Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00303707

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART3-3p:           MRI1:      

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Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol ebv-miR-BART3-3p MRI1
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0003411 84245
Organism Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - M1Pi//MRDI//MTNA//Ypr118w

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR MRI1
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chr19:13884742(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase MRI1
chr19:13875451-13875452(+) m6A CDS//exon       -
chr19:13876787-13876788(+) m6A CDS//exon//intron       22608085
chr19:13876802-13876803(+) m6A CDS//exon//intron       22608085
chr19:13876811-13876812(+) m6A CDS//exon//intron       22608085
chr19:13876829-13876830(+) m6A CDS//exon//intron       22608085
chr19:13879191-13879192(+) Gm CDS//exon//intron       -
chr19:13879223-13879224(+) m6A CDS//exon//intron       -
chr19:13879251-13879252(+) m6A CDS//exon//intron       -
chr19:13879287-13879288(+) m6A exon//intron       -
chr19:13879315-13879316(+) m6A exon//intron       -
chr19:13879430-13879431(+) m6A CDS//exon       -
chr19:13883004-13883005(+) m6A CDS       24284625//24981863
chr19:13883035-13883036(+) m6A CDS       24284625//24981863
chr19:13883071-13883072(+) m6A CDS       24284625//24981863
chr19:13883082-13883083(+) m6A CDS       24284625//24981863
chr19:13883212-13883213(+) m6A 3'UTR       24284625
chr19:13883769-13883770(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate MRI1
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: ebv-miR-BART3-3p
Interactor2: MRI1

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//Targetscan
Support Database VmiReg

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