Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00358917

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART15:  MIMAT0003713          OSBPL3:  NR_104111     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART15	OSBPL3
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003713	26031
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	ORP-3//ORP3//OSBP3

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	OSBPL3	chr7:24852621(-) A-I      intronic chr7:24852658(-) A-I      intronic chr7:24858680(-) A-I      intronic chr7:24840214(-) A-I      intronic chr7:24840711(-) A-I      intronic chr7:24906222(-) A-I      intronic chr7:24840825(-) A-I      intronic chr7:24840858(-) A-I      intronic chr7:24877980(-) A-I      intronic chr7:24877967(-) A-I      intronic chr7:24877966(-) A-I      intronic chr7:24877946(-) A-I      intronic chr7:24877935(-) A-I      intronic chr7:24877923(-) A-I      intronic chr7:24877898(-) A-I      intronic chr7:24877897(-) A-I      intronic chr7:24982079(-) A-I      intronic chr7:24877856(-) A-I      intronic chr7:24877112(-) A-I      intronic chr7:24876992(-) A-I      intronic chr7:25005346(-) A-I      intronic chr7:24845652(-) A-I      intronic chr7:24949657(-) A-I      intronic chr7:24876614(-) A-I      intronic chr7:24868179(-) A-I      intronic chr7:24868169(-) A-I      intronic chr7:24868163(-) A-I      intronic chr7:24868044(-) A-I      intronic chr7:24868042(-) A-I      intronic chr7:24867902(-) A-I      intronic chr7:24867846(-) A-I      intronic chr7:24867746(-) A-I      intronic chr7:24861994(-) A-I      intronic chr7:24861765(-) A-I      intronic chr7:24861760(-) A-I      intronic chr7:24861616(-) A-I      intronic chr7:24858825(-) A-I      intronic chr7:24980438(-) A-I      intronic chr7:24980643(-) A-I      intronic chr7:24984241(-) A-I      intronic chr7:24858692(-) A-I      intronic chr7:25001756(-) A-I      intronic chr7:24949592(-) A-I      intronic chr7:25001846(-) A-I      intronic chr7:25001883(-) A-I      intronic chr7:24949649(-) A-I      intronic chr7:24906598(-) A-I      intronic chr7:24949543(-) A-I      intronic chr7:24949533(-) A-I      intronic chr7:24945589(-) A-I      intronic chr7:24945588(-) A-I      intronic chr7:24945564(-) A-I      intronic chr7:24945458(-) A-I      intronic chr7:24936639(-) A-I      intronic chr7:24906151(-) A-I      intronic chr7:24936615(-) A-I      intronic chr7:24936608(-) A-I      intronic chr7:24936579(-) A-I      intronic chr7:24936543(-) A-I      intronic chr7:24906603(-) A-I      intronic chr7:24876582(-) A-I      intronic chr7:24845667(-) A-I      intronic chr7:24845668(-) A-I      intronic chr7:24846955(-) A-I      intronic chr7:24847004(-) A-I      intronic chr7:24847029(-) A-I      intronic chr7:24847614(-) A-I      intronic chr7:24840618(-) A-I      intronic chr7:24847698(-) A-I      intronic chr7:24906591(-) A-I      intronic chr7:24906589(-) A-I      intronic chr7:24906587(-) A-I      intronic chr7:24906584(-) A-I      intronic chr7:24840144(-) A-I      intronic chr7:24840164(-) A-I      intronic chr7:24840204(-) A-I      intronic chr7:24840294(-) A-I      intronic chr7:24840303(-) A-I      intronic chr7:24840370(-) A-I      intronic chr7:24840610(-) A-I      intronic chr7:24840181(-) A-I      intronic chr7:24840187(-) A-I      intronic chr7:24847716(-) A-I      intronic chr7:24847775(-) A-I      intronic chr7:24949698(-) A-I      intronic chr7:24876551(-) A-I      intronic chr7:24847030(-) A-I      intronic chr7:24840605(-) A-I      intronic chr7:24878032(-) A-I      intronic chr7:24876624(-) A-I      intronic chr7:25009957(-) A-I      intronic chr7:24945432(-) A-I      intronic chr7:24840343(-) A-I      intronic chr7:24840284(-) A-I      intronic chr7:24877096(-) A-I      intronic chr7:24878015(-) A-I      intronic chr7:24877893(-) A-I      intronic chr7:24876677(-) A-I      intronic chr7:24945479(-) A-I      intronic chr7:24945483(-) A-I      intronic chr7:24945503(-) A-I      intronic chr7:24877055(-) A-I      intronic chr7:24945599(-) A-I      intronic chr7:24906077(-) A-I      intronic chr7:24852744(-) A-I      intronic chr7:24906488(-) A-I      intronic chr7:24847615(-) A-I      intronic chr7:24840667(-) A-I      intronic chr7:24840748(-) A-I      intronic chr7:24867840(-) A-I      intronic chr7:24943639(-) A-I      intronic chr7:24906198(-) A-I      intronic chr7:24936508(-) A-I      intronic chr7:24840130(-) A-I      intronic chr7:24876983(-) A-I      intronic chr7:24847699(-) A-I      intronic chr7:24867784(-) A-I      intronic chr7:24862036(-) A-I      intronic chr7:24877118(-) A-I      intronic chr7:24845714(-) A-I      intronic chr7:24847695(-) A-I      intronic chr7:24906238(-) A-I      intronic chr7:24840254(-) A-I      intronic chr7:24878028(-) A-I      intronic chr7:24840694(-) A-I      intronic chr7:24906493(-) A-I      intronic chr7:24840701(-) A-I      intronic chr7:24840797(-) A-I      intronic chr7:24936428(-) A-I      intronic chr7:24906013(-) A-I      intronic chr7:24852528(-) A-I      intronic chr7:24906557(-) A-I      intronic chr7:24840143(-) A-I      intronic chr7:24840258(-) A-I      intronic chr7:24906065(-) A-I      intronic chr7:24867782(-) A-I      intronic chr7:24868180(-) A-I      intronic chr7:24840778(-) A-I      intronic chr7:24852730(-) A-I      intronic chr7:24877049(-) A-I      intronic chr7:24840249(-) A-I      intronic chr7:24877022(-) A-I      intronic chr7:24867724(-) A-I      intronic chr7:24936470(-) A-I      intronic chr7:24876993(-) A-I      intronic chr7:24840292(-) A-I      intronic chr7:24868182(-) A-I      intronic chr7:24840252(-) A-I      intronic chr7:24906203(-) A-I      intronic chr7:24945569(-) A-I      intronic chr7:24840614(-) A-I      intronic chr7:24876561(-) A-I      intronic chr7:24906558(-) A-I      intronic chr7:24867704(-) A-I      intronic chr7:24876961(-) A-I      intronic chr7:24876633(-) A-I      intronic chr7:24906148(-) A-I      intronic chr7:25009727(-) A-I      intronic chr7:24936644(-) A-I      intronic chr7:24945641(-) A-I      intronic chr7:24877894(-) A-I      intronic chr7:24936609(-) A-I      intronic chr7:24840348(-) A-I      intronic chr7:24906177(-) A-I      intronic chr7:25009967(-) A-I      intronic chr7:24840617(-) A-I      intronic chr7:24878033(-) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	OSBPL3	chr7:24840143(-) A-I intron -    22327324 chr7:24840252(-) A-I intron -    22327324 chr7:24970285(-) A-G intron -    22484847 chr7:24970286(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840130(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840143(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840184(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840252(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840253(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840255(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840258(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840284(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840343(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840605(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840614(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840617(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840667(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840668(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840694(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840701(-) A-G intron -    22484847 chr7:24840811(-) A-G intron -    22484847 chr7:24846980(-) G-A intron -    22484847 chr7:24847030(-) A-G intron -    22484847 chr7:24847615(-) A-G intron -    22484847 chr7:24851818(-) A-G intron -    22484847 chr7:24851826(-) A-G intron -    22484847 chr7:24851843(-) A-G intron -    22484847 chr7:24852730(-) A-G intron -    22484847 chr7:24852744(-) A-G intron -    22484847 chr7:24862036(-) A-G intron -    22484847 chr7:24867704(-) A-G intron -    22484847 chr7:24867724(-) A-G intron -    22484847 chr7:24867781(-) A-G intron -    22484847 chr7:24867782(-) A-G intron -    22484847 chr7:24867784(-) A-G intron -    22484847 chr7:24867848(-) A-G intron -    22484847 chr7:24867901(-) A-G intron -    22484847 chr7:24868180(-) A-G intron -    22484847 chr7:24868182(-) A-G intron -    22484847 chr7:24876551(-) A-G intron -    22484847 chr7:24876650(-) A-G intron -    22484847 chr7:24876653(-) A-G intron -    22484847 chr7:24876677(-) A-G intron -    22484847 chr7:24876921(-) A-G intron -    22484847 chr7:24876993(-) A-G intron -    22484847 chr7:24877022(-) A-G intron -    22484847 chr7:24877049(-) A-G intron -    22484847 chr7:24877096(-) A-G intron -    22484847 chr7:24877102(-) A-G intron -    22484847 chr7:24877118(-) A-G intron -    22484847 chr7:24877885(-) G-A intron -    22484847 chr7:24877894(-) A-G intron -    22484847 chr7:24877991(-) A-G intron -    22484847 chr7:24877999(-) A-G intron -    22484847 chr7:24878015(-) A-G intron -    22484847 chr7:24878028(-) A-G intron -    22484847 chr7:24878032(-) A-G intron -    22484847 chr7:24878033(-) A-G intron -    22484847 chr7:24878053(-) A-G intron -    22484847 chr7:24881075(-) T-C intron -    22484847 chr7:24906013(-) A-G intron -    22484847 chr7:24906074(-) A-G intron -    22484847 chr7:24906077(-) A-G intron -    22484847 chr7:24906085(-) A-G intron -    22484847 chr7:24906138(-) A-G intron -    22484847 chr7:24906148(-) A-G intron -    22484847 chr7:24906177(-) A-G intron -    22484847 chr7:24906198(-) A-G intron -    22484847 chr7:24906203(-) A-G intron -    22484847 chr7:24906238(-) A-G intron -    22484847 chr7:24906267(-) A-T intron -    22484847 chr7:24906488(-) A-G intron -    22484847 chr7:24906489(-) A-G intron -    22484847 chr7:24906493(-) A-G intron -    22484847 chr7:24906557(-) A-G intron -    22484847 chr7:24906558(-) A-G intron -    22484847 chr7:24936428(-) A-G intron -    22484847 chr7:24936508(-) A-G intron -    22484847 chr7:24936609(-) A-G intron -    22484847 chr7:24945432(-) A-G intron -    22484847 chr7:24945479(-) A-G intron -    22484847 chr7:24945483(-) A-G intron -    22484847 chr7:24945488(-) A-G intron -    22484847 chr7:24945503(-) A-G intron -    22484847 chr7:24945511(-) A-G intron -    22484847 chr7:24945529(-) A-G intron -    22484847 chr7:24945569(-) A-G intron -    22484847 chr7:24945573(-) A-G intron -    22484847 chr7:24945599(-) A-G intron -    22484847 chr7:24949591(-) A-G intron -    22484847 chr7:24949671(-) A-G intron -    22484847 chr7:24949698(-) A-G intron -    22484847 chr7:24967813(-) C-A intron -    22484847 chr7:25009727(-) A-G intron -    22484847 chr7:25009729(-) A-G intron -    22484847 chr7:25017453(-) G-A intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	OSBPL3	chr7:24837877-24837878(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535 chr7:24837907-24837908(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535 chr7:24837984-24837985(-) m6A 3'UTR       27773535 chr7:24838028-24838029(-) m6A 3'UTR       27773535 chr7:24838907-24838908(-) m6A 3'UTR       27773535 chr7:24838997-24838998(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535 chr7:24839048-24839049(-) m6A 3'UTR       27773535 chr7:24874247-24874248(-) Am CDS       - chr7:24888781-24888782(-) m6A CDS//exon//intron       27773535 chr7:24888838-24888839(-) m6A exon//intron       27773535 chr7:24910384-24910385(-) m6A CDS       27773535 chr7:24911365-24911366(-) m6A CDS       27773535 chr7:24911397-24911398(-) m6A CDS       27773535 chr7:24911664-24911665(-) m6A CDS       - chr7:24932071-24932072(-) m6A CDS       - chr7:24947261-24947262(-) Cm intron       - chr7:25019536-25019537(-) m6A 5'UTR//intron       27773536 chr7:25019724-25019725(-) m6A 5'UTR//intron       24981863//27773536 chr7:25019770-25019771(-) m6A 5'UTR//intron       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	OSBPL3	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Exosome Blood     - Membrane K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART15
Interactor2: OSBPL3

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg