       26404942//27773535 chr2:42559557-42559558(+) m6A 3'UTR//exon       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	EML4	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     - Exosome Blood     - Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Colon cancer cells     24393600 Nucleus HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART18-5p
Interactor2: EML4

Evidence Support:

Strong-Evidence	RT-PCR//Western blot
Support Database	VIRmiRNA

References:

PMID	25012295	Target region	3'UTR
Source	VIRmiRNA	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	BL2 cells//BJAB cells	Interactor2 expression	None
Description	BART 18-5p is one of the miRNAs that are abundantly expressed in latently infected resting memory B cells in vivo, with 300 copies per cell. Because EBV does not express any proteins in latently infected memory B cells, high levels of 18-5p expression may suggest a role for this miRNA in maintenance of viral latency. In this paper, we report on the identification of a target gene for 18-5p that implicates it in maintaining latency by suppressing viral replication.