Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00329839

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART9-3p:  MIMAT0003419          GTPBP10:  NM_033107     

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Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART9-3p	GTPBP10
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003419	85865
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	ObgH2//UG0751c10

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	GTPBP10	chr7:90003430(+) A-I      intronic chr7:89988250(+) A-I      intronic chr7:90006352(+) A-I      intronic chr7:89988975(+) A-I      intronic chr7:89988686(+) A-I      intronic chr7:89988687(+) A-I      intronic chr7:89988698(+) A-I      intronic chr7:89988702(+) A-I      intronic chr7:89977544(+) A-I      intronic chr7:90006427(+) A-I      intronic chr7:89980661(+) A-I      intronic chr7:89987687(+) A-I      intronic chr7:89988013(+) A-I      intronic chr7:89981127(+) A-I      intronic chr7:89981201(+) A-I      intronic chr7:89981212(+) A-I      intronic chr7:90003258(+) A-I      intronic chr7:90019333(+) A-I      3'UTR chr7:90016498(+) A-I      3'UTR chr7:90015908(+) A-I      3'UTR chr7:90015913(+) A-I      3'UTR chr7:90015320(+) A-I      3'UTR chr7:90015160(+) A-I      3'UTR chr7:90015286(+) A-I      3'UTR chr7:90016480(+) A-I      3'UTR chr7:90016486(+) A-I      3'UTR chr7:90016496(+) A-I      3'UTR chr7:90016497(+) A-I      3'UTR chr7:90016530(+) A-I      3'UTR chr7:90015183(+) A-I      3'UTR chr7:90016556(+) A-I      3'UTR chr7:90016570(+) A-I      3'UTR chr7:90016578(+) A-I      3'UTR chr7:90016591(+) A-I      3'UTR chr7:90018780(+) A-I      3'UTR chr7:90018856(+) A-I      3'UTR chr7:90016539(+) A-I      3'UTR chr7:90015219(+) A-I      3'UTR chr7:90018875(+) A-I      3'UTR chr7:90018830(+) A-I      3'UTR chr7:90019385(+) A-I      3'UTR chr7:90018842(+) A-I      3'UTR chr7:90018850(+) A-I      3'UTR chr7:90019133(+) A-I      3'UTR chr7:90019243(+) A-I      3'UTR chr7:90015228(+) A-I      3'UTR chr7:90015214(+) A-I      3'UTR chr7:90015280(+) A-I      3'UTR chr7:90015212(+) A-I      3'UTR chr7:90019267(+) A-I      3'UTR chr7:90003413(+) A-I      intronic chr7:90003208(+) A-I      intronic chr7:90000065(+) A-I      intronic chr7:90006417(+) A-I      intronic chr7:90003338(+) A-I      intronic chr7:90018800(+) A-I      3'UTR chr7:90019357(+) A-I      3'UTR chr7:90018805(+) A-I      3'UTR chr7:90016503(+) A-I      3'UTR chr7:90015184(+) A-I      3'UTR chr7:90018775(+) A-I      3'UTR chr7:90019137(+) A-I      3'UTR chr7:90016426(+) A-I      3'UTR chr7:90015155(+) A-I      3'UTR chr7:90016499(+) A-I      3'UTR chr7:90015224(+) A-I      3'UTR chr7:90018818(+) A-I      3'UTR chr7:90018840(+) A-I      3'UTR chr7:90015119(+) A-I      3'UTR chr7:90018760(+) A-I      3'UTR chr7:90015114(+) A-I      3'UTR chr7:90015253(+) A-I      3'UTR chr7:90018898(+) A-I      3'UTR chr7:90015263(+) A-I      3'UTR chr7:90019316(+) A-I      3'UTR chr7:90019259(+) A-I      3'UTR chr7:90018867(+) A-I      3'UTR chr7:90015267(+) A-I      3'UTR chr7:90015316(+) A-I      3'UTR chr7:90016489(+) A-I      3'UTR chr7:90015169(+) A-I      3'UTR chr7:90019281(+) A-I      3'UTR chr7:90015186(+) A-I      3'UTR chr7:90015174(+) A-I      3'UTR chr7:90015930(+) A-I      3'UTR chr7:90019294(+) A-I      3'UTR chr7:90015220(+) A-I      3'UTR chr7:90015313(+) A-I      3'UTR chr7:90019241(+) A-I      3'UTR chr7:90016396(+) A-I      3'UTR chr7:90015929(+) A-I      3'UTR chr7:90018801(+) A-I      3'UTR chr7:90019202(+) A-I      3'UTR chr7:90015113(+) A-I      3'UTR chr7:90018884(+) A-I      3'UTR chr7:90019131(+) A-I      3'UTR chr7:90019231(+) A-I      3'UTR chr7:90018804(+) A-I      3'UTR chr7:90015891(+) A-I      3'UTR chr7:90015234(+) A-I      3'UTR chr7:90015091(+) A-I      3'UTR chr7:90016490(+) A-I      3'UTR chr7:90018866(+) A-I      3'UTR chr7:90015259(+) A-I      3'UTR chr7:90016494(+) A-I      3'UTR chr7:90019302(+) A-I      3'UTR chr7:89980638(+) A-I      intronic chr7:90003284(+) A-I      intronic chr7:90003341(+) A-I      intronic chr7:89981217(+) A-I      intronic chr7:89983275(+) A-I      intronic chr7:89983293(+) A-I      intronic chr7:90003288(+) A-I      intronic chr7:89983334(+) A-I      intronic chr7:90006283(+) A-I      intronic chr7:90003178(+) A-I      intronic chr7:90000064(+) A-I      intronic chr7:89981284(+) A-I      intronic chr7:89980625(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	GTPBP10	chr7:90018765(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr7:90018804(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr7:90018805(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr7:90018866(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr7:90018867(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr7:90019235(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr7:90019241(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr7:90019244(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr7:89999470(+) A-I intron -    22327324 chr7:90015263(+) A-I intron -    21960545 chr7:90015267(+) A-I intron -    21960545 chr7:90015268(+) A-I intron -    21960545 chr7:90019373(+) A-I intron -    21960545 chr7:89987745(+) A-I intron -    21960545 chr7:89988213(+) A-I intron -    21960545 chr7:89987934(+) A-G intron -    22484847 chr7:89988019(+) A-G intron -    22484847 chr7:89988123(+) A-G intron -    22484847 chr7:89988300(+) A-G intron -    22484847 chr7:89999444(+) A-G intron -    22484847 chr7:89999470(+) A-G intron -    22484847 chr7:89980625(+) A-G intron -    22484847 chr7:89980638(+) A-G intron -    22484847 chr7:89980712(+) A-G intron -    22484847 chr7:89981217(+) A-G intron -    22484847 chr7:89981284(+) A-G intron -    22484847 chr7:90000064(+) A-G intron -    22484847 chr7:90000065(+) A-G intron -    22484847 chr7:90003208(+) A-G intron -    22484847 chr7:90015263(+) A-G intron -    22484847 chr7:90015268(+) A-G intron -    22484847 chr7:90015891(+) A-G intron -    22484847 chr7:90018801(+) A-G intron -    22484847 chr7:90018804(+) A-G intron -    22484847 chr7:90018866(+) A-G intron -    22484847 chr7:90018867(+) A-G intron -    22484847 chr7:90018884(+) A-G intron -    22484847 chr7:90019131(+) A-G intron -    22484847 chr7:90019235(+) A-G intron -    22484847 chr7:90019241(+) A-G intron -    22484847 chr7:90019294(+) A-G intron -    22484847 chr7:90019314(+) A-G intron -    22484847 chr7:90019316(+) A-G intron -    22484847 chr7:90019357(+) A-G intron -    22484847 chr7:90019367(+) A-G intron -    22484847 chr7:90019373(+) A-G intron -    22484847 chr7:90001663(+) G-T intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	GTPBP10	chr7:89982155-89982156(+) m6A CDS//exon       24981863 chr7:90014229-90014230(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//22608085 chr7:90014246-90014247(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085 chr7:90014284-90014285(+) Y 3'UTR//CDS//exon       26075521 chr7:90014338-90014339(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085 chr7:90014374-90014375(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085 chr7:90014493-90014494(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr7:90014513-90014514(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr7:90014548-90014549(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr7:90014581-90014582(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr7:90014620-90014621(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr7:90014718-90014719(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr7:90015170-90015171(+) m6A 3'UTR       24981863 chr7:90015193-90015194(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	GTPBP10	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART9-3p
Interactor2: GTPBP10

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg