Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00351899

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART14-3p:  MIMAT0003426          CHD2:  NM_001042572     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART14-3p	CHD2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003426	1106
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	EEOC

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	CHD2	chr15:93530770(+) A-I      intronic chr15:93473236(+) A-I      intronic chr15:93462266(+) A-I      intronic chr15:93530779(+) A-I      intronic chr15:93530771(+) A-I      intronic chr15:93462213(+) A-I      intronic chr15:93530702(+) A-I      intronic chr15:93462214(+) A-I      intronic chr15:93462218(+) A-I      intronic chr15:93462228(+) A-I      intronic chr15:93462236(+) A-I      intronic chr15:93462244(+) A-I      intronic chr15:93458680(+) A-I      intronic chr15:93458762(+) A-I      intronic chr15:93459839(+) A-I      intronic chr15:93459923(+) A-I      intronic chr15:93459949(+) A-I      intronic chr15:93460511(+) A-I      intronic chr15:93460564(+) A-I      intronic chr15:93460641(+) A-I      intronic chr15:93460670(+) A-I      intronic chr15:93460708(+) A-I      intronic chr15:93460736(+) A-I      intronic chr15:93460799(+) A-I      intronic chr15:93476057(+) A-I      intronic chr15:93489961(+) A-I      intronic chr15:93489965(+) A-I      intronic chr15:93491954(+) A-I      intronic chr15:93492014(+) A-I      intronic chr15:93493821(+) A-I      intronic chr15:93493824(+) A-I      intronic chr15:93493843(+) A-I      intronic chr15:93502776(+) A-I      intronic chr15:93502791(+) A-I      intronic chr15:93502897(+) A-I      intronic chr15:93502931(+) A-I      intronic chr15:93510951(+) A-I      intronic chr15:93523009(+) A-I      intronic chr15:93523017(+) A-I      intronic chr15:93523087(+) A-I      intronic chr15:93530087(+) A-I      intronic chr15:93530091(+) A-I      intronic chr15:93530107(+) A-I      intronic chr15:93530564(+) A-I      intronic chr15:93530646(+) A-I      intronic chr15:93530670(+) A-I      intronic chr15:93530684(+) A-I      intronic chr15:93531430(+) A-I      intronic chr15:93531439(+) A-I      intronic chr15:93531442(+) A-I      intronic chr15:93531447(+) A-I      intronic chr15:93531477(+) A-I      intronic chr15:93531489(+) A-I      intronic chr15:93558438(+) A-I      intronic chr15:93562954(+) A-I      intronic chr15:93563075(+) A-I      intronic chr15:93453421(+) A-I      intronic chr15:93453703(+) A-I      intronic chr15:93453722(+) A-I      intronic chr15:93453861(+) A-I      intronic chr15:93454713(+) A-I      intronic chr15:93454782(+) A-I      intronic chr15:93454791(+) A-I      intronic chr15:93454900(+) A-I      intronic chr15:93454906(+) A-I      intronic chr15:93454910(+) A-I      intronic chr15:93456900(+) A-I      intronic chr15:93456961(+) A-I      intronic chr15:93458574(+) A-I      intronic chr15:93539664(+) A-I      intronic chr15:93530603(+) A-I      intronic chr15:93484349(+) A-I      intronic chr15:93559870(+) A-I      intronic chr15:93502802(+) A-I      intronic chr15:93494575(+) A-I      intronic chr15:93559891(+) A-I      intronic chr15:93491906(+) A-I      intronic chr15:93556979(+) A-I      intronic chr15:93452080(+) A-I      intronic chr15:93494494(+) A-I      intronic chr15:93513670(+) A-I      intronic chr15:93530095(+) A-I      intronic chr15:93563076(+) A-I      intronic chr15:93494462(+) A-I      intronic chr15:93459884(+) A-I      intronic chr15:93530704(+) A-I      intronic chr15:93454817(+) A-I      intronic chr15:93558408(+) A-I      intronic chr15:93457037(+) A-I      intronic chr15:93493908(+) A-I      intronic chr15:93559853(+) A-I      intronic chr15:93459853(+) A-I      intronic chr15:93530594(+) A-I      intronic chr15:93531512(+) A-I      intronic chr15:93459967(+) A-I      intronic chr15:93453806(+) A-I      intronic chr15:93460671(+) A-I      intronic chr15:93563115(+) A-I      intronic chr15:93453759(+) A-I      intronic chr15:93456917(+) A-I      intronic chr15:93460680(+) A-I      intronic chr15:93537167(+) A-I      intronic chr15:93454712(+) A-I      intronic chr15:93452085(+) A-I      intronic chr15:93454847(+) A-I      intronic chr15:93530101(+) A-I      intronic chr15:93559840(+) A-I      intronic chr15:93453809(+) A-I      intronic chr15:93530758(+) A-I      intronic chr15:93513532(+) A-I      intronic chr15:93530240(+) A-I      intronic chr15:93483435(+) A-I      intronic chr15:93491884(+) A-I      intronic chr15:93509568(+) A-I      intronic chr15:93491897(+) A-I      intronic chr15:93530573(+) A-I      intronic chr15:93508739(+) A-I      intronic chr15:93458711(+) A-I      intronic chr15:93452270(+) A-I      intronic chr15:93523027(+) A-I      intronic chr15:93494456(+) A-I      intronic chr15:93454816(+) A-I      intronic chr15:93455812(+) A-I      intronic chr15:93452093(+) A-I      intronic chr15:93459913(+) A-I      intronic chr15:93460627(+) A-I      intronic chr15:93537184(+) A-I      intronic chr15:93459840(+) A-I      intronic chr15:93453021(+) A-I      intronic chr15:93558372(+) A-I      intronic chr15:93489790(+) A-I      intronic chr15:93539658(+) A-I      intronic chr15:93454758(+) A-I      intronic chr15:93531387(+) A-I      intronic chr15:93456955(+) A-I      intronic chr15:93489781(+) A-I      intronic chr15:93530757(+) A-I      intronic chr15:93452943(+) A-I      intronic chr15:93460648(+) A-I      intronic chr15:93454821(+) A-I      intronic chr15:93458775(+) A-I      intronic chr15:93513598(+) A-I      intronic chr15:93562999(+) A-I      intronic chr15:93454922(+) A-I      intronic chr15:93452881(+) A-I      intronic chr15:93558373(+) A-I      intronic chr15:93454848(+) A-I      intronic chr15:93453762(+) A-I      intronic chr15:93453811(+) A-I      intronic chr15:93460534(+) A-I      intronic chr15:93563043(+) A-I      intronic chr15:93456978(+) A-I      intronic chr15:93491948(+) A-I      intronic chr15:93558389(+) A-I      intronic chr15:93459896(+) A-I      intronic chr15:93452998(+) A-I      intronic chr15:93490066(+) A-I      intronic chr15:93459964(+) A-I      intronic chr15:93452094(+) A-I      intronic chr15:93559931(+) A-I      intronic chr15:93530644(+) A-I      intronic chr15:93453846(+) A-I      intronic chr15:93457008(+) A-I      intronic chr15:93530762(+) A-I      intronic chr15:93542207(+) A-I      intronic chr15:93459848(+) A-I      intronic chr15:93537057(+) A-I      intronic chr15:93452910(+) A-I      intronic chr15:93456920(+) A-I      intronic chr15:93489979(+) A-I      intronic chr15:93460730(+) A-I      intronic chr15:93531406(+) A-I      intronic chr15:93558481(+) A-I      intronic chr15:93452354(+) A-I      intronic chr15:93530710(+) A-I      intronic chr15:93536918(+) A-I      intronic chr15:93530026(+) A-I      intronic chr15:93489918(+) A-I      intronic chr15:93455864(+) A-I      intronic chr15:93489846(+) A-I      intronic chr15:93489892(+) A-I      intronic chr15:93563089(+) A-I      intronic chr15:93511474(+) A-I      intronic chr15:93539433(+) A-I      intronic chr15:93453008(+) A-I      intronic chr15:93456984(+) A-I      intronic chr15:93562914(+) A-I      intronic chr15:93457002(+) A-I      intronic chr15:93491885(+) A-I      intronic chr15:93491958(+) A-I      intronic chr15:93491886(+) A-I      intronic chr15:93453723(+) A-I      intronic chr15:93531452(+) A-I      intronic chr15:93530632(+) A-I      intronic chr15:93530801(+) A-I      intronic chr15:93491918(+) A-I      intronic chr15:93530218(+) A-I      intronic chr15:93466584(+) A-I      intronic chr15:93459847(+) A-I      intronic chr15:93459864(+) A-I      intronic chr15:93530202(+) A-I      intronic chr15:93462827(+) A-I      intronic chr15:93531368(+) A-I      intronic chr15:93454781(+) A-I      intronic chr15:93460613(+) A-I      intronic chr15:93530802(+) A-I      intronic chr15:93493812(+) A-I      intronic chr15:93526850(+) A-I      intronic chr15:93559856(+) A-I      intronic chr15:93531366(+) A-I      intronic chr15:93544163(+) A-I      intronic chr15:93509546(+) A-I      intronic chr15:93558370(+) A-I      intronic chr15:93458686(+) A-I      intronic chr15:93529980(+) A-I      intronic chr15:93458689(+) A-I      intronic chr15:93460743(+) A-I      intronic chr15:93559880(+) A-I      intronic chr15:93489740(+) A-I      intronic chr15:93489992(+) A-I      intronic chr15:93460775(+) A-I      intronic chr15:93559897(+) A-I      intronic chr15:93494581(+) A-I      intronic chr15:93491900(+) A-I      intronic chr15:93452228(+) A-I      intronic chr15:93558571(+) A-I      intronic chr15:93460644(+) A-I      intronic chr15:93489898(+) A-I      intronic chr15:93530716(+) A-I      intronic chr15:93466925(+) A-I      intronic chr15:93460697(+) A-I      intronic chr15:93453337(+) A-I      intronic chr15:93530157(+) A-I      intronic chr15:93459815(+) A-I      intronic chr15:93455687(+) A-I      intronic chr15:93456977(+) A-I      intronic chr15:93562988(+) A-I      intronic chr15:93510029(+) A-I      intronic chr15:93493822(+) A-I      intronic chr15:93453692(+) A-I      intronic chr15:93460746(+) A-I      intronic chr15:93457067(+) A-I      intronic chr15:93562926(+) A-I      intronic chr15:93491809(+) A-I      intronic chr15:93460555(+) A-I      intronic chr15:93492056(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	CHD2	chr15:93452080(+) A-I intron -    21960545 chr15:93489740(+) A-I intron -    21960545 chr15:93489846(+) A-I intron -    21960545 chr15:93530710(+) A-I intron -    21960545 chr15:93531366(+) A-I intron -    21960545 chr15:93531406(+) A-I intron -    21960545 chr15:93531447(+) A-I intron -    21960545 chr15:93531452(+) A-I intron -    21960545 chr15:93562914(+) A-I intron -    21960545 chr15:93452080(+) A-G intron -    22484847 chr15:93454817(+) A-G intron -    22484847 chr15:93454847(+) A-G intron -    22484847 chr15:93459840(+) A-G intron -    22484847 chr15:93460743(+) A-G intron -    22484847 chr15:93460746(+) A-G intron -    22484847 chr15:93531325(+) C-T intron -    22484847 chr15:93542172(+) G-A intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	CHD2	chr15:93552522-93552523(+) Cm -       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ebv-miR-BART14-3p	Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
	CHD2	Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleus Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART14-3p
Interactor2: CHD2

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg