Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | ebv-miR-BART3-3p | PPARGC1B |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0003411 | 133522 |
Organism | Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | ERRL1//PERC//PGC-1(beta)//PGC1B |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | PPARGC1B |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | PPARGC1B |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | PPARGC1B |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID |
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RNALocate | PPARGC1B |
Interactor1: ebv-miR-BART3-3p | Interactor2: PPARGC1B |
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Weak-Evidence | PAR-CLIP | |
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Prediction-Evidence | PARalyzer | |
Support Database | ViRBase//VIRmiRNA |
PMID | 22291592 | Target region | CDS |
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Source | ViRBase//VIRmiRNA | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | We identified an additional 2,972 CDS miRNA-interaction sites present in at least two libraries, 89.7% of which could be assigned to a miRNA (Table S7). |