Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00351058

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART14-5p:  MIMAT0003425          WDR43:  NM_015131     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART14-5p	WDR43
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003425	23160
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	NET12//UTP5

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	WDR43	chr2:29143692(+) A-I      intronic chr2:29162751(+) A-I      intronic chr2:29143636(+) A-I      intronic chr2:29162889(+) A-I      intronic chr2:29143672(+) A-I      intronic chr2:29162786(+) A-I      intronic chr2:29164555(+) A-I      intronic chr2:29163262(+) A-I      intronic chr2:29163241(+) A-I      intronic chr2:29162943(+) A-I      intronic chr2:29162919(+) A-I      intronic chr2:29162727(+) A-I      intronic chr2:29144647(+) A-I      intronic chr2:29143817(+) A-I      intronic chr2:29143726(+) A-I      intronic chr2:29143723(+) A-I      intronic chr2:29143688(+) A-I      intronic chr2:29143682(+) A-I      intronic chr2:29142861(+) A-I      intronic chr2:29142450(+) A-I      intronic chr2:29142407(+) A-I      intronic chr2:29142372(+) A-I      intronic chr2:29142371(+) A-I      intronic chr2:29142368(+) A-I      intronic chr2:29142361(+) A-I      intronic chr2:29142344(+) A-I      intronic chr2:29142059(+) A-I      intronic chr2:29142044(+) A-I      intronic chr2:29141964(+) A-I      intronic chr2:29141922(+) A-I      intronic chr2:29141380(+) A-I      intronic chr2:29141374(+) A-I      intronic chr2:29141364(+) A-I      intronic chr2:29134692(+) A-I      intronic chr2:29133840(+) A-I      intronic chr2:29133596(+) A-I      intronic chr2:29132590(+) A-I      intronic chr2:29132233(+) A-I      intronic chr2:29132141(+) A-I      intronic chr2:29132084(+) A-I      intronic chr2:29162821(+) A-I      intronic chr2:29169109(+) A-I      intronic chr2:29169098(+) A-I      intronic chr2:29164731(+) A-I      intronic chr2:29164714(+) A-I      intronic chr2:29164638(+) A-I      intronic chr2:29143612(+) A-I      intronic chr2:29134640(+) A-I      intronic chr2:29130609(+) A-I      intronic chr2:29130368(+) A-I      intronic chr2:29141904(+) A-I      intronic chr2:29162700(+) A-I      intronic chr2:29130233(+) A-I      intronic chr2:29162712(+) A-I      intronic chr2:29141469(+) A-I      intronic chr2:29141973(+) A-I      intronic chr2:29130382(+) A-I      intronic chr2:29133838(+) A-I      intronic chr2:29132085(+) A-I      intronic chr2:29141965(+) A-I      intronic chr2:29162771(+) A-I      intronic chr2:29142871(+) A-I      intronic chr2:29163160(+) A-I      intronic chr2:29162910(+) A-I      intronic chr2:29162795(+) A-I      intronic chr2:29134299(+) A-I      intronic chr2:29132581(+) A-I      intronic chr2:29143209(+) A-I      intronic chr2:29163152(+) A-I      intronic chr2:29166209(+) A-I      intronic chr2:29162852(+) A-I      intronic chr2:29144266(+) A-I      intronic chr2:29162862(+) A-I      intronic chr2:29162898(+) A-I      intronic chr2:29142734(+) A-I      intronic chr2:29142065(+) A-I      intronic chr2:29142848(+) A-I      intronic chr2:29143233(+) A-I      intronic chr2:29166073(+) A-I      intronic chr2:29163225(+) A-I      intronic chr2:29162788(+) A-I      intronic chr2:29144734(+) A-I      intronic chr2:29169025(+) A-I      intronic chr2:29141312(+) A-I      intronic chr2:29162826(+) A-I      intronic chr2:29142736(+) A-I      intronic chr2:29143623(+) A-I      intronic chr2:29132655(+) A-I      intronic chr2:29132513(+) A-I      intronic chr2:29163261(+) A-I      intronic chr2:29141977(+) A-I      intronic chr2:29132646(+) A-I      intronic chr2:29133664(+) A-I      intronic chr2:29144705(+) A-I      intronic chr2:29144782(+) A-I      intronic chr2:29163235(+) A-I      intronic chr2:29162933(+) A-I      intronic chr2:29142280(+) A-I      intronic chr2:29132532(+) A-I      intronic chr2:29163370(+) A-I      intronic chr2:29142306(+) A-I      intronic chr2:29143257(+) A-I      intronic chr2:29162718(+) A-I      intronic chr2:29162719(+) A-I      intronic chr2:29141985(+) A-I      intronic chr2:29132684(+) A-I      intronic chr2:29132144(+) A-I      intronic chr2:29162822(+) A-I      intronic chr2:29169047(+) A-I      intronic chr2:29144679(+) A-I      intronic chr2:29164520(+) A-I      intronic chr2:29162897(+) A-I      intronic chr2:29163376(+) A-I      intronic chr2:29141291(+) A-I      intronic chr2:29142362(+) A-I      intronic chr2:29132557(+) A-I      intronic chr2:29130623(+) A-I      intronic chr2:29166191(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	WDR43	chr2:29162718(+) A-I intron -    22327324 chr2:29162719(+) A-I intron -    22327324 chr2:29163370(+) A-I intron -    22327324 chr2:29132446(+) A-G intron -    22484847 chr2:29139367(+) A-G intron -    22484847 chr2:29130663(+) G-A intron -    22484847 chr2:29132513(+) A-G intron -    22484847 chr2:29132532(+) A-G intron -    22484847 chr2:29132557(+) A-G intron -    22484847 chr2:29132646(+) A-G intron -    22484847 chr2:29132655(+) A-G intron -    22484847 chr2:29141312(+) A-G intron -    22484847 chr2:29141335(+) A-G intron -    22484847 chr2:29141415(+) A-G intron -    22484847 chr2:29141478(+) G-T intron -    22484847 chr2:29141973(+) A-G intron -    22484847 chr2:29142280(+) A-G intron -    22484847 chr2:29142306(+) A-G intron -    22484847 chr2:29142362(+) A-G intron -    22484847 chr2:29142375(+) A-G intron -    22484847 chr2:29142401(+) A-G intron -    22484847 chr2:29142734(+) A-G intron -    22484847 chr2:29142736(+) A-G intron -    22484847 chr2:29142807(+) A-G intron -    22484847 chr2:29143233(+) A-G intron -    22484847 chr2:29143612(+) A-G intron -    22484847 chr2:29143709(+) A-G intron -    22484847 chr2:29144782(+) A-G intron -    22484847 chr2:29151722(+) A-T intron -    22484847 chr2:29155069(+) G-A intron -    22484847 chr2:29162718(+) A-G intron -    22484847 chr2:29162719(+) A-G intron -    22484847 chr2:29162796(+) A-G intron -    22484847 chr2:29162826(+) A-G intron -    22484847 chr2:29162852(+) A-G intron -    22484847 chr2:29162977(+) C-A intron -    22484847 chr2:29163370(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	WDR43	chr2:29117534-29117535(+) m6A 5'UTR       24981863 chr2:29118162-29118163(+) m6A 5'UTR//intron       22608085 chr2:29118710-29118711(+) m6A 5'UTR//intron       24981863 chr2:29124906-29124907(+) m6A CDS       24981863//22575960 chr2:29127903-29127904(+) m6A 5'UTR//intron       27773535//22575960 chr2:29129333-29129334(+) m6A 5'UTR//CDS       27773535//22575960 chr2:29129371-29129372(+) m6A 5'UTR//CDS       27773535//22575960 chr2:29129405-29129406(+) m6A 5'UTR//CDS       22575960 chr2:29129430-29129431(+) m6A 5'UTR//CDS       22575960 chr2:29150440-29150441(+) m6A CDS//exon       24981863 chr2:29150524-29150525(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr2:29152481-29152482(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr2:29152505-29152506(+) m6A CDS//exon       24981863 chr2:29164386-29164387(+) m6A CDS//exon       27773535 chr2:29164397-29164398(+) m6A CDS//exon       27773535 chr2:29165195-29165196(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr2:29165218-29165219(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:29165244-29165245(+) m1A CDS//exon       26863196 chr2:29169568-29169569(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:29169629-29169630(+) Am CDS       - chr2:29169637-29169638(+) m1A CDS       26863196 chr2:29169647-29169648(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:29169668-29169669(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:29169677-29169678(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:29169732-29169733(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:29169798-29169799(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:29169841-29169842(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085 chr2:29169859-29169860(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr2:29169968-29169969(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085 chr2:29169991-29169992(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:29169996-29169997(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:29170793-29170794(+) m6A 3'UTR       27773535 chr2:29170869-29170870(+) m6A 3'UTR       27773535 chr2:29170874-29170875(+) m6A 3'UTR       27773535 chr2:29170913-29170914(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	WDR43	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Exosome Blood     - Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     - Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART14-5p
Interactor2: WDR43

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	VmiReg