Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00355440

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.6040

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART14-3p:           HOOK3:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol ebv-miR-BART14-3p HOOK3
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0003426 84376
Organism Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - HK3

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR HOOK3
chr8:42830923(+) A-I      intronic
chr8:42830988(+) A-I      intronic
chr8:42831039(+) A-I      intronic
chr8:42831070(+) A-I      intronic
chr8:42831394(+) A-I      intronic
chr8:42831395(+) A-I      intronic
chr8:42831506(+) A-I      intronic
chr8:42831546(+) A-I      intronic
chr8:42831562(+) A-I      intronic
chr8:42831568(+) A-I      intronic
chr8:42831767(+) A-I      intronic
chr8:42831874(+) A-I      intronic
chr8:42831877(+) A-I      intronic
chr8:42806290(+) A-I      intronic
chr8:42831917(+) A-I      intronic
chr8:42831919(+) A-I      intronic
chr8:42831946(+) A-I      intronic
chr8:42832871(+) A-I      intronic
chr8:42832949(+) A-I      intronic
chr8:42832967(+) A-I      intronic
chr8:42833671(+) A-I      intronic
chr8:42833754(+) A-I      intronic
chr8:42834390(+) A-I      intronic
chr8:42835851(+) A-I      intronic
chr8:42835929(+) A-I      intronic
chr8:42835933(+) A-I      intronic
chr8:42836294(+) A-I      intronic
chr8:42836307(+) A-I      intronic
chr8:42836312(+) A-I      intronic
chr8:42836948(+) A-I      intronic
chr8:42836952(+) A-I      intronic
chr8:42838290(+) A-I      intronic
chr8:42838356(+) A-I      intronic
chr8:42838366(+) A-I      intronic
chr8:42838398(+) A-I      intronic
chr8:42839310(+) A-I      intronic
chr8:42839325(+) A-I      intronic
chr8:42839816(+) A-I      intronic
chr8:42806260(+) A-I      intronic
chr8:42839962(+) A-I      intronic
chr8:42842152(+) A-I      intronic
chr8:42842155(+) A-I      intronic
chr8:42842158(+) A-I      intronic
chr8:42842162(+) A-I      intronic
chr8:42845233(+) A-I      intronic
chr8:42846585(+) A-I      intronic
chr8:42846607(+) A-I      intronic
chr8:42846663(+) A-I      intronic
chr8:42847380(+) A-I      intronic
chr8:42847386(+) A-I      intronic
chr8:42847396(+) A-I      intronic
chr8:42847400(+) A-I      intronic
chr8:42847422(+) A-I      intronic
chr8:42847644(+) A-I      intronic
chr8:42848451(+) A-I      intronic
chr8:42849183(+) A-I      intronic
chr8:42849285(+) A-I      intronic
chr8:42849344(+) A-I      intronic
chr8:42831400(+) A-I      intronic
chr8:42849368(+) A-I      intronic
chr8:42849379(+) A-I      intronic
chr8:42757446(+) A-I      intronic
chr8:42757615(+) A-I      intronic
chr8:42757697(+) A-I      intronic
chr8:42758589(+) A-I      intronic
chr8:42758617(+) A-I      intronic
chr8:42849387(+) A-I      intronic
chr8:42758868(+) A-I      intronic
chr8:42759567(+) A-I      intronic
chr8:42849394(+) A-I      intronic
chr8:42760967(+) A-I      intronic
chr8:42761145(+) A-I      intronic
chr8:42849421(+) A-I      intronic
chr8:42851328(+) A-I      intronic
chr8:42851347(+) A-I      intronic
chr8:42851353(+) A-I      intronic
chr8:42851548(+) A-I      intronic
chr8:42852081(+) A-I      intronic
chr8:42859323(+) A-I      intronic
chr8:42859348(+) A-I      intronic
chr8:42870572(+) A-I      intronic
chr8:42859358(+) A-I      intronic
chr8:42859359(+) A-I      intronic
chr8:42859371(+) A-I      intronic
chr8:42806990(+) A-I      intronic
chr8:42806994(+) A-I      intronic
chr8:42806996(+) A-I      intronic
chr8:42807034(+) A-I      intronic
chr8:42808511(+) A-I      intronic
chr8:42808521(+) A-I      intronic
chr8:42808525(+) A-I      intronic
chr8:42808530(+) A-I      intronic
chr8:42808531(+) A-I      intronic
chr8:42808551(+) A-I      intronic
chr8:42824680(+) A-I      intronic
chr8:42761150(+) A-I      intronic
chr8:42761151(+) A-I      intronic
chr8:42764817(+) A-I      intronic
chr8:42766345(+) A-I      intronic
chr8:42766486(+) A-I      intronic
chr8:42766492(+) A-I      intronic
chr8:42766500(+) A-I      intronic
chr8:42770597(+) A-I      intronic
chr8:42780296(+) A-I      intronic
chr8:42780358(+) A-I      intronic
chr8:42780421(+) A-I      intronic
chr8:42780430(+) A-I      intronic
chr8:42781493(+) A-I      intronic
chr8:42781503(+) A-I      intronic
chr8:42781555(+) A-I      intronic
chr8:42781691(+) A-I      intronic
chr8:42781703(+) A-I      intronic
chr8:42781706(+) A-I      intronic
chr8:42782801(+) A-I      intronic
chr8:42782852(+) A-I      intronic
chr8:42782860(+) A-I      intronic
chr8:42783125(+) A-I      intronic
chr8:42783130(+) A-I      intronic
chr8:42783134(+) A-I      intronic
chr8:42783299(+) A-I      intronic
chr8:42783930(+) A-I      intronic
chr8:42784064(+) A-I      intronic
chr8:42784091(+) A-I      intronic
chr8:42784168(+) A-I      intronic
chr8:42796163(+) A-I      intronic
chr8:42796190(+) A-I      intronic
chr8:42796273(+) A-I      intronic
chr8:42796471(+) A-I      intronic
chr8:42796546(+) A-I      intronic
chr8:42797385(+) A-I      intronic
chr8:42800552(+) A-I      intronic
chr8:42800553(+) A-I      intronic
chr8:42800722(+) A-I      intronic
chr8:42804789(+) A-I      intronic
chr8:42804807(+) A-I      intronic
chr8:42804808(+) A-I      intronic
chr8:42805990(+) A-I      intronic
chr8:42859349(+) A-I      intronic
chr8:42859354(+) A-I      intronic
chr8:42859399(+) A-I      intronic
chr8:42859406(+) A-I      intronic
chr8:42859416(+) A-I      intronic
chr8:42859730(+) A-I      intronic
chr8:42859736(+) A-I      intronic
chr8:42859779(+) A-I      intronic
chr8:42861557(+) A-I      intronic
chr8:42861558(+) A-I      intronic
chr8:42861561(+) A-I      intronic
chr8:42861570(+) A-I      intronic
chr8:42861607(+) A-I      intronic
chr8:42862244(+) A-I      intronic
chr8:42862250(+) A-I      intronic
chr8:42862263(+) A-I      intronic
chr8:42869620(+) A-I      intronic
chr8:42869624(+) A-I      intronic
chr8:42871400(+) A-I      intronic
chr8:42871426(+) A-I      intronic
chr8:42871436(+) A-I      intronic
chr8:42871445(+) A-I      intronic
chr8:42871451(+) A-I      intronic
chr8:42872067(+) A-I      intronic
chr8:42872083(+) A-I      intronic
chr8:42872084(+) A-I      intronic
chr8:42872118(+) A-I      intronic
chr8:42872121(+) A-I      intronic
chr8:42806308(+) A-I      intronic
chr8:42806369(+) A-I      intronic
chr8:42806385(+) A-I      intronic
chr8:42869594(+) A-I      intronic
chr8:42806387(+) A-I      intronic
chr8:42806393(+) A-I      intronic
chr8:42870183(+) A-I      intronic
chr8:42870143(+) A-I      intronic
chr8:42859425(+) A-I      intronic
chr8:42806466(+) A-I      intronic
chr8:42806857(+) A-I      intronic
chr8:42806875(+) A-I      intronic
chr8:42859430(+) A-I      intronic
chr8:42806877(+) A-I      intronic
chr8:42806963(+) A-I      intronic
chr8:42808596(+) A-I      intronic
chr8:42817521(+) A-I      intronic
chr8:42817689(+) A-I      intronic
chr8:42817783(+) A-I      intronic
chr8:42819755(+) A-I      intronic
chr8:42872671(+) A-I      intronic
chr8:42872656(+) A-I      intronic
chr8:42872643(+) A-I      intronic
chr8:42859465(+) A-I      intronic
chr8:42872609(+) A-I      intronic
chr8:42872062(+) A-I      intronic
chr8:42871378(+) A-I      intronic
chr8:42871058(+) A-I      intronic
chr8:42871041(+) A-I      intronic
chr8:42870965(+) A-I      intronic
chr8:42870893(+) A-I      intronic
chr8:42870618(+) A-I      intronic
chr8:42870611(+) A-I      intronic
chr8:42870591(+) A-I      intronic
chr8:42870128(+) A-I      intronic
chr8:42870063(+) A-I      intronic
chr8:42869736(+) A-I      intronic
chr8:42869678(+) A-I      intronic
chr8:42869595(+) A-I      intronic
chr8:42869588(+) A-I      intronic
chr8:42869575(+) A-I      intronic
chr8:42869361(+) A-I      intronic
chr8:42869335(+) A-I      intronic
chr8:42869309(+) A-I      intronic
chr8:42869308(+) A-I      intronic
chr8:42869177(+) A-I      intronic
chr8:42868006(+) A-I      intronic
chr8:42867843(+) A-I      intronic
chr8:42867842(+) A-I      intronic
chr8:42867836(+) A-I      intronic
chr8:42867804(+) A-I      intronic
chr8:42867798(+) A-I      intronic
chr8:42867796(+) A-I      intronic
chr8:42866979(+) A-I      intronic
chr8:42859389(+) A-I      intronic
chr8:42866907(+) A-I      intronic
chr8:42866902(+) A-I      intronic
chr8:42866398(+) A-I      intronic
chr8:42866397(+) A-I      intronic
chr8:42859467(+) A-I      intronic
chr8:42859480(+) A-I      intronic
chr8:42866343(+) A-I      intronic
chr8:42866216(+) A-I      intronic
chr8:42866191(+) A-I      intronic
chr8:42864481(+) A-I      intronic
chr8:42823735(+) A-I      intronic
chr8:42757053(+) A-I      intronic
chr8:42757598(+) A-I      intronic
chr8:42761064(+) A-I      intronic
chr8:42823747(+) A-I      intronic
chr8:42761069(+) A-I      intronic
chr8:42807009(+) A-I      intronic
chr8:42824700(+) A-I      intronic
chr8:42824717(+) A-I      intronic
chr8:42826048(+) A-I      intronic
chr8:42826113(+) A-I      intronic
chr8:42826116(+) A-I      intronic
chr8:42827611(+) A-I      intronic
chr8:42859486(+) A-I      intronic
chr8:42859568(+) A-I      intronic
chr8:42859569(+) A-I      intronic
chr8:42859595(+) A-I      intronic
chr8:42859640(+) A-I      intronic
chr8:42859653(+) A-I      intronic
chr8:42859681(+) A-I      intronic
chr8:42859685(+) A-I      intronic
chr8:42859745(+) A-I      intronic
chr8:42860433(+) A-I      intronic
chr8:42860639(+) A-I      intronic
chr8:42860871(+) A-I      intronic
chr8:42860901(+) A-I      intronic
chr8:42861293(+) A-I      intronic
chr8:42861345(+) A-I      intronic
chr8:42861415(+) A-I      intronic
chr8:42861424(+) A-I      intronic
chr8:42861425(+) A-I      intronic
chr8:42862270(+) A-I      intronic
chr8:42863572(+) A-I      intronic
chr8:42829429(+) A-I      intronic
chr8:42829483(+) A-I      intronic
chr8:42829565(+) A-I      intronic
chr8:42864369(+) A-I      intronic
chr8:42823590(+) A-I      intronic
chr8:42875704(+) A-I      3'UTR
chr8:42878299(+) A-I      3'UTR
chr8:42878301(+) A-I      3'UTR
chr8:42878309(+) A-I      3'UTR
chr8:42883438(+) A-I      3'UTR
chr8:42882321(+) A-I      3'UTR
chr8:42878319(+) A-I      3'UTR
chr8:42882274(+) A-I      3'UTR
chr8:42882297(+) A-I      3'UTR
chr8:42882296(+) A-I      3'UTR
chr8:42882295(+) A-I      3'UTR
chr8:42878748(+) A-I      3'UTR
chr8:42878166(+) A-I      3'UTR
chr8:42878741(+) A-I      3'UTR
chr8:42878368(+) A-I      3'UTR
chr8:42878353(+) A-I      3'UTR
chr8:42878361(+) A-I      3'UTR
chr8:42878357(+) A-I      3'UTR
chr8:42875962(+) A-I      3'UTR
chr8:42878189(+) A-I      3'UTR
chr8:42878229(+) A-I      3'UTR
chr8:42876855(+) A-I      3'UTR
chr8:42878261(+) A-I      3'UTR
chr8:42878264(+) A-I      3'UTR
chr8:42875954(+) A-I      3'UTR
chr8:42875706(+) A-I      3'UTR
chr8:42875707(+) A-I      3'UTR
chr8:42875817(+) A-I      3'UTR
chr8:42875827(+) A-I      3'UTR
chr8:42882256(+) A-I      3'UTR
chr8:42882244(+) A-I      3'UTR
chr8:42875997(+) A-I      3'UTR
chr8:42878804(+) A-I      3'UTR
chr8:42878331(+) A-I      3'UTR
chr8:42878314(+) A-I      3'UTR
chr8:42876929(+) A-I      3'UTR
chr8:42876916(+) A-I      3'UTR
chr8:42883454(+) A-I      3'UTR
chr8:42884317(+) A-I      3'UTR
chr8:42884357(+) A-I      3'UTR
chr8:42876029(+) A-I      3'UTR
chr8:42876083(+) A-I      3'UTR
chr8:42878172(+) A-I      3'UTR
chr8:42876727(+) A-I      3'UTR
chr8:42882200(+) A-I      3'UTR
chr8:42882121(+) A-I      3'UTR
chr8:42875944(+) A-I      3'UTR
chr8:42882114(+) A-I      3'UTR
chr8:42878899(+) A-I      3'UTR
chr8:42876668(+) A-I      3'UTR
chr8:42876667(+) A-I      3'UTR
chr8:42876602(+) A-I      3'UTR
chr8:42876571(+) A-I      3'UTR
chr8:42876224(+) A-I      3'UTR
chr8:42878843(+) A-I      3'UTR
chr8:42878833(+) A-I      3'UTR
chr8:42876179(+) A-I      3'UTR
chr8:42876085(+) A-I      3'UTR
chr8:42876021(+) A-I      3'UTR
chr8:42876019(+) A-I      3'UTR
chr8:42876013(+) A-I      3'UTR
chr8:42875791(+) A-I      3'UTR
chr8:42875768(+) A-I      3'UTR
chr8:42875705(+) A-I      3'UTR
chr8:42875703(+) A-I      3'UTR
chr8:42875698(+) A-I      3'UTR
chr8:42875610(+) A-I      3'UTR
chr8:42884392(+) A-I      3'UTR
chr8:42876084(+) A-I      3'UTR
chr8:42876090(+) A-I      3'UTR
chr8:42876141(+) A-I      3'UTR
chr8:42876154(+) A-I      3'UTR
chr8:42876156(+) A-I      3'UTR
chr8:42878779(+) A-I      3'UTR
chr8:42878770(+) A-I      3'UTR
chr8:42878173(+) A-I      3'UTR
chr8:42878185(+) A-I      3'UTR
chr8:42878188(+) A-I      3'UTR
chr8:42878196(+) A-I      3'UTR
chr8:42878732(+) A-I      3'UTR
chr8:42876181(+) A-I      3'UTR
chr8:42876186(+) A-I      3'UTR
chr8:42876197(+) A-I      3'UTR
chr8:42878245(+) A-I      3'UTR
chr8:42882278(+) A-I      3'UTR
chr8:42878675(+) A-I      3'UTR
chr8:42878713(+) A-I      3'UTR
chr8:42878781(+) A-I      3'UTR
chr8:42876978(+) A-I      3'UTR
chr8:42883452(+) A-I      3'UTR
chr8:42876468(+) A-I      3'UTR
chr8:42876490(+) A-I      3'UTR
chr8:42876550(+) A-I      3'UTR
chr8:42876683(+) A-I      3'UTR
chr8:42884553(+) A-I      3'UTR
chr8:42884540(+) A-I      3'UTR
chr8:42884508(+) A-I      3'UTR
chr8:42884458(+) A-I      3'UTR
chr8:42884454(+) A-I      3'UTR
chr8:42878269(+) A-I      3'UTR
chr8:42884418(+) A-I      3'UTR
chr8:42882139(+) A-I      3'UTR
chr8:42884440(+) A-I      3'UTR
chr8:42882184(+) A-I      3'UTR
chr8:42882201(+) A-I      3'UTR
chr8:42882235(+) A-I      3'UTR
chr8:42882257(+) A-I      3'UTR
chr8:42875933(+) A-I      3'UTR
chr8:42884450(+) A-I      3'UTR
chr8:42877095(+) A-I      3'UTR
chr8:42878100(+) A-I      3'UTR
chr8:42878130(+) A-I      3'UTR
chr8:42878135(+) A-I      3'UTR
chr8:42878364(+) A-I      3'UTR
chr8:42878270(+) A-I      3'UTR
chr8:42878290(+) A-I      3'UTR
chr8:42878369(+) A-I      3'UTR
chr8:42878646(+) A-I      3'UTR
chr8:42878660(+) A-I      3'UTR
chr8:42882264(+) A-I      3'UTR
chr8:42877043(+) A-I      3'UTR
chr8:42883464(+) A-I      3'UTR
chr8:42883459(+) A-I      3'UTR
chr8:42877023(+) A-I      3'UTR
chr8:42877011(+) A-I      3'UTR
chr8:42883442(+) A-I      3'UTR
chr8:42876999(+) A-I      3'UTR
chr8:42875687(+) A-I      3'UTR
chr8:42875680(+) A-I      3'UTR
chr8:42875674(+) A-I      3'UTR
chr8:42875662(+) A-I      3'UTR
chr8:42875659(+) A-I      3'UTR
chr8:42875619(+) A-I      3'UTR
chr8:42760987(+) A-I      intronic
chr8:42871121(+) A-I      intronic
chr8:42871281(+) A-I      intronic
chr8:42872061(+) A-I      intronic
chr8:42758845(+) A-I      intronic
chr8:42872670(+) A-I      intronic
chr8:42871454(+) A-I      intronic
chr8:42872574(+) A-I      intronic
chr8:42871280(+) A-I      intronic
chr8:42862223(+) A-I      intronic
chr8:42852136(+) A-I      intronic
chr8:42757508(+) A-I      intronic
chr8:42758669(+) A-I      intronic
chr8:42783214(+) A-I      intronic
chr8:42811055(+) A-I      intronic
chr8:42862341(+) A-I      intronic
chr8:42866775(+) A-I      intronic
chr8:42833526(+) A-I      intronic
chr8:42831144(+) A-I      intronic
chr8:42860572(+) A-I      intronic
chr8:42870648(+) A-I      intronic
chr8:42796231(+) A-I      intronic
chr8:42759619(+) A-I      intronic
chr8:42827720(+) A-I      intronic
chr8:42859662(+) A-I      intronic
chr8:42869612(+) A-I      intronic
chr8:42831769(+) A-I      intronic
chr8:42838827(+) A-I      intronic
chr8:42864232(+) A-I      intronic
chr8:42842154(+) A-I      intronic
chr8:42780341(+) A-I      intronic
chr8:42782781(+) A-I      intronic
chr8:42781569(+) A-I      intronic
chr8:42831033(+) A-I      intronic
chr8:42859638(+) A-I      intronic
chr8:42779955(+) A-I      intronic
chr8:42806847(+) A-I      intronic
chr8:42770668(+) A-I      intronic
chr8:42848425(+) A-I      intronic
chr8:42824707(+) A-I      intronic
chr8:42782874(+) A-I      intronic
chr8:42807016(+) A-I      intronic
chr8:42872076(+) A-I      intronic
chr8:42831763(+) A-I      intronic
chr8:42836947(+) A-I      intronic
chr8:42852190(+) A-I      intronic
chr8:42849259(+) A-I      intronic
chr8:42846650(+) A-I      intronic
chr8:42848552(+) A-I      intronic
chr8:42866937(+) A-I      intronic
chr8:42833634(+) A-I      intronic
chr8:42806945(+) A-I      intronic
chr8:42860497(+) A-I      intronic
chr8:42802051(+) A-I      intronic
chr8:42859703(+) A-I      intronic
chr8:42833623(+) A-I      intronic
chr8:42835760(+) A-I      intronic
chr8:42846610(+) A-I      intronic
chr8:42872103(+) A-I      intronic
chr8:42859666(+) A-I      intronic
chr8:42783371(+) A-I      intronic
chr8:42862318(+) A-I      intronic
chr8:42842075(+) A-I      intronic
chr8:42871470(+) A-I      intronic
chr8:42869675(+) A-I      intronic
chr8:42869154(+) A-I      intronic
chr8:42859287(+) A-I      intronic
chr8:42861734(+) A-I      intronic
chr8:42781575(+) A-I      intronic
chr8:42859256(+) A-I      intronic
chr8:42758896(+) A-I      intronic
chr8:42859497(+) A-I      intronic
chr8:42852150(+) A-I      intronic
chr8:42859671(+) A-I      intronic
chr8:42860978(+) A-I      intronic
chr8:42878725(+) A-I      3'UTR
chr8:42878780(+) A-I      3'UTR
chr8:42875736(+) A-I      3'UTR
chr8:42878689(+) A-I      3'UTR
chr8:42878789(+) A-I      3'UTR
chr8:42875648(+) A-I      3'UTR
chr8:42878695(+) A-I      3'UTR
chr8:42876526(+) A-I      3'UTR
chr8:42876497(+) A-I      3'UTR
chr8:42884335(+) A-I      3'UTR
chr8:42876622(+) A-I      3'UTR
chr8:42882152(+) A-I      3'UTR
chr8:42875651(+) A-I      3'UTR
chr8:42884571(+) A-I      3'UTR
chr8:42878202(+) A-I      3'UTR
chr8:42883486(+) A-I      3'UTR
chr8:42876687(+) A-I      3'UTR
chr8:42878761(+) A-I      3'UTR
chr8:42883416(+) A-I      3'UTR
chr8:42876124(+) A-I      3'UTR
chr8:42876157(+) A-I      3'UTR
chr8:42876511(+) A-I      3'UTR
chr8:42876547(+) A-I      3'UTR
chr8:42877088(+) A-I      3'UTR
chr8:42883382(+) A-I      3'UTR
chr8:42875693(+) A-I      3'UTR
chr8:42876195(+) A-I      3'UTR
chr8:42875579(+) A-I      3'UTR
chr8:42875671(+) A-I      3'UTR
chr8:42878151(+) A-I      3'UTR
chr8:42875742(+) A-I      3'UTR
chr8:42877064(+) A-I      3'UTR
chr8:42876546(+) A-I      3'UTR
chr8:42884373(+) A-I      3'UTR
chr8:42878154(+) A-I      3'UTR
chr8:42876067(+) A-I      3'UTR
chr8:42878735(+) A-I      3'UTR
chr8:42876706(+) A-I      3'UTR
chr8:42878813(+) A-I      3'UTR
chr8:42878737(+) A-I      3'UTR
chr8:42876705(+) A-I      3'UTR
chr8:42878094(+) A-I      3'UTR
chr8:42878111(+) A-I      3'UTR
chr8:42876951(+) A-I      3'UTR
chr8:42883422(+) A-I      3'UTR
chr8:42876091(+) A-I      3'UTR
chr8:42878274(+) A-I      3'UTR
chr8:42876724(+) A-I      3'UTR
chr8:42878651(+) A-I      3'UTR
chr8:42878865(+) A-I      3'UTR
chr8:42875994(+) A-I      3'UTR
chr8:42877019(+) A-I      3'UTR
chr8:42875672(+) A-I      3'UTR
chr8:42884423(+) A-I      3'UTR
chr8:42883376(+) A-I      3'UTR
chr8:42876521(+) A-I      3'UTR
chr8:42882287(+) A-I      3'UTR
chr8:42878670(+) A-I      3'UTR
chr8:42875988(+) A-I      3'UTR
chr8:42876102(+) A-I      3'UTR
chr8:42878194(+) A-I      3'UTR
chr8:42876629(+) A-I      3'UTR
chr8:42876576(+) A-I      3'UTR
chr8:42882273(+) A-I      3'UTR
chr8:42882099(+) A-I      3'UTR
chr8:42875710(+) A-I      3'UTR
chr8:42883386(+) A-I      3'UTR
chr8:42876098(+) A-I      3'UTR
chr8:42875681(+) A-I      3'UTR
chr8:42882224(+) A-I      3'UTR
chr8:42884473(+) A-I      3'UTR
chr8:42876234(+) A-I      3'UTR
chr8:42875657(+) A-I      3'UTR
chr8:42876043(+) A-I      3'UTR
chr8:42882219(+) A-I      3'UTR
chr8:42876015(+) A-I      3'UTR
chr8:42882269(+) A-I      3'UTR
chr8:42882054(+) A-I      3'UTR
chr8:42878191(+) A-I      3'UTR
chr8:42875785(+) A-I      3'UTR
chr8:42883487(+) A-I      3'UTR
chr8:42875989(+) A-I      3'UTR
chr8:42877072(+) A-I      3'UTR
chr8:42882135(+) A-I      3'UTR
chr8:42875763(+) A-I      3'UTR
chr8:42882078(+) A-I      3'UTR
chr8:42876088(+) A-I      3'UTR
chr8:42875807(+) A-I      3'UTR
chr8:42876596(+) A-I      3'UTR
chr8:42875718(+) A-I      3'UTR
chr8:42882174(+) A-I      3'UTR
chr8:42884467(+) A-I      3'UTR
chr8:42878729(+) A-I      3'UTR
chr8:42877086(+) A-I      3'UTR
chr8:42878103(+) A-I      3'UTR
chr8:42876151(+) A-I      3'UTR
chr8:42876862(+) A-I      3'UTR
chr8:42878206(+) A-I      3'UTR
chr8:42884476(+) A-I      3'UTR
chr8:42878696(+) A-I      3'UTR
chr8:42878838(+) A-I      3'UTR
chr8:42876646(+) A-I      3'UTR
chr8:42875746(+) A-I      3'UTR
chr8:42884367(+) A-I      3'UTR
chr8:42884393(+) A-I      3'UTR
chr8:42882168(+) A-I      3'UTR
chr8:42876130(+) A-I      3'UTR
chr8:42884422(+) A-I      3'UTR
chr8:42875777(+) A-I      3'UTR
chr8:42875696(+) A-I      3'UTR
chr8:42876994(+) A-I      3'UTR
chr8:42884354(+) A-I      3'UTR
chr8:42875726(+) A-I      3'UTR
chr8:42875802(+) A-I      3'UTR
chr8:42876048(+) A-I      3'UTR
chr8:42878880(+) A-I      3'UTR
chr8:42875772(+) A-I      3'UTR
chr8:42878783(+) A-I      3'UTR
chr8:42884490(+) A-I      3'UTR
chr8:42876165(+) A-I      3'UTR
chr8:42878192(+) A-I      3'UTR
chr8:42878355(+) A-I      3'UTR
chr8:42876082(+) A-I      3'UTR
chr8:42878365(+) A-I      3'UTR
chr8:42884348(+) A-I      3'UTR
chr8:42884459(+) A-I      3'UTR
chr8:42876666(+) A-I      3'UTR
chr8:42876851(+) A-I      3'UTR
chr8:42875782(+) A-I      3'UTR
chr8:42875601(+) A-I      3'UTR
chr8:42884397(+) A-I      3'UTR
chr8:42876740(+) A-I      3'UTR
chr8:42878072(+) A-I      3'UTR
chr8:42875789(+) A-I      3'UTR
chr8:42876621(+) A-I      3'UTR
chr8:42876057(+) A-I      3'UTR
chr8:42884565(+) A-I      3'UTR
chr8:42878358(+) A-I      3'UTR
chr8:42878179(+) A-I      3'UTR
chr8:42883441(+) A-I      3'UTR
chr8:42876588(+) A-I      3'UTR
chr8:42878190(+) A-I      3'UTR
chr8:42876867(+) A-I      3'UTR
chr8:42878363(+) A-I      3'UTR
chr8:42875809(+) A-I      3'UTR
chr8:42876508(+) A-I      3'UTR
chr8:42876551(+) A-I      3'UTR
chr8:42878722(+) A-I      3'UTR
chr8:42878163(+) A-I      3'UTR
chr8:42876720(+) A-I      3'UTR
chr8:42876876(+) A-I      3'UTR
chr8:42876005(+) A-I      3'UTR
chr8:42875701(+) A-I      3'UTR
chr8:42876166(+) A-I      3'UTR
chr8:42884419(+) A-I      3'UTR
chr8:42875759(+) A-I      3'UTR
chr8:42876045(+) A-I      3'UTR
chr8:42876190(+) A-I      3'UTR
chr8:42875814(+) A-I      3'UTR
chr8:42876886(+) A-I      3'UTR
chr8:42878677(+) A-I      3'UTR
chr8:42875602(+) A-I      3'UTR
chr8:42882134(+) A-I      3'UTR
chr8:42876997(+) A-I      3'UTR
chr8:42875593(+) A-I      3'UTR
chr8:42878117(+) A-I      3'UTR
chr8:42876977(+) A-I      3'UTR
chr8:42876718(+) A-I      3'UTR
chr8:42878359(+) A-I      3'UTR
chr8:42876106(+) A-I      3'UTR
chr8:42875682(+) A-I      3'UTR
chr8:42884304(+) A-I      3'UTR
chr8:42876564(+) A-I      3'UTR
chr8:42875839(+) A-I      3'UTR
chr8:42875623(+) A-I      3'UTR
chr8:42878174(+) A-I      3'UTR
chr8:42876691(+) A-I      3'UTR
chr8:42884410(+) A-I      3'UTR
chr8:42878095(+) A-I      3'UTR
chr8:42877108(+) A-I      3'UTR
chr8:42876060(+) A-I      3'UTR
chr8:42875798(+) A-I      3'UTR
chr8:42875643(+) A-I      3'UTR
chr8:42875966(+) A-I      3'UTR
chr8:42878294(+) A-I      3'UTR
chr8:42882098(+) A-I      3'UTR
chr8:42878234(+) A-I      3'UTR
chr8:42878787(+) A-I      3'UTR
chr8:42882218(+) A-I      3'UTR
chr8:42876034(+) A-I      3'UTR
chr8:42876095(+) A-I      3'UTR
chr8:42859646(+) A-I      intronic
chr8:42838285(+) A-I      intronic
chr8:42827727(+) A-I      intronic
chr8:42870134(+) A-I      intronic
chr8:42862303(+) A-I      intronic
chr8:42846646(+) A-I      intronic
chr8:42869704(+) A-I      intronic
chr8:42780416(+) A-I      intronic
chr8:42770374(+) A-I      intronic
chr8:42761218(+) A-I      intronic
chr8:42806035(+) A-I      intronic
chr8:42869176(+) A-I      intronic
chr8:42770716(+) A-I      intronic
chr8:42861100(+) A-I      intronic
chr8:42872618(+) A-I      intronic
chr8:42780353(+) A-I      intronic
chr8:42872644(+) A-I      intronic
chr8:42872573(+) A-I      intronic
chr8:42859647(+) A-I      intronic
chr8:42864267(+) A-I      intronic
chr8:42845643(+) A-I      intronic
chr8:42824607(+) A-I      intronic
chr8:42848479(+) A-I      intronic
chr8:42870111(+) A-I      intronic
chr8:42834354(+) A-I      intronic
chr8:42872637(+) A-I      intronic
chr8:42770366(+) A-I      intronic
chr8:42780035(+) A-I      intronic
chr8:42796223(+) A-I      intronic
chr8:42805968(+) A-I      intronic
chr8:42759661(+) A-I      intronic
chr8:42758672(+) A-I      intronic
chr8:42859403(+) A-I      intronic
chr8:42861612(+) A-I      intronic
chr8:42759714(+) A-I      intronic
chr8:42770809(+) A-I      intronic
chr8:42808560(+) A-I      intronic
chr8:42829513(+) A-I      intronic
chr8:42870569(+) A-I      intronic
chr8:42872590(+) A-I      intronic
chr8:42859677(+) A-I      intronic
chr8:42757554(+) A-I      intronic
chr8:42770618(+) A-I      intronic
chr8:42861489(+) A-I      intronic
chr8:42866868(+) A-I      intronic
chr8:42838818(+) A-I      intronic
chr8:42831554(+) A-I      intronic
chr8:42852251(+) A-I      intronic
chr8:42832890(+) A-I      intronic
chr8:42782887(+) A-I      intronic
chr8:42859769(+) A-I      intronic
chr8:42796514(+) A-I      intronic
chr8:42864289(+) A-I      intronic
chr8:42838223(+) A-I      intronic
chr8:42866762(+) A-I      intronic
chr8:42806824(+) A-I      intronic
chr8:42806473(+) A-I      intronic
chr8:42859451(+) A-I      intronic
chr8:42756991(+) A-I      intronic
chr8:42757018(+) A-I      intronic
chr8:42862300(+) A-I      intronic
chr8:42759553(+) A-I      intronic
chr8:42859435(+) A-I      intronic
chr8:42831467(+) A-I      intronic
chr8:42870490(+) A-I      intronic
chr8:42859756(+) A-I      intronic
chr8:42819770(+) A-I      intronic
chr8:42870078(+) A-I      intronic
chr8:42869661(+) A-I      intronic
chr8:42808431(+) A-I      intronic
chr8:42859390(+) A-I      intronic
chr8:42859311(+) A-I      intronic
chr8:42829525(+) A-I      intronic
chr8:42871111(+) A-I      intronic
chr8:42824573(+) A-I      intronic
chr8:42800634(+) A-I      intronic
chr8:42761096(+) A-I      intronic
chr8:42817816(+) A-I      intronic
chr8:42859395(+) A-I      intronic
chr8:42870546(+) A-I      intronic
chr8:42870519(+) A-I      intronic
chr8:42824513(+) A-I      intronic
chr8:42842045(+) A-I      intronic
chr8:42796540(+) A-I      intronic
chr8:42837251(+) A-I      intronic
chr8:42869211(+) A-I      intronic
chr8:42759592(+) A-I      intronic
chr8:42817297(+) A-I      intronic
chr8:42829484(+) A-I      intronic
chr8:42832859(+) A-I      intronic
chr8:42764736(+) A-I      intronic
chr8:42839247(+) A-I      intronic
chr8:42825979(+) A-I      intronic
chr8:42780494(+) A-I      intronic
chr8:42770655(+) A-I      intronic
chr8:42861112(+) A-I      intronic
chr8:42766515(+) A-I      intronic
chr8:42831373(+) A-I      intronic
chr8:42863676(+) A-I      intronic
chr8:42758729(+) A-I      intronic
chr8:42864474(+) A-I      intronic
chr8:42823741(+) A-I      intronic
chr8:42757494(+) A-I      intronic
chr8:42872139(+) A-I      intronic
chr8:42838756(+) A-I      intronic
chr8:42869621(+) A-I      intronic
chr8:42855293(+) A-I      intronic
chr8:42862306(+) A-I      intronic
chr8:42757607(+) A-I      intronic
chr8:42806922(+) A-I      intronic
chr8:42859704(+) A-I      intronic
chr8:42836851(+) A-I      intronic
chr8:42869669(+) A-I      intronic
chr8:42872661(+) A-I      intronic
chr8:42761028(+) A-I      intronic
chr8:42799912(+) A-I      intronic
chr8:42757527(+) A-I      intronic
chr8:42761180(+) A-I      intronic
chr8:42782809(+) A-I      intronic
chr8:42851449(+) A-I      intronic
chr8:42867909(+) A-I      intronic
chr8:42859625(+) A-I      intronic
chr8:42757515(+) A-I      intronic
chr8:42871427(+) A-I      intronic
chr8:42829548(+) A-I      intronic
chr8:42859774(+) A-I      intronic
chr8:42782817(+) A-I      intronic
chr8:42833633(+) A-I      intronic
chr8:42757501(+) A-I      intronic
chr8:42758952(+) A-I      intronic
chr8:42817072(+) A-I      intronic
chr8:42870607(+) A-I      intronic
chr8:42861551(+) A-I      intronic
chr8:42869214(+) A-I      intronic
chr8:42806923(+) A-I      intronic
chr8:42758717(+) A-I      intronic
chr8:42817786(+) A-I      intronic
chr8:42770442(+) A-I      intronic
chr8:42829424(+) A-I      intronic
chr8:42849191(+) A-I      intronic
chr8:42847000(+) A-I      intronic
chr8:42833831(+) A-I      intronic
chr8:42758698(+) A-I      intronic
chr8:42860997(+) A-I      intronic
chr8:42770058(+) A-I      intronic
chr8:42848465(+) A-I      intronic
chr8:42860547(+) A-I      intronic
chr8:42770360(+) A-I      intronic
chr8:42802029(+) A-I      intronic
chr8:42770468(+) A-I      intronic
chr8:42862326(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED HOOK3
chr8:42875718(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42875726(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42875737(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324
chr8:42875746(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42875778(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42875782(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //21960545
chr8:42875789(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //21960545   //22327324
chr8:42875814(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //21960545   //22327324
chr8:42875972(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42875980(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //21960545
chr8:42875988(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42875989(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324
chr8:42876015(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42876043(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42876048(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //21960545
chr8:42876058(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //21960545
chr8:42876079(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42876095(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42876102(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //21960545
chr8:42876106(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42876134(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //21960545
chr8:42876177(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //21960545   //22327324
chr8:42877019(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42877055(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42877064(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42878094(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42878121(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42878149(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42878194(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42878653(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42878657(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42878725(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //21960545
chr8:42878729(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //21960545   //22327324
chr8:42878735(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42884422(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324
chr8:42884423(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324
chr8:42884459(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42884565(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr8:42875579(+) A-I intron -    21960545   //22327324
chr8:42875672(+) A-I intron -    22327324
chr8:42882152(+) A-I intron -    21960545   //22327324
chr8:42883363(+) A-I intron -    22327324
chr8:42883416(+) A-I intron -    22327324
chr8:42884354(+) A-I intron -    22327324
chr8:42884393(+) A-I intron -    22327324
chr8:42875602(+) A-I intron -    21960545
chr8:42876082(+) A-I intron -    21960545
chr8:42876098(+) A-I intron -    21960545
chr8:42876718(+) A-I intron -    21960545
chr8:42878696(+) A-I intron -    21960545
chr8:42878722(+) A-I intron -    21960545
chr8:42878851(+) A-I intron -    21960545
chr8:42770374(+) A-I intron -    21960545
chr8:42770599(+) A-I intron -    21960545
chr8:42876124(+) A-I intron -    21960545
chr8:42876508(+) A-I intron -    21960545
chr8:42876526(+) A-I intron -    21960545
chr8:42876546(+) A-I intron -    21960545
chr8:42878651(+) A-I intron -    21960545
chr8:42878838(+) A-I intron -    21960545
chr8:42882066(+) A-I intron -    21960545
chr8:42882134(+) A-I intron -    21960545
chr8:42882135(+) A-I intron -    21960545
chr8:42883382(+) A-I intron -    21960545
chr8:42882152(+) A-G intron -    21725310   //22484847
chr8:42883416(+) A-G intron -    21725310   //22484847
chr8:42884354(+) A-G intron -    21725310   //22484847
chr8:42884423(+) A-G intron -    21725310   //22484847
chr8:42878530(+) C-T intron -    22484847
chr8:42757438(+) A-G intron -    22484847
chr8:42757494(+) A-G intron -    22484847
chr8:42757508(+) A-G intron -    22484847
chr8:42757527(+) A-G intron -    22484847
chr8:42757650(+) A-G intron -    22484847
chr8:42758932(+) A-G intron -    22484847
chr8:42758965(+) A-G intron -    22484847
chr8:42759553(+) A-G intron -    22484847
chr8:42760987(+) A-G intron -    22484847
chr8:42761028(+) A-G intron -    22484847
chr8:42761047(+) A-G intron -    22484847
chr8:42761096(+) A-G intron -    22484847
chr8:42761110(+) A-G intron -    22484847
chr8:42766515(+) A-G intron -    22484847
chr8:42770360(+) A-G intron -    22484847
chr8:42770366(+) A-G intron -    22484847
chr8:42770374(+) A-G intron -    22484847
chr8:42770478(+) A-G intron -    22484847
chr8:42770618(+) A-G intron -    22484847
chr8:42770655(+) A-G intron -    22484847
chr8:42770668(+) A-G intron -    22484847
chr8:42770716(+) A-G intron -    22484847
chr8:42779951(+) A-G intron -    22484847
chr8:42779955(+) A-G intron -    22484847
chr8:42780035(+) A-G intron -    22484847
chr8:42780304(+) A-G intron -    22484847
chr8:42780341(+) A-G intron -    22484847
chr8:42780353(+) A-G intron -    22484847
chr8:42780416(+) A-G intron -    22484847
chr8:42780424(+) A-G intron -    22484847
chr8:42780494(+) A-G intron -    22484847
chr8:42781563(+) A-G intron -    22484847
chr8:42781569(+) A-G intron -    22484847
chr8:42781575(+) A-G intron -    22484847
chr8:42782781(+) A-G intron -    22484847
chr8:42782809(+) A-G intron -    22484847
chr8:42783012(+) A-G intron -    22484847
chr8:42796104(+) A-G intron -    22484847
chr8:42796540(+) A-G intron -    22484847
chr8:42799474(+) A-G intron -    22484847
chr8:42799480(+) A-G intron -    22484847
chr8:42800592(+) A-G intron -    22484847
chr8:42800634(+) A-G intron -    22484847
chr8:42802029(+) A-G intron -    22484847
chr8:42806035(+) A-G intron -    22484847
chr8:42825979(+) A-G intron -    22484847
chr8:42829484(+) A-G intron -    22484847
chr8:42829501(+) A-G intron -    22484847
chr8:42831033(+) A-G intron -    22484847
chr8:42831554(+) A-G intron -    22484847
chr8:42831769(+) A-G intron -    22484847
chr8:42832890(+) A-G intron -    22484847
chr8:42835760(+) A-G intron -    22484847
chr8:42836947(+) A-G intron -    22484847
chr8:42838223(+) A-G intron -    22484847
chr8:42838285(+) A-G intron -    22484847
chr8:42838756(+) A-G intron -    22484847
chr8:42838818(+) A-G intron -    22484847
chr8:42838827(+) A-G intron -    22484847
chr8:42842045(+) A-G intron -    22484847
chr8:42842075(+) A-G intron -    22484847
chr8:42842154(+) A-G intron -    22484847
chr8:42845171(+) A-G intron -    22484847
chr8:42846650(+) A-G intron -    22484847
chr8:42849224(+) A-G intron -    22484847
chr8:42852251(+) A-G intron -    22484847
chr8:42859390(+) A-G intron -    22484847
chr8:42859395(+) A-G intron -    22484847
chr8:42859435(+) A-G intron -    22484847
chr8:42860497(+) A-G intron -    22484847
chr8:42861734(+) A-G intron -    22484847
chr8:42862303(+) A-G intron -    22484847
chr8:42864267(+) A-G intron -    22484847
chr8:42866915(+) A-G intron -    22484847
chr8:42869211(+) A-G intron -    22484847
chr8:42870111(+) A-G intron -    22484847
chr8:42870490(+) A-G intron -    22484847
chr8:42870569(+) A-G intron -    22484847
chr8:42872637(+) A-G intron -    22484847
chr8:42872661(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875579(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875593(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875601(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875602(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875648(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875657(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875671(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875672(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875682(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875693(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875696(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875710(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875726(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875736(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875737(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875746(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875782(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875789(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875798(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875802(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875809(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875814(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875986(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875988(+) A-G intron -    22484847
chr8:42875989(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876015(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876058(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876068(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876082(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876088(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876102(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876124(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876173(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876177(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876247(+) G-A intron -    22484847
chr8:42876497(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876508(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876521(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876526(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876547(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876551(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876586(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876621(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876626(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876720(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876851(+) A-G intron -    22484847
chr8:42876997(+) A-G intron -    22484847
chr8:42877072(+) A-G intron -    22484847
chr8:42877086(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878094(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878095(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878117(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878121(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878149(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878151(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878174(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878194(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878202(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878210(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878234(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878238(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878358(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878653(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878696(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878722(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878725(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878729(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878826(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878838(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878851(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878865(+) A-G intron -    22484847
chr8:42878878(+) A-G intron -    22484847
chr8:42882066(+) A-G intron -    22484847
chr8:42882134(+) A-G intron -    22484847
chr8:42882135(+) A-G intron -    22484847
chr8:42882147(+) A-G intron -    22484847
chr8:42882168(+) A-G intron -    22484847
chr8:42883363(+) A-G intron -    22484847
chr8:42883417(+) A-G intron -    22484847
chr8:42883422(+) A-G intron -    22484847
chr8:42884367(+) A-G intron -    22484847
chr8:42884393(+) A-G intron -    22484847
chr8:42884410(+) A-G intron -    22484847
chr8:42884422(+) A-G intron -    22484847
chr8:42884473(+) A-G intron -    22484847
chr8:42884481(+) C-T intron -    22484847
chr8:42884565(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase HOOK3
chr8:42819515-42819516(+) m6A CDS//exon       24981863
chr8:42819541-42819542(+) m6A CDS//exon       24981863
chr8:42819582-42819583(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr8:42819593-42819594(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr8:42819609-42819610(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr8:42823342-42823343(+) m6A CDS//exon       24981863
chr8:42823353-42823354(+) m6A CDS//exon       24981863
chr8:42828439-42828440(+) m6A CDS//exon       24981863
chr8:42828447-42828448(+) m6A CDS//exon       24981863
chr8:42828481-42828482(+) m6A CDS//exon       24981863
chr8:42829258-42829259(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr8:42829282-42829283(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr8:42837802-42837803(+) m6A CDS//exon       27773535
chr8:42856211-42856212(+) m6A exon//intron       24981863
chr8:42857278-42857279(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr8:42863016-42863017(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr8:42868216-42868217(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr8:42868275-42868276(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr8:42868486-42868487(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085
chr8:42873535-42873536(+) m6A CDS       24981863//22608085
chr8:42873665-42873666(+) m6A 3'UTR//intron       24981863
chr8:42882835-42882836(+) Y 3'UTR       26075521

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate ebv-miR-BART14-3p
Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
HOOK3
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)     -
Ribosome HEK-293 cells     22199352

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: ebv-miR-BART14-3p
Interactor2: HOOK3

Evidence Support:


Weak-Evidence PAR-CLIP
Prediction-Evidence miRanda//PARalyzer//PITA//Targetscan
Support Database ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg

References:


PMID 22100165 Target region 3'UTR
Source ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg Interactor1 expression None
Tissue or cell line BC-1 cells Interactor2 expression Downregulation
Description Using PAR-CLIP, a technology which allows the direct and transcriptome-wide identification of miRNA targets, we delineate the target sites for all viral and cellular miRNAs expressed in PEL cell lines. The resulting data set revealed that KSHV miRNAs directly target more than 2000 cellular mRNAs, including many involved in pathways relevant to KSHV pathogenesis. Moreover, 58% of these mRNAs are also targeted by EBV miRNAs, via distinct binding sites.Clusters with seed matches to expressed miRNAs were considered candidate target sites. Of the clusters mapping to human 3'UTRs, 69% (BC-1) and 70% (BC-3) had seed matches to expressed miRNAs (Tables S6).Table S6A BC-1 derived 3'UTR clusters with seed matches to expressed miRNAs.

Starting a new search, please wait ...