Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00340369

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART11-3p:  MIMAT0003422          TBC1D22B:  NR_130108     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART11-3p	TBC1D22B
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003422	55633
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	C6orf197

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	TBC1D22B	chr6:37273558(+) A-I      intronic chr6:37273503(+) A-I      intronic chr6:37273374(+) A-I      intronic chr6:37267793(+) A-I      intronic chr6:37267627(+) A-I      intronic chr6:37267610(+) A-I      intronic chr6:37267531(+) A-I      intronic chr6:37298047(+) A-I      intronic chr6:37296677(+) A-I      intronic chr6:37296668(+) A-I      intronic chr6:37296642(+) A-I      intronic chr6:37296027(+) A-I      intronic chr6:37295948(+) A-I      intronic chr6:37254298(+) A-I      intronic chr6:37254282(+) A-I      intronic chr6:37254257(+) A-I      intronic chr6:37254193(+) A-I      intronic chr6:37254178(+) A-I      intronic chr6:37295925(+) A-I      intronic chr6:37295919(+) A-I      intronic chr6:37295914(+) A-I      intronic chr6:37294421(+) A-I      intronic chr6:37293996(+) A-I      intronic chr6:37293560(+) A-I      intronic chr6:37293555(+) A-I      intronic chr6:37293554(+) A-I      intronic chr6:37293390(+) A-I      intronic chr6:37290085(+) A-I      intronic chr6:37273488(+) A-I      intronic chr6:37290058(+) A-I      intronic chr6:37283573(+) A-I      intronic chr6:37283535(+) A-I      intronic chr6:37283439(+) A-I      intronic chr6:37283396(+) A-I      intronic chr6:37283283(+) A-I      intronic chr6:37283146(+) A-I      intronic chr6:37283104(+) A-I      intronic chr6:37279322(+) A-I      intronic chr6:37279318(+) A-I      intronic chr6:37279299(+) A-I      intronic chr6:37279241(+) A-I      intronic chr6:37254674(+) A-I      intronic chr6:37279222(+) A-I      intronic chr6:37278372(+) A-I      intronic chr6:37256453(+) A-I      intronic chr6:37256745(+) A-I      intronic chr6:37254156(+) A-I      intronic chr6:37246524(+) A-I      intronic chr6:37245850(+) A-I      intronic chr6:37245793(+) A-I      intronic chr6:37245777(+) A-I      intronic chr6:37242626(+) A-I      intronic chr6:37256764(+) A-I      intronic chr6:37256765(+) A-I      intronic chr6:37263917(+) A-I      intronic chr6:37245797(+) A-I      intronic chr6:37267620(+) A-I      intronic chr6:37268403(+) A-I      intronic chr6:37283242(+) A-I      intronic chr6:37283267(+) A-I      intronic chr6:37283278(+) A-I      intronic chr6:37275334(+) A-I      intronic chr6:37278346(+) A-I      intronic chr6:37278324(+) A-I      intronic chr6:37278258(+) A-I      intronic chr6:37290059(+) A-I      intronic chr6:37254640(+) A-I      intronic chr6:37254599(+) A-I      intronic chr6:37254577(+) A-I      intronic chr6:37276703(+) A-I      intronic chr6:37273570(+) A-I      intronic chr6:37254573(+) A-I      intronic chr6:37254569(+) A-I      intronic chr6:37254464(+) A-I      intronic chr6:37254352(+) A-I      intronic chr6:37228968(+) A-I      intronic chr6:37228979(+) A-I      intronic chr6:37229153(+) A-I      intronic chr6:37229948(+) A-I      intronic chr6:37231489(+) A-I      intronic chr6:37238938(+) A-I      intronic chr6:37242578(+) A-I      intronic chr6:37242625(+) A-I      intronic chr6:37296602(+) A-I      intronic chr6:37283451(+) A-I      intronic chr6:37290238(+) A-I      intronic chr6:37278389(+) A-I      intronic chr6:37240384(+) A-I      intronic chr6:37244601(+) A-I      intronic chr6:37268302(+) A-I      intronic chr6:37298286(+) A-I      intronic chr6:37278365(+) A-I      intronic chr6:37256364(+) A-I      intronic chr6:37275196(+) A-I      intronic chr6:37240438(+) A-I      intronic chr6:37262075(+) A-I      intronic chr6:37279283(+) A-I      intronic chr6:37267602(+) A-I      intronic chr6:37256734(+) A-I      intronic chr6:37256713(+) A-I      intronic chr6:37246544(+) A-I      intronic chr6:37268250(+) A-I      intronic chr6:37254231(+) A-I      intronic chr6:37263941(+) A-I      intronic chr6:37256253(+) A-I      intronic chr6:37298220(+) A-I      intronic chr6:37267638(+) A-I      intronic chr6:37263944(+) A-I      intronic chr6:37267536(+) A-I      intronic chr6:37279186(+) A-I      intronic chr6:37278301(+) A-I      intronic chr6:37275232(+) A-I      intronic chr6:37279193(+) A-I      intronic chr6:37256768(+) A-I      intronic chr6:37294417(+) A-I      intronic chr6:37295943(+) A-I      intronic chr6:37229556(+) A-I      intronic chr6:37245825(+) A-I      intronic chr6:37279198(+) A-I      intronic chr6:37267600(+) A-I      intronic chr6:37283272(+) A-I      intronic chr6:37254511(+) A-I      intronic chr6:37296686(+) A-I      intronic chr6:37298265(+) A-I      intronic chr6:37263963(+) A-I      intronic chr6:37278286(+) A-I      intronic chr6:37229665(+) A-I      intronic chr6:37283266(+) A-I      intronic chr6:37230093(+) A-I      intronic chr6:37266488(+) A-I      intronic chr6:37295934(+) A-I      intronic chr6:37229158(+) A-I      intronic chr6:37293465(+) A-I      intronic chr6:37263958(+) A-I      intronic chr6:37283401(+) A-I      intronic chr6:37268237(+) A-I      intronic chr6:37283218(+) A-I      intronic chr6:37279176(+) A-I      intronic chr6:37267524(+) A-I      intronic chr6:37279338(+) A-I      intronic chr6:37238072(+) A-I      intronic chr6:37278280(+) A-I      intronic chr6:37268338(+) A-I      intronic chr6:37279328(+) A-I      intronic chr6:37254589(+) A-I      intronic chr6:37264328(+) A-I      intronic chr6:37294473(+) A-I      intronic chr6:37263918(+) A-I      intronic chr6:37229655(+) A-I      intronic chr6:37268412(+) A-I      intronic chr6:37268194(+) A-I      intronic chr6:37264707(+) A-I      intronic chr6:37267557(+) A-I      intronic chr6:37279192(+) A-I      intronic chr6:37278230(+) A-I      intronic chr6:37296001(+) A-I      intronic chr6:37226817(+) A-I      intronic chr6:37298116(+) A-I      intronic chr6:37230017(+) A-I      intronic chr6:37254534(+) A-I      intronic chr6:37279401(+) A-I      intronic chr6:37263940(+) A-I      intronic chr6:37253205(+) A-I      intronic chr6:37279302(+) A-I      intronic chr6:37294485(+) A-I      intronic chr6:37275354(+) A-I      intronic chr6:37293947(+) A-I      intronic chr6:37268164(+) A-I      intronic chr6:37278307(+) A-I      intronic chr6:37276669(+) A-I      intronic chr6:37281119(+) A-I      intronic chr6:37267629(+) A-I      intronic chr6:37298404(+) A-I      intronic chr6:37275392(+) A-I      intronic chr6:37279269(+) A-I      intronic chr6:37279351(+) A-I      intronic chr6:37283541(+) A-I      intronic chr6:37229087(+) A-I      intronic chr6:37240186(+) A-I      intronic chr6:37245381(+) A-I      intronic chr6:37276624(+) A-I      intronic chr6:37279460(+) A-I      intronic chr6:37256682(+) A-I      intronic chr6:37256219(+) A-I      intronic chr6:37293902(+) A-I      intronic chr6:37254221(+) A-I      intronic chr6:37256460(+) A-I      intronic chr6:37231434(+) A-I      intronic chr6:37254533(+) A-I      intronic chr6:37295987(+) A-I      intronic chr6:37278212(+) A-I      intronic chr6:37268303(+) A-I      intronic chr6:37264672(+) A-I      intronic chr6:37254652(+) A-I      intronic chr6:37279170(+) A-I      intronic chr6:37293903(+) A-I      intronic chr6:37256229(+) A-I      intronic chr6:37278190(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	TBC1D22B	chr6:37262075(+) A-I intron -    21960545 chr6:37230017(+) A-G intron -    22484847 chr6:37231434(+) A-G intron -    22484847 chr6:37231499(+) A-G intron -    22484847 chr6:37245381(+) A-G intron -    22484847 chr6:37245383(+) A-G intron -    22484847 chr6:37254115(+) A-G intron -    22484847 chr6:37254221(+) A-G intron -    22484847 chr6:37254231(+) A-G intron -    22484847 chr6:37254365(+) A-G intron -    22484847 chr6:37254589(+) A-G intron -    22484847 chr6:37254652(+) A-G intron -    22484847 chr6:37256219(+) A-G intron -    22484847 chr6:37256460(+) A-G intron -    22484847 chr6:37256681(+) A-G intron -    22484847 chr6:37256682(+) A-G intron -    22484847 chr6:37256713(+) A-G intron -    22484847 chr6:37256734(+) A-G intron -    22484847 chr6:37256768(+) A-G intron -    22484847 chr6:37263940(+) A-G intron -    22484847 chr6:37263941(+) A-G intron -    22484847 chr6:37263944(+) A-G intron -    22484847 chr6:37263958(+) A-G intron -    22484847 chr6:37263963(+) A-G intron -    22484847 chr6:37267536(+) A-G intron -    22484847 chr6:37267629(+) A-G intron -    22484847 chr6:37268164(+) A-G intron -    22484847 chr6:37268194(+) A-G intron -    22484847 chr6:37268237(+) A-G intron -    22484847 chr6:37268238(+) A-G intron -    22484847 chr6:37268302(+) A-G intron -    22484847 chr6:37268303(+) A-G intron -    22484847 chr6:37268321(+) A-G intron -    22484847 chr6:37268335(+) A-G intron -    22484847 chr6:37268338(+) A-G intron -    22484847 chr6:37273312(+) G-T intron -    22484847 chr6:37275273(+) A-G intron -    22484847 chr6:37278280(+) A-G intron -    22484847 chr6:37278307(+) A-G intron -    22484847 chr6:37279186(+) A-G intron -    22484847 chr6:37279269(+) A-G intron -    22484847 chr6:37279328(+) A-G intron -    22484847 chr6:37283071(+) A-G intron -    22484847 chr6:37283266(+) A-G intron -    22484847 chr6:37283401(+) A-G intron -    22484847 chr6:37283417(+) A-G intron -    22484847 chr6:37283430(+) A-G intron -    22484847 chr6:37283451(+) A-G intron -    22484847 chr6:37283469(+) A-G intron -    22484847 chr6:37283594(+) G-A intron -    22484847 chr6:37293465(+) A-G intron -    22484847 chr6:37293509(+) A-G intron -    22484847 chr6:37293531(+) A-G intron -    22484847 chr6:37295821(+) A-G intron -    22484847 chr6:37296602(+) A-G intron -    22484847 chr6:37296606(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	TBC1D22B	chr6:37225653-37225654(+) m6A 5'UTR       24209618//25456834//24981863 chr6:37225674-37225675(+) m6A 5'UTR       24209618//25456834//24981863 chr6:37225706-37225707(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863 chr6:37247177-37247178(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr6:37247201-37247202(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr6:37247224-37247225(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr6:37247231-37247232(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr6:37247273-37247274(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr6:37247295-37247296(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr6:37298841-37298842(+) m6A CDS       24284625//24981863 chr6:37298902-37298903(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr6:37298966-37298967(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863 chr6:37298972-37298973(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863 chr6:37299027-37299028(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863 chr6:37299040-37299041(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863 chr6:37299129-37299130(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863 chr6:37299179-37299180(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085 chr6:37299220-37299221(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085 chr6:37299225-37299226(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863 chr6:37299274-37299275(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863 chr6:37299315-37299316(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863 chr6:37299364-37299365(+) m6A 3'UTR       24981863 chr6:37299449-37299450(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	TBC1D22B	Chromatin K562 cells     - Exosome Blood     - Insoluble cytoplasm K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Related Drug Information:

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID
RNAactDrug	ebv-miR-BART11-3p	Nvp-aew541       11476171

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART11-3p
Interactor2: TBC1D22B

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg