Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00339531

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART11-3p:  MIMAT0003422          SPN:  NM_001030288     

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Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART11-3p	SPN
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003422	6693
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CD43//GALGP//GPL115//LSN

RNA Editing:

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RADAR	SPN	chr16:29679006(+) A-I      3'UTR chr16:29680052(+) A-I      3'UTR chr16:29680282(+) A-I      3'UTR chr16:29678982(+) A-I      3'UTR chr16:29680045(+) A-I      3'UTR chr16:29679833(+) A-I      3'UTR chr16:29679652(+) A-I      3'UTR chr16:29680899(+) A-I      3'UTR chr16:29681479(+) A-I      3'UTR chr16:29681679(+) A-I      3'UTR chr16:29681656(+) A-I      3'UTR chr16:29681614(+) A-I      3'UTR chr16:29681576(+) A-I      3'UTR chr16:29681526(+) A-I      3'UTR chr16:29681521(+) A-I      3'UTR chr16:29681509(+) A-I      3'UTR chr16:29681501(+) A-I      3'UTR chr16:29679042(+) A-I      3'UTR chr16:29681352(+) A-I      3'UTR chr16:29681327(+) A-I      3'UTR chr16:29681314(+) A-I      3'UTR chr16:29681306(+) A-I      3'UTR chr16:29681200(+) A-I      3'UTR chr16:29681070(+) A-I      3'UTR chr16:29681044(+) A-I      3'UTR chr16:29681023(+) A-I      3'UTR chr16:29679182(+) A-I      3'UTR chr16:29680365(+) A-I      3'UTR chr16:29680354(+) A-I      3'UTR chr16:29680314(+) A-I      3'UTR 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RNA Modification:

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RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	SPN	Chromatin K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     -

Related Drug Information:

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID
RNAactDrug	ebv-miR-BART11-3p	Nvp-aew541       11476171

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART11-3p
Interactor2: SPN

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg