Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00366811

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART17-5p:  MIMAT0003715          HTT:  NM_001388492     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART17-5p	HTT
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003715	3064
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	HD//IT15//LOMARS

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	HTT	chr4:3093960(+) A-I      intronic chr4:3093886(+) A-I      intronic chr4:3089608(+) A-I      intronic chr4:3088165(+) A-I      intronic chr4:3087124(+) A-I      intronic chr4:3086964(+) A-I      intronic chr4:3086944(+) A-I      intronic chr4:3086921(+) A-I      intronic chr4:3086626(+) A-I      intronic chr4:3086604(+) A-I      intronic chr4:3086594(+) A-I      intronic chr4:3086587(+) A-I      intronic chr4:3086584(+) A-I      intronic chr4:3086296(+) A-I      intronic chr4:3086184(+) A-I      intronic chr4:3086183(+) A-I      intronic chr4:3086152(+) A-I      intronic chr4:3085955(+) A-I      intronic chr4:3085141(+) A-I      intronic chr4:3085137(+) A-I      intronic chr4:3085127(+) A-I      intronic chr4:3083545(+) A-I      intronic chr4:3083414(+) A-I      intronic chr4:3083411(+) A-I      intronic chr4:3083379(+) A-I      intronic chr4:3079344(+) A-I      intronic chr4:3079330(+) A-I      intronic chr4:3079276(+) A-I      intronic chr4:3079248(+) A-I      intronic chr4:3079246(+) A-I      intronic chr4:3079240(+) A-I      intronic chr4:3079166(+) A-I      intronic chr4:3078794(+) A-I      intronic chr4:3078755(+) A-I      intronic chr4:3078746(+) A-I      intronic chr4:3078743(+) A-I      intronic chr4:3078698(+) A-I      intronic chr4:3078695(+) A-I      intronic chr4:3145408(+) A-I      intronic chr4:3145497(+) A-I      intronic chr4:3085101(+) A-I      intronic chr4:3085133(+) A-I      intronic chr4:3129815(+) A-I      intronic chr4:3144965(+) A-I      intronic chr4:3144968(+) A-I      intronic chr4:3145084(+) A-I      intronic chr4:3145085(+) A-I      intronic chr4:3151178(+) A-I      intronic chr4:3201257(+) A-I      intronic chr4:3201255(+) A-I      intronic chr4:3201147(+) A-I      intronic chr4:3201146(+) A-I      intronic chr4:3201136(+) A-I      intronic chr4:3201120(+) A-I      intronic chr4:3200152(+) A-I      intronic chr4:3200117(+) A-I      intronic chr4:3200097(+) A-I      intronic chr4:3194027(+) A-I      intronic chr4:3193936(+) A-I      intronic chr4:3193919(+) A-I      intronic chr4:3193881(+) A-I      intronic chr4:3193085(+) A-I      intronic chr4:3193040(+) A-I      intronic chr4:3193005(+) A-I      intronic chr4:3193004(+) A-I      intronic chr4:3192994(+) A-I      intronic chr4:3191970(+) A-I      intronic chr4:3191916(+) A-I      intronic chr4:3191832(+) A-I      intronic chr4:3191797(+) A-I      intronic chr4:3191754(+) A-I      intronic chr4:3191556(+) A-I      intronic chr4:3191502(+) A-I      intronic chr4:3187619(+) A-I      intronic chr4:3187454(+) A-I      intronic chr4:3187415(+) A-I      intronic chr4:3187390(+) A-I      intronic chr4:3187385(+) A-I      intronic chr4:3184856(+) A-I      intronic chr4:3184855(+) A-I      intronic chr4:3184830(+) A-I      intronic chr4:3170453(+) A-I      intronic chr4:3157580(+) A-I      intronic chr4:3157049(+) A-I      intronic chr4:3156980(+) A-I      intronic chr4:3153919(+) A-I      intronic chr4:3153724(+) A-I      intronic chr4:3153686(+) A-I      intronic chr4:3151306(+) A-I      intronic chr4:3151235(+) A-I      intronic chr4:3151232(+) A-I      intronic chr4:3151199(+) A-I      intronic chr4:3150564(+) A-I      intronic chr4:3150404(+) A-I      intronic chr4:3150386(+) A-I      intronic chr4:3150383(+) A-I      intronic chr4:3150347(+) A-I      intronic chr4:3150341(+) A-I      intronic chr4:3150337(+) A-I      intronic chr4:3150321(+) A-I      intronic chr4:3150314(+) A-I      intronic chr4:3150262(+) A-I      intronic chr4:3150170(+) A-I      intronic chr4:3150124(+) A-I      intronic chr4:3146181(+) A-I      intronic chr4:3146180(+) A-I      intronic chr4:3145601(+) A-I      intronic chr4:3145564(+) A-I      intronic chr4:3145510(+) A-I      intronic chr4:3145496(+) A-I      intronic chr4:3145434(+) A-I      intronic chr4:3145430(+) A-I      intronic chr4:3145387(+) A-I      intronic chr4:3145043(+) A-I      intronic chr4:3144993(+) A-I      intronic chr4:3144886(+) A-I      intronic chr4:3141894(+) A-I      intronic chr4:3141857(+) A-I      intronic chr4:3141837(+) A-I      intronic chr4:3141836(+) A-I      intronic chr4:3141826(+) A-I      intronic chr4:3141807(+) A-I      intronic chr4:3141727(+) A-I      intronic chr4:3141108(+) A-I      intronic chr4:3141105(+) A-I      intronic chr4:3141054(+) A-I      intronic chr4:3140988(+) A-I      intronic chr4:3140601(+) A-I      intronic chr4:3140480(+) A-I      intronic chr4:3140478(+) A-I      intronic chr4:3140441(+) A-I      intronic chr4:3140358(+) A-I      intronic chr4:3139347(+) A-I      intronic chr4:3139328(+) A-I      intronic chr4:3139311(+) A-I      intronic chr4:3139276(+) A-I      intronic chr4:3139275(+) A-I      intronic chr4:3138893(+) A-I      intronic chr4:3138876(+) A-I      intronic chr4:3138815(+) A-I      intronic chr4:3138796(+) A-I      intronic chr4:3138784(+) A-I      intronic chr4:3138774(+) A-I      intronic chr4:3138739(+) A-I      intronic chr4:3129894(+) A-I      intronic chr4:3129840(+) A-I      intronic chr4:3129538(+) A-I      intronic chr4:3129526(+) A-I      intronic chr4:3129462(+) A-I      intronic chr4:3129454(+) A-I      intronic chr4:3111054(+) A-I      intronic chr4:3111010(+) A-I      intronic chr4:3111004(+) A-I      intronic chr4:3110664(+) A-I      intronic chr4:3110625(+) A-I      intronic chr4:3110558(+) A-I      intronic chr4:3110540(+) A-I      intronic chr4:3105905(+) A-I      intronic chr4:3094328(+) A-I      intronic chr4:3094159(+) A-I      intronic chr4:3078784(+) A-I      intronic chr4:3079226(+) A-I      intronic chr4:3139216(+) A-I      intronic chr4:3129880(+) A-I      intronic chr4:3184633(+) A-I      intronic chr4:3151194(+) A-I      intronic chr4:3129544(+) A-I      intronic chr4:3110695(+) A-I      intronic chr4:3094210(+) A-I      intronic chr4:3078632(+) A-I      intronic chr4:3129925(+) A-I      intronic chr4:3153729(+) A-I      intronic chr4:3200052(+) A-I      intronic chr4:3193067(+) A-I      intronic chr4:3191562(+) A-I      intronic chr4:3141738(+) A-I      intronic chr4:3078728(+) A-I      intronic chr4:3184740(+) A-I      intronic chr4:3192195(+) A-I      intronic chr4:3193817(+) A-I      intronic chr4:3150142(+) A-I      intronic chr4:3129826(+) A-I      intronic chr4:3136526(+) A-I      intronic chr4:3201091(+) A-I      intronic chr4:3193990(+) A-I      intronic chr4:3111079(+) A-I      intronic chr4:3184792(+) A-I      intronic chr4:3144930(+) A-I      intronic chr4:3191843(+) A-I      intronic chr4:3187615(+) A-I      intronic chr4:3087048(+) A-I      intronic chr4:3141050(+) A-I      intronic chr4:3150107(+) A-I      intronic chr4:3138894(+) A-I      intronic chr4:3152509(+) A-I      intronic chr4:3078650(+) A-I      intronic chr4:3157405(+) A-I      intronic chr4:3140976(+) A-I      intronic chr4:3129834(+) A-I      intronic chr4:3151129(+) A-I      intronic chr4:3138832(+) A-I      intronic chr4:3078887(+) A-I      intronic chr4:3139265(+) A-I      intronic chr4:3078826(+) A-I      intronic chr4:3099095(+) A-I      intronic chr4:3088251(+) A-I      intronic chr4:3144999(+) A-I      intronic chr4:3154036(+) A-I      intronic chr4:3086031(+) A-I      intronic chr4:3201217(+) A-I      intronic chr4:3078729(+) A-I      intronic chr4:3155403(+) A-I      intronic chr4:3092674(+) A-I      intronic chr4:3198344(+) A-I      intronic chr4:3151182(+) A-I      intronic chr4:3138895(+) A-I      intronic chr4:3145504(+) A-I      intronic chr4:3153955(+) A-I      intronic chr4:3085176(+) A-I      intronic chr4:3153965(+) A-I      intronic chr4:3129540(+) A-I      intronic chr4:3129857(+) A-I      intronic chr4:3145096(+) A-I      intronic chr4:3139341(+) A-I      intronic chr4:3081035(+) A-I      intronic chr4:3198227(+) A-I      intronic chr4:3098747(+) A-I      intronic chr4:3191799(+) A-I      intronic chr4:3086965(+) A-I      intronic chr4:3086326(+) A-I      intronic chr4:3144988(+) A-I      intronic chr4:3138837(+) A-I      intronic chr4:3085111(+) A-I      intronic chr4:3129537(+) A-I      intronic chr4:3138735(+) A-I      intronic chr4:3092677(+) A-I      intronic chr4:3078744(+) A-I      intronic chr4:3086994(+) A-I      intronic chr4:3138801(+) A-I      intronic chr4:3138800(+) A-I      intronic chr4:3082002(+) A-I      intronic chr4:3151125(+) A-I      intronic chr4:3153794(+) A-I      intronic chr4:3078825(+) A-I      intronic chr4:3079247(+) A-I      intronic chr4:3151174(+) A-I      intronic chr4:3140415(+) A-I      intronic chr4:3157406(+) A-I      intronic chr4:3153967(+) A-I      intronic chr4:3086913(+) A-I      intronic chr4:3139264(+) A-I      intronic chr4:3139346(+) A-I      intronic chr4:3141933(+) A-I      intronic chr4:3139270(+) A-I      intronic chr4:3151124(+) A-I      intronic chr4:3078643(+) A-I      intronic chr4:3086338(+) A-I      intronic chr4:3150151(+) A-I      intronic chr4:3105886(+) A-I      intronic chr4:3108063(+) A-I      intronic chr4:3151126(+) A-I      intronic chr4:3129570(+) A-I      intronic chr4:3111071(+) A-I      intronic chr4:3145558(+) A-I      intronic chr4:3078641(+) A-I      intronic chr4:3139261(+) A-I      intronic chr4:3141042(+) A-I      intronic chr4:3141064(+) A-I      intronic chr4:3080435(+) A-I      intronic chr4:3110668(+) A-I      intronic chr4:3145431(+) A-I      intronic chr4:3078811(+) A-I      intronic chr4:3086324(+) A-I      intronic chr4:3110997(+) A-I      intronic chr4:3079419(+) A-I      intronic chr4:3141823(+) A-I      intronic chr4:3151094(+) A-I      intronic chr4:3105873(+) A-I      intronic chr4:3138818(+) A-I      intronic chr4:3078815(+) A-I      intronic chr4:3079327(+) A-I      intronic chr4:3129882(+) A-I      intronic chr4:3078790(+) A-I      intronic chr4:3187384(+) A-I      intronic chr4:3141938(+) A-I      intronic chr4:3141881(+) A-I      intronic chr4:3192349(+) A-I      intronic chr4:3194039(+) A-I      intronic chr4:3184741(+) A-I      intronic chr4:3194033(+) A-I      intronic chr4:3078758(+) A-I      intronic chr4:3191953(+) A-I      intronic chr4:3144978(+) A-I      intronic chr4:3187490(+) A-I      intronic chr4:3150537(+) A-I      intronic chr4:3184852(+) A-I      intronic chr4:3144957(+) A-I      intronic chr4:3157359(+) A-I      intronic chr4:3153748(+) A-I      intronic chr4:3086928(+) A-I      intronic chr4:3153895(+) A-I      intronic chr4:3129922(+) A-I      intronic chr4:3191857(+) A-I      intronic chr4:3079178(+) A-I      intronic chr4:3141920(+) A-I      intronic chr4:3145120(+) A-I      intronic chr4:3151190(+) A-I      intronic chr4:3145592(+) A-I      intronic chr4:3086012(+) A-I      intronic chr4:3087053(+) A-I      intronic chr4:3141868(+) A-I      intronic chr4:3145448(+) A-I      intronic chr4:3145513(+) A-I      intronic chr4:3086290(+) A-I      intronic chr4:3153796(+) A-I      intronic chr4:3086630(+) A-I      intronic chr4:3140420(+) A-I      intronic chr4:3129817(+) A-I      intronic chr4:3191730(+) A-I      intronic chr4:3187489(+) A-I      intronic chr4:3153845(+) A-I      intronic chr4:3138844(+) A-I      intronic chr4:3187534(+) A-I      intronic chr4:3200992(+) A-I      intronic chr4:3141186(+) A-I      intronic chr4:3187464(+) A-I      intronic chr4:3138685(+) A-I      intronic chr4:3152645(+) A-I      intronic chr4:3123394(+) A-I      intronic chr4:3204664(+) A-I      intronic chr4:3129740(+) A-I      intronic chr4:3140560(+) A-I      intronic chr4:3098696(+) A-I      intronic chr4:3187529(+) A-I      intronic chr4:3129903(+) A-I      intronic chr4:3078745(+) A-I      intronic chr4:3191901(+) A-I      intronic chr4:3187519(+) A-I      intronic chr4:3153906(+) A-I      intronic chr4:3192957(+) A-I      intronic chr4:3106108(+) A-I      intronic chr4:3110544(+) A-I      intronic chr4:3140464(+) A-I      intronic chr4:3087073(+) A-I      intronic chr4:3150378(+) A-I      intronic chr4:3151099(+) A-I      intronic chr4:3139306(+) A-I      intronic chr4:3141828(+) A-I      intronic chr4:3145604(+) A-I      intronic chr4:3140375(+) A-I      intronic chr4:3138824(+) A-I      intronic chr4:3081008(+) A-I      intronic chr4:3087064(+) A-I      intronic chr4:3129419(+) A-I      intronic chr4:3078785(+) A-I      intronic chr4:3129849(+) A-I      intronic chr4:3086563(+) A-I      intronic chr4:3088173(+) A-I      intronic chr4:3141187(+) A-I      intronic chr4:3129799(+) A-I      intronic chr4:3144954(+) A-I      intronic chr4:3139315(+) A-I      intronic chr4:3088337(+) A-I      intronic chr4:3138809(+) A-I      intronic chr4:3129529(+) A-I      intronic chr4:3157514(+) A-I      intronic chr4:3129869(+) A-I      intronic chr4:3145519(+) A-I      intronic chr4:3086278(+) A-I      intronic chr4:3078754(+) A-I      intronic chr4:3193001(+) A-I      intronic chr4:3094276(+) A-I      intronic chr4:3086644(+) A-I      intronic chr4:3191636(+) A-I      intronic chr4:3085171(+) A-I      intronic chr4:3193066(+) A-I      intronic chr4:3110517(+) A-I      intronic chr4:3141732(+) A-I      intronic chr4:3144908(+) A-I      intronic chr4:3110515(+) A-I      intronic chr4:3086405(+) A-I      intronic chr4:3191474(+) A-I      intronic chr4:3151172(+) A-I      intronic chr4:3154099(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	HTT	chr4:3187519(+) A-I intron -    22327324 chr4:3105829(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078632(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078650(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078728(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078729(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078733(+) T-C intron -    22484847 chr4:3078740(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078744(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078745(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078754(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078784(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078785(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078790(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078811(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078815(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078825(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078826(+) A-G intron -    22484847 chr4:3078887(+) A-G intron -    22484847 chr4:3079178(+) A-G intron -    22484847 chr4:3079226(+) A-G intron -    22484847 chr4:3079286(+) A-G intron -    22484847 chr4:3079327(+) A-G intron -    22484847 chr4:3079347(+) A-G intron -    22484847 chr4:3081838(+) T-G intron -    22484847 chr4:3081839(+) G-A intron -    22484847 chr4:3082002(+) A-G intron -    22484847 chr4:3082074(+) A-G intron -    22484847 chr4:3083303(+) G-T intron -    22484847 chr4:3085214(+) A-G intron -    22484847 chr4:3086012(+) A-G intron -    22484847 chr4:3086032(+) A-G intron -    22484847 chr4:3086278(+) A-G intron -    22484847 chr4:3086290(+) A-G intron -    22484847 chr4:3086324(+) A-G intron -    22484847 chr4:3086329(+) A-G intron -    22484847 chr4:3086337(+) A-G intron -    22484847 chr4:3086338(+) A-G intron -    22484847 chr4:3086563(+) A-G intron -    22484847 chr4:3086913(+) A-G intron -    22484847 chr4:3086928(+) A-G intron -    22484847 chr4:3086929(+) A-G intron -    22484847 chr4:3087048(+) A-G intron -    22484847 chr4:3087053(+) A-G intron -    22484847 chr4:3087064(+) A-G intron -    22484847 chr4:3087073(+) A-G intron -    22484847 chr4:3088173(+) A-G intron -    22484847 chr4:3092584(+) A-G intron -    22484847 chr4:3093798(+) A-G intron -    22484847 chr4:3093879(+) A-G intron -    22484847 chr4:3094143(+) A-G intron -    22484847 chr4:3094210(+) A-G intron -    22484847 chr4:3099114(+) C-T intron -    22484847 chr4:3106081(+) A-G intron -    22484847 chr4:3106082(+) A-G intron -    22484847 chr4:3106108(+) A-G intron -    22484847 chr4:3107920(+) A-T intron -    22484847 chr4:3110515(+) A-G intron -    22484847 chr4:3110544(+) A-G intron -    22484847 chr4:3110997(+) A-G intron -    22484847 chr4:3111049(+) G-A intron -    22484847 chr4:3111071(+) A-G intron -    22484847 chr4:3111079(+) A-G intron -    22484847 chr4:3111181(+) A-G intron -    22484847 chr4:3111186(+) A-G intron -    22484847 chr4:3123421(+) C-A intron -    22484847 chr4:3129436(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129529(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129537(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129540(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129544(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129597(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129633(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129729(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129753(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129799(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129817(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129825(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129826(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129834(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129843(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129849(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129857(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129860(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129869(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129880(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129882(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129903(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129907(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129922(+) A-G intron -    22484847 chr4:3129925(+) A-G intron -    22484847 chr4:3138656(+) A-T intron -    22484847 chr4:3138668(+) A-G intron -    22484847 chr4:3138685(+) A-G intron -    22484847 chr4:3138734(+) A-G intron -    22484847 chr4:3138735(+) A-G intron -    22484847 chr4:3138752(+) A-G intron -    22484847 chr4:3138800(+) A-G intron -    22484847 chr4:3138818(+) A-G intron -    22484847 chr4:3138824(+) A-G intron -    22484847 chr4:3138832(+) A-G intron -    22484847 chr4:3138837(+) A-G intron -    22484847 chr4:3138894(+) A-G intron -    22484847 chr4:3138895(+) A-G intron -    22484847 chr4:3139196(+) T-C intron -    22484847 chr4:3139197(+) T-G intron -    22484847 chr4:3139216(+) A-G intron -    22484847 chr4:3139261(+) A-G intron -    22484847 chr4:3139270(+) A-G intron -    22484847 chr4:3139306(+) A-G intron -    22484847 chr4:3139315(+) A-G intron -    22484847 chr4:3139341(+) A-G intron -    22484847 chr4:3139346(+) A-G intron -    22484847 chr4:3140375(+) A-G intron -    22484847 chr4:3140420(+) A-G intron -    22484847 chr4:3140464(+) A-G intron -    22484847 chr4:3140523(+) A-G intron -    22484847 chr4:3140560(+) A-G intron -    22484847 chr4:3140976(+) A-G intron -    22484847 chr4:3141042(+) A-G intron -    22484847 chr4:3141050(+) A-G intron -    22484847 chr4:3141064(+) A-G intron -    22484847 chr4:3141086(+) G-A intron -    22484847 chr4:3141186(+) A-G intron -    22484847 chr4:3141738(+) A-G intron -    22484847 chr4:3141823(+) A-G intron -    22484847 chr4:3141829(+) A-G intron -    22484847 chr4:3141841(+) A-G intron -    22484847 chr4:3141920(+) A-G intron -    22484847 chr4:3141986(+) T-A intron -    22484847 chr4:3141987(+) C-A intron -    22484847 chr4:3144908(+) A-G intron -    22484847 chr4:3144909(+) A-G intron -    22484847 chr4:3144925(+) A-G intron -    22484847 chr4:3144930(+) A-G intron -    22484847 chr4:3144999(+) A-G intron -    22484847 chr4:3145431(+) A-G intron -    22484847 chr4:3145448(+) A-G intron -    22484847 chr4:3145504(+) A-G intron -    22484847 chr4:3145513(+) A-G intron -    22484847 chr4:3145519(+) A-G intron -    22484847 chr4:3145558(+) A-G intron -    22484847 chr4:3145592(+) A-G intron -    22484847 chr4:3145604(+) A-G intron -    22484847 chr4:3150107(+) A-G intron -    22484847 chr4:3150142(+) A-G intron -    22484847 chr4:3150378(+) A-G intron -    22484847 chr4:3150537(+) A-G intron -    22484847 chr4:3150628(+) A-G intron -    22484847 chr4:3151094(+) A-G intron -    22484847 chr4:3151099(+) A-G intron -    22484847 chr4:3151124(+) A-G intron -    22484847 chr4:3151125(+) A-G intron -    22484847 chr4:3151126(+) A-G intron -    22484847 chr4:3151129(+) A-G intron -    22484847 chr4:3151174(+) A-G intron -    22484847 chr4:3151255(+) A-G intron -    22484847 chr4:3151309(+) A-G intron -    22484847 chr4:3152500(+) A-G intron -    22484847 chr4:3152509(+) A-G intron -    22484847 chr4:3153729(+) A-G intron -    22484847 chr4:3153748(+) A-G intron -    22484847 chr4:3153772(+) A-G intron -    22484847 chr4:3153794(+) A-G intron -    22484847 chr4:3153796(+) A-G intron -    22484847 chr4:3153844(+) G-T intron -    22484847 chr4:3153845(+) A-G intron -    22484847 chr4:3153847(+) A-G intron -    22484847 chr4:3153895(+) A-G intron -    22484847 chr4:3153906(+) A-G intron -    22484847 chr4:3153955(+) A-G intron -    22484847 chr4:3153965(+) A-G intron -    22484847 chr4:3153967(+) A-G intron -    22484847 chr4:3154027(+) A-G intron -    22484847 chr4:3154099(+) A-G intron -    22484847 chr4:3155394(+) A-G intron -    22484847 chr4:3155403(+) A-G intron -    22484847 chr4:3170468(+) A-G intron -    22484847 chr4:3170870(+) T-C intron -    22484847 chr4:3184633(+) A-G intron -    22484847 chr4:3184852(+) A-G intron -    22484847 chr4:3187490(+) A-G intron -    22484847 chr4:3187519(+) A-G intron -    22484847 chr4:3187534(+) A-G intron -    22484847 chr4:3188782(+) T-C intron -    22484847 chr4:3191636(+) A-G intron -    22484847 chr4:3191857(+) A-G intron -    22484847 chr4:3191901(+) A-G intron -    22484847 chr4:3192195(+) A-G intron -    22484847 chr4:3192910(+) T-C intron -    22484847 chr4:3192925(+) A-G intron -    22484847 chr4:3193001(+) A-G intron -    22484847 chr4:3193066(+) A-G intron -    22484847 chr4:3193067(+) A-G intron -    22484847 chr4:3193108(+) A-G intron -    22484847 chr4:3193987(+) A-G intron -    22484847 chr4:3193990(+) A-G intron -    22484847 chr4:3194033(+) A-G intron -    22484847 chr4:3194039(+) A-G intron -    22484847 chr4:3198227(+) A-G intron -    22484847 chr4:3198275(+) A-G intron -    22484847 chr4:3200014(+) A-G intron -    22484847 chr4:3200052(+) A-G intron -    22484847 chr4:3200161(+) A-G intron -    22484847 chr4:3203094(+) G-A intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	HTT	chr4:3127324-3127325(+) Gm CDS       - chr4:3129078-3129079(+) m6A CDS       - chr4:3129110-3129111(+) m6A CDS       - chr4:3129227-3129228(+) m6A CDS       - chr4:3129241-3129242(+) m6A CDS       - chr4:3129277-3129278(+) m6A CDS       - chr4:3129317-3129318(+) m6A CDS       - chr4:3130107-3130108(+) m6A exon//intron       - chr4:3131641-3131642(+) m6A exon//intron       - chr4:3131708-3131709(+) Am CDS//exon       - chr4:3174093-3174094(+) m6A CDS//exon       - chr4:3174643-3174644(+) m6A CDS//exon       - chr4:3174659-3174660(+) m6A CDS//exon       - chr4:3225136-3225137(+) m6A CDS//exon       - chr4:3225147-3225148(+) m6A CDS//exon       - chr4:3231714-3231715(+) Y CDS//exon       26075521 chr4:3237433-3237434(+) m6A CDS//exon       24284625 chr4:3240256-3240257(+) m6A CDS//exon       - chr4:3240265-3240266(+) m6A CDS//exon       - chr4:3240590-3240591(+) m6A CDS//exon       24284625 chr4:3241622-3241623(+) m6A CDS//exon       24284625//22608085 chr4:3241646-3241647(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//22608085 chr4:3241656-3241657(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//22608085 chr4:3241803-3241804(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr4:3242609-3242610(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863 chr4:3242616-3242617(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863 chr4:3242705-3242706(+) m6A 3'UTR//exon       25456834 chr4:3243362-3243363(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863 chr4:3243386-3243387(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863 chr4:3243446-3243447(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863 chr4:3243568-3243569(+) m6A 3'UTR//exon       24284625 chr4:3244138-3244139(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085 chr4:3244235-3244236(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863//22608085 chr4:3244265-3244266(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863//22608085 chr4:3244369-3244370(+) m6A 3'UTR//exon       24209618//25456834//24981863//22608085 chr4:3244709-3244710(+) m6A 3'UTR//exon       - chr4:3244720-3244721(+) m6A 3'UTR//exon       - chr4:3244763-3244764(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr4:3244821-3244822(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr4:3244879-3244880(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863 chr4:3244917-3244918(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863 chr4:3245013-3245014(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834 chr4:3245064-3245065(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//22608085 chr4:3245071-3245072(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//22608085 chr4:3245094-3245095(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//22608085 chr4:3245165-3245166(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//22608085 chr4:3245197-3245198(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr4:3245424-3245425(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//22608085 chr4:3245504-3245505(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr4:3245575-3245576(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//22608085 chr4:3245605-3245606(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//22608085 chr4:3245645-3245646(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863 chr4:3245680-3245681(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	HTT	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Colon cancer cells     24393600 Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART17-5p
Interactor2: HTT

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg