Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00367531

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART17-5p:           TAF2:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol ebv-miR-BART17-5p TAF2
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0003715 6873
Organism Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - CIF150//MRT40//TAF2B//TAFII150

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR TAF2
chr8:120840197(-) A-I      intronic
chr8:120767557(-) A-I      intronic
chr8:120760318(-) A-I      intronic
chr8:120749968(-) A-I      intronic
chr8:120749967(-) A-I      intronic
chr8:120745030(-) A-I      intronic
chr8:120840178(-) A-I      intronic
chr8:120839388(-) A-I      intronic
chr8:120839189(-) A-I      intronic
chr8:120839174(-) A-I      intronic
chr8:120839098(-) A-I      intronic
chr8:120838995(-) A-I      intronic
chr8:120838954(-) A-I      intronic
chr8:120838942(-) A-I      intronic
chr8:120838063(-) A-I      intronic
chr8:120838057(-) A-I      intronic
chr8:120834185(-) A-I      intronic
chr8:120834056(-) A-I      intronic
chr8:120834032(-) A-I      intronic
chr8:120827765(-) A-I      intronic
chr8:120827764(-) A-I      intronic
chr8:120827717(-) A-I      intronic
chr8:120827698(-) A-I      intronic
chr8:120827653(-) A-I      intronic
chr8:120827623(-) A-I      intronic
chr8:120827612(-) A-I      intronic
chr8:120827373(-) A-I      intronic
chr8:120827350(-) A-I      intronic
chr8:120827337(-) A-I      intronic
chr8:120827066(-) A-I      intronic
chr8:120827049(-) A-I      intronic
chr8:120827040(-) A-I      intronic
chr8:120826357(-) A-I      intronic
chr8:120818360(-) A-I      intronic
chr8:120818319(-) A-I      intronic
chr8:120818318(-) A-I      intronic
chr8:120818260(-) A-I      intronic
chr8:120818242(-) A-I      intronic
chr8:120817899(-) A-I      intronic
chr8:120817862(-) A-I      intronic
chr8:120817741(-) A-I      intronic
chr8:120817729(-) A-I      intronic
chr8:120817720(-) A-I      intronic
chr8:120815850(-) A-I      intronic
chr8:120815765(-) A-I      intronic
chr8:120815748(-) A-I      intronic
chr8:120815696(-) A-I      intronic
chr8:120839076(-) A-I      intronic
chr8:120838069(-) A-I      intronic
chr8:120838036(-) A-I      intronic
chr8:120750004(-) A-I      intronic
chr8:120749976(-) A-I      intronic
chr8:120815686(-) A-I      intronic
chr8:120815337(-) A-I      intronic
chr8:120806632(-) A-I      intronic
chr8:120806541(-) A-I      intronic
chr8:120806513(-) A-I      intronic
chr8:120806266(-) A-I      intronic
chr8:120806202(-) A-I      intronic
chr8:120806198(-) A-I      intronic
chr8:120806515(-) A-I      intronic
chr8:120806197(-) A-I      intronic
chr8:120794165(-) A-I      intronic
chr8:120794154(-) A-I      intronic
chr8:120794147(-) A-I      intronic
chr8:120794144(-) A-I      intronic
chr8:120843235(-) A-I      intronic
chr8:120794140(-) A-I      intronic
chr8:120794066(-) A-I      intronic
chr8:120794052(-) A-I      intronic
chr8:120815751(-) A-I      intronic
chr8:120806589(-) A-I      intronic
chr8:120842429(-) A-I      intronic
chr8:120842357(-) A-I      intronic
chr8:120794039(-) A-I      intronic
chr8:120806579(-) A-I      intronic
chr8:120783653(-) A-I      intronic
chr8:120783309(-) A-I      intronic
chr8:120844287(-) A-I      intronic
chr8:120843264(-) A-I      intronic
chr8:120842343(-) A-I      intronic
chr8:120842310(-) A-I      intronic
chr8:120767563(-) A-I      intronic
chr8:120842271(-) A-I      intronic
chr8:120840256(-) A-I      intronic
chr8:120749822(-) A-I      intronic
chr8:120834737(-) A-I      intronic
chr8:120840121(-) A-I      intronic
chr8:120804398(-) A-I      intronic
chr8:120838897(-) A-I      intronic
chr8:120818375(-) A-I      intronic
chr8:120826200(-) A-I      intronic
chr8:120839321(-) A-I      intronic
chr8:120749925(-) A-I      intronic
chr8:120803175(-) A-I      intronic
chr8:120840272(-) A-I      intronic
chr8:120818315(-) A-I      intronic
chr8:120818727(-) A-I      intronic
chr8:120842254(-) A-I      intronic
chr8:120818361(-) A-I      intronic
chr8:120806553(-) A-I      intronic
chr8:120840184(-) A-I      intronic
chr8:120815713(-) A-I      intronic
chr8:120834094(-) A-I      intronic
chr8:120827365(-) A-I      intronic
chr8:120815810(-) A-I      intronic
chr8:120839099(-) A-I      intronic
chr8:120744876(-) A-I      intronic
chr8:120839182(-) A-I      intronic
chr8:120834160(-) A-I      intronic
chr8:120827325(-) A-I      intronic
chr8:120840155(-) A-I      intronic
chr8:120794146(-) A-I      intronic
chr8:120826329(-) A-I      intronic
chr8:120744949(-) A-I      intronic
chr8:120806554(-) A-I      intronic
chr8:120842267(-) A-I      intronic
chr8:120839034(-) A-I      intronic
chr8:120840086(-) A-I      intronic
chr8:120839382(-) A-I      intronic
chr8:120834186(-) A-I      intronic
chr8:120839333(-) A-I      intronic
chr8:120804462(-) A-I      intronic
chr8:120783718(-) A-I      intronic
chr8:120783114(-) A-I      intronic
chr8:120834026(-) A-I      intronic
chr8:120804496(-) A-I      intronic
chr8:120806329(-) A-I      intronic
chr8:120818317(-) A-I      intronic
chr8:120839277(-) A-I      intronic
chr8:120806265(-) A-I      intronic
chr8:120838927(-) A-I      intronic
chr8:120802473(-) A-I      intronic
chr8:120834731(-) A-I      intronic
chr8:120839260(-) A-I      intronic
chr8:120793798(-) A-I      intronic
chr8:120838968(-) A-I      intronic
chr8:120806328(-) A-I      intronic
chr8:120815898(-) A-I      intronic
chr8:120806270(-) A-I      intronic
chr8:120803313(-) A-I      intronic
chr8:120803316(-) A-I      intronic
chr8:120817783(-) A-I      intronic
chr8:120834189(-) A-I      intronic
chr8:120834564(-) A-I      intronic
chr8:120819979(-) A-I      intronic
chr8:120818980(-) A-I      intronic
chr8:120839231(-) A-I      intronic
chr8:120826899(-) A-I      intronic
chr8:120839377(-) A-I      intronic
chr8:120827025(-) A-I      intronic
chr8:120749860(-) A-I      intronic
chr8:120818321(-) A-I      intronic
chr8:120817830(-) A-I      intronic
chr8:120794194(-) A-I      intronic
chr8:120815849(-) A-I      intronic
chr8:120794174(-) A-I      intronic
chr8:120843183(-) A-I      intronic
chr8:120827446(-) A-I      intronic
chr8:120803314(-) A-I      intronic
chr8:120818805(-) A-I      intronic
chr8:120749931(-) A-I      intronic
chr8:120803129(-) A-I      intronic
chr8:120834204(-) A-I      intronic
chr8:120815674(-) A-I      intronic
chr8:120839286(-) A-I      intronic
chr8:120817868(-) A-I      intronic
chr8:120826112(-) A-I      intronic
chr8:120806303(-) A-I      intronic
chr8:120834696(-) A-I      intronic
chr8:120834601(-) A-I      intronic
chr8:120839176(-) A-I      intronic
chr8:120843238(-) A-I      intronic
chr8:120827037(-) A-I      intronic
chr8:120834219(-) A-I      intronic
chr8:120826173(-) A-I      intronic
chr8:120803327(-) A-I      intronic
chr8:120750015(-) A-I      intronic
chr8:120815875(-) A-I      intronic
chr8:120815683(-) A-I      intronic
chr8:120818813(-) A-I      intronic
chr8:120843341(-) A-I      intronic
chr8:120802618(-) A-I      intronic
chr8:120752843(-) A-I      intronic
chr8:120827237(-) A-I      intronic
chr8:120838903(-) A-I      intronic
chr8:120815808(-) A-I      intronic
chr8:120750021(-) A-I      intronic
chr8:120806573(-) A-I      intronic
chr8:120827359(-) A-I      intronic
chr8:120818940(-) A-I      intronic
chr8:120760207(-) A-I      intronic
chr8:120839026(-) A-I      intronic
chr8:120819981(-) A-I      intronic
chr8:120827751(-) A-I      intronic
chr8:120806325(-) A-I      intronic
chr8:120793812(-) A-I      intronic
chr8:120838969(-) A-I      intronic
chr8:120818981(-) A-I      intronic
chr8:120752810(-) A-I      intronic
chr8:120827356(-) A-I      intronic
chr8:120818324(-) A-I      intronic
chr8:120806260(-) A-I      intronic
chr8:120783145(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED TAF2
chr8:120826111(-) A-I intron -    21960545
chr8:120826173(-) A-I intron -    21960545
chr8:120826269(-) A-I intron -    21960545
chr8:120744949(-) A-G intron -    22484847
chr8:120745025(-) A-G intron -    22484847
chr8:120749767(-) C-A intron -    22484847
chr8:120782267(-) C-T intron -    22484847
chr8:120783063(-) A-G intron -    22484847
chr8:120783114(-) A-G intron -    22484847
chr8:120783613(-) A-G intron -    22484847
chr8:120783614(-) A-G intron -    22484847
chr8:120783694(-) A-G intron -    22484847
chr8:120783697(-) A-G intron -    22484847
chr8:120783718(-) A-G intron -    22484847
chr8:120793798(-) A-G intron -    22484847
chr8:120793812(-) A-G intron -    22484847
chr8:120794146(-) A-G intron -    22484847
chr8:120794194(-) A-G intron -    22484847
chr8:120803316(-) A-G intron -    22484847
chr8:120804398(-) A-G intron -    22484847
chr8:120804462(-) A-G intron -    22484847
chr8:120804573(-) C-T intron -    22484847
chr8:120806199(-) A-G intron -    22484847
chr8:120806204(-) A-G intron -    22484847
chr8:120806241(-) A-G intron -    22484847
chr8:120806252(-) A-G intron -    22484847
chr8:120806260(-) A-G intron -    22484847
chr8:120806265(-) A-G intron -    22484847
chr8:120806270(-) A-G intron -    22484847
chr8:120806313(-) A-G intron -    22484847
chr8:120806321(-) A-G intron -    22484847
chr8:120806325(-) A-G intron -    22484847
chr8:120806328(-) A-G intron -    22484847
chr8:120806329(-) A-G intron -    22484847
chr8:120806554(-) A-G intron -    22484847
chr8:120806573(-) A-G intron -    22484847
chr8:120806622(-) A-G intron -    22484847
chr8:120815808(-) A-G intron -    22484847
chr8:120815810(-) A-G intron -    22484847
chr8:120815849(-) A-G intron -    22484847
chr8:120815875(-) A-G intron -    22484847
chr8:120817780(-) A-G intron -    22484847
chr8:120817868(-) A-G intron -    22484847
chr8:120818237(-) A-G intron -    22484847
chr8:120818324(-) A-G intron -    22484847
chr8:120818330(-) A-G intron -    22484847
chr8:120818361(-) A-G intron -    22484847
chr8:120818375(-) A-G intron -    22484847
chr8:120826112(-) A-G intron -    22484847
chr8:120826269(-) A-G intron -    22484847
chr8:120826899(-) A-G intron -    22484847
chr8:120826977(-) G-T intron -    22484847
chr8:120827027(-) A-G intron -    22484847
chr8:120827149(-) A-T intron -    22484847
chr8:120827237(-) A-G intron -    22484847
chr8:120827325(-) A-G intron -    22484847
chr8:120827356(-) A-G intron -    22484847
chr8:120827359(-) A-G intron -    22484847
chr8:120827365(-) A-G intron -    22484847
chr8:120827446(-) A-G intron -    22484847
chr8:120834189(-) A-G intron -    22484847
chr8:120834601(-) A-G intron -    22484847
chr8:120838858(-) A-G intron -    22484847
chr8:120838897(-) A-G intron -    22484847
chr8:120838903(-) A-G intron -    22484847
chr8:120838927(-) A-G intron -    22484847
chr8:120838968(-) A-G intron -    22484847
chr8:120838969(-) A-G intron -    22484847
chr8:120839182(-) A-G intron -    22484847
chr8:120839231(-) A-G intron -    22484847
chr8:120839251(-) A-G intron -    22484847
chr8:120839260(-) A-G intron -    22484847
chr8:120839286(-) A-G intron -    22484847
chr8:120839382(-) A-G intron -    22484847
chr8:120840121(-) A-G intron -    22484847
chr8:120840184(-) A-G intron -    22484847
chr8:120840272(-) A-G intron -    22484847
chr8:120840336(-) A-G intron -    22484847
chr8:120842411(-) A-G intron -    22484847
chr8:120843238(-) A-G intron -    22484847
chr8:120843341(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase TAF2
chr8:120743908-120743909(-) m6A 3'UTR       27773535
chr8:120743925-120743926(-) m6A 3'UTR       27773535
chr8:120743954-120743955(-) m6A 3'UTR       27773535
chr8:120744147-120744148(-) m6A 3'UTR       24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr8:120744155-120744156(-) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr8:120744167-120744168(-) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr8:120744233-120744234(-) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085
chr8:120744265-120744266(-) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085
chr8:120744277-120744278(-) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085
chr8:120744288-120744289(-) m1A CDS       26863196
chr8:120744337-120744338(-) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085
chr8:120744418-120744419(-) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535
chr8:120754776-120754777(-) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535
chr8:120754792-120754793(-) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535
chr8:120754810-120754811(-) m6A CDS//exon       27773535
chr8:120756553-120756554(-) m6A CDS//exon       -
chr8:120800609-120800610(-) m6A CDS       24981863
chr8:120800619-120800620(-) m6A CDS       24981863
chr8:120800684-120800685(-) m6A CDS       24981863
chr8:120801043-120801044(-) m6A CDS       24981863
chr8:120801060-120801061(-) m6A CDS       24981863
chr8:120844754-120844755(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//22608085
chr8:120844769-120844770(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//22608085
chr8:120844811-120844812(-) m6A 5'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chr8:120844863-120844864(-) m6A 5'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085
chr8:120844897-120844898(-) m6A 5'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085
chr8:120845069-120845070(-) m6A 5'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate TAF2
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus Colon cancer cells     24393600
Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: ebv-miR-BART17-5p
Interactor2: TAF2

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//PITA
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...