Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00312042

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART5-5p:  MIMAT0003413          SLC38A9:  NR_146165     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART5-5p	SLC38A9
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003413	153129
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	URLC11

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	SLC38A9	chr5:54974651(-) A-I      intronic chr5:54974147(-) A-I      intronic chr5:54974062(-) A-I      intronic chr5:54948103(-) A-I      intronic chr5:54948078(-) A-I      intronic chr5:54948077(-) A-I      intronic chr5:54980481(-) A-I      intronic chr5:55007039(-) A-I      intronic chr5:54999989(-) A-I      intronic chr5:55002867(-) A-I      intronic chr5:54946816(-) A-I      intronic chr5:55002873(-) A-I      intronic chr5:55005834(-) A-I      intronic chr5:55005358(-) A-I      intronic chr5:54946718(-) A-I      intronic chr5:54946717(-) A-I      intronic chr5:54946652(-) A-I      intronic chr5:54945550(-) A-I      intronic chr5:54943980(-) A-I      intronic chr5:54943967(-) A-I      intronic chr5:54942136(-) A-I      intronic chr5:54942116(-) A-I      intronic chr5:54942087(-) A-I      intronic chr5:54994961(-) A-I      intronic chr5:54941987(-) A-I      intronic chr5:54941040(-) A-I      intronic chr5:55002893(-) A-I      intronic chr5:55003363(-) A-I      intronic chr5:55005347(-) A-I      intronic chr5:54999819(-) A-I      intronic chr5:54955308(-) A-I      intronic chr5:54954126(-) A-I      intronic chr5:54950732(-) A-I      intronic chr5:54950744(-) A-I      intronic chr5:54950776(-) A-I      intronic chr5:54954119(-) A-I      intronic chr5:54954110(-) A-I      intronic chr5:54950777(-) A-I      intronic chr5:54950211(-) A-I      intronic chr5:54994970(-) A-I      intronic chr5:54950201(-) A-I      intronic chr5:54999884(-) A-I      intronic chr5:54999982(-) A-I      intronic chr5:55005788(-) A-I      intronic chr5:55005701(-) A-I      intronic chr5:55007038(-) A-I      intronic chr5:54955462(-) A-I      intronic chr5:54955467(-) A-I      intronic chr5:54978386(-) A-I      intronic chr5:54989764(-) A-I      intronic chr5:54989785(-) A-I      intronic chr5:54989807(-) A-I      intronic chr5:54989811(-) A-I      intronic chr5:54989812(-) A-I      intronic chr5:55006229(-) A-I      intronic chr5:55006582(-) A-I      intronic chr5:55006215(-) A-I      intronic chr5:55006214(-) A-I      intronic chr5:54962779(-) A-I      intronic chr5:54962767(-) A-I      intronic chr5:54983804(-) A-I      intronic chr5:54983798(-) A-I      intronic chr5:54983791(-) A-I      intronic chr5:54983776(-) A-I      intronic chr5:54983775(-) A-I      intronic chr5:54983589(-) A-I      intronic chr5:54980655(-) A-I      intronic chr5:54980620(-) A-I      intronic chr5:54980619(-) A-I      intronic chr5:54980574(-) A-I      intronic chr5:54980567(-) A-I      intronic chr5:54926310(-) A-I      intronic chr5:54979166(-) A-I      intronic chr5:54979044(-) A-I      intronic chr5:54978520(-) A-I      intronic chr5:54961548(-) A-I      intronic chr5:54961541(-) A-I      intronic chr5:54961535(-) A-I      intronic chr5:54957164(-) A-I      intronic chr5:54941029(-) A-I      intronic chr5:54941027(-) A-I      intronic chr5:54940987(-) A-I      intronic chr5:54939945(-) A-I      intronic chr5:54936093(-) A-I      intronic chr5:54936087(-) A-I      intronic chr5:54957151(-) A-I      intronic chr5:54957083(-) A-I      intronic chr5:54956106(-) A-I      intronic chr5:54956081(-) A-I      intronic chr5:54955799(-) A-I      intronic chr5:54935992(-) A-I      intronic chr5:54935989(-) A-I      intronic chr5:54935987(-) A-I      intronic chr5:54955705(-) A-I      intronic chr5:54955505(-) A-I      intronic chr5:54935038(-) A-I      intronic chr5:54934992(-) A-I      intronic chr5:54994996(-) A-I      intronic chr5:54995981(-) A-I      intronic chr5:54934969(-) A-I      intronic chr5:54934902(-) A-I      intronic chr5:54934880(-) A-I      intronic chr5:54928219(-) A-I      intronic chr5:54996131(-) A-I      intronic chr5:54998291(-) A-I      intronic chr5:54998306(-) A-I      intronic chr5:54928154(-) A-I      intronic chr5:54928144(-) A-I      intronic chr5:54928142(-) A-I      intronic chr5:54926874(-) A-I      intronic chr5:54926866(-) A-I      intronic chr5:54926842(-) A-I      intronic chr5:54926725(-) A-I      intronic chr5:54926416(-) A-I      intronic chr5:54926340(-) A-I      intronic chr5:54926325(-) A-I      intronic chr5:54926284(-) A-I      intronic chr5:54974042(-) A-I      intronic chr5:54926283(-) A-I      intronic chr5:54973524(-) A-I      intronic chr5:54926257(-) A-I      intronic chr5:54926243(-) A-I      intronic chr5:54972232(-) A-I      intronic chr5:54972182(-) A-I      intronic chr5:54967638(-) A-I      intronic chr5:54967616(-) A-I      intronic chr5:54967484(-) A-I      intronic chr5:54965931(-) A-I      intronic chr5:54965921(-) A-I      intronic chr5:54963650(-) A-I      intronic chr5:54962791(-) A-I      intronic chr5:54974777(-) A-I      intronic chr5:54974755(-) A-I      intronic chr5:54974701(-) A-I      intronic chr5:55006213(-) A-I      intronic chr5:55006212(-) A-I      intronic chr5:54955497(-) A-I      intronic chr5:54994713(-) A-I      intronic chr5:54994837(-) A-I      intronic chr5:54994647(-) A-I      intronic chr5:54990853(-) A-I      intronic chr5:54990808(-) A-I      intronic chr5:54990775(-) A-I      intronic chr5:54990654(-) A-I      intronic chr5:54990638(-) A-I      intronic chr5:54950187(-) A-I      intronic chr5:54989989(-) A-I      intronic chr5:54989912(-) A-I      intronic chr5:54989863(-) A-I      intronic chr5:54989808(-) A-I      intronic chr5:54994959(-) A-I      intronic chr5:54949081(-) A-I      intronic chr5:54989645(-) A-I      intronic chr5:54984293(-) A-I      intronic chr5:54949050(-) A-I      intronic chr5:54948977(-) A-I      intronic chr5:54935916(-) A-I      intronic chr5:54926703(-) A-I      intronic chr5:54978478(-) A-I      intronic chr5:54950346(-) A-I      intronic chr5:54941953(-) A-I      intronic chr5:54998181(-) A-I      intronic chr5:54974591(-) A-I      intronic chr5:55002953(-) A-I      intronic chr5:54959372(-) A-I      intronic chr5:54994559(-) A-I      intronic chr5:55006999(-) A-I      intronic chr5:54972028(-) A-I      intronic chr5:54955861(-) A-I      intronic chr5:54999944(-) A-I      intronic chr5:54947297(-) A-I      intronic chr5:54942123(-) A-I      intronic chr5:54990718(-) A-I      intronic chr5:54926878(-) A-I      intronic chr5:54998342(-) A-I      intronic chr5:54967969(-) A-I      intronic chr5:54926879(-) A-I      intronic chr5:54974761(-) A-I      intronic chr5:54983676(-) A-I      intronic chr5:54950347(-) A-I      intronic chr5:54959346(-) A-I      intronic chr5:54974539(-) A-I      intronic chr5:54999759(-) A-I      intronic chr5:54935991(-) A-I      intronic chr5:54942139(-) A-I      intronic chr5:54935978(-) A-I      intronic chr5:54974738(-) A-I      intronic chr5:54978486(-) A-I      intronic chr5:54948102(-) A-I      intronic chr5:54942037(-) A-I      intronic chr5:54928968(-) A-I      intronic chr5:54950934(-) A-I      intronic chr5:54945380(-) A-I      intronic chr5:54983702(-) A-I      intronic chr5:54984497(-) A-I      intronic chr5:54947255(-) A-I      intronic chr5:54928118(-) A-I      intronic chr5:54935922(-) A-I      intronic chr5:54926794(-) A-I      intronic chr5:54974627(-) A-I      intronic chr5:54950228(-) A-I      intronic chr5:54983709(-) A-I      intronic chr5:54926175(-) A-I      intronic chr5:54926849(-) A-I      intronic chr5:54946776(-) A-I      intronic chr5:54998360(-) A-I      intronic chr5:54952922(-) A-I      intronic chr5:54990649(-) A-I      intronic chr5:54950249(-) A-I      intronic chr5:54926417(-) A-I      intronic chr5:54974071(-) A-I      intronic chr5:54996006(-) A-I      intronic chr5:54955866(-) A-I      intronic chr5:54990648(-) A-I      intronic chr5:54956083(-) A-I      intronic chr5:54926423(-) A-I      intronic chr5:54928258(-) A-I      intronic chr5:54990713(-) A-I      intronic chr5:54942681(-) A-I      intronic chr5:54998218(-) A-I      intronic chr5:54935019(-) A-I      intronic chr5:54990727(-) A-I      intronic chr5:54967613(-) A-I      intronic chr5:54926793(-) A-I      intronic chr5:54978410(-) A-I      intronic chr5:54928203(-) A-I      intronic chr5:55005835(-) A-I      intronic chr5:54954078(-) A-I      intronic chr5:54983814(-) A-I      intronic chr5:54936100(-) A-I      intronic chr5:54978540(-) A-I      intronic chr5:54974783(-) A-I      intronic chr5:54926960(-) A-I      intronic chr5:54967814(-) A-I      intronic chr5:54967975(-) A-I      intronic chr5:54983664(-) A-I      intronic chr5:54942699(-) A-I      intronic chr5:54943918(-) A-I      intronic chr5:54974760(-) A-I      intronic chr5:54998250(-) A-I      intronic chr5:54983700(-) A-I      intronic chr5:54929054(-) A-I      intronic chr5:55005775(-) A-I      intronic chr5:54990725(-) A-I      intronic chr5:54990653(-) A-I      intronic chr5:54974725(-) A-I      intronic chr5:54983690(-) A-I      intronic chr5:55003014(-) A-I      intronic chr5:55006196(-) A-I      intronic chr5:54950428(-) A-I      intronic chr5:54967564(-) A-I      intronic chr5:54926328(-) A-I      intronic chr5:54928989(-) A-I      intronic chr5:54952915(-) A-I      intronic chr5:55005850(-) A-I      intronic chr5:54954023(-) A-I      intronic chr5:54990813(-) A-I      intronic chr5:54994594(-) A-I      intronic chr5:54956146(-) A-I      intronic chr5:54935952(-) A-I      intronic chr5:54990854(-) A-I      intronic chr5:54928892(-) A-I      intronic chr5:54989841(-) A-I      intronic chr5:54998234(-) A-I      intronic chr5:55004144(-) A-I      intronic chr5:54947349(-) A-I      intronic chr5:54929038(-) A-I      intronic chr5:54926339(-) A-I      intronic chr5:54989858(-) A-I      intronic chr5:54973629(-) A-I      intronic chr5:54972095(-) A-I      intronic chr5:54983637(-) A-I      intronic chr5:54967746(-) A-I      intronic chr5:54956238(-) A-I      intronic chr5:54942090(-) A-I      intronic chr5:54979161(-) A-I      intronic chr5:54950427(-) A-I      intronic chr5:54942845(-) A-I      intronic chr5:54929107(-) A-I      intronic chr5:54945510(-) A-I      intronic chr5:54925132(-) A-I      intronic chr5:54942036(-) A-I      intronic chr5:54945568(-) A-I      intronic chr5:54952863(-) A-I      intronic chr5:54983666(-) A-I      intronic chr5:54955385(-) A-I      intronic chr5:54926839(-) A-I      intronic chr5:54954087(-) A-I      intronic chr5:54949002(-) A-I      intronic chr5:54955772(-) A-I      intronic chr5:54950272(-) A-I      intronic chr5:54978361(-) A-I      intronic chr5:54990719(-) A-I      intronic chr5:54956119(-) A-I      intronic chr5:54950294(-) A-I      intronic chr5:54978594(-) A-I      intronic chr5:54962947(-) A-I      intronic chr5:55007005(-) A-I      intronic chr5:54950900(-) A-I      intronic chr5:54955867(-) A-I      intronic chr5:54994515(-) A-I      intronic chr5:54998286(-) A-I      intronic chr5:54940445(-) A-I      intronic chr5:54942719(-) A-I      intronic chr5:54990784(-) A-I      intronic chr5:54980777(-) A-I      intronic chr5:54959398(-) A-I      intronic chr5:54974708(-) A-I      intronic chr5:54955732(-) A-I      intronic chr5:55002992(-) A-I      intronic chr5:54990807(-) A-I      intronic chr5:54948064(-) A-I      intronic chr5:54989671(-) A-I      intronic chr5:54955775(-) A-I      intronic chr5:55006168(-) A-I      intronic chr5:54944014(-) A-I      intronic chr5:54929053(-) A-I      intronic chr5:54938012(-) A-I      intronic chr5:54978411(-) A-I      intronic chr5:55002843(-) A-I      intronic chr5:55005327(-) A-I      intronic chr5:54929017(-) A-I      intronic chr5:55005334(-) A-I      intronic chr5:54956189(-) A-I      intronic chr5:54967654(-) A-I      intronic chr5:54956141(-) A-I      intronic chr5:54947254(-) A-I      intronic chr5:54980646(-) A-I      intronic chr5:54926179(-) A-I      intronic chr5:54942716(-) A-I      intronic chr5:54974715(-) A-I      intronic chr5:54989914(-) A-I      intronic chr5:54935015(-) A-I      intronic chr5:54958887(-) A-I      intronic chr5:54929099(-) A-I      intronic chr5:54974238(-) A-I      intronic chr5:54989906(-) A-I      intronic chr5:54928076(-) A-I      intronic chr5:55005288(-) A-I      intronic chr5:54926797(-) A-I      intronic chr5:54978551(-) A-I      intronic chr5:54980630(-) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	SLC38A9	chr5:54928892(-) A-I intron -    15342557 chr5:54928906(-) A-I intron -    15342557 chr5:54928974(-) A-I intron -    15342557   //22327324 chr5:54928989(-) A-I intron -    15342557   //22327324 chr5:54929038(-) A-I intron -    15342557 chr5:54982905(-) A-C intron -    22484847 chr5:54925089(-) G-C intron -    22484847 chr5:54926175(-) A-G intron -    22484847 chr5:54926179(-) A-G intron -    22484847 chr5:54926849(-) A-G intron -    22484847 chr5:54926878(-) A-G intron -    22484847 chr5:54926879(-) A-G intron -    22484847 chr5:54926948(-) A-G intron -    22484847 chr5:54928076(-) A-G intron -    22484847 chr5:54928101(-) A-G intron -    22484847 chr5:54928968(-) A-G intron -    22484847 chr5:54928974(-) A-G intron -    22484847 chr5:54928989(-) A-G intron -    22484847 chr5:54929017(-) A-G intron -    22484847 chr5:54929038(-) A-G intron -    22484847 chr5:54929086(-) A-G intron -    22484847 chr5:54935019(-) A-G intron -    22484847 chr5:54936100(-) A-G intron -    22484847 chr5:54936941(-) A-G intron -    22484847 chr5:54942031(-) A-G intron -    22484847 chr5:54942036(-) A-G intron -    22484847 chr5:54942037(-) A-G intron -    22484847 chr5:54942090(-) A-G intron -    22484847 chr5:54942099(-) A-G intron -    22484847 chr5:54942123(-) A-G intron -    22484847 chr5:54942139(-) A-G intron -    22484847 chr5:54942681(-) A-G intron -    22484847 chr5:54942719(-) A-G intron -    22484847 chr5:54942845(-) A-G intron -    22484847 chr5:54944014(-) A-G intron -    22484847 chr5:54945510(-) A-G intron -    22484847 chr5:54946776(-) A-G intron -    22484847 chr5:54947297(-) A-G intron -    22484847 chr5:54947349(-) A-G intron -    22484847 chr5:54948064(-) A-G intron -    22484847 chr5:54949002(-) A-G intron -    22484847 chr5:54950249(-) A-G intron -    22484847 chr5:54950272(-) A-G intron -    22484847 chr5:54950294(-) A-G intron -    22484847 chr5:54950338(-) A-G intron -    22484847 chr5:54950346(-) A-G intron -    22484847 chr5:54950347(-) A-G intron -    22484847 chr5:54950381(-) A-G intron -    22484847 chr5:54950427(-) A-G intron -    22484847 chr5:54950900(-) A-G intron -    22484847 chr5:54950934(-) A-G intron -    22484847 chr5:54955772(-) A-G intron -    22484847 chr5:54955778(-) A-G intron -    22484847 chr5:54955861(-) A-G intron -    22484847 chr5:54955866(-) A-G intron -    22484847 chr5:54955867(-) A-G intron -    22484847 chr5:54955982(-) A-G intron -    22484847 chr5:54956083(-) A-G intron -    22484847 chr5:54956119(-) A-G intron -    22484847 chr5:54956141(-) A-G intron -    22484847 chr5:54956146(-) A-G intron -    22484847 chr5:54956189(-) A-G intron -    22484847 chr5:54956238(-) A-G intron -    22484847 chr5:54957157(-) A-G intron -    22484847 chr5:54959346(-) A-G intron -    22484847 chr5:54959372(-) A-G intron -    22484847 chr5:54959555(-) A-G intron -    22484847 chr5:54962947(-) A-G intron -    22484847 chr5:54966042(-) G-A intron -    22484847 chr5:54967654(-) A-G intron -    22484847 chr5:54967969(-) A-G intron -    22484847 chr5:54967975(-) A-G intron -    22484847 chr5:54974066(-) T-G intron -    22484847 chr5:54974237(-) A-G intron -    22484847 chr5:54974238(-) A-G intron -    22484847 chr5:54974783(-) A-G intron -    22484847 chr5:54978410(-) A-G intron -    22484847 chr5:54978478(-) A-G intron -    22484847 chr5:54978486(-) A-G intron -    22484847 chr5:54978540(-) A-G intron -    22484847 chr5:54978551(-) A-G intron -    22484847 chr5:54979161(-) A-G intron -    22484847 chr5:54979167(-) A-G intron -    22484847 chr5:54980630(-) A-G intron -    22484847 chr5:54980646(-) A-G intron -    22484847 chr5:54980728(-) A-G intron -    22484847 chr5:54980732(-) A-G intron -    22484847 chr5:54983637(-) A-G intron -    22484847 chr5:54983664(-) A-G intron -    22484847 chr5:54983666(-) A-G intron -    22484847 chr5:54983709(-) A-G intron -    22484847 chr5:54984497(-) A-G intron -    22484847 chr5:54989841(-) A-G intron -    22484847 chr5:54989858(-) A-G intron -    22484847 chr5:54989906(-) A-G intron -    22484847 chr5:54989914(-) A-G intron -    22484847 chr5:54990648(-) A-G intron -    22484847 chr5:54990649(-) A-G intron -    22484847 chr5:54990653(-) A-G intron -    22484847 chr5:54990713(-) A-G intron -    22484847 chr5:54990718(-) A-G intron -    22484847 chr5:54990719(-) A-G intron -    22484847 chr5:54990725(-) A-G intron -    22484847 chr5:54990727(-) A-G intron -    22484847 chr5:54990745(-) A-G intron -    22484847 chr5:54990807(-) A-G intron -    22484847 chr5:54990813(-) A-G intron -    22484847 chr5:54990818(-) A-G intron -    22484847 chr5:54996006(-) A-G intron -    22484847 chr5:54998181(-) A-G intron -    22484847 chr5:54998192(-) A-G intron -    22484847 chr5:54998218(-) A-G intron -    22484847 chr5:54998234(-) A-G intron -    22484847 chr5:54998286(-) A-G intron -    22484847 chr5:54998342(-) A-G intron -    22484847 chr5:54998360(-) A-G intron -    22484847 chr5:55004144(-) A-G intron -    22484847 chr5:55005327(-) A-G intron -    22484847 chr5:55005835(-) A-G intron -    22484847 chr5:55005845(-) A-G intron -    22484847 chr5:55005850(-) A-G intron -    22484847 chr5:55006999(-) A-G intron -    22484847 chr5:55007005(-) A-G intron -    22484847 chr5:55007120(-) A-T intron -    22484847 chr5:55007121(-) C-T intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	SLC38A9	chr5:54921752-54921753(-) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr5:55007260-55007261(-) m6A 5'UTR//intron       24981863 chr5:55007294-55007295(-) m6A 5'UTR//exon//intron       24981863 chr5:55007318-55007319(-) m6A 5'UTR//exon//intron       24981863 chr5:55008138-55008139(-) m6A 5'UTR//exon       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	SLC38A9	Cytosol HeLa-S3 cells     - Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART5-5p
Interactor2: SLC38A9

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda
Support Database	RepTar//VmiReg