Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | ebv-miR-BART18-5p | PAPOLA |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0003717 | 10914 |
Organism | Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | PAP//PAP-alpha |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | PAPOLA |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | PAPOLA |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | PAPOLA |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID |
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RNALocate | PAPOLA |
Interactor1: ebv-miR-BART18-5p | Interactor2: PAPOLA |
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Strong-Evidence | RT-PCR//Western blot | |
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Weak-Evidence | Microarray | |
Prediction-Evidence | miRanda//Targetscan | |
Support Database | VIRmiRNA//VmiReg |
PMID | 25012295 | Target region | 3'UTR |
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Source | VIRmiRNA//VmiReg | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | BL2 cells//BJAB cells | Interactor2 expression | None |
Description | BART 18-5p is one of the miRNAs that are abundantly expressed in latently infected resting memory B cells in vivo, with 300 copies per cell. Because EBV does not express any proteins in latently infected memory B cells, high levels of 18-5p expression may suggest a role for this miRNA in maintenance of viral latency. In this paper, we report on the identification of a target gene for 18-5p that implicates it in maintaining latency by suppressing viral replication. |