Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00374639

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.9523

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART18-5p:  MIMAT0003717          PAK2:  NM_002577     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART18-5p	PAK2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003717	5062
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	PAK65//PAKgamma

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	PAK2	chr3:196469531(+) A-I      intronic chr3:196473534(+) A-I      intronic chr3:196524254(+) A-I      intronic chr3:196545355(+) A-I      intronic chr3:196545342(+) A-I      intronic chr3:196536380(+) A-I      intronic chr3:196536372(+) A-I      intronic chr3:196536344(+) A-I      intronic chr3:196535652(+) A-I      intronic chr3:196535647(+) A-I      intronic chr3:196535555(+) A-I      intronic chr3:196535533(+) A-I      intronic chr3:196533056(+) A-I      intronic chr3:196533029(+) A-I      intronic chr3:196532919(+) A-I      intronic chr3:196532912(+) A-I      intronic chr3:196532887(+) A-I      intronic chr3:196525424(+) A-I      intronic chr3:196525308(+) A-I      intronic chr3:196525265(+) A-I      intronic chr3:196524181(+) A-I      intronic chr3:196524255(+) A-I      intronic chr3:196524266(+) A-I      intronic chr3:196524279(+) A-I      intronic chr3:196524294(+) A-I      intronic chr3:196524178(+) A-I      intronic chr3:196524169(+) A-I      intronic chr3:196524126(+) A-I      intronic chr3:196514335(+) A-I      intronic chr3:196514329(+) A-I      intronic chr3:196514285(+) A-I      intronic chr3:196513857(+) A-I      intronic chr3:196508897(+) A-I      intronic chr3:196508866(+) A-I      intronic chr3:196487836(+) A-I      intronic chr3:196469606(+) A-I      intronic chr3:196469608(+) A-I      intronic chr3:196548309(+) A-I      intronic chr3:196487947(+) A-I      intronic chr3:196490806(+) A-I      intronic chr3:196490811(+) A-I      intronic chr3:196491223(+) A-I      intronic chr3:196491272(+) A-I      intronic chr3:196508741(+) A-I      intronic chr3:196547974(+) A-I      intronic chr3:196547785(+) A-I      intronic chr3:196547762(+) A-I      intronic chr3:196546775(+) A-I      intronic chr3:196508713(+) A-I      intronic chr3:196508657(+) A-I      intronic chr3:196506789(+) A-I      intronic chr3:196506781(+) A-I      intronic chr3:196506776(+) A-I      intronic chr3:196506659(+) A-I      intronic chr3:196506642(+) A-I      intronic chr3:196502504(+) A-I      intronic chr3:196500649(+) A-I      intronic chr3:196500639(+) A-I      intronic chr3:196473493(+) A-I      intronic chr3:196545422(+) A-I      intronic chr3:196473503(+) A-I      intronic chr3:196473526(+) A-I      intronic chr3:196473531(+) A-I      intronic chr3:196552409(+) A-I      intronic chr3:196552391(+) A-I      intronic chr3:196552260(+) A-I      intronic chr3:196498719(+) A-I      intronic chr3:196498651(+) A-I      intronic chr3:196498559(+) A-I      intronic chr3:196498487(+) A-I      intronic chr3:196491339(+) A-I      intronic chr3:196498484(+) A-I      intronic chr3:196470606(+) A-I      intronic chr3:196470600(+) A-I      intronic chr3:196470598(+) A-I      intronic chr3:196470597(+) A-I      intronic chr3:196470594(+) A-I      intronic chr3:196470593(+) A-I      intronic chr3:196470591(+) A-I      intronic chr3:196470588(+) A-I      intronic chr3:196470574(+) A-I      intronic chr3:196470566(+) A-I      intronic chr3:196470559(+) A-I      intronic chr3:196470518(+) A-I      intronic chr3:196470517(+) A-I      intronic chr3:196470499(+) A-I      intronic chr3:196470470(+) A-I      intronic chr3:196497030(+) A-I      intronic chr3:196497007(+) A-I      intronic chr3:196496945(+) A-I      intronic chr3:196496858(+) A-I      intronic chr3:196496042(+) A-I      intronic chr3:196496039(+) A-I      intronic chr3:196491922(+) A-I      intronic chr3:196492123(+) A-I      intronic chr3:196492259(+) A-I      intronic chr3:196495942(+) A-I      intronic chr3:196495936(+) A-I      intronic chr3:196495825(+) A-I      intronic chr3:196495814(+) A-I      intronic chr3:196470685(+) A-I      intronic chr3:196470464(+) A-I      intronic chr3:196470463(+) A-I      intronic chr3:196469700(+) A-I      intronic chr3:196469684(+) A-I      intronic chr3:196492968(+) A-I      intronic chr3:196495503(+) A-I      intronic chr3:196495636(+) A-I      intronic chr3:196469677(+) A-I      intronic chr3:196553605(+) A-I      intronic chr3:196553593(+) A-I      intronic chr3:196553553(+) A-I      intronic chr3:196548168(+) A-I      intronic chr3:196548155(+) A-I      intronic chr3:196548147(+) A-I      intronic chr3:196548133(+) A-I      intronic chr3:196535039(+) A-I      intronic chr3:196535036(+) A-I      intronic chr3:196535028(+) A-I      intronic chr3:196534990(+) A-I      intronic chr3:196524316(+) A-I      intronic chr3:196524299(+) A-I      intronic chr3:196545423(+) A-I      intronic chr3:196545421(+) A-I      intronic chr3:196525289(+) A-I      intronic chr3:196546760(+) A-I      intronic chr3:196535601(+) A-I      intronic chr3:196535538(+) A-I      intronic chr3:196535068(+) A-I      intronic chr3:196535042(+) A-I      intronic chr3:196551642(+) A-I      intronic chr3:196551612(+) A-I      intronic chr3:196548543(+) A-I      intronic chr3:196495798(+) A-I      intronic chr3:196469574(+) A-I      intronic chr3:196469039(+) A-I      intronic chr3:196548537(+) A-I      intronic chr3:196547955(+) A-I      intronic chr3:196553806(+) A-I      intronic chr3:196553606(+) A-I      intronic chr3:196553563(+) A-I      intronic chr3:196553531(+) A-I      intronic chr3:196552997(+) A-I      intronic chr3:196552856(+) A-I      intronic chr3:196495717(+) A-I      intronic chr3:196495722(+) A-I      intronic chr3:196478743(+) A-I      intronic chr3:196552851(+) A-I      intronic chr3:196468992(+) A-I      intronic chr3:196476805(+) A-I      intronic chr3:196473587(+) A-I      intronic chr3:196473570(+) A-I      intronic chr3:196473468(+) A-I      intronic chr3:196472697(+) A-I      intronic chr3:196469673(+) A-I      intronic chr3:196472178(+) A-I      intronic chr3:196472066(+) A-I      intronic chr3:196472050(+) A-I      intronic chr3:196469667(+) A-I      intronic chr3:196548469(+) A-I      intronic chr3:196478343(+) A-I      intronic chr3:196478670(+) A-I      intronic chr3:196478714(+) A-I      intronic chr3:196478811(+) A-I      intronic chr3:196483505(+) A-I      intronic chr3:196548415(+) A-I      intronic chr3:196546823(+) A-I      intronic chr3:196535556(+) A-I      intronic chr3:196495490(+) A-I      intronic chr3:196502280(+) A-I      intronic chr3:196469712(+) A-I      intronic chr3:196497021(+) A-I      intronic chr3:196472055(+) A-I      intronic chr3:196495500(+) A-I      intronic chr3:196508898(+) A-I      intronic chr3:196492851(+) A-I      intronic chr3:196472558(+) A-I      intronic chr3:196547780(+) A-I      intronic chr3:196495943(+) A-I      intronic chr3:196473454(+) A-I      intronic chr3:196491215(+) A-I      intronic chr3:196483546(+) A-I      intronic chr3:196552832(+) A-I      intronic chr3:196500793(+) A-I      intronic chr3:196553631(+) A-I      intronic chr3:196547823(+) A-I      intronic chr3:196472103(+) A-I      intronic chr3:196479969(+) A-I      intronic chr3:196525268(+) A-I      intronic chr3:196534988(+) A-I      intronic chr3:196470477(+) A-I      intronic chr3:196553538(+) A-I      intronic chr3:196552768(+) A-I      intronic chr3:196536398(+) A-I      intronic chr3:196552991(+) A-I      intronic chr3:196546784(+) A-I      intronic chr3:196472018(+) A-I      intronic chr3:196492148(+) A-I      intronic chr3:196500598(+) A-I      intronic chr3:196535588(+) A-I      intronic chr3:196478333(+) A-I      intronic chr3:196492965(+) A-I      intronic chr3:196496577(+) A-I      intronic chr3:196544550(+) A-I      intronic chr3:196524172(+) A-I      intronic chr3:196495996(+) A-I      intronic chr3:196472475(+) A-I      intronic chr3:196525332(+) A-I      intronic chr3:196478309(+) A-I      intronic chr3:196469796(+) A-I      intronic chr3:196495666(+) A-I      intronic chr3:196495703(+) A-I      intronic chr3:196496047(+) A-I      intronic chr3:196478848(+) A-I      intronic chr3:196506671(+) A-I      intronic chr3:196535095(+) A-I      intronic chr3:196535972(+) A-I      intronic chr3:196524097(+) A-I      intronic chr3:196547946(+) A-I      intronic chr3:196469222(+) A-I      intronic chr3:196476716(+) A-I      intronic chr3:196490884(+) A-I      intronic chr3:196472494(+) A-I      intronic chr3:196552779(+) A-I      intronic chr3:196506777(+) A-I      intronic chr3:196472485(+) A-I      intronic chr3:196486598(+) A-I      intronic chr3:196469142(+) A-I      intronic chr3:196470632(+) A-I      intronic chr3:196535585(+) A-I      intronic chr3:196525425(+) A-I      intronic chr3:196478372(+) A-I      intronic chr3:196487898(+) A-I      intronic chr3:196492977(+) A-I      intronic chr3:196535926(+) A-I      intronic chr3:196552403(+) A-I      intronic chr3:196478340(+) A-I      intronic chr3:196548412(+) A-I      intronic chr3:196525237(+) A-I      intronic chr3:196477063(+) A-I      intronic chr3:196542663(+) A-I      intronic chr3:196500663(+) A-I      intronic chr3:196500588(+) A-I      intronic chr3:196491300(+) A-I      intronic chr3:196472269(+) A-I      intronic chr3:196491818(+) A-I      intronic chr3:196557939(+) A-I      3'UTR chr3:196558033(+) A-I      3'UTR chr3:196557858(+) A-I      3'UTR chr3:196535069(+) A-I      intronic chr3:196544277(+) A-I      intronic chr3:196472902(+) A-I      intronic chr3:196469089(+) A-I      intronic chr3:196548317(+) A-I      intronic chr3:196472605(+) A-I      intronic chr3:196485548(+) A-I      intronic chr3:196479527(+) A-I      intronic chr3:196476744(+) A-I      intronic chr3:196535103(+) A-I      intronic chr3:196525398(+) A-I      intronic chr3:196508857(+) A-I      intronic chr3:196478247(+) A-I      intronic chr3:196469077(+) A-I      intronic chr3:196492185(+) A-I      intronic chr3:196496016(+) A-I      intronic chr3:196535024(+) A-I      intronic chr3:196473560(+) A-I      intronic chr3:196548434(+) A-I      intronic chr3:196491277(+) A-I      intronic chr3:196495509(+) A-I      intronic chr3:196525389(+) A-I      intronic chr3:196472085(+) A-I      intronic chr3:196536381(+) A-I      intronic chr3:196491229(+) A-I      intronic chr3:196495403(+) A-I      intronic chr3:196535311(+) A-I      intronic chr3:196472950(+) A-I      intronic chr3:196478304(+) A-I      intronic chr3:196553671(+) A-I      intronic chr3:196487972(+) A-I      intronic chr3:196495702(+) A-I      intronic chr3:196500888(+) A-I      intronic chr3:196487852(+) A-I      intronic chr3:196496087(+) A-I      intronic chr3:196524074(+) A-I      intronic chr3:196506731(+) A-I      intronic chr3:196552854(+) A-I      intronic chr3:196553672(+) A-I      intronic chr3:196472905(+) A-I      intronic chr3:196552957(+) A-I      intronic chr3:196485699(+) A-I      intronic chr3:196552367(+) A-I      intronic chr3:196469536(+) A-I      intronic chr3:196470595(+) A-I      intronic chr3:196492158(+) A-I      intronic chr3:196535589(+) A-I      intronic chr3:196478391(+) A-I      intronic chr3:196525395(+) A-I      intronic chr3:196495591(+) A-I      intronic chr3:196491301(+) A-I      intronic chr3:196469060(+) A-I      intronic chr3:196529717(+) A-I      intronic chr3:196546222(+) A-I      intronic chr3:196492933(+) A-I      intronic chr3:196492088(+) A-I      intronic chr3:196502273(+) A-I      intronic chr3:196495410(+) A-I      intronic chr3:196535029(+) A-I      intronic chr3:196525483(+) A-I      intronic chr3:196472493(+) A-I      intronic chr3:196495759(+) A-I      intronic chr3:196547759(+) A-I      intronic chr3:196552253(+) A-I      intronic chr3:196495726(+) A-I      intronic chr3:196535634(+) A-I      intronic chr3:196536332(+) A-I      intronic chr3:196486572(+) A-I      intronic chr3:196552737(+) A-I      intronic chr3:196473671(+) A-I      intronic chr3:196469211(+) A-I      intronic chr3:196552975(+) A-I      intronic chr3:196534993(+) A-I      intronic chr3:196478368(+) A-I      intronic chr3:196553537(+) A-I      intronic chr3:196506600(+) A-I      intronic chr3:196495637(+) A-I      intronic chr3:196548148(+) A-I      intronic chr3:196478398(+) A-I      intronic chr3:196495737(+) A-I      intronic chr3:196500675(+) A-I      intronic chr3:196478438(+) A-I      intronic chr3:196508717(+) A-I      intronic chr3:196478313(+) A-I      intronic chr3:196495940(+) A-I      intronic chr3:196495617(+) A-I      intronic chr3:196472115(+) A-I      intronic chr3:196476932(+) A-I      intronic chr3:196469805(+) A-I      intronic chr3:196487225(+) A-I      intronic chr3:196492040(+) A-I      intronic chr3:196496531(+) A-I      intronic chr3:196540733(+) A-I      intronic chr3:196545280(+) A-I      intronic chr3:196486600(+) A-I      intronic chr3:196536354(+) A-I      intronic chr3:196544175(+) A-I      intronic chr3:196552818(+) A-I      intronic chr3:196473411(+) A-I      intronic chr3:196535027(+) A-I      intronic chr3:196548482(+) A-I      intronic chr3:196547898(+) A-I      intronic chr3:196508830(+) A-I      intronic chr3:196547766(+) A-I      intronic chr3:196535094(+) A-I      intronic chr3:196545499(+) A-I      intronic chr3:196513789(+) A-I      intronic chr3:196478473(+) A-I      intronic chr3:196495988(+) A-I      intronic chr3:196536356(+) A-I      intronic chr3:196552733(+) A-I      intronic chr3:196487935(+) A-I      intronic chr3:196470569(+) A-I      intronic chr3:196469064(+) A-I      intronic chr3:196487844(+) A-I      intronic chr3:196551574(+) A-I      intronic chr3:196535998(+) A-I      intronic chr3:196500792(+) A-I      intronic chr3:196496122(+) A-I      intronic chr3:196547894(+) A-I      intronic chr3:196534987(+) A-I      intronic chr3:196535716(+) A-I      intronic chr3:196490737(+) A-I      intronic chr3:196487978(+) A-I      intronic chr3:196547850(+) A-I      intronic chr3:196548105(+) A-I      intronic chr3:196470509(+) A-I      intronic chr3:196548123(+) A-I      intronic chr3:196535569(+) A-I      intronic chr3:196500668(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	PAK2	chr3:196486537(+) A-I intron -    15545495 chr3:196486559(+) A-I intron -    15545495 chr3:196486572(+) A-I intron -    15545495 chr3:196486598(+) A-I intron -    15545495 chr3:196486600(+) A-I intron -    15545495 chr3:196486670(+) A-I intron -    15545495 chr3:196472564(+) A-I intron -    22327324 chr3:196542224(+) A-I intron -    22327324 chr3:196553671(+) A-I intron -    22327324 chr3:196468989(+) G-T intron -    22484847 chr3:196469059(+) A-G intron -    22484847 chr3:196469064(+) A-G intron -    22484847 chr3:196469077(+) A-G intron -    22484847 chr3:196469142(+) A-G intron -    22484847 chr3:196469536(+) A-G intron -    22484847 chr3:196469641(+) A-G intron -    22484847 chr3:196469688(+) T-C intron -    22484847 chr3:196469712(+) A-G intron -    22484847 chr3:196470440(+) C-T intron -    22484847 chr3:196470444(+) T-C intron -    22484847 chr3:196472018(+) A-G intron -    22484847 chr3:196472055(+) A-G intron -    22484847 chr3:196472085(+) A-G intron -    22484847 chr3:196472086(+) A-G intron -    22484847 chr3:196472103(+) A-G intron -    22484847 chr3:196472115(+) A-G intron -    22484847 chr3:196472493(+) A-G intron -    22484847 chr3:196472494(+) A-G intron -    22484847 chr3:196472564(+) A-G intron -    22484847 chr3:196472574(+) A-G intron -    22484847 chr3:196472902(+) A-G intron -    22484847 chr3:196472905(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478247(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478304(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478309(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478313(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478333(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478340(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478341(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478368(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478372(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478391(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478397(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478398(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478407(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478438(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478473(+) A-G intron -    22484847 chr3:196478848(+) A-G intron -    22484847 chr3:196482455(+) G-A intron -    22484847 chr3:196483546(+) A-G intron -    22484847 chr3:196486385(+) T-G intron -    22484847 chr3:196487225(+) A-G intron -    22484847 chr3:196487844(+) A-G intron -    22484847 chr3:196487845(+) A-G intron -    22484847 chr3:196487852(+) A-G intron -    22484847 chr3:196487853(+) A-G intron -    22484847 chr3:196487898(+) A-G intron -    22484847 chr3:196487935(+) A-G intron -    22484847 chr3:196490799(+) A-G intron -    22484847 chr3:196490809(+) A-G intron -    22484847 chr3:196490884(+) A-G intron -    22484847 chr3:196491209(+) A-G intron -    22484847 chr3:196491215(+) A-G intron -    22484847 chr3:196491225(+) A-G intron -    22484847 chr3:196491229(+) A-G intron -    22484847 chr3:196491277(+) A-G intron -    22484847 chr3:196491300(+) A-G intron -    22484847 chr3:196491301(+) A-G intron -    22484847 chr3:196491312(+) A-G intron -    22484847 chr3:196491369(+) A-G intron -    22484847 chr3:196491370(+) A-G intron -    22484847 chr3:196491818(+) A-G intron -    22484847 chr3:196492088(+) A-G intron -    22484847 chr3:196492148(+) A-G intron -    22484847 chr3:196492158(+) A-G intron -    22484847 chr3:196492185(+) A-G intron -    22484847 chr3:196492912(+) T-C intron -    22484847 chr3:196492913(+) G-C intron -    22484847 chr3:196495403(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495410(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495500(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495591(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495617(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495631(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495637(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495666(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495702(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495703(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495737(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495765(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495929(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495940(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495943(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495988(+) A-G intron -    22484847 chr3:196495996(+) A-G intron -    22484847 chr3:196496016(+) A-G intron -    22484847 chr3:196496047(+) A-G intron -    22484847 chr3:196496048(+) A-G intron -    22484847 chr3:196496051(+) A-G intron -    22484847 chr3:196496087(+) A-G intron -    22484847 chr3:196497021(+) A-G intron -    22484847 chr3:196500565(+) A-G intron -    22484847 chr3:196500588(+) A-G intron -    22484847 chr3:196500663(+) A-G intron -    22484847 chr3:196500668(+) A-G intron -    22484847 chr3:196500675(+) A-G intron -    22484847 chr3:196500792(+) A-G intron -    22484847 chr3:196500793(+) A-G intron -    22484847 chr3:196500888(+) A-G intron -    22484847 chr3:196502280(+) A-G intron -    22484847 chr3:196506597(+) A-G intron -    22484847 chr3:196506671(+) A-G intron -    22484847 chr3:196506752(+) A-G intron -    22484847 chr3:196506777(+) A-G intron -    22484847 chr3:196508857(+) A-G intron -    22484847 chr3:196508870(+) A-G intron -    22484847 chr3:196508898(+) A-G intron -    22484847 chr3:196508901(+) T-C intron -    22484847 chr3:196513728(+) A-G intron -    22484847 chr3:196513789(+) A-G intron -    22484847 chr3:196524074(+) A-G intron -    22484847 chr3:196525237(+) A-G intron -    22484847 chr3:196525268(+) A-G intron -    22484847 chr3:196525332(+) A-G intron -    22484847 chr3:196525389(+) A-G intron -    22484847 chr3:196525395(+) A-G intron -    22484847 chr3:196525398(+) A-G intron -    22484847 chr3:196525425(+) A-G intron -    22484847 chr3:196525483(+) A-G intron -    22484847 chr3:196534987(+) A-G intron -    22484847 chr3:196534988(+) A-G intron -    22484847 chr3:196534993(+) A-G intron -    22484847 chr3:196535024(+) A-G intron -    22484847 chr3:196535027(+) A-G intron -    22484847 chr3:196535029(+) A-G intron -    22484847 chr3:196535716(+) A-G intron -    22484847 chr3:196536315(+) A-G intron -    22484847 chr3:196542060(+) G-A intron -    22484847 chr3:196544054(+) G-T intron -    22484847 chr3:196544424(+) A-G intron -    22484847 chr3:196545280(+) A-G intron -    22484847 chr3:196547734(+) A-G intron -    22484847 chr3:196547759(+) A-G intron -    22484847 chr3:196547766(+) A-G intron -    22484847 chr3:196547780(+) A-G intron -    22484847 chr3:196547804(+) A-G intron -    22484847 chr3:196547823(+) A-G intron -    22484847 chr3:196547894(+) A-G intron -    22484847 chr3:196548105(+) A-G intron -    22484847 chr3:196548148(+) A-G intron -    22484847 chr3:196548317(+) A-G intron -    22484847 chr3:196548412(+) A-G intron -    22484847 chr3:196548434(+) A-G intron -    22484847 chr3:196551574(+) A-G intron -    22484847 chr3:196552253(+) A-G intron -    22484847 chr3:196552331(+) A-G intron -    22484847 chr3:196552737(+) A-G intron -    22484847 chr3:196552779(+) A-G intron -    22484847 chr3:196552818(+) A-G intron -    22484847 chr3:196552832(+) A-G intron -    22484847 chr3:196552854(+) A-G intron -    22484847 chr3:196552991(+) A-G intron -    22484847 chr3:196553537(+) A-G intron -    22484847 chr3:196553538(+) A-G intron -    22484847 chr3:196553590(+) A-G intron -    22484847 chr3:196553671(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	PAK2	chr3:196466846-196466847(+) m6A 5'UTR       24284625//24981863 chr3:196532245-196532246(+) m6A CDS       24981863 chr3:196533464-196533465(+) m6A CDS//exon       24981863 chr3:196533512-196533513(+) m6A CDS//exon       24981863 chr3:196534835-196534836(+) m6A exon//intron       24981863 chr3:196555416-196555417(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr3:196555441-196555442(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr3:196555462-196555463(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr3:196555494-196555495(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr3:196555525-196555526(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr3:196556415-196556416(+) Cm 3'UTR       - chr3:196557221-196557222(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr3:196557286-196557287(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr3:196557334-196557335(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr3:196557351-196557352(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr3:196557397-196557398(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr3:196557549-196557550(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr3:196557607-196557608(+) m6A 3'UTR       24209618//24981863//22608085 chr3:196558402-196558403(+) Y 3'UTR       26075521 chr3:196558746-196558747(+) m6A 3'UTR       27773535 chr3:196558811-196558812(+) m6A 3'UTR       27773535 chr3:196558898-196558899(+) m6A 3'UTR       27773535 chr3:196559016-196559017(+) m6A 3'UTR       27773535 chr3:196559073-196559074(+) m6A 3'UTR       27773535 chr3:196559095-196559096(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	PAK2	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus K562 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352 Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART18-5p
Interactor2: PAK2

Evidence Support:

Strong-Evidence	RT-PCR//Western blot
Weak-Evidence	Microarray
Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Targetscan
Support Database	RepTar//VIRmiRNA//VmiReg

References:

PMID	25012295	Target region	3'UTR
Source	RepTar//VIRmiRNA//VmiReg	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	BL2 cells//BJAB cells	Interactor2 expression	None
Description	BART 18-5p is one of the miRNAs that are abundantly expressed in latently infected resting memory B cells in vivo, with 300 copies per cell. Because EBV does not express any proteins in latently infected memory B cells, high levels of 18-5p expression may suggest a role for this miRNA in maintenance of viral latency. In this paper, we report on the identification of a target gene for 18-5p that implicates it in maintaining latency by suppressing viral replication.