Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00366874

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.8935

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART17-5p:  MIMAT0003715          IKBKB:  NR_040009     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART17-5p	IKBKB
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003715	3551
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	IKK-beta//IKK2//IKKB//IMD15//IMD15A//IMD15B//NFKBIKB

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	IKBKB	chr8:42168982(+) A-I      intronic chr8:42130379(+) A-I      intronic chr8:42145870(+) A-I      intronic chr8:42145846(+) A-I      intronic chr8:42183077(+) A-I      intronic chr8:42183060(+) A-I      intronic chr8:42183050(+) A-I      intronic chr8:42183038(+) A-I      intronic chr8:42181949(+) A-I      intronic chr8:42181940(+) A-I      intronic chr8:42181833(+) A-I      intronic chr8:42180295(+) A-I      intronic chr8:42130364(+) A-I      intronic chr8:42130314(+) A-I      intronic chr8:42130196(+) A-I      intronic chr8:42142414(+) A-I      intronic chr8:42153892(+) A-I      intronic chr8:42183019(+) A-I      intronic chr8:42130386(+) A-I      intronic chr8:42184969(+) A-I      intronic chr8:42185058(+) A-I      intronic chr8:42132888(+) A-I      intronic chr8:42136392(+) A-I      intronic chr8:42130715(+) A-I      intronic chr8:42136369(+) A-I      intronic chr8:42136365(+) A-I      intronic chr8:42136351(+) A-I      intronic chr8:42130680(+) A-I      intronic chr8:42136348(+) A-I      intronic chr8:42136336(+) A-I      intronic chr8:42136327(+) A-I      intronic chr8:42136267(+) A-I      intronic chr8:42133588(+) A-I      intronic chr8:42133559(+) A-I      intronic chr8:42133463(+) A-I      intronic chr8:42133440(+) A-I      intronic chr8:42132955(+) A-I      intronic chr8:42172195(+) A-I      intronic chr8:42132847(+) A-I      intronic chr8:42130759(+) A-I      intronic chr8:42130813(+) A-I      intronic chr8:42131838(+) A-I      intronic chr8:42131347(+) A-I      intronic chr8:42131653(+) A-I      intronic chr8:42131666(+) A-I      intronic chr8:42133506(+) A-I      intronic chr8:42137532(+) A-I      intronic chr8:42137533(+) A-I      intronic chr8:42137541(+) A-I      intronic chr8:42183094(+) A-I      intronic chr8:42173275(+) A-I      intronic chr8:42172288(+) A-I      intronic chr8:42172263(+) A-I      intronic chr8:42172225(+) A-I      intronic chr8:42172214(+) A-I      intronic chr8:42131678(+) A-I      intronic chr8:42131685(+) A-I      intronic chr8:42142899(+) A-I      intronic chr8:42131745(+) A-I      intronic chr8:42142938(+) A-I      intronic chr8:42131782(+) A-I      intronic chr8:42168917(+) A-I      intronic chr8:42172046(+) A-I      intronic chr8:42172037(+) A-I      intronic chr8:42172031(+) A-I      intronic chr8:42168959(+) A-I      intronic chr8:42170818(+) A-I      intronic chr8:42184945(+) A-I      intronic chr8:42183103(+) A-I      intronic chr8:42168968(+) A-I      intronic chr8:42168983(+) A-I      intronic chr8:42169004(+) A-I      intronic chr8:42169534(+) A-I      intronic chr8:42169580(+) A-I      intronic chr8:42169586(+) A-I      intronic chr8:42137556(+) A-I      intronic chr8:42169603(+) A-I      intronic chr8:42169665(+) A-I      intronic chr8:42145826(+) A-I      intronic chr8:42170811(+) A-I      intronic chr8:42170783(+) A-I      intronic chr8:42170768(+) A-I      intronic chr8:42145813(+) A-I      intronic chr8:42145762(+) A-I      intronic chr8:42142955(+) A-I      intronic chr8:42139862(+) A-I      intronic chr8:42136298(+) A-I      intronic chr8:42130383(+) A-I      intronic chr8:42168847(+) A-I      intronic chr8:42168826(+) A-I      intronic chr8:42158609(+) A-I      intronic chr8:42158490(+) A-I      intronic chr8:42158452(+) A-I      intronic chr8:42153204(+) A-I      intronic chr8:42153087(+) A-I      intronic chr8:42153081(+) A-I      intronic chr8:42152803(+) A-I      intronic chr8:42152789(+) A-I      intronic chr8:42152658(+) A-I      intronic chr8:42148799(+) A-I      intronic chr8:42146595(+) A-I      intronic chr8:42146574(+) A-I      intronic chr8:42146568(+) A-I      intronic chr8:42146462(+) A-I      intronic chr8:42146435(+) A-I      intronic chr8:42146416(+) A-I      intronic chr8:42146390(+) A-I      intronic chr8:42146377(+) A-I      intronic chr8:42145865(+) A-I      intronic chr8:42145754(+) A-I      intronic chr8:42145729(+) A-I      intronic chr8:42145719(+) A-I      intronic chr8:42145664(+) A-I      intronic chr8:42144154(+) A-I      intronic chr8:42142982(+) A-I      intronic chr8:42142960(+) A-I      intronic chr8:42142954(+) A-I      intronic chr8:42142916(+) A-I      intronic chr8:42142634(+) A-I      intronic chr8:42142574(+) A-I      intronic chr8:42142492(+) A-I      intronic chr8:42133495(+) A-I      intronic chr8:42142400(+) A-I      intronic chr8:42142396(+) A-I      intronic chr8:42142394(+) A-I      intronic chr8:42141992(+) A-I      intronic chr8:42141989(+) A-I      intronic chr8:42141943(+) A-I      intronic chr8:42141934(+) A-I      intronic chr8:42141928(+) A-I      intronic chr8:42139866(+) A-I      intronic chr8:42139857(+) A-I      intronic chr8:42139724(+) A-I      intronic chr8:42136397(+) A-I      intronic chr8:42182946(+) A-I      intronic chr8:42152899(+) A-I      intronic chr8:42158610(+) A-I      intronic chr8:42146363(+) A-I      intronic chr8:42145790(+) A-I      intronic chr8:42132190(+) A-I      intronic chr8:42146587(+) A-I      intronic chr8:42148829(+) A-I      intronic chr8:42131752(+) A-I      intronic chr8:42172128(+) A-I      intronic chr8:42145839(+) A-I      intronic chr8:42131109(+) A-I      intronic chr8:42146639(+) A-I      intronic chr8:42141846(+) A-I      intronic chr8:42145695(+) A-I      intronic chr8:42142865(+) A-I      intronic chr8:42145798(+) A-I      intronic chr8:42181900(+) A-I      intronic chr8:42137628(+) A-I      intronic chr8:42137470(+) A-I      intronic chr8:42181883(+) A-I      intronic chr8:42132872(+) A-I      intronic chr8:42139793(+) A-I      intronic chr8:42170737(+) A-I      intronic chr8:42132871(+) A-I      intronic chr8:42142838(+) A-I      intronic chr8:42170848(+) A-I      intronic chr8:42130739(+) A-I      intronic chr8:42158577(+) A-I      intronic chr8:42153078(+) A-I      intronic chr8:42161123(+) A-I      intronic chr8:42158564(+) A-I      intronic chr8:42131822(+) A-I      intronic chr8:42142808(+) A-I      intronic chr8:42134299(+) A-I      intronic chr8:42139925(+) A-I      intronic chr8:42183035(+) A-I      intronic chr8:42142504(+) A-I      intronic chr8:42133477(+) A-I      intronic chr8:42169431(+) A-I      intronic chr8:42143052(+) A-I      intronic chr8:42139814(+) A-I      intronic chr8:42146446(+) A-I      intronic chr8:42131185(+) A-I      intronic chr8:42167001(+) A-I      Syn:Thr->Thr chr8:42133460(+) A-I      intronic chr8:42131768(+) A-I      intronic chr8:42172226(+) A-I      intronic chr8:42153072(+) A-I      intronic chr8:42145745(+) A-I      intronic chr8:42167044(+) A-I      NonSyn:Arg->Gly chr8:42141985(+) A-I      intronic chr8:42181912(+) A-I      intronic chr8:42131187(+) A-I      intronic chr8:42134963(+) A-I      intronic chr8:42136394(+) A-I      intronic chr8:42179179(+) A-I      intronic chr8:42130127(+) A-I      intronic chr8:42173274(+) A-I      intronic chr8:42139732(+) A-I      intronic chr8:42141881(+) A-I      intronic chr8:42145784(+) A-I      intronic chr8:42181968(+) A-I      intronic chr8:42131824(+) A-I      intronic chr8:42141889(+) A-I      intronic chr8:42170819(+) A-I      intronic chr8:42167018(+) A-I      NonSyn:Asn->Ser chr8:42130507(+) A-I      intronic chr8:42133611(+) A-I      intronic chr8:42173361(+) A-I      intronic chr8:42146571(+) A-I      intronic chr8:42133568(+) A-I      intronic chr8:42173196(+) A-I      intronic chr8:42142882(+) A-I      intronic chr8:42145703(+) A-I      intronic chr8:42184746(+) A-I      intronic chr8:42158421(+) A-I      intronic chr8:42184778(+) A-I      intronic chr8:42153104(+) A-I      intronic chr8:42136462(+) A-I      intronic chr8:42137549(+) A-I      intronic chr8:42136433(+) A-I      intronic chr8:42139833(+) A-I      intronic chr8:42131184(+) A-I      intronic chr8:42131333(+) A-I      intronic chr8:42131159(+) A-I      intronic chr8:42141979(+) A-I      intronic chr8:42152717(+) A-I      intronic chr8:42181832(+) A-I      intronic chr8:42167176(+) A-I      3'UTR chr8:42167186(+) A-I      3'UTR chr8:42167195(+) A-I      3'UTR chr8:42167094(+) A-I      3'UTR chr8:42167162(+) A-I      3'UTR chr8:42167087(+) A-I      3'UTR chr8:42167146(+) A-I      3'UTR chr8:42167086(+) A-I      3'UTR chr8:42167156(+) A-I      3'UTR chr8:42167095(+) A-I      3'UTR chr8:42167163(+) A-I      3'UTR chr8:42167147(+) A-I      3'UTR chr8:42167089(+) A-I      3'UTR chr8:42167097(+) A-I      3'UTR chr8:42167178(+) A-I      3'UTR chr8:42167169(+) A-I      3'UTR chr8:42167192(+) A-I      3'UTR chr8:42167187(+) A-I      3'UTR chr8:42146347(+) A-I      intronic chr8:42142083(+) A-I      intronic chr8:42131186(+) A-I      intronic chr8:42137601(+) A-I      intronic chr8:42158502(+) A-I      intronic chr8:42142928(+) A-I      intronic chr8:42131643(+) A-I      intronic chr8:42145920(+) A-I      intronic chr8:42136391(+) A-I      intronic chr8:42179284(+) A-I      intronic chr8:42142849(+) A-I      intronic chr8:42142939(+) A-I      intronic chr8:42130600(+) A-I      intronic chr8:42132730(+) A-I      intronic chr8:42146362(+) A-I      intronic chr8:42158434(+) A-I      intronic chr8:42173227(+) A-I      intronic chr8:42183116(+) A-I      intronic chr8:42136401(+) A-I      intronic chr8:42131690(+) A-I      intronic chr8:42155174(+) A-I      intronic chr8:42130826(+) A-I      intronic chr8:42144168(+) A-I      intronic chr8:42173244(+) A-I      intronic chr8:42172044(+) A-I      intronic chr8:42139908(+) A-I      intronic chr8:42131769(+) A-I      intronic chr8:42170842(+) A-I      intronic chr8:42133633(+) A-I      intronic chr8:42181846(+) A-I      intronic chr8:42144030(+) A-I      intronic chr8:42142821(+) A-I      intronic chr8:42131713(+) A-I      intronic chr8:42180360(+) A-I      intronic chr8:42142398(+) A-I      intronic chr8:42142406(+) A-I      intronic chr8:42149437(+) A-I      intronic chr8:42142809(+) A-I      intronic chr8:42142548(+) A-I      intronic chr8:42132439(+) A-I      intronic chr8:42134595(+) A-I      intronic chr8:42154079(+) A-I      intronic chr8:42142475(+) A-I      intronic chr8:42132807(+) A-I      intronic chr8:42133531(+) A-I      intronic chr8:42179133(+) A-I      intronic chr8:42142993(+) A-I      intronic chr8:42167023(+) A-I      NonSyn:Ser->Gly chr8:42167017(+) A-I      NonSyn:Asn->Asp chr8:42184757(+) A-I      intronic chr8:42146454(+) A-I      intronic chr8:42133539(+) A-I      intronic chr8:42130229(+) A-I      intronic chr8:42182982(+) A-I      intronic chr8:42146618(+) A-I      intronic chr8:42152826(+) A-I      intronic chr8:42146572(+) A-I      intronic chr8:42139886(+) A-I      intronic chr8:42142479(+) A-I      intronic chr8:42158473(+) A-I      intronic chr8:42131810(+) A-I      intronic chr8:42133630(+) A-I      intronic chr8:42131728(+) A-I      intronic chr8:42141922(+) A-I      intronic chr8:42130779(+) A-I      intronic chr8:42144118(+) A-I      intronic chr8:42136405(+) A-I      intronic chr8:42145704(+) A-I      intronic chr8:42131714(+) A-I      intronic chr8:42142998(+) A-I      intronic chr8:42132232(+) A-I      intronic chr8:42170913(+) A-I      intronic chr8:42170714(+) A-I      intronic chr8:42142814(+) A-I      intronic chr8:42144087(+) A-I      intronic chr8:42183118(+) A-I      intronic chr8:42139946(+) A-I      intronic chr8:42142636(+) A-I      intronic chr8:42132506(+) A-I      intronic chr8:42131648(+) A-I      intronic chr8:42144123(+) A-I      intronic chr8:42170713(+) A-I      intronic chr8:42131253(+) A-I      intronic chr8:42130812(+) A-I      intronic chr8:42152906(+) A-I      intronic chr8:42145685(+) A-I      intronic chr8:42154047(+) A-I      intronic chr8:42139987(+) A-I      intronic chr8:42179253(+) A-I      intronic chr8:42131731(+) A-I      intronic chr8:42141845(+) A-I      intronic chr8:42145658(+) A-I      intronic chr8:42133488(+) A-I      intronic chr8:42179166(+) A-I      intronic chr8:42131290(+) A-I      intronic chr8:42139905(+) A-I      intronic chr8:42131271(+) A-I      intronic chr8:42146438(+) A-I      intronic chr8:42142648(+) A-I      intronic chr8:42131572(+) A-I      intronic chr8:42152766(+) A-I      intronic chr8:42142508(+) A-I      intronic chr8:42139771(+) A-I      intronic chr8:42145785(+) A-I      intronic chr8:42182954(+) A-I      intronic chr8:42173364(+) A-I      intronic chr8:42131268(+) A-I      intronic chr8:42141913(+) A-I      intronic chr8:42173197(+) A-I      intronic chr8:42145699(+) A-I      intronic chr8:42139986(+) A-I      intronic chr8:42155135(+) A-I      intronic chr8:42131795(+) A-I      intronic chr8:42158635(+) A-I      intronic chr8:42131770(+) A-I      intronic chr8:42132168(+) A-I      intronic chr8:42145820(+) A-I      intronic chr8:42183117(+) A-I      intronic chr8:42134352(+) A-I      intronic chr8:42131688(+) A-I      intronic chr8:42184756(+) A-I      intronic chr8:42145749(+) A-I      intronic chr8:42131158(+) A-I      intronic chr8:42133399(+) A-I      intronic chr8:42139968(+) A-I      intronic chr8:42146439(+) A-I      intronic chr8:42141915(+) A-I      intronic chr8:42173201(+) A-I      intronic chr8:42152911(+) A-I      intronic chr8:42142823(+) A-I      intronic chr8:42145814(+) A-I      intronic chr8:42181852(+) A-I      intronic chr8:42144032(+) A-I      intronic chr8:42145743(+) A-I      intronic chr8:42152898(+) A-I      intronic chr8:42137506(+) A-I      intronic chr8:42172132(+) A-I      intronic chr8:42144117(+) A-I      intronic chr8:42131800(+) A-I      intronic chr8:42152706(+) A-I      intronic chr8:42143022(+) A-I      intronic chr8:42152811(+) A-I      intronic chr8:42153188(+) A-I      intronic chr8:42146612(+) A-I      intronic chr8:42139737(+) A-I      intronic chr8:42131748(+) A-I      intronic chr8:42144088(+) A-I      intronic chr8:42181826(+) A-I      intronic chr8:42133516(+) A-I      intronic chr8:42143077(+) A-I      intronic chr8:42170778(+) A-I      intronic chr8:42131162(+) A-I      intronic chr8:42152990(+) A-I      intronic chr8:42144029(+) A-I      intronic chr8:42133629(+) A-I      intronic chr8:42180355(+) A-I      intronic chr8:42170695(+) A-I      intronic chr8:42130347(+) A-I      intronic chr8:42136323(+) A-I      intronic chr8:42152696(+) A-I      intronic chr8:42137453(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	IKBKB	chr8:42157954(+) A-I intron -    15342557 chr8:42158421(+) A-I intron -    15342557 chr8:42158502(+) A-I intron -    15342557 chr8:42158558(+) A-I intron -    15342557 chr8:42158564(+) A-I intron -    15342557 chr8:42167017(+) A-I intron -    15258596 chr8:42167018(+) A-I intron -    15258596 chr8:42167023(+) A-I intron -    15258596 chr8:42167146(+) A-I intron -    15258596 chr8:42144123(+) A-I intron -    21960545   //22327324 chr8:42145784(+) A-I intron -    22327324 chr8:42145785(+) A-I intron -    22327324 chr8:42146347(+) A-I intron -    22327324 chr8:42179254(+) A-I intron -    21960545   //22327324 chr8:42131185(+) A-I intron -    21960545 chr8:42131186(+) A-I intron -    21960545 chr8:42131187(+) A-I intron -    21960545 chr8:42131253(+) A-I intron -    21960545 chr8:42131678(+) A-I intron -    21960545 chr8:42131688(+) A-I intron -    21960545 chr8:42131713(+) A-I intron -    21960545 chr8:42131748(+) A-I intron -    21960545 chr8:42131768(+) A-I intron -    21960545 chr8:42139732(+) A-I intron -    21960545 chr8:42142936(+) A-I intron -    21960545 chr8:42142960(+) A-I intron -    21960545 chr8:42179166(+) A-I intron -    21960545 chr8:42179253(+) A-I intron -    21960545 chr8:42184757(+) A-I intron -    21960545 chr8:42130131(+) A-G intron -    22484847 chr8:42130203(+) A-G intron -    22484847 chr8:42130229(+) A-G intron -    22484847 chr8:42130310(+) A-G intron -    22484847 chr8:42130336(+) A-G intron -    22484847 chr8:42130347(+) A-G intron -    22484847 chr8:42130600(+) A-G intron -    22484847 chr8:42130673(+) A-G intron -    22484847 chr8:42130700(+) C-T intron -    22484847 chr8:42130706(+) A-G intron -    22484847 chr8:42130739(+) A-G intron -    22484847 chr8:42130779(+) A-G intron -    22484847 chr8:42130787(+) A-G intron -    22484847 chr8:42130826(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131158(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131159(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131162(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131185(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131186(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131187(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131253(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131268(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131271(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131333(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131572(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131574(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131643(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131648(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131649(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131688(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131690(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131713(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131714(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131722(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131728(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131731(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131734(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131748(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131752(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131768(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131769(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131770(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131795(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131800(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131809(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131810(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131822(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131824(+) A-G intron -    22484847 chr8:42131825(+) A-G intron -    22484847 chr8:42132144(+) A-G intron -    22484847 chr8:42132506(+) A-G intron -    22484847 chr8:42132807(+) A-G intron -    22484847 chr8:42132950(+) A-G intron -    22484847 chr8:42133429(+) A-G intron -    22484847 chr8:42133460(+) A-G intron -    22484847 chr8:42133531(+) A-G intron -    22484847 chr8:42133611(+) A-G intron -    22484847 chr8:42134244(+) G-T intron -    22484847 chr8:42134293(+) G-A intron -    22484847 chr8:42134963(+) A-G intron -    22484847 chr8:42136242(+) A-G intron -    22484847 chr8:42136391(+) A-G intron -    22484847 chr8:42136394(+) A-G intron -    22484847 chr8:42136401(+) A-G intron -    22484847 chr8:42137601(+) A-G intron -    22484847 chr8:42137628(+) A-G intron -    22484847 chr8:42139732(+) A-G intron -    22484847 chr8:42139737(+) A-G intron -    22484847 chr8:42139847(+) A-G intron -    22484847 chr8:42139850(+) A-G intron -    22484847 chr8:42139860(+) A-G intron -    22484847 chr8:42139876(+) A-G intron -    22484847 chr8:42139905(+) A-G intron -    22484847 chr8:42139908(+) A-G intron -    22484847 chr8:42139914(+) A-G intron -    22484847 chr8:42139927(+) A-G intron -    22484847 chr8:42139945(+) A-G intron -    22484847 chr8:42139968(+) A-G intron -    22484847 chr8:42139987(+) A-G intron -    22484847 chr8:42141846(+) A-G intron -    22484847 chr8:42141889(+) A-G intron -    22484847 chr8:42141913(+) A-G intron -    22484847 chr8:42141915(+) A-G intron -    22484847 chr8:42141922(+) A-G intron -    22484847 chr8:42141923(+) A-G intron -    22484847 chr8:42141937(+) A-G intron -    22484847 chr8:42141953(+) A-G intron -    22484847 chr8:42141979(+) A-G intron -    22484847 chr8:42141985(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142393(+) G-T intron -    22484847 chr8:42142398(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142406(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142467(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142475(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142508(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142514(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142608(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142809(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142821(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142838(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142868(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142882(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142928(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142936(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142939(+) A-G intron -    22484847 chr8:42142993(+) A-G intron -    22484847 chr8:42143022(+) A-G intron -    22484847 chr8:42144029(+) A-G intron -    22484847 chr8:42144030(+) A-G intron -    22484847 chr8:42144032(+) A-G intron -    22484847 chr8:42144088(+) A-G intron -    22484847 chr8:42144117(+) A-G intron -    22484847 chr8:42144118(+) A-G intron -    22484847 chr8:42144123(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145685(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145699(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145703(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145721(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145740(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145743(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145749(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145752(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145784(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145785(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145790(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145798(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145820(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145825(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145855(+) A-G intron -    22484847 chr8:42145920(+) A-G intron -    22484847 chr8:42146347(+) A-G intron -    22484847 chr8:42146362(+) A-G intron -    22484847 chr8:42146369(+) A-G intron -    22484847 chr8:42146438(+) A-G intron -    22484847 chr8:42146439(+) A-G intron -    22484847 chr8:42146446(+) A-G intron -    22484847 chr8:42146454(+) A-G intron -    22484847 chr8:42146560(+) C-T intron -    22484847 chr8:42146571(+) A-G intron -    22484847 chr8:42146572(+) A-G intron -    22484847 chr8:42146577(+) A-G intron -    22484847 chr8:42146587(+) A-G intron -    22484847 chr8:42146612(+) A-G intron -    22484847 chr8:42146618(+) A-G intron -    22484847 chr8:42146658(+) A-G intron -    22484847 chr8:42148829(+) A-G intron -    22484847 chr8:42149389(+) A-G intron -    22484847 chr8:42149437(+) A-G intron -    22484847 chr8:42152706(+) A-G intron -    22484847 chr8:42152711(+) A-G intron -    22484847 chr8:42152802(+) A-G intron -    22484847 chr8:42152811(+) A-G intron -    22484847 chr8:42152817(+) A-G intron -    22484847 chr8:42152826(+) A-G intron -    22484847 chr8:42152899(+) A-G intron -    22484847 chr8:42152906(+) A-G intron -    22484847 chr8:42152911(+) A-G intron -    22484847 chr8:42152990(+) A-G intron -    22484847 chr8:42152995(+) A-G intron -    22484847 chr8:42153041(+) A-G intron -    22484847 chr8:42153066(+) A-G intron -    22484847 chr8:42153067(+) A-G intron -    22484847 chr8:42153072(+) A-G intron -    22484847 chr8:42153078(+) A-G intron -    22484847 chr8:42153092(+) A-G intron -    22484847 chr8:42153096(+) A-G intron -    22484847 chr8:42153104(+) A-G intron -    22484847 chr8:42153152(+) A-G intron -    22484847 chr8:42153167(+) A-G intron -    22484847 chr8:42153188(+) A-G intron -    22484847 chr8:42154047(+) A-G intron -    22484847 chr8:42155135(+) A-G intron -    22484847 chr8:42155337(+) C-T intron -    22484847 chr8:42158421(+) A-G intron -    22484847 chr8:42158577(+) A-G intron -    22484847 chr8:42161068(+) T-C intron -    22484847 chr8:42165810(+) C-T intron -    22484847 chr8:42170695(+) A-G intron -    22484847 chr8:42170711(+) A-G intron -    22484847 chr8:42170713(+) A-G intron -    22484847 chr8:42170714(+) A-G intron -    22484847 chr8:42170718(+) T-C intron -    22484847 chr8:42170778(+) A-G intron -    22484847 chr8:42170790(+) A-G intron -    22484847 chr8:42170791(+) A-G intron -    22484847 chr8:42170819(+) A-G intron -    22484847 chr8:42170842(+) A-G intron -    22484847 chr8:42170848(+) A-G intron -    22484847 chr8:42170862(+) A-G intron -    22484847 chr8:42170913(+) A-G intron -    22484847 chr8:42172044(+) A-G intron -    22484847 chr8:42172128(+) A-G intron -    22484847 chr8:42172131(+) A-G intron -    22484847 chr8:42172132(+) A-G intron -    22484847 chr8:42172194(+) A-G intron -    22484847 chr8:42172226(+) A-G intron -    22484847 chr8:42173196(+) A-G intron -    22484847 chr8:42173197(+) A-G intron -    22484847 chr8:42173201(+) A-G intron -    22484847 chr8:42173244(+) A-G intron -    22484847 chr8:42173274(+) A-G intron -    22484847 chr8:42173361(+) A-G intron -    22484847 chr8:42173364(+) A-G intron -    22484847 chr8:42173446(+) T-G intron -    22484847 chr8:42179056(+) A-G intron -    22484847 chr8:42179133(+) A-G intron -    22484847 chr8:42179253(+) A-G intron -    22484847 chr8:42179254(+) A-G intron -    22484847 chr8:42180355(+) A-G intron -    22484847 chr8:42180360(+) A-G intron -    22484847 chr8:42181832(+) A-G intron -    22484847 chr8:42181882(+) A-G intron -    22484847 chr8:42181900(+) A-G intron -    22484847 chr8:42182982(+) A-G intron -    22484847 chr8:42183099(+) A-G intron -    22484847 chr8:42183116(+) A-G intron -    22484847 chr8:42183117(+) A-G intron -    22484847 chr8:42183118(+) A-G intron -    22484847 chr8:42184757(+) A-G intron -    22484847 chr8:42187005(+) T-C intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	IKBKB	chr8:42173849-42173850(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625 chr8:42174243-42174244(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625 chr8:42174324-42174325(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625 chr8:42174345-42174346(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625 chr8:42174478-42174479(+) m6A exon//intron       - chr8:42176143-42176144(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625 chr8:42176178-42176179(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625 chr8:42176218-42176219(+) m6A exon//intron       24284625 chr8:42176884-42176885(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625 chr8:42176923-42176924(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625 chr8:42177112-42177113(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24209618 chr8:42177171-42177172(+) m6A exon//intron       24284625//24209618//24981863 chr8:42177190-42177191(+) m6A exon//intron       24284625//24209618//24981863 chr8:42177241-42177242(+) m6A exon//intron       24284625//24209618 chr8:42178266-42178267(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24209618 chr8:42178297-42178298(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863 chr8:42178310-42178311(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24209618//24981863 chr8:42178405-42178406(+) m6A exon//intron       24284625//24209618//24981863 chr8:42178459-42178460(+) m6A exon//intron       24209618 chr8:42179389-42179390(+) m6A exon//intron       24209618//24981863 chr8:42179394-42179395(+) m6A exon//intron       24209618//24981863 chr8:42179443-42179444(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24209618//24981863 chr8:42179455-42179456(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24209618//24981863 chr8:42179579-42179580(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24209618//24981863 chr8:42179868-42179869(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24209618//24981863 chr8:42179897-42179898(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24209618//24981863 chr8:42179949-42179950(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       - chr8:42182445-42182446(+) m6A exon//intron       - chr8:42182552-42182553(+) m6A exon//intron       - chr8:42182571-42182572(+) m6A exon//intron       - chr8:42186647-42186648(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24981863 chr8:42186700-42186701(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr8:42186713-42186714(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr8:42186718-42186719(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr8:42186749-42186750(+) m6A exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr8:42188438-42188439(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr8:42188506-42188507(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr8:42188558-42188559(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr8:42188718-42188719(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr8:42188898-42188899(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr8:42189039-42189040(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr8:42189288-42189289(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	IKBKB	Chromatin K562 cells     - Cytosol HeLa-S3 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART17-5p
Interactor2: IKBKB

Evidence Support:

Strong-Evidence	3'UTR indicator assay
Weak-Evidence	PAR-CLIP
Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PARalyzer//Targetscan
Support Database	RepTar//ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg

References:

[1]PMID	30615681	Target region	3'UTR
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	293T cells	Interactor2 expression	None
Description	Luciferase knockdown was observed for 12 out of 15 PAR-CLIP-identified miRNA interactions, confirming these cellular 3'UTRs as targets of the EBV miRNAs (Fig 3A-3C).

[2]PMID	22100165	Target region	3'UTR
Source	RepTar//ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	BC-1 cells	Interactor2 expression	None
Description	Using PAR-CLIP, a technology which allows the direct and transcriptome-wide identification of miRNA targets, we delineate the target sites for all viral and cellular miRNAs expressed in PEL cell lines. The resulting data set revealed that KSHV miRNAs directly target more than 2000 cellular mRNAs, including many involved in pathways relevant to KSHV pathogenesis. Moreover, 58% of these mRNAs are also targeted by EBV miRNAs, via distinct binding sites.Clusters with seed matches to expressed miRNAs were considered candidate target sites. Of the clusters mapping to human 3'UTRs, 69% (BC-1) and 70% (BC-3) had seed matches to expressed miRNAs (Tables S6).Table S6A BC-1 derived 3'UTR clusters with seed matches to expressed miRNAs.