Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00366908

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART17-5p:  MIMAT0003715          ITPR3:  NM_002224     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART17-5p	ITPR3
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003715	3710
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	IP3R//IP3R3

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	ITPR3	chr6:33612520(+) A-I      intronic chr6:33612462(+) A-I      intronic chr6:33611873(+) A-I      intronic chr6:33611869(+) A-I      intronic chr6:33611863(+) A-I      intronic chr6:33615882(+) A-I      intronic chr6:33611758(+) A-I      intronic chr6:33612497(+) A-I      intronic chr6:33612505(+) A-I      intronic chr6:33612515(+) A-I      intronic chr6:33612553(+) A-I      intronic chr6:33612575(+) A-I      intronic chr6:33613066(+) A-I      intronic chr6:33615955(+) A-I      intronic chr6:33615972(+) A-I      intronic chr6:33611820(+) A-I      intronic chr6:33607116(+) A-I      intronic chr6:33597838(+) A-I      intronic chr6:33597770(+) A-I      intronic chr6:33597764(+) A-I      intronic chr6:33597757(+) A-I      intronic chr6:33611744(+) A-I      intronic chr6:33611752(+) A-I      intronic chr6:33611771(+) A-I      intronic chr6:33611809(+) A-I      intronic chr6:33611811(+) A-I      intronic chr6:33614968(+) A-I      intronic chr6:33621835(+) A-I      intronic chr6:33621880(+) A-I      intronic chr6:33621884(+) A-I      intronic chr6:33621886(+) A-I      intronic chr6:33621902(+) A-I      intronic chr6:33616103(+) A-I      intronic chr6:33615982(+) A-I      intronic chr6:33615068(+) A-I      intronic chr6:33615033(+) A-I      intronic chr6:33614972(+) A-I      intronic chr6:33614881(+) A-I      intronic chr6:33614563(+) A-I      intronic chr6:33614541(+) A-I      intronic chr6:33614417(+) A-I      intronic chr6:33613874(+) A-I      intronic chr6:33613824(+) A-I      intronic chr6:33613798(+) A-I      intronic chr6:33616495(+) A-I      intronic chr6:33616496(+) A-I      intronic chr6:33616499(+) A-I      intronic chr6:33616508(+) A-I      intronic chr6:33620784(+) A-I      intronic chr6:33620785(+) A-I      intronic chr6:33620811(+) A-I      intronic chr6:33620895(+) A-I      intronic chr6:33620937(+) A-I      intronic chr6:33621166(+) A-I      intronic chr6:33621869(+) A-I      intronic chr6:33621883(+) A-I      intronic chr6:33621893(+) A-I      intronic chr6:33621894(+) A-I      intronic chr6:33621934(+) A-I      intronic chr6:33621951(+) A-I      intronic chr6:33621965(+) A-I      intronic chr6:33621997(+) A-I      intronic chr6:33622005(+) A-I      intronic chr6:33622010(+) A-I      intronic chr6:33622015(+) A-I      intronic chr6:33643092(+) A-I      intronic chr6:33643102(+) A-I      intronic chr6:33613795(+) A-I      intronic chr6:33613781(+) A-I      intronic chr6:33613780(+) A-I      intronic chr6:33613732(+) A-I      intronic chr6:33613679(+) A-I      intronic chr6:33613031(+) A-I      intronic chr6:33613017(+) A-I      intronic chr6:33613013(+) A-I      intronic chr6:33613004(+) A-I      intronic chr6:33613000(+) A-I      intronic chr6:33612890(+) A-I      intronic chr6:33612881(+) A-I      intronic chr6:33612558(+) A-I      intronic chr6:33597160(+) A-I      intronic chr6:33612946(+) A-I      intronic chr6:33611828(+) A-I      intronic chr6:33593770(+) A-I      intronic chr6:33612566(+) A-I      intronic chr6:33621861(+) A-I      intronic chr6:33614573(+) A-I      intronic chr6:33620343(+) A-I      intronic chr6:33614544(+) A-I      intronic chr6:33613754(+) A-I      intronic chr6:33611938(+) A-I      intronic chr6:33614983(+) A-I      intronic chr6:33620789(+) A-I      intronic chr6:33612675(+) A-I      intronic chr6:33614611(+) A-I      intronic chr6:33612715(+) A-I      intronic chr6:33614622(+) A-I      intronic chr6:33597441(+) A-I      intronic chr6:33613812(+) A-I      intronic chr6:33614628(+) A-I      intronic chr6:33597362(+) A-I      intronic chr6:33615041(+) A-I      intronic chr6:33612717(+) A-I      intronic chr6:33614543(+) A-I      intronic chr6:33612109(+) A-I      intronic chr6:33611896(+) A-I      intronic chr6:33612703(+) A-I      intronic chr6:33593763(+) A-I      intronic chr6:33614981(+) A-I      intronic chr6:33614583(+) A-I      intronic chr6:33613875(+) A-I      intronic chr6:33621076(+) A-I      intronic chr6:33593280(+) A-I      intronic chr6:33614995(+) A-I      intronic chr6:33614665(+) A-I      intronic chr6:33620342(+) A-I      intronic chr6:33614439(+) A-I      intronic chr6:33621813(+) A-I      intronic chr6:33620814(+) A-I      intronic chr6:33613881(+) A-I      intronic chr6:33621106(+) A-I      intronic chr6:33615055(+) A-I      intronic chr6:33614592(+) A-I      intronic chr6:33614927(+) A-I      intronic chr6:33614614(+) A-I      intronic chr6:33612852(+) A-I      intronic chr6:33621849(+) A-I      intronic chr6:33613012(+) A-I      intronic chr6:33612580(+) A-I      intronic chr6:33614937(+) A-I      intronic chr6:33612615(+) A-I      intronic chr6:33616600(+) A-I      intronic chr6:33614987(+) A-I      intronic chr6:33612932(+) A-I      intronic chr6:33611856(+) A-I      intronic chr6:33620360(+) A-I      intronic chr6:33621825(+) A-I      intronic chr6:33612958(+) A-I      intronic chr6:33614565(+) A-I      intronic chr6:33612877(+) A-I      intronic chr6:33616111(+) A-I      intronic chr6:33615936(+) A-I      intronic chr6:33620452(+) A-I      intronic chr6:33614466(+) A-I      intronic chr6:33614542(+) A-I      intronic chr6:33612955(+) A-I      intronic chr6:33620372(+) A-I      intronic chr6:33612854(+) A-I      intronic chr6:33612953(+) A-I      intronic chr6:33611846(+) A-I      intronic chr6:33611932(+) A-I      intronic chr6:33616636(+) A-I      intronic chr6:33620293(+) A-I      intronic chr6:33611893(+) A-I      intronic chr6:33614822(+) A-I      intronic chr6:33613887(+) A-I      intronic chr6:33612504(+) A-I      intronic chr6:33612959(+) A-I      intronic chr6:33622033(+) A-I      intronic chr6:33621995(+) A-I      intronic chr6:33615866(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	ITPR3	chr6:33648330(+) A-G exon CDS    21725310 chr6:33611828(+) A-G intron -    22484847 chr6:33611846(+) A-G intron -    22484847 chr6:33611856(+) A-G intron -    22484847 chr6:33611864(+) A-G intron -    22484847 chr6:33611893(+) A-G intron -    22484847 chr6:33611938(+) A-G intron -    22484847 chr6:33612566(+) A-G intron -    22484847 chr6:33612580(+) A-G intron -    22484847 chr6:33612615(+) A-G intron -    22484847 chr6:33612675(+) A-G intron -    22484847 chr6:33612852(+) A-G intron -    22484847 chr6:33612854(+) A-G intron -    22484847 chr6:33612877(+) A-G intron -    22484847 chr6:33612958(+) A-G intron -    22484847 chr6:33612959(+) A-G intron -    22484847 chr6:33613012(+) A-G intron -    22484847 chr6:33613684(+) A-G intron -    22484847 chr6:33613754(+) A-G intron -    22484847 chr6:33613789(+) A-G intron -    22484847 chr6:33613804(+) A-G intron -    22484847 chr6:33613812(+) A-G intron -    22484847 chr6:33613875(+) A-G intron -    22484847 chr6:33614547(+) A-G intron -    22484847 chr6:33614622(+) A-G intron -    22484847 chr6:33614628(+) A-G intron -    22484847 chr6:33614981(+) A-G intron -    22484847 chr6:33614983(+) A-G intron -    22484847 chr6:33614987(+) A-G intron -    22484847 chr6:33615936(+) A-G intron -    22484847 chr6:33620293(+) A-G intron -    22484847 chr6:33620307(+) A-G intron -    22484847 chr6:33620342(+) A-G intron -    22484847 chr6:33620343(+) A-G intron -    22484847 chr6:33620360(+) A-G intron -    22484847 chr6:33620452(+) A-G intron -    22484847 chr6:33621106(+) A-G intron -    22484847 chr6:33621813(+) A-G intron -    22484847 chr6:33629494(+) G-A intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	ITPR3	chr6:33588447-33588448(+) m6A 5'UTR       25456834 chr6:33589192-33589193(+) m6A 5'UTR       22575960 chr6:33608301-33608302(+) m6A CDS       - chr6:33608307-33608308(+) m6A CDS       - chr6:33623569-33623570(+) m6A CDS       24981863//22575960 chr6:33623610-33623611(+) m6A CDS       24284625//24981863//22575960 chr6:33623620-33623621(+) m6A CDS       24284625//24981863//22575960 chr6:33625748-33625749(+) m6A CDS       24284625//24981863//22575960 chr6:33626483-33626484(+) m6A CDS       22575960 chr6:33626600-33626601(+) m6A CDS       22575960 chr6:33626810-33626811(+) m6A CDS       22575960 chr6:33627255-33627256(+) m6A CDS       22575960 chr6:33631617-33631618(+) m6A CDS       22575960 chr6:33631637-33631638(+) m6A CDS       22575960 chr6:33632648-33632649(+) m6A CDS       22575960 chr6:33632854-33632855(+) m6A CDS       22575960 chr6:33632902-33632903(+) m6A CDS       22575960 chr6:33632908-33632909(+) m6A CDS       22575960 chr6:33635632-33635633(+) m6A CDS       22575960 chr6:33635691-33635692(+) m6A CDS       22575960 chr6:33635703-33635704(+) m6A CDS       22575960 chr6:33635728-33635729(+) m6A CDS       22575960 chr6:33636299-33636300(+) m6A CDS       22575960 chr6:33636377-33636378(+) m6A CDS       - chr6:33636386-33636387(+) m6A CDS       - chr6:33636406-33636407(+) m6A CDS       - chr6:33636832-33636833(+) m6A CDS       - chr6:33638184-33638185(+) m6A CDS       24284625//22575960 chr6:33638271-33638272(+) m6A CDS       24284625//22575960 chr6:33638321-33638322(+) m6A CDS       24284625//22575960 chr6:33638488-33638489(+) m6A CDS       22575960 chr6:33638521-33638522(+) m6A CDS       22575960 chr6:33638575-33638576(+) m6A CDS       22575960 chr6:33644578-33644579(+) m6A CDS       24284625//24209618//22575960 chr6:33644605-33644606(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr6:33644616-33644617(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr6:33644647-33644648(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr6:33644698-33644699(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr6:33644846-33644847(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr6:33645296-33645297(+) m6A CDS       24209618//22575960 chr6:33645353-33645354(+) m6A CDS       22575960 chr6:33645380-33645381(+) m6A CDS       22575960 chr6:33646264-33646265(+) m6A CDS       22575960 chr6:33646292-33646293(+) m6A CDS       22575960 chr6:33646430-33646431(+) m6A CDS       22575960 chr6:33646452-33646453(+) m6A CDS       22575960 chr6:33646545-33646546(+) m6A CDS       22575960 chr6:33653225-33653226(+) m6A CDS       - chr6:33653280-33653281(+) m6A CDS       22575960 chr6:33655048-33655049(+) m6A CDS       - chr6:33655271-33655272(+) m6A CDS       - chr6:33655903-33655904(+) m6A CDS       - chr6:33655935-33655936(+) Cm CDS       - chr6:33659433-33659434(+) m6A CDS       24284625//25456834//22575960//22608085 chr6:33659448-33659449(+) m6A CDS       24284625//25456834//22575960//22608085 chr6:33659457-33659458(+) m6A CDS       24284625//25456834//22575960//22608085 chr6:33659580-33659581(+) m6A CDS       24284625//25456834//22575960 chr6:33659592-33659593(+) m6A CDS       24284625//25456834//22575960 chr6:33659646-33659647(+) m6A CDS       24284625 chr6:33663540-33663541(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863 chr6:33663601-33663602(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr6:33663617-33663618(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr6:33663683-33663684(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr6:33663765-33663766(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr6:33663783-33663784(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr6:33663830-33663831(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//26404942//22575960//22608085 chr6:33664080-33664081(+) m6A 3'UTR       27773536 chr6:33664161-33664162(+) m6A 3'UTR       27773536 chr6:33664298-33664299(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ITPR3	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Colon cancer cells     24393600 Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART17-5p
Interactor2: ITPR3

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA
Support Database	VmiReg