Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00344947

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART12:           PDP2:      

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Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol ebv-miR-BART12 PDP2
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0003423 57546
Organism Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - PDPC 2//PPM2B//PPM2C2

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position
Lncediting PDP2
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Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
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RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
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RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate ebv-miR-BART12
Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
PDP2
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -

Related Drug Information:


Resource Symbol Drug Name PubChem ID
RNAactDrug ebv-miR-BART12

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: ebv-miR-BART12
Interactor2: PDP2

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//PITA
Support Database RepTar//VmiReg

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