Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00363444

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART16:           RUFY3:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol ebv-miR-BART16 RUFY3
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0003714 22902
Organism Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - RIPX//SINGAR1//ZFYVE30

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR RUFY3
chr4:71653174(+) A-I      intronic
chr4:71653044(+) A-I      intronic
chr4:71652996(+) A-I      intronic
chr4:71651532(+) A-I      intronic
chr4:71651528(+) A-I      intronic
chr4:71651502(+) A-I      intronic
chr4:71648531(+) A-I      intronic
chr4:71648509(+) A-I      intronic
chr4:71648501(+) A-I      intronic
chr4:71648472(+) A-I      intronic
chr4:71648471(+) A-I      intronic
chr4:71648468(+) A-I      intronic
chr4:71648465(+) A-I      intronic
chr4:71648380(+) A-I      intronic
chr4:71648375(+) A-I      intronic
chr4:71648372(+) A-I      intronic
chr4:71648276(+) A-I      intronic
chr4:71648274(+) A-I      intronic
chr4:71648185(+) A-I      intronic
chr4:71646992(+) A-I      intronic
chr4:71646991(+) A-I      intronic
chr4:71646972(+) A-I      intronic
chr4:71646928(+) A-I      intronic
chr4:71646093(+) A-I      intronic
chr4:71634949(+) A-I      intronic
chr4:71631660(+) A-I      intronic
chr4:71631641(+) A-I      intronic
chr4:71631621(+) A-I      intronic
chr4:71631560(+) A-I      intronic
chr4:71630653(+) A-I      intronic
chr4:71630631(+) A-I      intronic
chr4:71621561(+) A-I      intronic
chr4:71621547(+) A-I      intronic
chr4:71621534(+) A-I      intronic
chr4:71621466(+) A-I      intronic
chr4:71621465(+) A-I      intronic
chr4:71621457(+) A-I      intronic
chr4:71612211(+) A-I      intronic
chr4:71612174(+) A-I      intronic
chr4:71611923(+) A-I      intronic
chr4:71611885(+) A-I      intronic
chr4:71611884(+) A-I      intronic
chr4:71610179(+) A-I      intronic
chr4:71610154(+) A-I      intronic
chr4:71610153(+) A-I      intronic
chr4:71610152(+) A-I      intronic
chr4:71603813(+) A-I      intronic
chr4:71603611(+) A-I      intronic
chr4:71603586(+) A-I      intronic
chr4:71603565(+) A-I      intronic
chr4:71601716(+) A-I      intronic
chr4:71601662(+) A-I      intronic
chr4:71601660(+) A-I      intronic
chr4:71601630(+) A-I      intronic
chr4:71601601(+) A-I      intronic
chr4:71601598(+) A-I      intronic
chr4:71601590(+) A-I      intronic
chr4:71601585(+) A-I      intronic
chr4:71601584(+) A-I      intronic
chr4:71601566(+) A-I      intronic
chr4:71601484(+) A-I      intronic
chr4:71601430(+) A-I      intronic
chr4:71601329(+) A-I      intronic
chr4:71597520(+) A-I      intronic
chr4:71596390(+) A-I      intronic
chr4:71596342(+) A-I      intronic
chr4:71596254(+) A-I      intronic
chr4:71596246(+) A-I      intronic
chr4:71595801(+) A-I      intronic
chr4:71595751(+) A-I      intronic
chr4:71595716(+) A-I      intronic
chr4:71595210(+) A-I      intronic
chr4:71595131(+) A-I      intronic
chr4:71595115(+) A-I      intronic
chr4:71595113(+) A-I      intronic
chr4:71595103(+) A-I      intronic
chr4:71664424(+) A-I      intronic
chr4:71594999(+) A-I      intronic
chr4:71593410(+) A-I      intronic
chr4:71593393(+) A-I      intronic
chr4:71593384(+) A-I      intronic
chr4:71664448(+) A-I      intronic
chr4:71664756(+) A-I      intronic
chr4:71664783(+) A-I      intronic
chr4:71664787(+) A-I      intronic
chr4:71664807(+) A-I      intronic
chr4:71669265(+) A-I      intronic
chr4:71669274(+) A-I      intronic
chr4:71670437(+) A-I      intronic
chr4:71670447(+) A-I      intronic
chr4:71593202(+) A-I      intronic
chr4:71593142(+) A-I      intronic
chr4:71595043(+) A-I      intronic
chr4:71586909(+) A-I      intronic
chr4:71586908(+) A-I      intronic
chr4:71586882(+) A-I      intronic
chr4:71586879(+) A-I      intronic
chr4:71586878(+) A-I      intronic
chr4:71586873(+) A-I      intronic
chr4:71586853(+) A-I      intronic
chr4:71586842(+) A-I      intronic
chr4:71586833(+) A-I      intronic
chr4:71586827(+) A-I      intronic
chr4:71586822(+) A-I      intronic
chr4:71586792(+) A-I      intronic
chr4:71586784(+) A-I      intronic
chr4:71586091(+) A-I      intronic
chr4:71585986(+) A-I      intronic
chr4:71585908(+) A-I      intronic
chr4:71585902(+) A-I      intronic
chr4:71584535(+) A-I      intronic
chr4:71584504(+) A-I      intronic
chr4:71583843(+) A-I      intronic
chr4:71583839(+) A-I      intronic
chr4:71583822(+) A-I      intronic
chr4:71583807(+) A-I      intronic
chr4:71583799(+) A-I      intronic
chr4:71583785(+) A-I      intronic
chr4:71583704(+) A-I      intronic
chr4:71583680(+) A-I      intronic
chr4:71583862(+) A-I      intronic
chr4:71585886(+) A-I      intronic
chr4:71585894(+) A-I      intronic
chr4:71585895(+) A-I      intronic
chr4:71586914(+) A-I      intronic
chr4:71586963(+) A-I      intronic
chr4:71595779(+) A-I      intronic
chr4:71595781(+) A-I      intronic
chr4:71595793(+) A-I      intronic
chr4:71605593(+) A-I      intronic
chr4:71583631(+) A-I      intronic
chr4:71582514(+) A-I      intronic
chr4:71582482(+) A-I      intronic
chr4:71582430(+) A-I      intronic
chr4:71582405(+) A-I      intronic
chr4:71582402(+) A-I      intronic
chr4:71582390(+) A-I      intronic
chr4:71582362(+) A-I      intronic
chr4:71582351(+) A-I      intronic
chr4:71582336(+) A-I      intronic
chr4:71582297(+) A-I      intronic
chr4:71582139(+) A-I      intronic
chr4:71582124(+) A-I      intronic
chr4:71582029(+) A-I      intronic
chr4:71581924(+) A-I      intronic
chr4:71581815(+) A-I      intronic
chr4:71581720(+) A-I      intronic
chr4:71581668(+) A-I      intronic
chr4:71581628(+) A-I      intronic
chr4:71581606(+) A-I      intronic
chr4:71581575(+) A-I      intronic
chr4:71581141(+) A-I      intronic
chr4:71581054(+) A-I      intronic
chr4:71578974(+) A-I      intronic
chr4:71578923(+) A-I      intronic
chr4:71605629(+) A-I      intronic
chr4:71605636(+) A-I      intronic
chr4:71605658(+) A-I      intronic
chr4:71653154(+) A-I      intronic
chr4:71578925(+) A-I      intronic
chr4:71653183(+) A-I      intronic
chr4:71653817(+) A-I      intronic
chr4:71653848(+) A-I      intronic
chr4:71578898(+) A-I      intronic
chr4:71578886(+) A-I      intronic
chr4:71578840(+) A-I      intronic
chr4:71578805(+) A-I      intronic
chr4:71578771(+) A-I      intronic
chr4:71578759(+) A-I      intronic
chr4:71576956(+) A-I      intronic
chr4:71576885(+) A-I      intronic
chr4:71576783(+) A-I      intronic
chr4:71576694(+) A-I      intronic
chr4:71576671(+) A-I      intronic
chr4:71576667(+) A-I      intronic
chr4:71576662(+) A-I      intronic
chr4:71576332(+) A-I      intronic
chr4:71576198(+) A-I      intronic
chr4:71576173(+) A-I      intronic
chr4:71574692(+) A-I      intronic
chr4:71574668(+) A-I      intronic
chr4:71574664(+) A-I      intronic
chr4:71574542(+) A-I      intronic
chr4:71574499(+) A-I      intronic
chr4:71574152(+) A-I      intronic
chr4:71574107(+) A-I      intronic
chr4:71574075(+) A-I      intronic
chr4:71574072(+) A-I      intronic
chr4:71574028(+) A-I      intronic
chr4:71574018(+) A-I      intronic
chr4:71574015(+) A-I      intronic
chr4:71573989(+) A-I      intronic
chr4:71573982(+) A-I      intronic
chr4:71573963(+) A-I      intronic
chr4:71573953(+) A-I      intronic
chr4:71573944(+) A-I      intronic
chr4:71573939(+) A-I      intronic
chr4:71573937(+) A-I      intronic
chr4:71573921(+) A-I      intronic
chr4:71573915(+) A-I      intronic
chr4:71573215(+) A-I      intronic
chr4:71573210(+) A-I      intronic
chr4:71573198(+) A-I      intronic
chr4:71573153(+) A-I      intronic
chr4:71573076(+) A-I      intronic
chr4:71573056(+) A-I      intronic
chr4:71573050(+) A-I      intronic
chr4:71653851(+) A-I      intronic
chr4:71586993(+) A-I      intronic
chr4:71662713(+) A-I      intronic
chr4:71670591(+) A-I      intronic
chr4:71670498(+) A-I      intronic
chr4:71670457(+) A-I      intronic
chr4:71670449(+) A-I      intronic
chr4:71670431(+) A-I      intronic
chr4:71662719(+) A-I      intronic
chr4:71662762(+) A-I      intronic
chr4:71662807(+) A-I      intronic
chr4:71662810(+) A-I      intronic
chr4:71662813(+) A-I      intronic
chr4:71662815(+) A-I      intronic
chr4:71662936(+) A-I      intronic
chr4:71663413(+) A-I      intronic
chr4:71663488(+) A-I      intronic
chr4:71670396(+) A-I      intronic
chr4:71663927(+) A-I      intronic
chr4:71663906(+) A-I      intronic
chr4:71663899(+) A-I      intronic
chr4:71663878(+) A-I      intronic
chr4:71663516(+) A-I      intronic
chr4:71663466(+) A-I      intronic
chr4:71663456(+) A-I      intronic
chr4:71663376(+) A-I      intronic
chr4:71663364(+) A-I      intronic
chr4:71663359(+) A-I      intronic
chr4:71663353(+) A-I      intronic
chr4:71663312(+) A-I      intronic
chr4:71663284(+) A-I      intronic
chr4:71662921(+) A-I      intronic
chr4:71662895(+) A-I      intronic
chr4:71662894(+) A-I      intronic
chr4:71662881(+) A-I      intronic
chr4:71662845(+) A-I      intronic
chr4:71662805(+) A-I      intronic
chr4:71662708(+) A-I      intronic
chr4:71662691(+) A-I      intronic
chr4:71662685(+) A-I      intronic
chr4:71662680(+) A-I      intronic
chr4:71661831(+) A-I      intronic
chr4:71664020(+) A-I      intronic
chr4:71664027(+) A-I      intronic
chr4:71664038(+) A-I      intronic
chr4:71664372(+) A-I      intronic
chr4:71664376(+) A-I      intronic
chr4:71664378(+) A-I      intronic
chr4:71664379(+) A-I      intronic
chr4:71664388(+) A-I      intronic
chr4:71664406(+) A-I      intronic
chr4:71661828(+) A-I      intronic
chr4:71661822(+) A-I      intronic
chr4:71661818(+) A-I      intronic
chr4:71660237(+) A-I      intronic
chr4:71660187(+) A-I      intronic
chr4:71660183(+) A-I      intronic
chr4:71660178(+) A-I      intronic
chr4:71660127(+) A-I      intronic
chr4:71660122(+) A-I      intronic
chr4:71660064(+) A-I      intronic
chr4:71653881(+) A-I      intronic
chr4:71653859(+) A-I      intronic
chr4:71653855(+) A-I      intronic
chr4:71653757(+) A-I      intronic
chr4:71653749(+) A-I      intronic
chr4:71653157(+) A-I      intronic
chr4:71653136(+) A-I      intronic
chr4:71673486(+) A-I      3'UTR
chr4:71673456(+) A-I      3'UTR
chr4:71673339(+) A-I      3'UTR
chr4:71673256(+) A-I      3'UTR
chr4:71673312(+) A-I      3'UTR
chr4:71673338(+) A-I      3'UTR
chr4:71673343(+) A-I      3'UTR
chr4:71673261(+) A-I      3'UTR
chr4:71673293(+) A-I      3'UTR
chr4:71673301(+) A-I      3'UTR
chr4:71673375(+) A-I      3'UTR
chr4:71673364(+) A-I      3'UTR
chr4:71673305(+) A-I      3'UTR
chr4:71673493(+) A-I      3'UTR
chr4:71673465(+) A-I      3'UTR
chr4:71663358(+) A-I      intronic
chr4:71578821(+) A-I      intronic
chr4:71646947(+) A-I      intronic
chr4:71581091(+) A-I      intronic
chr4:71653240(+) A-I      intronic
chr4:71663328(+) A-I      intronic
chr4:71654008(+) A-I      intronic
chr4:71662928(+) A-I      intronic
chr4:71586918(+) A-I      intronic
chr4:71663350(+) A-I      intronic
chr4:71574006(+) A-I      intronic
chr4:71663266(+) A-I      intronic
chr4:71578870(+) A-I      intronic
chr4:71581125(+) A-I      intronic
chr4:71574716(+) A-I      intronic
chr4:71669403(+) A-I      intronic
chr4:71581679(+) A-I      intronic
chr4:71652637(+) A-I      intronic
chr4:71615466(+) A-I      intronic
chr4:71602518(+) A-I      intronic
chr4:71595826(+) A-I      intronic
chr4:71646271(+) A-I      intronic
chr4:71643797(+) A-I      intronic
chr4:71583861(+) A-I      intronic
chr4:71581962(+) A-I      intronic
chr4:71581559(+) A-I      intronic
chr4:71576950(+) A-I      intronic
chr4:71582115(+) A-I      intronic
chr4:71574600(+) A-I      intronic
chr4:71663963(+) A-I      intronic
chr4:71574507(+) A-I      intronic
chr4:71576866(+) A-I      intronic
chr4:71596325(+) A-I      intronic
chr4:71669250(+) A-I      intronic
chr4:71662843(+) A-I      intronic
chr4:71611617(+) A-I      intronic
chr4:71624644(+) A-I      intronic
chr4:71592149(+) A-I      intronic
chr4:71670385(+) A-I      intronic
chr4:71601796(+) A-I      intronic
chr4:71596178(+) A-I      intronic
chr4:71661837(+) A-I      intronic
chr4:71605660(+) A-I      intronic
chr4:71664352(+) A-I      intronic
chr4:71595670(+) A-I      intronic
chr4:71662725(+) A-I      intronic
chr4:71664613(+) A-I      intronic
chr4:71586775(+) A-I      intronic
chr4:71663829(+) A-I      intronic
chr4:71662775(+) A-I      intronic
chr4:71669240(+) A-I      intronic
chr4:71648287(+) A-I      intronic
chr4:71623236(+) A-I      intronic
chr4:71662860(+) A-I      intronic
chr4:71582037(+) A-I      intronic
chr4:71634810(+) A-I      intronic
chr4:71601518(+) A-I      intronic
chr4:71581115(+) A-I      intronic
chr4:71670570(+) A-I      intronic
chr4:71663505(+) A-I      intronic
chr4:71581619(+) A-I      intronic
chr4:71664812(+) A-I      intronic
chr4:71662737(+) A-I      intronic
chr4:71586931(+) A-I      intronic
chr4:71670548(+) A-I      intronic
chr4:71651291(+) A-I      intronic
chr4:71584612(+) A-I      intronic
chr4:71602345(+) A-I      intronic
chr4:71582106(+) A-I      intronic
chr4:71596450(+) A-I      intronic
chr4:71586776(+) A-I      intronic
chr4:71664691(+) A-I      intronic
chr4:71641621(+) A-I      intronic
chr4:71583876(+) A-I      intronic
chr4:71664011(+) A-I      intronic
chr4:71601528(+) A-I      intronic
chr4:71662722(+) A-I      intronic
chr4:71651268(+) A-I      intronic
chr4:71582002(+) A-I      intronic
chr4:71573797(+) A-I      intronic
chr4:71601594(+) A-I      intronic
chr4:71582408(+) A-I      intronic
chr4:71582028(+) A-I      intronic
chr4:71669459(+) A-I      intronic
chr4:71663882(+) A-I      intronic
chr4:71581671(+) A-I      intronic
chr4:71586999(+) A-I      intronic
chr4:71573077(+) A-I      intronic
chr4:71576299(+) A-I      intronic
chr4:71582360(+) A-I      intronic
chr4:71663445(+) A-I      intronic
chr4:71603664(+) A-I      intronic
chr4:71573093(+) A-I      intronic
chr4:71663440(+) A-I      intronic
chr4:71583729(+) A-I      intronic
chr4:71669349(+) A-I      intronic
chr4:71574660(+) A-I      intronic
chr4:71673368(+) A-I      3'UTR
chr4:71673406(+) A-I      3'UTR
chr4:71673296(+) A-I      3'UTR
chr4:71673351(+) A-I      3'UTR
chr4:71673307(+) A-I      3'UTR
chr4:71673491(+) A-I      3'UTR
chr4:71673302(+) A-I      3'UTR
chr4:71586937(+) A-I      intronic
chr4:71581963(+) A-I      intronic
chr4:71663881(+) A-I      intronic
chr4:71601756(+) A-I      intronic
chr4:71593357(+) A-I      intronic
chr4:71662934(+) A-I      intronic
chr4:71624634(+) A-I      intronic
chr4:71576936(+) A-I      intronic
chr4:71605587(+) A-I      intronic
chr4:71581670(+) A-I      intronic
chr4:71581980(+) A-I      intronic
chr4:71663903(+) A-I      intronic
chr4:71662799(+) A-I      intronic
chr4:71635644(+) A-I      intronic
chr4:71601325(+) A-I      intronic
chr4:71596194(+) A-I      intronic
chr4:71582410(+) A-I      intronic
chr4:71647076(+) A-I      intronic
chr4:71664752(+) A-I      intronic
chr4:71584564(+) A-I      intronic
chr4:71604264(+) A-I      intronic
chr4:71603491(+) A-I      intronic
chr4:71646766(+) A-I      intronic
chr4:71586991(+) A-I      intronic
chr4:71605633(+) A-I      intronic
chr4:71581144(+) A-I      intronic
chr4:71581143(+) A-I      intronic
chr4:71647019(+) A-I      intronic
chr4:71601805(+) A-I      intronic
chr4:71663510(+) A-I      intronic
chr4:71634962(+) A-I      intronic
chr4:71579001(+) A-I      intronic
chr4:71573001(+) A-I      intronic
chr4:71601527(+) A-I      intronic
chr4:71578993(+) A-I      intronic
chr4:71573037(+) A-I      intronic
chr4:71638478(+) A-I      intronic
chr4:71581658(+) A-I      intronic
chr4:71612103(+) A-I      intronic
chr4:71660223(+) A-I      intronic
chr4:71663409(+) A-I      intronic
chr4:71581967(+) A-I      intronic
chr4:71663329(+) A-I      intronic
chr4:71584616(+) A-I      intronic
chr4:71584712(+) A-I      intronic
chr4:71635643(+) A-I      intronic
chr4:71581664(+) A-I      intronic
chr4:71576524(+) A-I      intronic
chr4:71573755(+) A-I      intronic
chr4:71597451(+) A-I      intronic
chr4:71664846(+) A-I      intronic
chr4:71633735(+) A-I      intronic
chr4:71664266(+) A-I      intronic
chr4:71663300(+) A-I      intronic
chr4:71582414(+) A-I      intronic
chr4:71652806(+) A-I      intronic
chr4:71661762(+) A-I      intronic
chr4:71581992(+) A-I      intronic
chr4:71583874(+) A-I      intronic
chr4:71624741(+) A-I      intronic
chr4:71669195(+) A-I      intronic
chr4:71595832(+) A-I      intronic
chr4:71597308(+) A-I      intronic
chr4:71582319(+) A-I      intronic
chr4:71663374(+) A-I      intronic
chr4:71576910(+) A-I      intronic
chr4:71663875(+) A-I      intronic
chr4:71576132(+) A-I      intronic
chr4:71573143(+) A-I      intronic
chr4:71608969(+) A-I      intronic
chr4:71582457(+) A-I      intronic
chr4:71651439(+) A-I      intronic
chr4:71583739(+) A-I      intronic
chr4:71635563(+) A-I      intronic
chr4:71669304(+) A-I      intronic
chr4:71584572(+) A-I      intronic
chr4:71662732(+) A-I      intronic
chr4:71605585(+) A-I      intronic
chr4:71573712(+) A-I      intronic
chr4:71593203(+) A-I      intronic
chr4:71646244(+) A-I      intronic
chr4:71601387(+) A-I      intronic
chr4:71663992(+) A-I      intronic
chr4:71612145(+) A-I      intronic
chr4:71594997(+) A-I      intronic
chr4:71663395(+) A-I      intronic
chr4:71581051(+) A-I      intronic
chr4:71663835(+) A-I      intronic
chr4:71610186(+) A-I      intronic
chr4:71595243(+) A-I      intronic
chr4:71581669(+) A-I      intronic
chr4:71582048(+) A-I      intronic
chr4:71582092(+) A-I      intronic
chr4:71611574(+) A-I      intronic
chr4:71596472(+) A-I      intronic
chr4:71578873(+) A-I      intronic
chr4:71573950(+) A-I      intronic
chr4:71601382(+) A-I      intronic
chr4:71663384(+) A-I      intronic
chr4:71653196(+) A-I      intronic
chr4:71611545(+) A-I      intronic
chr4:71663934(+) A-I      intronic
chr4:71576679(+) A-I      intronic
chr4:71662711(+) A-I      intronic
chr4:71662721(+) A-I      intronic
chr4:71663979(+) A-I      intronic
chr4:71663923(+) A-I      intronic
chr4:71573743(+) A-I      intronic
chr4:71584599(+) A-I      intronic
chr4:71586940(+) A-I      intronic
chr4:71663429(+) A-I      intronic
chr4:71635639(+) A-I      intronic
chr4:71586935(+) A-I      intronic
chr4:71598641(+) A-I      intronic
chr4:71662823(+) A-I      intronic
chr4:71578975(+) A-I      intronic
chr4:71663439(+) A-I      intronic
chr4:71574727(+) A-I      intronic
chr4:71664041(+) A-I      intronic
chr4:71573765(+) A-I      intronic
chr4:71646116(+) A-I      intronic
chr4:71630727(+) A-I      intronic
chr4:71582097(+) A-I      intronic
chr4:71594993(+) A-I      intronic
chr4:71573105(+) A-I      intronic
chr4:71630732(+) A-I      intronic
chr4:71634963(+) A-I      intronic
chr4:71652723(+) A-I      intronic
chr4:71621588(+) A-I      intronic
chr4:71601804(+) A-I      intronic
chr4:71576648(+) A-I      intronic
chr4:71601551(+) A-I      intronic
chr4:71586819(+) A-I      intronic
chr4:71635561(+) A-I      intronic
chr4:71670551(+) A-I      intronic
chr4:71610846(+) A-I      intronic
chr4:71664265(+) A-I      intronic
chr4:71582441(+) A-I      intronic
chr4:71586998(+) A-I      intronic
chr4:71581180(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED RUFY3
chr4:71663300(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr4:71663306(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr4:71663307(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr4:71663351(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr4:71663374(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr4:71663384(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr4:71663429(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr4:71663440(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr4:71663481(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr4:71663505(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr4:71663510(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr4:71663544(+) A-I intron -    15342557   //15258596
chr4:71664846(+) A-I intron -    15258596
chr4:71574661(+) A-I intron -    22327324
chr4:71662722(+) A-I intron -    22327324
chr4:71663822(+) A-I intron -    21960545   //22327324
chr4:71663903(+) A-I intron -    21960545   //22327324
chr4:71662843(+) A-I intron -    21960545
chr4:71662860(+) A-I intron -    21960545
chr4:71663920(+) A-I intron -    21960545
chr4:71664041(+) A-I intron -    21960545
chr4:71673406(+) A-I intron -    21960545
chr4:71663936(+) A-I intron -    21960545

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase RUFY3
chr4:71570662-71570663(+) m6A CDS//intron       24209618
chr4:71570768-71570769(+) m6A CDS//intron       24209618
chr4:71628322-71628323(+) m6A CDS       -
chr4:71628333-71628334(+) m6A CDS       -
chr4:71628395-71628396(+) m6A CDS       -
chr4:71629276-71629277(+) m6A CDS       -
chr4:71629287-71629288(+) m6A CDS       -
chr4:71629317-71629318(+) m6A CDS       -
chr4:71634364-71634365(+) m6A CDS       27773535
chr4:71634370-71634371(+) m6A CDS       27773535
chr4:71639267-71639268(+) m6A CDS       27773535
chr4:71640910-71640911(+) m6A CDS       24981863//27773535
chr4:71640919-71640920(+) m6A CDS       24981863//27773535
chr4:71640932-71640933(+) m6A CDS       24981863//27773535
chr4:71640937-71640938(+) m6A CDS       24981863//27773535
chr4:71644096-71644097(+) m6A CDS       24981863//27773535
chr4:71644142-71644143(+) m6A CDS       24981863//27773535
chr4:71648820-71648821(+) m6A CDS       24981863//27773535
chr4:71650525-71650526(+) m6A CDS       24981863//27773535
chr4:71650530-71650531(+) m6A CDS       24981863//27773535
chr4:71650581-71650582(+) m6A CDS       24981863//27773535
chr4:71654536-71654537(+) m6A CDS       24981863
chr4:71655294-71655295(+) m6A CDS       22608085
chr4:71655303-71655304(+) m6A CDS       22608085
chr4:71655334-71655335(+) m6A 3'UTR//intron       22608085
chr4:71655424-71655425(+) m6A 3'UTR//intron       22608085
chr4:71659542-71659543(+) m6A CDS//intron       -
chr4:71659558-71659559(+) m6A CDS//intron       -
chr4:71659563-71659564(+) m6A CDS//intron       -
chr4:71659572-71659573(+) m6A CDS//intron       24981863
chr4:71660431-71660432(+) m6A exon//intron       -
chr4:71665400-71665401(+) m6A exon//intron       22608085
chr4:71672245-71672246(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       22608085
chr4:71672256-71672257(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//22608085
chr4:71672285-71672286(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085
chr4:71672377-71672378(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr4:71672390-71672391(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr4:71672396-71672397(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate RUFY3
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: ebv-miR-BART16
Interactor2: RUFY3

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//PITA
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...