Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00340723

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART11-3p:  MIMAT0003422          FRMD8:  NM_001300833     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART11-3p	FRMD8
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003422	83786
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	FKSG44//iTAP

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	FRMD8	chr11:65169669(+) A-I      intronic chr11:65169804(+) A-I      intronic chr11:65173035(+) A-I      intronic chr11:65173051(+) A-I      intronic chr11:65177047(+) A-I      intronic chr11:65177669(+) A-I      intronic chr11:65177674(+) A-I      intronic chr11:65177697(+) A-I      intronic chr11:65177072(+) A-I      intronic chr11:65176318(+) A-I      intronic chr11:65177033(+) A-I      intronic chr11:65169637(+) A-I      intronic chr11:65169643(+) A-I      intronic chr11:65169656(+) A-I      intronic chr11:65169662(+) A-I      intronic chr11:65174862(+) A-I      intronic chr11:65174250(+) A-I      intronic chr11:65177598(+) A-I      intronic chr11:65174221(+) A-I      intronic chr11:65172907(+) A-I      intronic chr11:65172829(+) A-I      intronic chr11:65176220(+) A-I      intronic chr11:65177808(+) A-I      intronic chr11:65175174(+) A-I      intronic chr11:65176738(+) A-I      intronic chr11:65173688(+) A-I      intronic chr11:65173617(+) A-I      intronic chr11:65155065(+) A-I      intronic chr11:65172974(+) A-I      intronic chr11:65154881(+) A-I      intronic chr11:65155194(+) A-I      intronic chr11:65173616(+) A-I      intronic chr11:65169611(+) A-I      intronic chr11:65169633(+) A-I      intronic chr11:65169723(+) A-I      intronic chr11:65169757(+) A-I      intronic chr11:65169761(+) A-I      intronic chr11:65169770(+) A-I      intronic chr11:65172859(+) A-I      intronic chr11:65174323(+) A-I      intronic chr11:65173400(+) A-I      intronic chr11:65172891(+) A-I      intronic chr11:65177061(+) A-I      intronic chr11:65172915(+) A-I      intronic chr11:65172917(+) A-I      intronic chr11:65172942(+) A-I      intronic chr11:65172945(+) A-I      intronic chr11:65172963(+) A-I      intronic chr11:65172990(+) A-I      intronic chr11:65174985(+) A-I      intronic chr11:65172996(+) A-I      intronic chr11:65173004(+) A-I      intronic chr11:65173019(+) A-I      intronic chr11:65173981(+) A-I      intronic chr11:65173076(+) A-I      intronic chr11:65173237(+) A-I      intronic chr11:65173244(+) A-I      intronic chr11:65173331(+) A-I      intronic chr11:65175183(+) A-I      intronic chr11:65173984(+) A-I      intronic chr11:65173560(+) A-I      intronic chr11:65173740(+) A-I      intronic chr11:65173939(+) A-I      intronic chr11:65173746(+) A-I      intronic chr11:65173752(+) A-I      intronic chr11:65173791(+) A-I      intronic chr11:65173815(+) A-I      intronic chr11:65173864(+) A-I      intronic chr11:65174059(+) A-I      intronic chr11:65174073(+) A-I      intronic chr11:65174251(+) A-I      intronic chr11:65174779(+) A-I      intronic chr11:65174803(+) A-I      intronic chr11:65175145(+) A-I      intronic chr11:65176832(+) A-I      intronic chr11:65176988(+) A-I      intronic chr11:65177018(+) A-I      intronic chr11:65177057(+) A-I      intronic chr11:65177085(+) A-I      intronic chr11:65177090(+) A-I      intronic chr11:65177122(+) A-I      intronic chr11:65177152(+) A-I      intronic chr11:65177170(+) A-I      intronic chr11:65177313(+) A-I      intronic chr11:65177315(+) A-I      intronic chr11:65177321(+) A-I      intronic chr11:65177621(+) A-I      intronic chr11:65178050(+) A-I      intronic chr11:65178084(+) A-I      intronic chr11:65178249(+) A-I      intronic chr11:65173352(+) A-I      intronic chr11:65174225(+) A-I      intronic chr11:65173805(+) A-I      intronic chr11:65173967(+) A-I      intronic chr11:65173421(+) A-I      intronic chr11:65176329(+) A-I      intronic chr11:65174235(+) A-I      intronic chr11:65177178(+) A-I      intronic chr11:65175106(+) A-I      intronic chr11:65177041(+) A-I      intronic chr11:65173209(+) A-I      intronic chr11:65173792(+) A-I      intronic chr11:65177115(+) A-I      intronic chr11:65155434(+) A-I      intronic chr11:65173872(+) A-I      intronic chr11:65173628(+) A-I      intronic chr11:65169582(+) A-I      intronic chr11:65172940(+) A-I      intronic chr11:65173795(+) A-I      intronic chr11:65173388(+) A-I      intronic chr11:65173518(+) A-I      intronic chr11:65180710(+) A-I      3'UTR chr11:65180516(+) A-I      3'UTR chr11:65180657(+) A-I      3'UTR chr11:65180720(+) A-I      3'UTR chr11:65180560(+) A-I      3'UTR chr11:65180711(+) A-I      3'UTR chr11:65174397(+) A-I      intronic chr11:65173433(+) A-I      intronic chr11:65172916(+) A-I      intronic chr11:65173059(+) A-I      intronic chr11:65175221(+) A-I      intronic chr11:65176637(+) A-I      intronic chr11:65173696(+) A-I      intronic chr11:65177335(+) A-I      intronic chr11:65175275(+) A-I      intronic chr11:65173314(+) A-I      intronic chr11:65173238(+) A-I      intronic chr11:65177036(+) A-I      intronic chr11:65176792(+) A-I      intronic chr11:65155143(+) A-I      intronic chr11:65173207(+) A-I      intronic chr11:65173986(+) A-I      intronic chr11:65176103(+) A-I      intronic chr11:65172983(+) A-I      intronic chr11:65174021(+) A-I      intronic chr11:65177460(+) A-I      intronic chr11:65177859(+) A-I      intronic chr11:65177225(+) A-I      intronic chr11:65174060(+) A-I      intronic chr11:65177820(+) A-I      intronic chr11:65173998(+) A-I      intronic chr11:65173879(+) A-I      intronic chr11:65177791(+) A-I      intronic chr11:65177625(+) A-I      intronic chr11:65175685(+) A-I      intronic chr11:65178215(+) A-I      intronic chr11:65177126(+) A-I      intronic chr11:65177157(+) A-I      intronic chr11:65174289(+) A-I      intronic chr11:65176582(+) A-I      intronic chr11:65175150(+) A-I      intronic chr11:65177845(+) A-I      intronic chr11:65174997(+) A-I      intronic chr11:65176344(+) A-I      intronic chr11:65173015(+) A-I      intronic chr11:65174362(+) A-I      intronic chr11:65177295(+) A-I      intronic chr11:65176810(+) A-I      intronic chr11:65175671(+) A-I      intronic chr11:65176767(+) A-I      intronic chr11:65174299(+) A-I      intronic chr11:65176687(+) A-I      intronic chr11:65174899(+) A-I      intronic chr11:65174609(+) A-I      intronic chr11:65165536(+) A-I      intronic chr11:65174712(+) A-I      intronic chr11:65175672(+) A-I      intronic chr11:65177649(+) A-I      intronic chr11:65177608(+) A-I      intronic chr11:65173927(+) A-I      intronic chr11:65173941(+) A-I      intronic chr11:65173441(+) A-I      intronic chr11:65172941(+) A-I      intronic chr11:65177691(+) A-I      intronic chr11:65173310(+) A-I      intronic chr11:65173215(+) A-I      intronic chr11:65169665(+) A-I      intronic chr11:65177098(+) A-I      intronic chr11:65174224(+) A-I      intronic chr11:65172837(+) A-I      intronic chr11:65176140(+) A-I      intronic chr11:65175620(+) A-I      intronic chr11:65176657(+) A-I      intronic chr11:65174259(+) A-I      intronic chr11:65176732(+) A-I      intronic chr11:65175209(+) A-I      intronic chr11:65174246(+) A-I      intronic chr11:65176170(+) A-I      intronic chr11:65175218(+) A-I      intronic chr11:65177659(+) A-I      intronic chr11:65155472(+) A-I      intronic chr11:65174363(+) A-I      intronic chr11:65154902(+) A-I      intronic chr11:65177477(+) A-I      intronic chr11:65172973(+) A-I      intronic chr11:65175176(+) A-I      intronic chr11:65177485(+) A-I      intronic chr11:65175663(+) A-I      intronic chr11:65176684(+) A-I      intronic chr11:65174313(+) A-I      intronic chr11:65173395(+) A-I      intronic chr11:65174155(+) A-I      intronic chr11:65177042(+) A-I      intronic chr11:65172928(+) A-I      intronic chr11:65176675(+) A-I      intronic chr11:65176187(+) A-I      intronic chr11:65176221(+) A-I      intronic chr11:65173326(+) A-I      intronic chr11:65170928(+) A-I      intronic chr11:65176163(+) A-I      intronic chr11:65177470(+) A-I      intronic chr11:65177687(+) A-I      intronic chr11:65174852(+) A-I      intronic chr11:65173026(+) A-I      intronic chr11:65176747(+) A-I      intronic chr11:65174210(+) A-I      intronic chr11:65170728(+) A-I      intronic chr11:65174263(+) A-I      intronic chr11:65173638(+) A-I      intronic chr11:65177816(+) A-I      intronic chr11:65176184(+) A-I      intronic chr11:65175182(+) A-I      intronic chr11:65174903(+) A-I      intronic chr11:65173216(+) A-I      intronic chr11:65172860(+) A-I      intronic chr11:65178140(+) A-I      intronic chr11:65176613(+) A-I      intronic chr11:65173552(+) A-I      intronic chr11:65173926(+) A-I      intronic chr11:65174943(+) A-I      intronic chr11:65176578(+) A-I      intronic chr11:65177891(+) A-I      intronic chr11:65177424(+) A-I      intronic chr11:65176758(+) A-I      intronic chr11:65155450(+) A-I      intronic chr11:65174164(+) A-I      intronic chr11:65177014(+) A-I      intronic chr11:65155546(+) A-I      intronic chr11:65173342(+) A-I      intronic chr11:65176110(+) A-I      intronic chr11:65175612(+) A-I      intronic chr11:65174906(+) A-I      intronic chr11:65177186(+) A-I      intronic chr11:65162858(+) A-I      intronic chr11:65174849(+) A-I      intronic chr11:65155033(+) A-I      intronic chr11:65172864(+) A-I      intronic chr11:65177082(+) A-I      intronic chr11:65175276(+) A-I      intronic chr11:65173802(+) A-I      intronic chr11:65173271(+) A-I      intronic chr11:65174006(+) A-I      intronic chr11:65176278(+) A-I      intronic chr11:65177116(+) A-I      intronic chr11:65176115(+) A-I      intronic chr11:65174840(+) A-I      intronic chr11:65172838(+) A-I      intronic chr11:65177064(+) A-I      intronic chr11:65157382(+) A-I      intronic chr11:65177464(+) A-I      intronic chr11:65174314(+) A-I      intronic chr11:65176994(+) A-I      intronic chr11:65174249(+) A-I      intronic chr11:65173081(+) A-I      intronic chr11:65172948(+) A-I      intronic chr11:65176826(+) A-I      intronic chr11:65176334(+) A-I      intronic chr11:65177162(+) A-I      intronic chr11:65176317(+) A-I      intronic chr11:65173082(+) A-I      intronic chr11:65174336(+) A-I      intronic chr11:65175084(+) A-I      intronic chr11:65175225(+) A-I      intronic chr11:65176210(+) A-I      intronic chr11:65155528(+) A-I      intronic chr11:65175247(+) A-I      intronic chr11:65169800(+) A-I      intronic chr11:65173783(+) A-I      intronic chr11:65174061(+) A-I      intronic chr11:65175107(+) A-I      intronic chr11:65174156(+) A-I      intronic chr11:65169769(+) A-I      intronic chr11:65180643(+) A-I      3'UTR chr11:65180669(+) A-I      3'UTR chr11:65180640(+) A-I      3'UTR chr11:65180649(+) A-I      3'UTR chr11:65180589(+) A-I      3'UTR chr11:65180524(+) A-I      3'UTR chr11:65180586(+) A-I      3'UTR

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	FRMD8	chr11:65173352(+) A-I intron -    22327324 chr11:65177014(+) A-I intron -    22327324 chr11:65177061(+) A-I intron -    22327324 chr11:65180649(+) A-I intron -    21960545 chr11:65172973(+) A-G intron -    22484847 chr11:65173026(+) A-G intron -    22484847 chr11:65173081(+) A-G intron -    22484847 chr11:65173209(+) A-G intron -    22484847 chr11:65173326(+) A-G intron -    22484847 chr11:65173352(+) A-G intron -    22484847 chr11:65173518(+) A-G intron -    22484847 chr11:65173984(+) A-G intron -    22484847 chr11:65174006(+) A-G intron -    22484847 chr11:65174061(+) A-G intron -    22484847 chr11:65174225(+) A-G intron -    22484847 chr11:65175176(+) A-G intron -    22484847 chr11:65175183(+) A-G intron -    22484847 chr11:65176115(+) A-G intron -    22484847 chr11:65176317(+) A-G intron -    22484847 chr11:65176329(+) A-G intron -    22484847 chr11:65176684(+) A-G intron -    22484847 chr11:65176792(+) A-G intron -    22484847 chr11:65177014(+) A-G intron -    22484847 chr11:65177061(+) A-G intron -    22484847 chr11:65177064(+) A-G intron -    22484847 chr11:65177116(+) A-G intron -    22484847 chr11:65177186(+) A-G intron -    22484847 chr11:65177625(+) A-G intron -    22484847 chr11:65177687(+) A-G intron -    22484847 chr11:65177691(+) A-G intron -    22484847 chr11:65178215(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	FRMD8	chr11:65172407-65172408(+) m6A CDS       24284625 chr11:65172431-65172432(+) m6A CDS       24284625 chr11:65178962-65178963(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr11:65179092-65179093(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr11:65179131-65179132(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr11:65179207-65179208(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr11:65179227-65179228(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr11:65179266-65179267(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr11:65179316-65179317(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr11:65179420-65179421(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr11:65179426-65179427(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr11:65179432-65179433(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr11:65179615-65179616(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr11:65179631-65179632(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr11:65179655-65179656(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr11:65179708-65179709(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr11:65179717-65179718(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr11:65179898-65179899(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr11:65179919-65179920(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr11:65180048-65180049(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr11:65180091-65180092(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr11:65180141-65180142(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863 chr11:65180261-65180262(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863 chr11:65180916-65180917(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	FRMD8	Chromatin K562 cells     - Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HeLa-S3 cells     - Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Related Drug Information:

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID
RNAactDrug	ebv-miR-BART11-3p	Nvp-aew541       11476171

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART11-3p
Interactor2: FRMD8

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg