Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | ebv-miR-BART6-3p | DICER1 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0003415 | 23405 |
Organism | Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | DCR1//Dicer//Dicer1e//GLOW//HERNA//K12H4.8-LIKE//MNG1//RMSE2 |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | DICER1 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID |
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DARNED | DICER1 |
Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | DICER1 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | DICER1 |
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Interactor1: ebv-miR-BART6-3p | Interactor2: DICER1 |
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Strong-Evidence | Luciferase reporter assay | |
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Weak-Evidence | PAR-CLIP | |
Prediction-Evidence | miRanda//PARalyzer//Targetscan | |
Support Database | ViRBase//VmiReg |
PMID | 22291592 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase//VmiReg | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells | Interactor2 expression | Upregulation |
Description | MICB and DICER1 were both identified by PAR-CLIP as EBV miRNA targets; however, we identified different miRNAs with seed matches to clusters mapping to these 3'UTRs than what has been previously reported. DICER1 is a reported target of miR-BART6[36], which is deleted in EBV B95-8. |