Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00353732

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART14-3p:  MIMAT0003426          GLIPR1:  NM_006851     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART14-3p	GLIPR1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003426	11010
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CRISP7//GLIPR//RTVP1

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	GLIPR1	chr12:75882147(+) A-I      intronic chr12:75882136(+) A-I      intronic chr12:75889883(+) A-I      intronic chr12:75890055(+) A-I      intronic chr12:75890024(+) A-I      intronic chr12:75886045(+) A-I      intronic chr12:75889832(+) A-I      intronic chr12:75889853(+) A-I      intronic chr12:75889839(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	GLIPR1	chr12:75890052(+) A-I intron -    22327324 chr12:75889814(+) T-C intron -    22484847 chr12:75889880(+) T-C intron -    22484847 chr12:75889881(+) T-C intron -    22484847 chr12:75890052(+) T-C intron -    22484847 chr12:75890053(+) T-C intron -    22484847 chr12:75890088(+) T-C intron -    22484847 chr12:75890091(+) T-C intron -    22484847 chr12:75890097(+) T-C intron -    22484847 chr12:75890121(+) T-C intron -    22484847 chr12:75889832(+) A-G intron -    22484847 chr12:75889839(+) A-G intron -    22484847 chr12:75889853(+) A-G intron -    22484847 chr12:75889883(+) A-G intron -    22484847 chr12:75889912(+) T-C intron -    22484847 chr12:75890024(+) A-G intron -    22484847 chr12:75890055(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	GLIPR1	chr12:75874462-75874463(+) m6A 5'UTR       24981863 chr12:75874495-75874496(+) m6A 5'UTR       24981863 chr12:75874509-75874510(+) m6A 5'UTR       24981863 chr12:75874520-75874521(+) m6A 5'UTR       24981863 chr12:75874609-75874610(+) m6A 5'UTR       24981863 chr12:75874625-75874626(+) m6A 5'UTR       24981863 chr12:75874653-75874654(+) m6A 5'UTR       24981863 chr12:75875713-75875714(+) m6A 5'UTR//CDS       24981863 chr12:75875734-75875735(+) m6A 5'UTR//CDS       24981863 chr12:75875742-75875743(+) m6A 5'UTR//CDS       24981863 chr12:75875785-75875786(+) m6A 5'UTR//CDS       24981863 chr12:75875806-75875807(+) m6A CDS       24981863 chr12:75875820-75875821(+) m6A CDS       24981863 chr12:75893298-75893299(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:75893313-75893314(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:75893339-75893340(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:75893385-75893386(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:75893449-75893450(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535 chr12:75893463-75893464(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085 chr12:75893735-75893736(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//27371828//22608085 chr12:75893784-75893785(+) m6A 3'UTR       27773535//27371828//22608085 chr12:75894381-75894382(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75894451-75894452(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75894543-75894544(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75894550-75894551(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75895399-75895400(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:75895438-75895439(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:75895477-75895478(+) m6A 3'UTR       27773535//22608085 chr12:75895663-75895664(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085 chr12:75895686-75895687(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085 chr12:75895868-75895869(+) m6A 3'UTR       27773535//22608085 chr12:75896049-75896050(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75896096-75896097(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75896145-75896146(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75896154-75896155(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75896238-75896239(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75896751-75896752(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75896867-75896868(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75896878-75896879(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75896902-75896903(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75896935-75896936(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75896958-75896959(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75897021-75897022(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75897143-75897144(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75897180-75897181(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535 chr12:75897208-75897209(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535 chr12:75897224-75897225(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535 chr12:75897235-75897236(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535 chr12:75897269-75897270(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535 chr12:75897338-75897339(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75897344-75897345(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75897403-75897404(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75897412-75897413(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:75897427-75897428(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ebv-miR-BART14-3p	Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
	GLIPR1	Chromatin K562 cells     - Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleoplasm K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART14-3p
Interactor2: GLIPR1

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda
Support Database	RepTar//VmiReg